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Hola a todos/as estoy analizando un diseño factorial con una variable intrasujeto y una inter-sujeto. Ambas resultan significativas en el anova y quiero hacer un análisis por pares, pero aún no sé como puedo hacerlo en R. Me interesan ambos Bonferroni y Tukey. ¿Alguien podría indicarme? Gracias [[alternative HTML version deleted]]

Quiero comparar varias dosis letales 50% (LD50) usando análisis probit. He seguido un ejemplo que viene en paquete DRC, pero no obtengo el resultado esperado. Lo que quiero es saber si las LD50s, son diferentes y si la diferencias son estadísticamente significativas. Gracias de antemano. José Arturo e-mail. jafarfan@uady.mx <grejon@uady.mx> e-mail alterno. jafarfan@gmail.com <julian.garcia.rejon@gmail.com> [[alternative HTML version deleted]]

...Dosis Letal Media (DL50) por medio de regresión logística, de dos compuestos similares (denominados 1 y 2) aplicados a grupos de individuos similares, evaluando el número de individuos vivos y muertos al final del ensayo. Mi duda es qué forma me recomiendan para determinar si la diferencia es significativa entre las DL50's estimadas para cada compuesto. De antemano muchas gracias por su ayuda. ---------------------------------------------------------------------- Código: datos.1 = data.frame( dosis.1 = c(1,10,10,10,50,50,50,100,100,100,1000,1000,1000), vivos.1 = c(20,20,20,20,19...

...el tratamiento. p.e. Para la especie 1 comparamos los 20 valores de C con los 20 valores de H y vemos si hay un efecto significativo de el tratamiento. Esto se hace con cada especie. La pregunta es la siguiente: Si hubiéramos comparado especie a especie con un test post-hoc para ver diferencias significativas ENTRE las especies habríamos aplicado una corrección p.e. Bonferroni para la significación. Ahora, nos encontramos que hacemos 10 tests, uno por especie ¿Habría que corregir el valor critico de la significación de alguna forma? En mi opinión no, son tests independientes, uno para cada especie...

...uot;Miguel Lázaro" <lazarolv@yahoo.es> > To: r-help-es@r-project.org > Date: Sun, 5 Sep 2010 15:01:17 +0000 (GMT) > Subject: [R-es] bonferroni en R > Hola a todos/as > estoy analizando un diseño factorial con una variable intrasujeto y una > inter-sujeto. Ambas resultan significativas en el anova y quiero hacer un > análisis por pares, pero aún no sé como puedo hacerlo en R. Me interesan > ambos Bonferroni y Tukey. ¿Alguien podría indicarme? > Gracias > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > Hola Miguel: >...

...que lo que hace survdiff es comparar las curvas de supervivencia, pero yo quiero comparar la probabilidad de supervivencia entre grupos al final del estudio. Con survdiff (log-rank test) *ya* estas haciendo la comparacion de supervivencias entre los grupos, y el resultado es que no hay diferencias significativas. Esto se ve tambien en el solapamiento entre los intervalos de confianza para los diferentes grupos. Cuando dices que quieres comparar la probabilidad de supervivencia estas diciendo lo mismo que si quieres comparar las curvas de supervivencia. Estas curvas son una representacion de la probabilida...

Hola a todos, Ajusté un modelo lineal mixto en el cual tengo una interacción significativa entre dos facotres, cada uno con 3 niveles (osea un diseño 3x3). Esta es la tabla de medias             P1                P 2             P3 M1      220.66       311.85        260.80 M2      348.57        89.33         191.71 M3      103.57      381.37         511.62 Con el fin de interpretar c...

...ta.frame(REPETICIONES = Repeticiones, TIEMPO = factor(Tiempo), CONCENTRACION_CELULAR = Concentracion_celular) Se trata de cultivos bacterianos, realizado con tres repeticiones, a los que se les monitoreó la concentración celular en el tiempo (en horas). Para determinar si existe diferencia significativa en la concentración celular en los diferentes tiempos necesito aplicar un anova de medidas repetidas, lo que estoy haciendo con la siguiente instrucción (tomado de http://blog.gribblelab.org/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/): # Modelo medidas repetidas: library(nlme) modelo.medidas...

Hola, tenemos como equivalencia no paramétrica al Anova de 1 vía el test Kruskal Wallis, pero ¿existe un test no paramétrico equivalente al Anova de 2 vías? Gracias. Saludos. -- Sec. Apoyo Estadístico. Servicio de Apoyo a la Investigación (SAI) Vicerrectorado de Investigación e Internacionalización. Universidad de Murcia Edif. SACE. Campus de Espinardo. 30100 Murcia @. mariaelvira.ferre en

Hola a tod en s, queremos hacer una comparación entre dos lugares muy alejados entre sí en relación a la temperatura de cada sitio usando medias horarias de un período determinado. Sólo hay medidas de un sensor en cada sitio y queremos saber si las diferencias son significativas o no entre sitios/curvas. Hemos usado un test de Mann?Whitney U con la función wilcox.test (paired=F) ya que los valores no son normales (n = 24; 24h en base a medias minutales). ¿Creéis que es correcto o estaríamos incumpliendo alguna asunción del test al ser datos temporales y/o no tener réplica...

