R help - Sep 2003 - installation : make fails (R-1.7.1 on RedHat 8.0)

Hi,

I'm trying to compile R-1.7.1 from source (on a RedHat 8.0) instead of 
using the binary version, as it has often been advised.
However I don't manage to find a solution to the following error which 
occurs during the make procedure :

/!\-------------------------------------------/!\

building package 'ctest'
mkdir -p -- ../../../library/ctest/R
mkdir -p -- ../../../library/ctest/man
make[4]: Entre dans le r?pertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
making ansari.d from ansari.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entr?e d'?dition de liens n'est
pas
utilis? parce l'?dition de lien n'a pas ?t? faite
making chisqsim.d from chisqsim.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entr?e d'?dition de liens n'est
pas
utilis? parce l'?dition de lien n'a pas ?t? faite
making d2x2xk.d from d2x2xk.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entr?e d'?dition de liens n'est
pas
utilis? parce l'?dition de lien n'a pas ?t? faite
making fexact.d from fexact.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entr?e d'?dition de liens n'est
pas
utilis? parce l'?dition de lien n'a pas ?t? faite
making kendall.d from kendall.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entr?e d'?dition de liens n'est
pas
utilis? parce l'?dition de lien n'a pas ?t? faite
making ks.d from ks.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entr?e d'?dition de liens n'est
pas
utilis? parce l'?dition de lien n'a pas ?t? faite
making prho.d from prho.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entr?e d'?dition de liens n'est
pas
utilis? parce l'?dition de lien n'a pas ?t? faite
making swilk.d from swilk.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entr?e d'?dition de liens n'est
pas
utilis? parce l'?dition de lien n'a pas ?t? faite
making init.d from init.c
gcc: /usr/include/mysql: fichier d'entr?e d'?dition de liens n'est
pas
utilis? parce l'?dition de lien n'a pas ?t? faite
make[5]: Entre dans le r?pertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
make[5]: `Makedeps' est ? jour.
make[5]: Quitte le r?pertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
make[5]: Entre dans le r?pertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
gcc -I../../../../include /usr/include/mysql  -D__NO_MATH_INLINES 
-mieee-fp  -fPIC  -g -O2 -c ansari.c -o ansari.o
gcc: ne peut sp?cifier -o avec -c ou -S et de multiples compilations
make[5]: *** [ansari.o] Erreur 1
make[5]: Quitte le r?pertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
make[4]: *** [all] Erreur 2
make[4]: Quitte le r?pertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest/src'
make[3]: *** [all] Erreur 1
make[3]: Quitte le r?pertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library/ctest'
make[2]: *** [R] Erreur 1
make[2]: Quitte le r?pertoire `/usr/local/R-1.7.1/src/library'
make[1]: *** [R] Erreur 1
make[1]: Quitte le r?pertoire `/usr/local/R-1.7.1/src'
make: *** [R] Erreur 1

--------------------------

The problem seems to be related to package ctest (see also problem to 
make ansari.d from ansari.c). There also seems to be trouble with mysql, 
as if links should have been created (or are there paths to specify at 
that step ?).

Any help on this would be greatly appreciated.

Regards,
Laurent

Laurent Faisnel <laurent.faisnel at ariase.com> writes:
> Hi,
> 
> I'm trying to compile R-1.7.1 from source (on a RedHat 8.0) instead of
> using the binary version, as it has often been advised.
> However I don't manage to find a solution to the following error which
> occurs during the make procedure :
> gcc -I../../../../include /usr/include/mysql  -D__NO_MATH_INLINES
                            ******************
> -mieee-fp  -fPIC  -g -O2 -c ansari.c -o ansari.o

The stars indicate the problem. This wants to -I/usr/include/mysql if
anything, otherwise gcc will believe that there are two files to
compile and complain about the -o. I suspect that you entered the
wrong thing during configuration.

-- 
   O__  ---- Peter Dalgaard             Blegdamsvej 3  
  c/ /'_ --- Dept. of Biostatistics     2200 Cph. N   
 (*) \(*) -- University of Copenhagen   Denmark      Ph: (+45) 35327918
~~~~~~~~~~ - (p.dalgaard at biostat.ku.dk)             FAX: (+45) 35327907