R help - Oct 2010 - Tukey HSD Test als Post Hoc Test nach einem GLM inkl. Anova

Hallo,
   zur Analyse von Daten zum Artenreichtum von Pflanzen, habe ich ein Glm (glm)
   und anschlie?end eine Anova (anova) durchgef??hrt. Nun m??chte ich f??r die
   signifikanten Einflussfaktoren einen Post Hoc Tukey Test durchf??hren, um zu
   ermitteln  in  wie  weit  die  einzelnen Faktorstufen sich signifikant
   voneinander unterscheiden.
   Mit dem Befehl (TukeyHSD) komme ich nicht weiter, weil derscheinbar mit den
   Ergebnissen  der  Anova  nihct zurecht kommt. Er basiert wohl auf aov-
   Datentypen. F??hre ich die Anova dann mit dem Befehl aov durch und dann den
   Tukey Test, bekomme ich als Antwort, dass keine Faktoren im gefitteten Model
   vorhanden sind.
   Gibt es eine M??glichkeit den Tukey Test an ein GLM anzuschlie?en, wenn ja,
   wie?
   Vielen Dank
   Lena


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Please, the language of the mailing list is English. A majority of
readers do not understand what you are talking about.

The Tukey test was designed for comparing means in equal replication
ANOVA. Some "folklore" suggests that it may work reasonably for
not-too-unequal replication cases, but I wouldn't trust it in the
general case, and in particular not for arbitrary glm() models.

Look ?nto the multcomp package instead.

-pd

On 10/05/2010 07:48 AM, Lena Neuenkamp wrote:
> 
>     Hallo,
>    zur Analyse von Daten zum Artenreichtum von Pflanzen, habe ich ein Glm
(glm)
>    und anschlie?end eine Anova (anova) durchgef??hrt. Nun m??chte ich f??r
die
>    signifikanten Einflussfaktoren einen Post Hoc Tukey Test durchf??hren,
um zu
>    ermitteln  in  wie  weit  die  einzelnen Faktorstufen sich signifikant
>    voneinander unterscheiden.
>    Mit dem Befehl (TukeyHSD) komme ich nicht weiter, weil derscheinbar mit
den
>    Ergebnissen  der  Anova  nihct zurecht kommt. Er basiert wohl auf aov-
>    Datentypen. F??hre ich die Anova dann mit dem Befehl aov durch und dann
den
>    Tukey Test, bekomme ich als Antwort, dass keine Faktoren im gefitteten
Model
>    vorhanden sind.
>    Gibt es eine M??glichkeit den Tukey Test an ein GLM anzuschlie?en, wenn
ja,
>    wie?
>    Vielen Dank
>    Lena
> 
> 
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