...la especie 1 comparamos los 20 valores de C con los 20 valores > de H y vemos si hay un efecto significativo de el tratamiento. Esto se > hace con cada especie. > > La pregunta es la siguiente: > Si hubiéramos comparado especie a especie con un test post-hoc para ver > diferencias significativas ENTRE las especies habríamos aplicado una > corrección p.e. Bonferroni para la significación. Ahora, nos encontramos > que hacemos 10 tests, uno por especie ¿Habría que corregir el valor > critico de la significación de alguna forma? En mi opinión no, son tests > independientes, uno pa...

...e mejor se ajuste a mis datos, por lo que no me sirven métodos para comparar distintos modelos, como podrían ser AIC() o tal vez un ANOVA (aunque no sé si aplica para modelos No Lineales). En un trabajo que encontré sobre mi mismo tema el autor dice textualmente que obtuvo "Regresiones muy significativas (P&lt;0.001) con R2 de 0,54–0,61" al aplicar el modelo de la forma que puse más arriba. Aunque no dice cómo obtuvo el R² y el P-valor. Lo único que pude econtrar es que teniendo en cuenta que: SS_total = SS_regresion+SS_residual y que R² = SS_regresion/SS_total = 1-SS_res...

...quisiera conocer algunos tips o recomendaciones basados en su > experiencia. > > ¿Cuál sería la mejor estrategia para enseñarles como trabaja R? > > > > Cuando he sido estudiante siento que las clases en las que el profe nos > > daba el script sólo para correr fueron poco significativas. Me parece > mejor > > opción que los estudiantes vayan escribiendo para que se enfrenten a los > > errores comunes que uno tiene cuando empieza, por ejemplo, de simple > > sintaxis. > > > > Algo que me ayudó mucho cuando empecé, fue el hecho de escribir en texto &...

Hola a tod en s, estoy trabajando con modelos de regresión mixta con el paquete "nlme", concretamente con la función "lme". Una vez que hago mi modelo y el summary del mismo obtengo por ejemplo la significación (valor p) de la variable independiente, así como el valor del AIC para comparar mi modelo con otro similar, pero no sé cómo obtener un valor del grado de ajuste de la

...uiente modelo: R = 103.92 -2.16 Bloque -2.24 V1 -0.99 V2 + 8.75 V1 V2 -37.07 V1² -37.07 V2² donde la R² = 0.9660, la desviación absoluta promedio (AAD) = 17.33 %, y la prueba de falta de ajuste (LOF) da una p = 1.45e-09. Viendo que la AAD es algo alta y que la falta de ajuste es significativa, decidí probar con una red neural artificial, usando los paquetes "caret" y "nnet". He probado las siguientes opciones: NN.1 <- train(R ~ V1 + V2, data = DATOS.Codificados, method = "nnet", maxit = 10000, tuneGrid = SIZE.DECAY, trace = F, linout = TRUE) dond...

...dia (DL50) por medio de regresión logística, de dos compuestos > similares (denominados 1 y 2) aplicados a grupos de individuos similares, > evaluando el número de individuos vivos y muertos al final del ensayo. Mi > duda es qué forma me recomiendan para determinar si la diferencia es > significativa entre las DL50's estimadas para cada compuesto. > > De antemano muchas gracias por su ayuda. > > ------------------------------**------------------------------**---------- > Código: > > datos.1 = data.frame( > dosis.1 = c(1,10,10,10,50,50,50,100,100,**100,1000,10...

Me parece que R funciona mejor en Linux que en Windows, en mac ni idea. Un buen ejercicio sería hacer lo que plantea Marcuzzi Linux con Linux, en lo personal lo he probrado en Ubuntu, Centos, Oracle Linux y Fedora y no he sentido diferencias significativas, tal vez porque han sido tareas diferentes. Sería que bueno hacer un benchmark y ver que resultados salen o si alguien ya lo ha realizado tal vez pueda compartirlo. Saludos ________________________________ De: R-help-es <r-help-es-bounces en r-project.org> en nombre de Javier Marcuzzi &...

...encionar la rotación. Se trata de proyectar la solución inicial PCA en un espacio diferente de tal manera que las variables estén máximamente separadas, en la práctica, los pesos variable-componente serán o muy altos o muy bajos, de tal modo que se facilita enormemente la tarea de separar variables significativas por componente de las que no lo son. Las rotaciones son un mundo (ortogonales, oblicuas, ...), la más habitual es la varimax que mantiene la ortogonalidad de la solución original. Aquí una descripción que he encontrado al vuelo: http://data-mining-tutorials.blogspot.com.es/2009/12/varimax-rotatio...

Hola, Lo primero muchas gracias a todos por vuesta habitual ayuda. Llevo meses con las funciones lmer, pero tengo un problema no se como plantear unas comparaciones multiples una vez demostrado que el factor tiene diferencias significativas. Tengo multiples opciones, Solución A: una es hacer un bonferroni a saco (pero eso me chirria ya que tego muchos datos) Solución B: Otra es utilizar glht, pero esa opción no me convence del todo. Solución C: Otra es intentar imitar este articulo cosa que he sido incapaz(tabla 1) http://www.mitp...

Dispongo de un experimento en el que cinco tratamientos ha sido aplicados a cinco grupos de voluntarios. En cada grupo había tres personas y a cada persona se le tomaron 3 medidas, En total dispongo de 45 medidas, pero evidentemente no son independientes entre sí. Si no tomo en cuenta que las medidas de la misma persona son más parecidas entre sí (bloques anidados) estaría incurriendo en