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523 0 0 0 0 0 0 0 0 17 0 0 0 524 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 525 0 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 526 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 527 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 528 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 529 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 530 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 531 0 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 532 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 533 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 534 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 535 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 536 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 537 0 0 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0 538 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 539 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 540 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 541 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 542 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 543 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 544 0 0 0 0 0 0 0 0 17 0 0 0 545 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 546 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 547 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 548 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 549 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 550 0 0 0 0 0 0 0 0 17 0 0 0 551 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 552 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 553 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 554 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 555 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 556 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 557 0 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 558 0 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 559 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 560 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 561 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 562 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 563 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 564 0 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 565 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 566 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 567 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 568 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 569 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 570 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 571 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8 572 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 573 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 574 0 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 575 0 0 0 0 0 0 0 0 18 0 0 0 576 0 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 577 0 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 578 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 579 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 580 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 581 0 0 0 0 0 0 0 0 21 0 0 0 582 0 0 0 0 0 0 0 0 24 0 0 0 583 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 584 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 585 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 586 0 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 587 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 588 0 0 0 0 0 0 0 0 18 0 0 0 589 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 590 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 591 0 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 592 0 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 593 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 594 0 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 595 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 596 0 0 0 0 0 0 0 0 18 0 0 0 597 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 598 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 599 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 600 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0> dim(tmp)[1] 576 12 Why the dim(tmp) gave me different results? THe line numbers are not right? Thanks! -- Sincerely, Changbin -- [[alternative HTML version deleted]]
Hi Changbin, it's not line numbers. It's row names, and you deleted some of them. If you checked, you'd have seen that eg 107-109 are missing. So you have 576 lines left from a matrix that had 600 when it was formed. Cheers Joris On Wed, Jun 2, 2010 at 11:47 PM, Changbin Du <changbind@gmail.com> wrote:> > dim(tmp) > [1] 576 12 > > tmp > > 1 10 11 12 13 2 3 4 5 6 7 9 > 1 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 > 2 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 > 3 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 > 4 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 > 5 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 > 6 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 > 7 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 8 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 > 9 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 > 10 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 11 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 > 12 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 > 13 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 > 14 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 15 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 16 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 > 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 > 18 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 > 19 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 > 20 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 0 > 21 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 > 22 0 0 0 0 0 0 0 17 0 0 0 0 > 23 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 > 24 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 25 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 > 26 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 0 > 27 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 > 28 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 > 29 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 > 30 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 > 31 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 > 32 0 0 0 0 0 0 0 14 0 0 0 0 > 33 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 > 34 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 > 35 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 > 36 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 > 37 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 > 38 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 0 > 39 0 0 0 0 0 0 0 10 0 0 0 0 > 40 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 0 > 41 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 > 42 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 > 43 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 44 0 0 0 0 0 0 0 14 0 0 0 0 > 45 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 > 46 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 > 47 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 > 48 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 > 49 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 > 50 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 > 51 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 > 52 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 > 53 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 > 54 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 > 55 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 > 56 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 > 57 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 > 58 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 > 59 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 > 60 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 > 61 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 > 62 0 0 0 0 0 0 0 9 0 0 0 0 > 63 0 0 0 0 0 0 0 13 0 0 0 0 > 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THe line numbers are not right? > > Thanks! > > > -- > Sincerely, > Changbin > -- > > [[alternative HTML version deleted]] > > ______________________________________________ > R-help@r-project.org mailing list > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > PLEASE do read the posting guide > http://www.R-project.org/posting-guide.html > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. >-- Joris Meys Statistical Consultant Ghent University Faculty of Bioscience Engineering Department of Applied mathematics, biometrics and process control Coupure Links 653 B-9000 Gent tel : +32 9 264 59 87 Joris.Meys@Ugent.be ------------------------------- Disclaimer : http://helpdesk.ugent.be/e-maildisclaimer.php [[alternative HTML version deleted]]
