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2015 Mar 28
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Comparaciones múltiples
Saludos,
tengo una base de datos con tres variables: especie, tratamiento y
abundancia.
Quiero hacer comparaciones múltiples con Tukey.
Ya había usado el comando TukeyHSD(aov(x~y)).
La cuestión esque ahora tengo varios niveles del factor especie y varios
niveles del factor tratamiento.
Si hago TukeyHSD(aov(abundancia~especie:tratamiento)) me salen todas las
comparaciones posibles, pero yo sólo estoy interesa...
2017 Jun 07
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OPINIONES comparacion personal de R en linux y windows
...s-bounces en r-project.org> en nombre de Javier Marcuzzi <javier.ruben.marcuzzi en gmail.com>
Enviado: miércoles, 7 de junio de 2017 11:27:22 a. m.
Para: Javier Valdes Cantallopts (DGA); Carlos Ortega (cof en qualityexcellence.es)
CC: r-help-es en r-project.org
Asunto: Re: [R-es] OPINIONES comparacion personal de R en linux y windows
Estimado Javier Valdes Cantallopts
Hace mucho que no uso R en Linux ni en mac, como experiencia de usuario Windows no es tan cómodo, aunque realice lo mismo, sin embargo es algo muy personal que tiene más que ver con la interfaz gráfica y su funcionamiento, aunque...
2013 May 06
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Comparaciones multiples lmer
Hola,
Lo primero muchas gracias a todos por vuesta habitual ayuda. Llevo meses
con las funciones lmer, pero tengo un problema no se como plantear unas
comparaciones multiples una vez demostrado que el factor tiene diferencias
significativas.
Tengo multiples opciones,
Solución A: una es hacer un bonferroni a saco (pero eso me chirria ya que
tego muchos datos)
Solución B: Otra es utilizar glht, pero esa opción no me convence del todo.
Solución C: Otra es in...
2012 May 06
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comparaciones planeadas
Hola a todos,
hace poquito una persona escribía con una duda que se parece, o es, la misma que yo vengo teniendo. Se trata de hacer comparaciones planeadas.
Supongamos un experimento en el que participan 4 grupos de niños 8por ejemplo de distintos coles). Estos niños leen palabras largas y cortas, frecuentes e infrecuentes. Por lo tanto el diseño es fácil, un intergrupo "niños" y dos intragrupo "frecuencia" y "long...
2010 Sep 05
4
bonferroni en R
Hola a todos/as
estoy analizando un diseño factorial con una variable intrasujeto y una inter-sujeto. Ambas resultan significativas en el anova y quiero hacer un análisis por pares, pero aún no sé como puedo hacerlo en R. Me interesan ambos Bonferroni y Tukey. ¿Alguien podría indicarme?
Gracias
[[alternative HTML version deleted]]
2011 May 24
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test de Friedman , con comparación planificada simple (la primera contra el resto...).
Hola.
Hay alguna función que haga un Friedman test (digamos 4 tratamientos o
tiempos relacionados/dependientes) y que después haga una comparación
de un tratamiento contra el resto, digamos el primero, como un
contratase simple, o un Dunnett?
o simplemente ¿como hago un Dunnett para unos tratamientos relacionados?
--
Antonio M
[[alternative HTML version deleted]]
2017 Jun 07
4
OPINIONES comparacion personal de R en linux y windows
Hola estimados.
Les quería plantear un tema que tiene que ver con las plataformas en donde hacemos correr nuestro R.
En mi caso, tengo instalado R en mi oficina(Windows) y en mi casa(Linux) y la verdad, después de probar algunas funciones gráficas, claramente R sobre Linux me entrega resultados más satisfactorios, no solo por la rapidez, sino porque también, Linux al parecer, interpreta mejor las
2016 Sep 13
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t-test y distribución de variables
Hola,
Estoy analizando unos datos para una tesis doctoral.
