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efecto
2011 Jul 08
3
Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey
Queridos R-users:
Tengo una duda que hace mucho tiempo que estoy intentando resolver, os
explico a modo de ejemplo:
Tengo estos efectos: Año(5 niveles),Localidad (10 niveles) y genotipo
(3 niveles), año y localidad son aleatorios y genotipo es fijo (los he
escogido yo).
Me gustaría hacer obtener una tabla parecida a la Tabla Anova donde
aparezca cada factor y sus interacciones y finalmente hacer un
comparación de medias d...
2015 Jul 04
2
Problema con loop
Buenas a todos, acá estoy yo de nuevo con problemas de loops.
Tengo el siguiente problema: un vector de datos (y) y una serie de
efectos. El loop lo que intenta es evaluar el R² de modelos
incrementando por vuelta una variable efecto.
Seria algo así:
for(i in 1:x) {
modelo=lm(y~efectos[,1:i])
... codigo para guardar R² y otros por cada vuelta...
}
apply() puede ir columna a columna pero no sé como hacer para que me
vaya "a...
2016 Mar 07
2
Efectos aleatorios anidados en gamlss
Hola a tod en s,
tengo una duda que la comunidad R me puede ayudar. Estoy trabajando con
gamlss, porque tengo una variable respuesta con valores entre 0 y 1 e
incluidos estos. La distribución que utilizo com gamlss para este caso es
"beta inflated" (Stasinopulos and Rigby 2007. Journal of Statistical
Software 23(7)). El modelo que intento correr es:
m1<-gamlss(Teleosteos ~
2015 Jul 04
2
Problema con loop
...uería probar con apply o en este caso sapply, muchas
gracias!
Saludos!!
F Macedo
El 03/07/15 a las 23:09, Jorge I Velez escribió:
> Hola Fernando,
>
> Podrias considerar las siguientes opciones:
>
> R2 <- vector("list", x)
> for(i in 1:x){
> modelo <- lm(y ~ efectos[, 1:i])
> R2[[i]] <- summary(modelo)$r.squared
> }
> R2
>
> ? opt2 <- sapply(1:x, ?function(i){
> modelo <- lm(y ~ efectos[, 1:i])
> summary(modelo)$r.squared
> })
> opt2
>
> Para mas información revisa ?sapply, ?lapply y ?lm. En caso de que
> ne...
2012 Sep 26
3
DUDA SOBRE PARTICIÓN DE DATOS PARA VALIDACIÓN CRUZADA
...Estimados muy buenas quería hacerles unas consulta:
Estoy trabajando en mi tesis sobre mejoramiento animal y mi objetivo es
evaluar la habilidad predictiva de modelos estadísticos mediante validación
cruzada.
Pero antes la intención es dividir mi base de datos en 3 partes y quisiera
que todos los efectos incluidos en el estudio y cada uno de sus niveles,
estén lo más equitativamente representados en los tres subconjuntos.
Mis efectos son año (32 niveles), sexo (3 niveles), edad (2 niveles) y
efecto genético animal (5561 niveles).
¿Existe alguna forma de realizar una partición al azar de mi ba...
2015 Jul 05
2
Problema con loop
...>>
>> F Macedo
>>
>> El 03/07/15 a las 23:09, Jorge I Velez escribió:
>>
>> Hola Fernando,
>>
>> Podrias considerar las siguientes opciones:
>>
>> R2 <- vector("list", x)
>> for(i in 1:x){
>> modelo <- lm(y ~ efectos[, 1:i])
>> R2[[i]] <- summary(modelo)$r.squared
>> }
>> R2
>>
>> ? opt2 <- sapply(1:x, ?function(i){
>> modelo <- lm(y ~ efectos[, 1:i])
>> summary(modelo)$r.squared
>> })
>> opt2
>>
>> Para mas información revisa ?...
