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2017 Sep 25
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Medidas Repetidas
Buenos días a todos! Quisiera saber si me pueden ayudar con un Script. Necesito hacer un ANOVA para medidas repetidas. Sé que el modelo es el *lme,* pero no se indicarle las medidas repetidas. El conjunto de datos tiene como variable respuesta volumen ingresado y como factores tiempo y tratamientos. El tiempo se midió a las 2,4,6 y 8 min para los distintos tratamientos, son medidas repetidas porque se observó en...
2012 May 04
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Medidas Repetidas
Hola a todos, Estoy intentando realizar un análisis de medidas repetidas en R y me gustaría pediros opinión porque estoy un poco atascada. Estoy utilizando las funciones lme y lmer. Tengo datos de censos de grillos (efi) realizados semanalmente (week) en tres parcelas (plot) diferentes, cada una de las cuales tiene seis transectos (transect) donde se realizan dichos c...
2011 Aug 10
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anova medidas repetidas con lme
...ar) Se trata de cultivos bacterianos, realizado con tres repeticiones, a los que se les monitoreó la concentración celular en el tiempo (en horas). Para determinar si existe diferencia significativa en la concentración celular en los diferentes tiempos necesito aplicar un anova de medidas repetidas, lo que estoy haciendo con la siguiente instrucción (tomado de http://blog.gribblelab.org/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/): # Modelo medidas repetidas: library(nlme) modelo.medidas.repetidas <- lme(CONCENTRACION_CELULAR ~ TIEMPO, random = ~1|REPETICIONES/TIEMPO, na.action = na....
2010 Jun 14
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Sintaxis para Medidas repetidas
...ctos de dos sistemas de siembra en la abundancia de insectos (variable de conteo). Tengo un diseño en bloques con el sistema de siembra, con muestreo semanales de insectos (10 semanas) en cada unidad experimental. Quiero aplicar un modelo lineal generalizado con distribución de Poisson, con medidas repetidas en el tiempo. Agradecería ayuda con la sintaxis. La estructura de los datos se ilustra en el siguiente ejemplo: *Fecha* *Muestreo Nro.* *Bloque* *Sistema* *Abundancia insectos* 05/02/2010 1 1 A 4 05/02/2010 1 1 B 3 05/02/2010 1 2 A 0 05/02/2010 1 2 B 2 05/02/2010 1 3...
2015 Dec 28
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RV: ANOVA R
Estimados He buscado un script para ANOVA en medidas repetidas en los paquetes aov y easyanova y no los encuentro ¿Podrían enviarme un script para para ANOVA para medidas repetidas? Saludos y feliz 2016 José (mi correo usual no funciona ahora) -- Este mensaje le ha llegado mediante el servicio de correo electronico que ofrece Infomed para respaldar el c...
2012 Oct 05
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Dúvida função Anova pacote car - Medidas repetidas
Olá pessoal, estou realizando uma ANOVA com medidas repetidas e estou utilizando a função "Anova" do pacote "car". Medi o biovolume de algas a cada dois dias durante 10 dias (no banco de dados abaixo só coloquei até o 4° dia). Tenho 2 tratamentos ("c","t") e o experimento foi realizado em tréplicas ("A",&quo...
2010 Sep 22
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Modelo de Brunner-Langer para medidas repetidas..?
Alguien conoce este un test no paramétrico que se llama de Brunner-Langer model para dependent data, también conocido como modelo longitudinal? Intuyo que es como un Friedman pero que admite algún efecto fijo. Graccie mile. -- Antonio Maurandi López Universidad de Murcia Edif. CAID. Campus de Espinardo. 30100 Murcia @. amaurandi en um.es T. 868 88 7315 F. 868 88 7302 www.um.es/sai
2011 May 24
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Sumarizar medidas repetidas
Hola ¿Alguno tiene un código para sumarizar medidas? my.df <- data.frame( "ID" = c( rep("A", 3 ), rep("B",2),"C", rep("D",3) ), "Obs.1" = rnorm( 9,0,1 ), "Obs.2" = rnorm( 9,0,3 ) ) Algo que quede mas bonito que esto: by( my.df, my.df$ID, mean ) Gracias un saludo! -- Patricia García González [[alternative HTML
2010 Sep 13
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Help MLG(M) con datos longitudinales
Estimados, Necesito estudiar los efectos de dos factores sobre una variable de conteo con un rango estrecho de variación (es decir, probablemente sin distribución Normal). El experimento tiene más de 10 (fechas de muestreo) observaciones repetidas en el tiempo. En primer lugar, considero que debería aplicar un modelo lineal generalizado (¿Mixto?) usando Poisson como distribución de referencia. Segundo, creo que se trata de un problema de datos longitudinales. Tengo entendido que se debería aplicar un modelo de correlación serial como el a...
2016 Oct 29
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Modelo mixto en R
Hola quisiera saber como parameterizar el siguiente diseño con lme4. Tengo 4 tratamientos, con 4 parcelas cada uno, divididas a su vez en 4 subparcelas, y se han tomado 5 medidas repetidas (5 ocasiones) y se quiere ver el cambio en la variable respuesta producido por los tratamientos a través de las 5 ocasiones. Mi intento con lmer es el siguiente: mod <- lmer(variable respuesta ~ ocasión * tratamiento + (ocasión | parcela/subparcela) Es correcta esta forma de parameterización...