Changbin - If you take the time to look at your data frame, you'll see the following 24 numbers are missing from the rownames. 78 84 107 108 109 158 164 194 197 203 240 241 243 255 256 264 275 277 282 284 300 305 311 312 (I found this using (1:600)[!(1:600) %in% rownames(tmp)] ) - Phil Spector Statistical Computing Facility Department of Statistics UC Berkeley spector at stat.berkeley.edu On Wed, 2 Jun 2010, Changbin Du wrote:>> dim(tmp) > [1] 576 12 >> tmp > > 1 10 11 12 13 2 3 4 5 6 7 9 > 1 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 > 2 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 > 3 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 > 4 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 > 5 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 > 6 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 > 7 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 8 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 > 9 0 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 > 10 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 11 0 0 0 0 0 0 0 8 0 0 0 0 > 12 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 > 13 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 > 14 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 15 0 0 0 0 0 0 0 5 0 0 0 0 > 16 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 > 17 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9 0 > 18 0 0 0 0 0 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THe line numbers are not right? > > Thanks! > > > -- > Sincerely, > Changbin > -- > > [[alternative HTML version deleted]] > > ______________________________________________ > R-help at r-project.org mailing list > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. >
row names are not the same as line numbers or indices. you've likely done some row-based selection on an original matrix or data frame. observe from the example below. (and in the future please don't expect people to sort through your 500+ line matrices by hand to find your problems.)> x <- matrix(1:12, byrow = TRUE, ncol = 3) > rownames(x) <- 1:4 > x[,1] [,2] [,3] 1 1 2 3 2 4 5 6 3 7 8 9 4 10 11 12> y <- x[x[,2] != 5,] > y[,1] [,2] [,3] 1 1 2 3 3 7 8 9 4 10 11 12> dim(x)[1] 4 3> dim(y)[1] 3 3 -murat On Jun 2, 5:47?pm, Changbin Du <changb... at gmail.com> wrote:> > dim(tmp) > [1] 576 ?12 > > tmp > > ? ? ? ?1 10 11 12 13 ?2 ?3 ?4 ?5 ?6 ?7 ?9 > ? 1 ? ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 12 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 2 ? ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 15 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 3 ? ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 11 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 4 ? ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 11 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 5 ? ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 12 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 6 ? ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?6 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 7 ? ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?5 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 8 ? ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 11 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 9 ? ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 11 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 10 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?5 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 11 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?8 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 12 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 12 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 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36 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?8 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 37 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 12 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 38 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 10 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 39 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 10 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 40 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 14 ?0 > ? 41 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?9 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 42 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?7 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 43 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?5 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 44 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 14 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 45 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?6 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 46 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?3 ?0 > ? 47 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?8 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 48 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?9 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 49 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?8 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 50 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?7 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 51 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 13 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 52 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 13 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 53 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?7 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 54 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?8 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 55 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?7 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 56 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?4 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 57 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?8 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 58 ? 0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 13 ?0 ?0 ?0 ?0 > ? 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566 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?5 ?0 ?0 ?0 > ? 567 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?8 ?0 ?0 ?0 > ? 568 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?9 ?0 ?0 ?0 > ? 569 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?7 ?0 ?0 ?0 > ? 570 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?7 > ? 571 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?8 > ? 572 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?5 ?0 ?0 ?0 > ? 573 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?5 ?0 ?0 ?0 > ? 574 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 13 ?0 ?0 ?0 > ? 575 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 18 ?0 ?0 ?0 > ? 576 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?8 ?0 ?0 ?0 > ? 577 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 11 ?0 ?0 ?0 > ? 578 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?5 ?0 ?0 ?0 > ? 579 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?9 ?0 ?0 ?0 > ? 580 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?7 ?0 ?0 ?0 > ? 581 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 21 ?0 ?0 ?0 > ? 582 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 24 ?0 ?0 ?0 > ? 583 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?6 ?0 ?0 ?0 > ? 584 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?9 ?0 ?0 ?0 > ? 585 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?9 ?0 ?0 ?0 > ? 586 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 13 ?0 ?0 ?0 > ? 587 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?6 ?0 ?0 ?0 > ? 588 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 18 ?0 ?0 ?0 > ? 589 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?9 ?0 ?0 ?0 > ? 590 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 12 ?0 ?0 ?0 > ? 591 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 11 ?0 ?0 ?0 > ? 592 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?5 ?0 ?0 ?0 > ? 593 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 12 ?0 ?0 ?0 > ? 594 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 10 ?0 ?0 ?0 > ? 595 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 12 ?0 ?0 ?0 > ? 596 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 18 ?0 ?0 ?0 > ? 597 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 14 > ? 598 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?6 ?0 ?0 ?0 > ? 599 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?6 > ? 600 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?0 ?6 ?0 ?0 ?0> dim(tmp) > > [1] 576 ?12 > > Why the dim(tmp) gave me different results? THe line numbers are not right? > > Thanks! > > -- > Sincerely, > Changbin > -- > > ? ? ? ? [[alternative HTML version deleted]] > > ______________________________________________ > R-h... at r-project.org mailing listhttps://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > PLEASE do read the posting guidehttp://www.R-project.org/posting-guide.html > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
This is a guess since you didn't say where it comes from. It looks like a data.frame where some rows were deleted. Also, note that the column names in your example are sorted alphabetically instead of numerically. This example shows one way to get that behavior. Rich> tmp <- data.frame(matrix(1:24, 6, 4, dimnames=list(1:6, c(1,2,11,12)))) > tmpX1 X2 X11 X12 1 1 7 13 19 2 2 8 14 20 3 3 9 15 21 4 4 10 16 22 5 5 11 17 23 6 6 12 18 24> dimnames(tmp)[[2]] <- sort(dimnames(tmp)[[2]]) > tmpX1 X11 X12 X2 1 1 7 13 19 2 2 8 14 20 3 3 9 15 21 4 4 10 16 22 5 5 11 17 23 6 6 12 18 24> tmp[c(2,5,3),]X1 X11 X12 X2 2 2 8 14 20 5 5 11 17 23 3 3 9 15 21>On Wed, Jun 2, 2010 at 5:47 PM, Changbin Du <changbind@gmail.com> wrote:> > dim(tmp) > [1] 576 12 > > tmp > > 1 10 11 12 13 2 3 4 5 6 7 9 > 1 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 0 0 > 2 0 0 0 0 0 0 0 15 0 0 0 0 >[[alternative HTML version deleted]]