Hola, ¿Alguien sabe cómo lidia la función aov con diseño no balanceado? ¿Utiliza el las funciones de suma de cuadrados type II ? Gracias!! [[alternative HTML version deleted]]
2009/6/24 Usuario R <r.user.spain en gmail.com>:> Hola, > > ¿Alguien sabe cómo lidiaNo entiendo "lidia"! la función aov con diseño no balanceado? ¿Utiliza> el las funciones de suma de cuadrados type II ?No creo. Otros pueden saber más. Estan basada en calcular proyecciones, que pueden ser no ótimos en el caso no balanceado. (supongo que refieres al caso con múltiples niveles de variación, en otro caso simplemente es mínimos cuadrados). Para diseños no balanceados probablemente es mejor usar lme4 o nlme. Kjetil> > Gracias!! > > [[alternative HTML version deleted]] > > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > >-- "... an entire human genome would fit on a music CD." --- www.thinkgene.com
Supongo que quieres contrastar algún modelo. Para evitar cualquier problema de interpretación en diseños no ortogonales, te aconsejo utilizar el comando: anova(modelo_ref, modelo_1) que permite comparar los modelos que te interesan. Para más detalles leer http://cran.r-project.org/doc/FAQ/R-FAQ.html#Why-does-the-output-from- anova_0028_0029-depend-on-the-order-of-factors-in-the-model_003f Olivier -- ____________________________________ Olivier G. Nuñez Email: onunez@iberstat.es Tel : +34 663 03 69 09 Web: http://www.iberstat.es ____________________________________ El 24/06/2009, a las 15:58, Usuario R escribió:> Hola, > > ¿Alguien sabe cómo lidia la función aov con diseño no balanceado? > ¿Utiliza > el las funciones de suma de cuadrados type II ? > > Gracias!! > > [[alternative HTML version deleted]] > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es@r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es[[alternative HTML version deleted]]
Ramon Diaz-Uriarte
2009-Jun-24 14:42 UTC
[R-es] algoritmo en aov para diseño no balanceado
Además de las sugerencias anteriores, si quieres por alguna razón usar algo similar a aov, puedes utilizar "Anova", en el paquete "car" de J. Fox. La función "Anova" utiliza por defecto las de tipo II. R. 2009/6/24 Olivier Nuñez <onunez en iberstat.es>:> Supongo que quieres contrastar algún modelo. > Para evitar cualquier problema de interpretación en diseños no > ortogonales, te aconsejo utilizar el comando: > > anova(modelo_ref, modelo_1) > que permite comparar los modelos que te interesan. > > Para más detalles leer > > http://cran.r-project.org/doc/FAQ/R-FAQ.html#Why-does-the-output-from- > anova_0028_0029-depend-on-the-order-of-factors-in-the-model_003f > > Olivier > > -- > ____________________________________ > > Olivier G. Nuñez > Email: onunez en iberstat.es > Tel : +34 663 03 69 09 > Web: http://www.iberstat.es > > ____________________________________ > > > > > El 24/06/2009, a las 15:58, Usuario R escribió: > >> Hola, >> >> ¿Alguien sabe cómo lidia la función aov con diseño no balanceado? >> ¿Utiliza >> el las funciones de suma de cuadrados type II ? >> >> Gracias!! >> >> [[alternative HTML version deleted]] >> >> _______________________________________________ >> R-help-es mailing list >> R-help-es en r-project.org >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > >-- Ramon Diaz-Uriarte Structural Biology and Biocomputing Programme Spanish National Cancer Centre (CNIO) http://ligarto.org/rdiaz Phone: +34-91-732-8000 ext. 3019
Pablo Emilio Verde
2009-Jun-24 15:19 UTC
[R-es] Re: algoritmo en aov para diseño no balanceado
