Buenas tardes,
Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos callejeros
('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería
'adegenet') de R.
Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede explicarnos a
qué corresponde la variable respuesta?
Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las columnas
se corresponden con los 9 microsatélites (¿dentro de los que hay las 17
colonias de gatos?)
Pero a qué se corresponden las cifras 0.0, 0.1, 0.5, etc.?
Muchas gracias de antemano.
--
Gemma
gemma.ruizolalla en gmail.com
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Hola, ¿qué tal? Para una pregunta tan específica sobre un conjunto de datos tan específico de un paquete tan específico, mejor preguntar a los autores del último. En cualquier caso, la documentación del paquete dice que el conjunto de datos está documentado en un artículo (¿aún sin publicar?) que igual puedes conseguir. Ahí debería describirse con detalle. Un saludo, Carlos J. Gil Bellosta http://www.datanalytics.com El día 11 de abril de 2015, 16:37, Gemma Ruiz-Olalla <gemma.ruizolalla en gmail.com> escribió:> Buenas tardes, > > Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos callejeros > ('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería 'adegenet') de R. > Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede explicarnos a > qué corresponde la variable respuesta? > > Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las columnas > se corresponden con los 9 microsatélites (¿dentro de los que hay las 17 > colonias de gatos?) > Pero a qué se corresponden las cifras 0.0, 0.1, 0.5, etc.? > > Muchas gracias de antemano. > > -- > Gemma > gemma.ruizolalla en gmail.com > > [[alternative HTML version deleted]] > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
Gemma, Tiene que ver con cuantos alelos hay en cada locus. Generalmente esto se codifica como 0, 1 y 2, pero los autores optaron por una codificacion 0, 0.5 y 1 (que corresponde a tener 0, 1 o 2 alelos, respectivamente, en el locus de interes). Asumiendo un microsatelite con alelos "A" y "a", por ejemplo, 0 corresponderia al genotipo "aa", 0.5 a "Aa" y 1 a "AA". Saludos cordiales, Jorge.- 2015-04-12 0:37 GMT+10:00 Gemma Ruiz-Olalla <gemma.ruizolalla en gmail.com>:> Buenas tardes, > > Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos callejeros > ('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería 'adegenet') de R. > Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede explicarnos a > qué corresponde la variable respuesta? > > Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las columnas > se corresponden con los 9 microsatélites (¿dentro de los que hay las 17 > colonias de gatos?) > Pero a qué se corresponden las cifras 0.0, 0.1, 0.5, etc.? > > Muchas gracias de antemano. > > -- > Gemma > gemma.ruizolalla en gmail.com > > [[alternative HTML version deleted]] > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es >[[alternative HTML version deleted]]
Estimado Gemma Ruiz Olalla De curioso miré una búsqueda en internet, y se la comparto, de esta observe la página 8 http://adegenet.r-forge.r-project.org/files/tutorial-basics.pdf Estoy de acuerdo con Jorge y Carlos, pero por las dudas, es solo una codificación, yo sin mirar más no interpretaría que el heterocigota tiene un "peso" de 0.5, porque si hay sobredominancia, dominancia, etc ..., aunque desconozco el caso en particular. Javier Rubén Marcuzzi El 11 de abril de 2015, 11:52, Jorge I Velez <jorgeivanvelez en gmail.com> escribió:> Gemma, > > Tiene que ver con cuantos alelos hay en cada locus. Generalmente esto > se codifica como 0, 1 y 2, pero los autores optaron por una codificacion 0, > 0.5 y 1 (que corresponde a tener 0, 1 o 2 alelos, respectivamente, en > el locus de interes). Asumiendo un microsatelite con alelos "A" y "a", por > ejemplo, 0 corresponderia al genotipo "aa", 0.5 a "Aa" y 1 a "AA". > > Saludos cordiales, > Jorge.- > > > > 2015-04-12 0:37 GMT+10:00 Gemma Ruiz-Olalla <gemma.ruizolalla en gmail.com>: > > > Buenas tardes, > > > > Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos callejeros > > ('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería 'adegenet') de > R. > > Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede > explicarnos a > > qué corresponde la variable respuesta? > > > > Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las > columnas > > se corresponden con los 9 microsatélites (¿dentro de los que hay las 17 > > colonias de gatos?) > > Pero a qué se corresponden las cifras 0.0, 0.1, 0.5, etc.? > > > > Muchas gracias de antemano. > > > > -- > > Gemma > > gemma.ruizolalla en gmail.com > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > _______________________________________________ > > R-help-es mailing list > > R-help-es en r-project.org > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > >[[alternative HTML version deleted]]