jenny tan
2006-Jul-15 01:02 UTC
[R] lm: Displaying 95% confidence and prediction intervals on scatterplots
Hi, May I know how does one superimpose the 95% confidence and prediction intervals on the linear regression line of a scatterplot? Thanks in advance! jenny My data: CEU8 EA 0.033 0 0.014 0 0.019 0 0.023 0 0.033 0 0.033 0 0.033 0 0.037 0 0.033 0 0.014 0 0.019 0 0.023 0 0.014 0 0.019 0 0.023 0 0.014 0 0.019 0 0.023 0 0.017 0 0.018 0 0.022 0 0.014 0 0.019 0 0.023 0 0.114 0.004 0.114 0.004 0.042 0.004 0.012 0.007 0.13 0.008 0.13 0.008 0.122 0.008 0.122 0.008 0.122 0.008 0.122 0.008 0.112 0.008 0.112 0.008 0.105 0.009 0.111 0.009 0.232 0.009 0.242 0.009 0.005 0.014 0.006 0.014 0.006 0.014 0.007 0.014 0.047 0.016 0.05 0.017 0.05 0.017 0.04 0.018 0.04 0.018 0.04 0.018 0.04 0.018 0.034 0.018 0.04 0.018 0.01 0.018 0.02 0.021 0.022 0.021 0.021 0.021 0.032 0.022 0.011 0.022 0.011 0.022 0 0.022 0 0.022 0.011 0.022 0.011 0.022 0.011 0.022 0.011 0.022 0.033 0.023 0.032 0.023 0.035 0.023 0.033 0.023 0.049 0.026 0.047 0.026 0.179 0.026 0.038 0.026 0.012 0.028 0.012 0.028 0.013 0.034 0.013 0.034 0.033 0.036 0.057 0.041 0.06 0.048 0.06 0.048 0.023 0.05 0.031 0.05 0.031 0.05 0.033 0.05 0.034 0.05 0.418 0.052 0.094 0.059 0.106 0.059 0.1 0.059 0.012 0.059 0.019 0.059 0.018 0.059 0.017 0.059 0.025 0.059 0.024 0.059 0.02 0.059 0.027 0.059 0.022 0.059 0.02 0.059 0.029 0.059 0.024 0.059 0.06 0.062 0.043 0.062 0.047 0.062 0.037 0.062 0.036 0.062 0.06 0.062 0.174 0.066 0.04 0.067 0.052 0.067 0.048 0.067 0.055 0.067 0.027 0.07 0.011 0.07 0.011 0.07 0.014 0.07 0.037 0.071 0.034 0.071 0.054 0.071 0.052 0.071 0.05 0.071 0.048 0.071 0.057 0.071 0.055 0.071 0.151 0.076 0.373 0.082 0.408 0.082 0.408 0.082 0.418 0.082 0.057 0.086 0.057 0.086 0.042 0.086 0.046 0.086 0.04 0.086 0.04 0.086 0.09 0.09 0.112 0.091 0.131 0.091 0.124 0.091 0.095 0.091 0.09 0.091 0.588 0.094 0.026 0.1 0.038 0.1 0.038 0.1 0.042 0.1 0.191 0.107 0.191 0.107 0.191 0.107 0.191 0.107 0.193 0.107 0.191 0.107 0.045 0.107 0.446 0.116 0.042 0.12 0.017 0.12 0.019 0.12 0.015 0.12 0.016 0.12 0.157 0.125 0.082 0.128 0.103 0.128 0.114 0.128 0.114 0.128 0.143 0.129 0.166 0.129 0.157 0.129 0.143 0.129 0.166 0.129 0.157 0.129 0.143 0.129 0.166 0.129 0.157 0.129 0.143 0.129 0.166 0.129 0.157 0.129 0.149 0.129 0.175 0.129 0.166 0.129 0.143 0.129 0.166 0.129 0.157 0.129 0.064 0.129 0.067 0.13 0.064 0.13 0.05 0.13 0.081 0.138 0.081 0.138 0.269 0.145 0.194 0.152 0.02 0.158 0.135 0.159 0.074 0.163 0.074 0.163 0.074 0.163 0.073 0.163 0.104 0.167 0.104 0.167 0.104 0.167 0.201 0.175 0.187 0.175 0.084 0.175 0.084 0.175 0.088 0.175 0.086 0.175 0.08 0.175 0.08 0.175 0.083 0.175 0.081 0.175 0.08 0.175 0.08 0.175 0.083 0.175 0.081 0.175 0.072 0.175 0.073 0.175 0.073 0.175 0.072 0.175 0.187 0.176 0.234 0.176 0.216 0.176 0.446 0.176 0.412 0.176 0.412 0.176 0.41 0.176 0.11 0.179 0.109 0.179 0.117 0.179 0.132 0.185 0.135 0.185 0.135 0.188 0.132 0.188 0.14 0.188 0.136 0.188 0.252 0.189 0.256 0.192 0.147 0.2 0.165 0.2 