2024 Apr 17
0
Ayuda: Calculo tamaño del efecto
Necesito realizar un an?lisis del tama?o de muestra para un experimento con las siguientes caracter?sticas: 1) Una variable independiente intrasujeto es el tipo de queso con dos niveles, Queso A (1) y Queso B (2). 2) La otra variable independiente intrasujeto es la ronda de degustaci?n con tres niveles: ronda de degustaci?n a ciegas (1), ronda de degustaci?n de expectativas (2) y ronda de
2012 Mar 19
9
Efectos fijos y aleatorios en un modelo lineal
Hola a todos,
Tengo algunas dudas sobre como introducir en un modelo lineal factores
con efectos fijos y aleatorios. Mi diseño es el siguiente:
Factores
Line: 40 líneas de trigo (Fijo)
Rep: 3 Bloques (Aleatorio)
Year: 2 Años (Aleatorio)
Variable dependiente
alpha.ug.mg
Nota: Adjunto tabla de datos
Dentro del diseño, 'Rep' y 'Year' se considera de efectos aleatorios y...
2010 Apr 14
3
pdMat
Alguien tiene experiencia en escribir una pdMat. Para aquellos que no lo
recuerden son las matrices de covarianzas de los efectos aleatorios que
ajusta la función lme de la librería nlme
Estas matrices tiene especial importancia en aplicaciones de genética de
poblaciones y en particular en mapeo de asociación. Pinheiro y Bates dicen
que el usuario puede crear sus propias pdMat y sugiere como ejemplo ver una
pdDiag, pero cuand...
2013 Feb 04
10
duda con lmer. Añadir predictor a nivel de grupos
...iscs_a + (sau_com | cod_com) , data=datos.agr)
El modelo ajusta y puedo obtener los coeficientes con fixef(mod.ingr)
y ranef(mod.ingr) , pero si quiero obtener los coeficientes para cada
una de las comarcas con coef(mod.ingr) me dice qeu no puede alinearlos.
Si incluyo sau_com en la parte de efectos fijos, el modelo tb ajusta y
esta vez si puedo obtener los coeficientes con coef(mod.ingr2)
mod.ingr.2 <- lmer(ingre_6 ~ iscs_a + sau_com + (sau_com | cod_com) ,
data=datos.agr)
En la bibliografía y ejemplos que he consultado siempre aparece de la
segunda forma. ¿Hay que ponerlo siempre así...
2010 Sep 24
7
help
...roduced
2: In pf(q, df1, df2, lower.tail, log.p) : NaNs produced
3: In pf(q, df1, df2, lower.tail, log.p) : NaNs produced
Y hasta aquí llegue. Veo que algo está mal con la distribución de los
grados de libertad, ¿Qué es lo que tendría que odificar para resolver
el problema? ¿Están mal elegidos los efectos aleatorios? ¿Tendría que
usar otra formulación del modelo u otro modelo?
Muchas gracias a todos
Saludos
Santiago
--
Santiago. L. Poggio
Ing. Agr., Dr.
CONICET - Cátedra de Producción Vegetal
Departamento de Producción Vegetal
Facultad de Agronomía
Universidad de Buenos Aires
Av. San Martín 4453...
2013 Jun 30
0
EFECTO ANIDADO ALEATORIO SOBRE FIJO
Estimados quería realizarles la siguiente consulta:
1) ¿es posible dentro de un modelo con enfoque bayesiano, anidar un efecto
con distribución multivariada ("aleatorio" en términos frecuentistas) sobre
un factor de distribución no multivariada (fijo en términos frecuentistas)
en R?
.
Trabajo sobre datos de competencia en enduro y dispongo de una variable Año
(33 niveles) y una
2013 Feb 13
5
off topic ¿comparaciones múltiples?
Estimados herreros,
Sabéis si hay algún sitio donde pueda hacer una pregunta sobre
estadística, en concreto un diseño experimental. Alguna lista, foros, etc.