Durante la investigación se han recogido distintas variables clínicas de
dos grupos (n=30 y n=40). Me encuentro que las comparaciones de medias
se han realizado mediante t-tests sin preocuparse de estudiar la
distribución de las variables. Al revisar si las variables se ajustan a
la distribución normal, aunque los QQplots no tienen "mala pinta" las
distribuciones de las variables se alejan de la normalidad
(Shap...
2011 Jun 21
2
Consulta glm
Estimados:
Les pido disculpas por la molestia, quisiera preguntarles si luego de haber utilizado la funcion glm para ajustar datos (en mi caso family = poisson) es posible realizar además del ANOVA comparaciones de a pares.
Desde ya muchas gracias!
Cordialmente,
Lic. Anahí Domínguez
Universidad Nacional de Río Cuarto.
Argentina
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Este mensaje ha sido enviado usando el servicio de Webmail de
la Universidad Nacional de Rio Cuarto.
Basado e...
2013 Feb 13
0
Resumen de R-help-es, Vol 48, Envío 13
...por favor, incluya en
> la respuesta sólo aquellas partes del mensaje a las que está
> respondiendo.
>
>
> Asuntos del día:
>
> 1. Re: Alguien ha usado R para calcular curvas de rarefacción de
> especies en análisis de diversidad? (Fernando Canovas Garcia)
> 2. off topic ¿comparaciones múltiples? (jaume)
> 3. Re: off topic ¿comparaciones múltiples? (Carlos Ortega)
> 4. Re: off topic ¿comparaciones múltiples? (Jorge I Velez)
>
>
> ----------------------------------------------------------------------
>
> Message: 1
> Date: Tue, 12 Feb 2013 19:27:13 +0100...
2010 Sep 06
0
Resumen de R-help-es, Vol 19, Envío 5
..."Olivier Nuñez" <onunez@iberstat.es>
> To: r-help-es CRAN <r-help-es@r-project.org>
> Date: Sun, 5 Sep 2010 19:33:42 +0200
> Subject: Re: [R-es] bonferroni en R
> Gracias José!
> No conocía la terminología de "análisis por pares", sino la de
> "comparaciones multiples dos a dos".
> ¡Pero en realidad da el contexto, hubiera podido intuirlo!
> Un saludo. Olivier
>
> -- ____________________________________
>
> Olivier G. Nuñez
> Email: onunez@iberstat.es
> Tel : +34 663 03 69 09
> Web: http://www.iberstat.es
>
> ___...
2013 Feb 13
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off topic ¿comparaciones múltiples?
Estimados herreros,
Sabéis si hay algún sitio donde pueda hacer una pregunta sobre
estadística, en concreto un diseño experimental. Alguna lista, foros, etc.
Ya se que este no es el sitio adecuado para preguntas de estadística,
pero por si alguien se pica os la pongo a continuación.
Dos tratamientos C y H.
Se aplican a una serie de especies (p.e. 10)
Se observa la respuesta de las especies a
2014 Jan 02
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Ayuda con red neuronal y creación de curvas ROC
...er mi mensaje:
Llevo utilizando unos meses R, vengo de SPSS, y estoy muy sorprendido con su capacidad.
Mi problema, es que estoy intentando hacer una comparación entre tres sistemas de predicción: una regresión logística, un árbol de clasificación y una red neuronal. De momento, he podido hacer las comparaciones con los dos primeros sistemas, pero mi problema es la red.
He utilizado el paquete neuralnet y logro crear la red, pero ahora no sé cómo hacer que calcule los valores esperados y luego hacer la curva roc. Ahora estoy utilizando todos los datos, no he dividido la muestra en entrenamiento y prueba...
2013 Jan 23
0
Mixed effects para factores y no para covariables. Guia y dudas
...ompartirlas con vosotros con doble intención, la primera es
compartirla para que si otro se encuentra en esta situación que tenga el
trabajo hecho y la segunda es que sean criticadas por los que más saben.
Pues hasta hace poco yo era alumno, pero ahora he de ser autodidacta.