Basicamente, "aov" usa la funcion "lm" para estimar los coeficientes del modelo. Esto lo encontras tambien en el help de R. La diferencia en diseños no balanceados es que la tabla de anova que produce "summary.aov" hay que interpretarla secuencialmente. Entiendo que esto es lo que llaman suma de cuadrados "type I". [En general es constructivo para la documentacion de la lista que las preguntas sean especificas y en lo posible tener algun pequeño ejemplo replicable.] Pablo ----- Original Message ----- From: "Ramon Diaz-Uriarte" <rdiaz02 en gmail.com> To: "Olivier Nuñez" <onunez en iberstat.es> Cc: "r-help-es" <r-help-es en r-project.org> Sent: Wednesday, June 24, 2009 4:42 PM Subject: Re: [R-es]algoritmo en aov para diseño no balanceado Además de las sugerencias anteriores, si quieres por alguna razón usar algo similar a aov, puedes utilizar "Anova", en el paquete "car" de J. Fox. La función "Anova" utiliza por defecto las de tipo II. R. 2009/6/24 Olivier Nuñez <onunez en iberstat.es>:> Supongo que quieres contrastar algún modelo. > Para evitar cualquier problema de interpretación en diseños no > ortogonales, te aconsejo utilizar el comando: > > anova(modelo_ref, modelo_1) > que permite comparar los modelos que te interesan. > > Para más detalles leer > > http://cran.r-project.org/doc/FAQ/R-FAQ.html#Why-does-the-output-from- > anova_0028_0029-depend-on-the-order-of-factors-in-the-model_003f > > Olivier > > -- > ____________________________________ > > Olivier G. Nuñez > Email: onunez en iberstat.es > Tel : +34 663 03 69 09 > Web: http://www.iberstat.es > > ____________________________________ > > > > > El 24/06/2009, a las 15:58, Usuario R escribió: > >> Hola, >> >> ¿Alguien sabe cómo lidia la función aov con diseño no balanceado? >> ¿Utiliza >> el las funciones de suma de cuadrados type II ? >> >> Gracias!! >> >> [[alternative HTML version deleted]] >> >> _______________________________________________ >> R-help-es mailing list >> R-help-es en r-project.org >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > >-- Ramon Diaz-Uriarte Structural Biology and Biocomputing Programme Spanish National Cancer Centre (CNIO) http://ligarto.org/rdiaz Phone: +34-91-732-8000 ext. 3019 _______________________________________________ R-help-es mailing list R-help-es en r-project.org https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
Hola Muchas gracias Pablo. Sobre los ejemplos etc, estamos trabajando ahora mismo en una serie de normas para usar la lista. De hecho esas sugerencias que me haces están incluidas. Supongo que publicaremos las normas antes de hacerlas "oficiales" para que podáis dar todos vuestra opinión sobre las normas. Para eso bueno, quizá hay que definir bien para qué queremos usar esta lista. Es un tema que me gustaría abrir porque yo tengo muchas ideas pero de momento no veo que la participación sea muy alta.... (y eso que ya somos 107) Un saludo! El 24 de junio de 2009 17:12, Pablo Emilio Verde < PabloEmilio.Verde@uni-duesseldorf.de> escribió:> Basicamente, "aov" usa la funcion "lm" para estimar los coeficientes > del modelo. Esto lo encontras tambien en el help de R. > > La diferencia en diseños no balanceados es que la tabla de anova > que produce "summary.aov" hay que interpretarla secuencialmente. > Entiendo que esto es lo que llaman suma de cuadrados "type I". > > [En general es constructivo para la documentacion de la lista > que las preguntas sean especificas y en lo posible tener algun > pequeño ejemplo replicable.] > > Pablo > > > > ----- Original Message ----- > From: "Usuario R" <r.user.spain@gmail.com> > To: "r-help-es" <r-help-es@r-project.org> > Sent: Wednesday, June 24, 2009 3:58 PM > Subject: [R-es] algoritmo en aov para diseño no balanceado > > > Hola, > > ¿Alguien sabe cómo lidia la función aov con diseño no balanceado? ¿Utiliza > el las funciones de suma de cuadrados type II ? > > Gracias!! > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > > > ---------------------------------------------------------------------------- > ---- > > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es@r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > >[[alternative HTML version deleted]]