0.111 0.2 0.096 0.2 0.111 0.2 0.197 0.2 0.187 0.2 0.197 0.2 0.143 0.2 0.142 0.2 0.151 0.2 0.401 0.2 0.435 0.2 0.435 0.2 0.447 0.2 0.083 0.205 0.136 0.206 0.246 0.214 0.246 0.214 0.246 0.214 0.246 0.214 0.266 0.214 0.246 0.214 0.282 0.219 0.289 0.219 0.244 0.219 0.234 0.219 0.266 0.219 0.274 0.219 0.228 0.219 0.217 0.219 0.086 0.219 0.091 0.219 0.091 0.219 0.081 0.219 0.177 0.222 0.422 0.222 0.303 0.231 0.325 0.236 0.283 0.236 0.153 0.236 0.745 0.239 0.745 0.239 0.745 0.239 0.745 0.239 0.765 0.239 0.745 0.239 0.175 0.25 0.181 0.25 0.093 0.25 0.325 0.257 0.344 0.263 0.346 0.263 0.363 0.263 0.322 0.266 0.325 0.266 0.28 0.266 0.283 0.266 0.097 0.266 0.101 0.266 0.101 0.266 0.091 0.266 0.558 0.273 0.328 0.273 0.299 0.273 0.451 0.273 0.31 0.273 0.277 0.273 0.212 0.286 0.169 0.286 0.193 0.286 0.152 0.286 0.209 0.286 0.241 0.286 0.258 0.286 0.601 0.288 0.334 0.289 0.322 0.289 0.325 0.289 0.17 0.289 0.344 0.3 0.356 0.3 0.346 0.3 0.359 0.3 0.363 0.3 0.376 0.3 0.214 0.304 0.223 0.304 0.063 0.327 0.063 0.327 0.064 0.327 0.064 0.327 0.424 0.347 0.602 0.347 0.296 0.357 0.424 0.375 0.44 0.375 0.46 0.398 0.46 0.398 0.269 0.429 0.284 0.429 0.269 0.429 0.284 0.429 0.269 0.429 0.284 0.429 0.269 0.429 0.274 0.429 0.269 0.429 0.284 0.429 0.309 0.429 0.284 0.429 0.562 0.449 0.607 0.449 0.607 0.449 0.609 0.449 0.637 0.476 0.574 0.5 0.595 0.5 0.583 0.576 0.674 0.576 0.653 0.576 0.324 0.591 0.324 0.591 0.312 0.591 0.416 0.618 0.416 0.641 0.402 0.641 0.803 0.657 0.802 0.657 0.803 0.657 0.803 0.657 0.81 0.675 0.804 0.675 0.856 0.675 0.79 0.71 0.79 0.71 0.79 0.71 0.79 0.71 0.785 0.71 0.79 0.71 0.681 0.8 0.703 0.8 0.868 0.8 0.862 0.8 0.687 0.8 0.685 0.8 0.686 0.8 0.687 0.8 0.901 0.821 0.96 0.833 0.924 0.865 0.966 0.865 0.966 0.865 1 0.865 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.849 1 0.849 1 0.849 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.769 1 0.746 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.93 1 0.926 1 0.936 1 0.933 1 1 1 1 1 0.946 1 0.944 1 0.721 1 1 1 0.965 1 0.965 1 1 1 1 1 1 1 0.963 1 0.963 1 0.96 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 _________________________________________________________________ Get MSN Hotmail alerts on your mobile.
Dieter Menne
2006-Jul-15 08:40 UTC
[R] lm: Displaying 95% confidence and prediction intervals on scatterplots
jenny tan <jennytimp <at> hotmail.com> writes:> May I know how does one superimpose the 95% confidence and prediction > intervals on the linear regression line of a scatterplot?Check http://finzi.psych.upenn.edu/R/Rhelp02a/archive/8380.html Dieter
hadley wickham
2006-Jul-15 09:03 UTC
[R] lm: Displaying 95% confidence and prediction intervals on scatterplots
> May I know how does one superimpose the 95% confidence and prediction > intervals on the linear regression line of a scatterplot?You could use ggplot: install.packages("ggplot") library(ggplot) qplot(wt, mpg, data=mtcars, type=c("point","smooth"), method=lm) (which gives the 95% confidence interval) Hadley