Mis dudas están en las comparaciones multiples con interacción y en maneras
mejores de hacer el tamaño del efecto.
Muchas gracias por adelantado y un saludo.
#---------------------------------------------------------------------------------------------------------
# Cargo paquetes
rm(list=ls())
require(lme4)
require(multco...
2012 Feb 02
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Error con package agricolae
...= 2 niveles={2,5}
B= 4 niveles={F1,F2,F3,F4}
C= 2 niveles={S,N}
FV GL
A 1
B 3
C 1
AB 3
AC 1
BC 3
ABC 2
Error 6213
Total 6228
Hasta ahora todo marcha bien, pero cuando intento hacer las comparaciones multiples con LSD obtengo un error. Lo declare de la siguiente forma:
Anavar<-aov(Resp~A*B*C,data=Resultado)
Comparacion1 <- LSD.test(ANAVAR,"A*B*C",DFerror=6213,MSerror=0.01619,p.adj="bonferroni",group=T)
Comentaros tambien que declare p.adj="bo...
2016 Aug 11
3
Comparación de probabilidades de supervivencia en R
...(en este caso anual) entre grupos sin utilizar un
chi-cuadrado y un valor de P. Entiendo que lo que hace survdiff es comparar
las curvas de supervivencia, pero yo quiero comparar la probabilidad de
supervivencia entre grupos al final del estudio.
Con survdiff (log-rank test) *ya* estas haciendo la comparacion de supervivencias entre los grupos, y el resultado es que no hay diferencias significativas.
Esto se ve tambien en el solapamiento entre los intervalos de confianza para los diferentes grupos. Cuando dices que quieres comparar la probabilidad de supervivencia estas diciendo lo mismo que si quieres...
2011 Mar 29
7
Error en cor, too many elements specified
Hola, tengo una serie de datos datExpr, al usar cor() :
cor(datExpr ,method = "pearson", use ="pairwise.complete.obs")
me da el siguiente error
allocMatrix: too many elements specified
Trate con "complete.obs", "na.or.complete", y el resto de las opciones para "use", pero siempre me da algun error.
¿Alguna idea de como puedo hacer que cor() lea
2019 Feb 07
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Optimización identificación de casos similares
Buen día a todos,
Agradezco su ayuda con lo siguiente:
Tengo 100.000 registros con nombres de personas con su respectivo número de
documento, quiero identificar casos que tengan un porcentaje de igualdad
alto, no del 100% porque ya esos los tengo identificados, sino casos como
por ejemplo:
Nombre: Juan Pérez Documento: 123456789
Nombre: Juan Pérez Documento: 1234056789
Este caso sería una
2011 Sep 15
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Creando scrips en R
...SP1 <- sample(Mapa.vn, 50) ### Extraigo una muestra de 50 datos.
El asunto ahí no termina, después de realizar esas operaciones necesito calcular las "medidas de separabilidad" mediante el paquete(o script) separability.measures de Nikos Alexandris. La operación consiste en realizar comparaciones de pares para ese conjunto de 18 muestras (SPn). La #operación base es la siguiente:
#operación base
separability.measures (SP1,SP2) -> SP1ySP2
separability.measures (SP1,SP3) -> SP1ySP3
?
separability.measures (SP2,SP3) -> SP2ySP3
separability.measures (SP2,SP3) -> SP2ySP4
?
separa...
2012 Feb 04
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Comparaciones múltiples en ANOVA anidadp
...his fit does not inherit from "lm"
Para no alargarme en mis indagaciones. Para los análisis de la varianza
podría haber utilizado las funciones lme del paquete nlme o lmer del
paquete lme4, pero tampoco proporcionan objetos válidos para glht o
TukeyHSD.
¿Alguien sabe como abordar las comparaciones múltiples con medidas
repetidas o anova anidado?
Gracias de antemano.
--
_____---^---_____
Univ. de Extremadura
Dept. Matemáticas.
Despacho B29
Tf: + 34 924 289 300
Ext. 86823