Ya se que este no es el sitio adecuado para preguntas de estadística,
pero por si alguien se pica os la pongo a continuación.
Dos tratamientos C y H.
Se aplican a una serie de especies (p.e. 10)
Se observa la respuesta de las especies a
2011 Jul 08
0
Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey a claración de las datos
...diadas son Producción neta, Peso de 100
semillas y Proteína.
Tercero: Observo los mismos genotipos (G) en varios años (A) en las
misma localidades (L). La especie es Phaseolus vulgaris L., en forma
de judía seca, por lo que cada año se planta y se recolecta.
Con el lme no ser introducir dos efectos aleatorios, ni su
interacción; y en el caso de que no exista significación en ninguna
interacción con G, como podría hacer la comparación múltiple de medias.
Muchas gracias de nuevo y gracias por el comentario Olivier Nuñez.
Marçal Plans
--
UPC-ESAB.
Campus del Baix Llobregat . Edifici D4....
2013 Jan 23
0
Mixed effects para factores y no para covariables. Guia y dudas
Hola buenas tras meses investigando como hacer anovas para factores con
efectos fijos y efectos aleatorios, he encontrado una serie de funciones
que satisfacen mis pretensiones y creo correctas en cierta medida. Me
gustaría compartirlas con vosotros con doble intención, la primera es
compartirla para que si otro se encuentra en esta situación que tenga el
trabajo hecho y la se...
2015 Feb 04
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Interpretación de coeficientes en un cox proportional hazards con variable strata
Buenas.
Abajo pongo la salida de un modelo de cox , dónde he estratificado por
una variable de país (Countryb) y por otra (Q6). Además hay interacción
entre la variable mobilityPDurG2 (es una variable 0,1, y 0 es la
categoría de referencia) país.
La categoría de referencia para país es "united kingdom".
Mi duda surge si quiero calcular el hazard ratio para los que tienen un
1
2011 May 24
3
test de Friedman , con comparación planificada simple (la primera contra el resto...).
Hola.
Hay alguna función que haga un Friedman test (digamos 4 tratamientos o
tiempos relacionados/dependientes) y que después haga una comparación
de un tratamiento contra el resto, digamos el primero, como un
contratase simple, o un Dunnett?
o simplemente ¿como hago un Dunnett para unos tratamientos relacionados?
--
Antonio M
[[alternative HTML version deleted]]
2014 Jan 14
2
Duda Regresión Multiple
Buenos días,
*Muchas gracias, todas las aportaciones han sido bien útiles.* Las he
tenido en cuenta y he pasado los datos con el R, siguiendo el siguiente
comando:
*modeloRTUN2<-lm(AVE.~ Tariff + d1 + d2 + d3 + d4 + d5 + d6 + d7 + d8 + d9+
d10 + d11+ d12+ d13+ d14+ d15+ d16+ d17+ d18+ d19+ d20 +d21 + Tariff*d1 +
Tariff*d2 + Tariff*d10)*
*summary(modeloRTUN2)*
Siendo:
AVE. = Variable
2013 Feb 13
0
Resumen de R-help-es, Vol 48, Envío 13
Hola Angela, yo tambien he usado la funcion "rarecurve" para crear curvas de rarefacción
Saludos
Gabriel Antonio Trujillo Paucar
Egresado de Biologia - Especialidad de Ecología
Investigador en el Area de Limnología de CORBIDI
997603768
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> From: r-help-es-request en r-project.org
> Subject: Resumen de R-help-es, Vol 48, Envío 13
> To:
2012 Jun 28
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Sobre survival analysis
Hola
Estoy tratando de correr un survival analysis usando un Cox regression model.
Tengo una duda respecto a la organizacion del script. Tengo una variable que es -tamano del individuo- y quiero ver si hay diferencia en sobrevivencia respecto a tamano. Como diseno de campo los tamanos fueron ubicados de forma aleatoria en bloques al azar.
Cuado planteo el script tengo algo como: