Dear All
I want to chose just spacial columns in R. (read table)
data1<- read.table("/home/Documents/data.txt",header=F,sep =
"\t", as.is =F)
data.2<-data1[sub.data[,1],]
The dimension of data.2 is correct but my data are transformed NA
head(data.2)
V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18
V19 V20 V21 V22 V23 V24
NA <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
NA NA NA NA NA NA
NA.1 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
NA NA NA NA NA NA
NA.2 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
NA NA NA NA NA NA
NA.3 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
NA NA NA NA NA NA
NA.4 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
NA NA NA NA NA NA
NA.5 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
NA NA NA NA NA NA
when I used as.is =T
Error in read.table("/home/Documents/data.txt", :
invalid numeric 'as.is' expression
I will appreciate if you help me.
Soheila
[[alternative HTML version deleted]]
GHard to tell given the file is not available nor do we see the first lines of it. Uwe Ligges On 13.02.2012 10:51, Soheila Khodakarim wrote:> Dear All > I want to chose just spacial columns in R. (read table) > > data1<- read.table("/home/Documents/data.txt",header=F,sep = "\t", as.is =F) > data.2<-data1[sub.data[,1],] > > > The dimension of data.2 is correct but my data are transformed NA > > head(data.2) > > V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 > V19 V20 V21 V22 V23 V24 > NA<NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.1<NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.2<NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.3<NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.4<NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.5<NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > > > > when I used as.is =T > > Error in read.table("/home/Documents/data.txt", : > invalid numeric 'as.is' expression > > > I will appreciate if you help me. > > Soheila > > [[alternative HTML version deleted]] > > ______________________________________________ > R-help at r-project.org mailing list > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
On Feb 13, 2012, at 4:51 AM, Soheila Khodakarim wrote:> Dear All > I want to chose just spacial columns in R. (read table) > > data1<- read.table("/home/Documents/data.txt",header=F,sep = "\t", > as.is =F) > data.2<-data1[sub.data[,1],]What is "sub.data"? are you migrating to R from a language where "sub." would be some kind of operation on data? -- David.> > > The dimension of data.2 is correct but my data are transformed NA > > head(data.2) > > V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 > V19 V20 V21 V22 V23 V24 > NA <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.1 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.2 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.3 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.4 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > NA.5 <NA> NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA > NA NA NA NA NA NA > > > > when I used as.is =T > > Error in read.table("/home/Documents/data.txt", : > invalid numeric 'as.is' expression > > > I will appreciate if you help me. > > Soheila > > [[alternative HTML version deleted]] > > ______________________________________________ > R-help at r-project.org mailing list > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.David Winsemius, MD West Hartford, CT