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Queridos R-users: Tengo una duda que hace mucho tiempo que estoy intentando resolver, os explico a modo de ejemplo: Tengo estos efectos: Año(5 niveles),Localidad (10 niveles) y genotipo (3 niveles), año y localidad son aleatorios y genotipo es fijo (los he escogido yo). Me gustaría hacer obtener una tabla parecida a la Tabla Anova donde aparezca cada factor y sus interacciones y finalmente hacer un comparación de medias del efecto fijo y del efecto Localidad. NO ser si...

Hola a todos, -Estoy estudiando el efecto de dos genotipos (~tratamientos) en la aparición de síndrome metabólico (MetS) con datos longitudinales recogidos a tiempo 0,7,10,15,20 y 25 años. -He hecho un dataframe con las siguientes variables MetS: Síndrome Metabólico (Si=1,No=0) bmi: Indice de masa corporal (IMC) cuando se produce la conversión a MetS+ ....

...nte esto > se codifica como 0, 1 y 2, pero los autores optaron por una codificacion 0, > 0.5 y 1 (que corresponde a tener 0, 1 o 2 alelos, respectivamente, en > el locus de interes). Asumiendo un microsatelite con alelos "A" y "a", por > ejemplo, 0 corresponderia al genotipo "aa", 0.5 a "Aa" y 1 a "AA". > > Saludos cordiales, > Jorge.- > > > > 2015-04-12 0:37 GMT+10:00 Gemma Ruiz-Olalla <gemma.ruizolalla en gmail.com>: > > > Buenas tardes, > > > > Estamos intentando hacer un estudio sobre div...

Buenas tardes, Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos callejeros ('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería 'adegenet') de R. Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede explicarnos a qué corresponde la variable respuesta? Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las columnas se corresponden con

Hola, mi pregunta es la siguiente: Tengo un modelo genético aditivo, donde los individuos estan emparentados. Quiero que la matriz de parentesco sea la matriz de coeficientes de las correlaciones entre genotipos. En SAS, con PROC MIxed podia agregarla como un archivo y usarla en la sentencia random...No encuentro como hacerlo en R, alguna idea?? En resumen, puedo imponerle a los efectos aleatorios la matriz de correlaciones? ¿Cómo lo hago? Desde ya cualquier sugerencia será agradecida!! Cariños Teresa E...

...as para aclara. Primero de todo tengo cinco repeticiones y 20 missings, así que mi n es de 5×10×3×5-20= 730 datos en total, todos los grupos tienen al menos 3 representantes. Segundo: Las variables estudiadas son Producción neta, Peso de 100 semillas y Proteína. Tercero: Observo los mismos genotipos (G) en varios años (A) en las misma localidades (L). La especie es Phaseolus vulgaris L., en forma de judía seca, por lo que cada año se planta y se recolecta. Con el lme no ser introducir dos efectos aleatorios, ni su interacción; y en el caso de que no exista significación en ninguna in...