similar to: Efectos fijos y aleatorios en un modelo lineal

Queridos R-users: Tengo una duda que hace mucho tiempo que estoy intentando resolver, os explico a modo de ejemplo: Tengo estos efectos: Año(5 niveles),Localidad (10 niveles) y genotipo (3 niveles), año y localidad son aleatorios y genotipo es fijo (los he escogido yo). Me gustaría hacer obtener una tabla parecida a la Tabla Anova donde aparezca cada factor y sus interacciones y

Estimados Escribo para consultar sobre el uso de modelos mixtos anidados. Los datos que estoy analizando provienen de censos de malezas en cuatro tipos de paisajes de la región pampeana, en los que seleccioné al azar igual número de lotes agrícolas cultivados con tres cultivos (maíz, soja y trigo-soja). En cada lote censé el número de especies de malezas en tres posiciones: el alambrado, el borde

Hola a todos. Estoy utilizando la función lmer del paquete lme4 para ajustar un modelo mixto. Tengo varias variables en mi data.frame, unas son a nivel individual y otras a nivel de comarcas. Listo algunas. ingre_6 : Ingresos (nivel individual) iscs_a : un indicador sintético resumen de otras variables, calculado mediante componentes principales. sau_com : superficie agraria útil de cada una

Hola a tod en s, tengo una duda que la comunidad R me puede ayudar. Estoy trabajando con gamlss, porque tengo una variable respuesta con valores entre 0 y 1 e incluidos estos. La distribución que utilizo com gamlss para este caso es "beta inflated" (Stasinopulos and Rigby 2007. Journal of Statistical Software 23(7)). El modelo que intento correr es: m1<-gamlss(Teleosteos ~

Alguien tiene experiencia en escribir una pdMat. Para aquellos que no lo recuerden son las matrices de covarianzas de los efectos aleatorios que ajusta la función lme de la librería nlme Estas matrices tiene especial importancia en aplicaciones de genética de poblaciones y en particular en mapeo de asociación. Pinheiro y Bates dicen que el usuario puede crear sus propias pdMat y sugiere como

Estimados Tengo un error que me desconcierta, es un código que simplifiqué de otro trabajo donde no hay problemas, sin embargo me da un error. Una diferencia es que en mi otro trabajo uso spline y ahora polinomio, este es de segundo grado y se encuentra tanto en efectos fijos como aleatorios, el modelo es correcto, corre con MCMCglmm pero no con nlme. grid <- expand.grid(Tiempo=4:6,

Estimado Oliver Nuñez Envío un ejemplo reproducible. Javier Marcuzzi # de donde tomo datos, y tiene el modelo (en el pdf) library(MCMCglmm) # librería con las funciónes que voy a usar library(nlme) datos0<-ChickWeight # creo algunos datos que agrego a los origonales Factor<-as.numeric(datos0$Chick) Factor[Factor > 0 & Factor <= 10] <- 'A' Factor[Factor > 10

Hola, Tengo una base de datos con estructura jerárquica en la que quiero clasificar observaciones en distintas categorías. En el caso más simple, tengo una variable con dos categorías (variable Y1) y dentro de cada una de ellas hay otras dos categorías (variable Y2). Además tengo una variable explicativa cuantitativa discreta X. El banco de datos sería de este tipo: X Y1 Y2 5 0 1 9 0 0 2

Buenos días; Estoy intentando aprender algo de sobre los modelos lineales mixtos. Estoy siguiendo el libro "Multilevlel analysis: techniques and applications" de Joop Hox. Estoy intentado reproducir las tablas y gráficos que trae el libro con el paquete lmer. En este libro se indica que en la comprobación de los supuestos del modelo hay que estudiar los gráficos de residuales tanto

Hola, mi pregunta es la siguiente: Tengo un modelo genético aditivo, donde los individuos estan emparentados. Quiero que la matriz de parentesco sea la matriz de coeficientes de las correlaciones entre genotipos. En SAS, con PROC MIxed podia agregarla como un archivo y usarla en la sentencia random...No encuentro como hacerlo en R, alguna idea?? En resumen, puedo imponerle a los efectos

Hola Estoy tratando de correr un survival analysis usando un Cox regression model. Tengo una duda respecto a la organizacion del script. Tengo una variable que es -tamano del individuo- y quiero ver si hay diferencia en sobrevivencia respecto a tamano. Como diseno de campo los tamanos fueron ubicados de forma aleatoria en bloques al azar. Cuado planteo el script tengo algo como:

Hola, Soy nuevo manejando R y no tengo mucha experiencia. Estoy intentando modelar una función que me relacione el nº de cebas (nº de presas que los padres traen a los pollos) con el tamaño de parche de un bosque (factor categórico; 2 niveles= grande y pequeño). Al ser un conteo (nº de cebas) he pensado utilizar familia= poisson con link= logarítmico. He construido un GLMM con: Nº de cebas

Hola, el otro día envié una consulta a lista de la cual estoy subscripto porque recibo diariamente todos los emails de la comunidad. Este mensaje mío creo que no ha salido de la administración de la lista porque no lo recibí, ¿puede ser que no haya salido o no lo recibo por ser el remitente? Muchas gracias por su respuesta. Tengo que resolver una duda y creo que la comunidad va a darme una

Hola de nuevo R-Users, me he dejado cosas para aclara. Primero de todo tengo cinco repeticiones y 20 missings, así que mi n es de 5×10×3×5-20= 730 datos en total, todos los grupos tienen al menos 3 representantes. Segundo: Las variables estudiadas son Producción neta, Peso de 100 semillas y Proteína. Tercero: Observo los mismos genotipos (G) en varios años (A) en las misma localidades

El 24/01/16 a las 16:29, Fernando Sánchez Lasheras escribió: > Hola José, > > Efectivamente le mensaje me lo enviaste a mí, pero yo al contestar lo mandé > a la lista. > > Los grupos son tratamientos distintos. Es decir, se estudia a una serie de > personas a las que se les aplican tres tratamientos distintos (A, B y C) > durante el mismo tiempo y vemos el número de eventos

Dispongo de un experimento en el que cinco tratamientos ha sido aplicados a cinco grupos de voluntarios. En cada grupo había tres personas y a cada persona se le tomaron 3 medidas, En total dispongo de 45 medidas, pero evidentemente no son independientes entre sí. Si no tomo en cuenta que las medidas de la misma persona son más parecidas entre sí (bloques anidados) estaría incurriendo en

Hola buenas tras meses investigando como hacer anovas para factores con efectos fijos y efectos aleatorios, he encontrado una serie de funciones que satisfacen mis pretensiones y creo correctas en cierta medida. Me gustaría compartirlas con vosotros con doble intención, la primera es compartirla para que si otro se encuentra en esta situación que tenga el trabajo hecho y la segunda es que sean

Estimados herreros, Sabéis si hay algún sitio donde pueda hacer una pregunta sobre estadística, en concreto un diseño experimental. Alguna lista, foros, etc. Ya se que este no es el sitio adecuado para preguntas de estadística, pero por si alguien se pica os la pongo a continuación. Dos tratamientos C y H. Se aplican a una serie de especies (p.e. 10) Se observa la respuesta de las especies a

Buenos dias para todos, Estoy trabajando en una aplicación que involucra análisis de clusters. Básicamente el objetivo es determinar a qué cluster pertenece cada observación de una matriz de datos "mydata" y luego generar muestras aleatorias de los mismos datos para determinar la proporción de veces que cada observación es clasificada en el cluster k. Este tipo de análisis es muy común

Hola a todos, -Estoy estudiando el efecto de dos genotipos (~tratamientos) en la aparición de síndrome metabólico (MetS) con datos longitudinales recogidos a tiempo 0,7,10,15,20 y 25 años. -He hecho un dataframe con las siguientes variables MetS: Síndrome Metabólico (Si=1,No=0) bmi: Indice de masa corporal (IMC) cuando se produce la conversión a MetS+ . Para los que permancen MetS-, esta variable