2016 Nov 01
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Modelo mixto en R
...rg> > Enviados: Sábado, 29 de Octubre 2016 14:56:02 > Asunto: [R-es] Modelo mixto en R > > Hola quisiera saber como parameterizar el siguiente diseño con lme4. > > Tengo 4 tratamientos, con 4 parcelas cada uno, divididas a su vez en 4 > subparcelas, y se han tomado 5 medidas repetidas (5 ocasiones) y se quiere > ver el cambio en la variable respuesta producido por los tratamientos a > través de las 5 ocasiones. > > Mi intento con lmer es el siguiente: > > mod <- lmer(variable respuesta ~ ocasión * tratamiento + (ocasión | > parcela/subparcela) > >...
2016 Mar 03
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Representar datos longitudinales mediante splines
Buenas noches a todos, Me dirijo a vosotros porque estoy trabajando con medidas repetidas sobre un grupo de sujetos y quisiera graficar la evolución temporal de cada uno de ellos pero suavizada mediante un spline (o en su defecto algún tipo de línea suavizadora que no necesariamente tenga que pasar por los puntos de cada sujeto). Además, quisiera hacerlo en R básico, esto es, sin recur...
2011 Oct 10
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tapply
...;1, (d_inicio-d_inicio[n_accion+1]), d_inicio) # como tengo numeradas las acciónes tomo el valor de d_inicio para la acción siquiente n_accion + 1 ver <- data.frame(datos_quiero, yo_funca) ver # # Ahora el problema # # # en este ejemplo solo tengo individuos (a,b,c) y no hay acciónes repetidas mayores a 1 # lógicamente en los datos reales tengo muchos individuos con el mismo n_accion # por tal motivo pense en crear un conteo utilizando tapply # pero hay un error en lo siguiente "conteo <- with ..." conteo <- with(ver, tapply(n_accion, individuo, function(x){ con...
2015 Apr 30
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búsqueda y sustitución masiva
Hola a tod en s, explico lo que estoy intentando hacer... Tengo un listado de url comprimidas de twitter, entre las cuales hay muchas repetidas, por lo que el número de registros llega a más de 15K. Por otro lado tengo otra lista de esas url únicas con su equivalente ya descomprimido llegando a un registro de 900. El problema que tengo es que estoy intentando hacer un loop para hacer la sustitución de la url comprimida por su equivalent...
2014 Jun 23
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Resumen de R-help-es, Vol 64, Envío 33
...calculados las tasas de verdaderos y falsos positivos (TPR y FPR). También parece que los tienes ordenados por la variable FishSpeed y supongo que también por las que parecen marcas de tiempo. No necesitas ROCR porque con un simple plot te sale algo parecido a una curva. Eso sí, veo que son medidas repetidas en el tiempo para cada valor de FishSpeed. Como apaño rápido he promediado por esa variable para que salga algo parecido a una curva ROC, lo podrás hacer con el código que pongo abajo. Te cuento hasta donde sé lo que se puede hacer a partir de aquí: - Las librerías especializadas en ROC (ROCR y pR...
2018 Jul 18
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Legendas en una gráfica de ggplot2
...ot; (ancho), donde tienes la columna t y una columna para cada curva. > Pero para lo que quieres hacer en ggplot, necesitas un formato "long" > (largo), donde tienes una columna con el tipo de curva (l,o,u,i) otra > columna con los valores para cada curva y la columna t, solo que repetida > para cada curva. > > Con este código puedes cambiar los datos y hacer la gráfica como quieres: > > library(ggplot2) > > t=seq (-4, 4, by=0.01) > > #### Con b=-2 > > l=exp(t+2)/(1+(exp(t+2))) > > ##con b igual a -1 > > o=exp(t+1)/(1+(exp(t+1))) > &gt...
2018 Jul 18
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Legendas en una gráfica de ggplot2
Buenas tardes, estoy haciendo una gráfica de múltiples lineas pero no he podido generar las legendas. Alguno de ustedes me podría colaborar. library(ggplot2) #### Con b=-2 t=seq (-4, 4, by=0.01) l=exp(t+2)/(1+(exp(t+2))) ##con b igual a -1 t=seq (-4, 4, by=0.01) o=exp(t+1)/(1+(exp(t+1))) ### Con b igual a 0.7 t=seq (-4, 4, by=0.01) i=exp(t-0.7)/(1+(exp(t-0.7))) ### Con b igual a 2 t=seq
2012 Feb 04
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Comparaciones múltiples en ANOVA anidadp
...m" Para no alargarme en mis indagaciones. Para los análisis de la varianza podría haber utilizado las funciones lme del paquete nlme o lmer del paquete lme4, pero tampoco proporcionan objetos válidos para glht o TukeyHSD. ¿Alguien sabe como abordar las comparaciones múltiples con medidas repetidas o anova anidado? Gracias de antemano. -- _____---^---_____ Univ. de Extremadura Dept. Matemáticas. Despacho B29 Tf: + 34 924 289 300 Ext. 86823
2011 May 01
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Determinar Patron
Saludos a todos como analizo las curvas o funciones (ANALISIS DE COMPONENTES PRINCIPALES O CORRELACION CANONICA) que estan adjuntadas en el archivo JPEG, Necesito determinar el patron o una funcion equivalente, gracias a todos CARLOS ANDRES ------------ próxima parte ------------ Se ha borrado un adjunto en formato HTML... URL:
2009 Oct 28
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Insertar filas en un data frame
Hola, Por favor, necesito insertar una fila debajo de las filas que tengan DV distinto de cero, pero no me deja insertar hasta el final de la tabla. Esta es mi tabla y este es el código con el que estoy apurado. C ID TIME DV AMT RATE CMT SS II EVID GRUPO VISITA DOSIS VECES FORMA NAP EDAD SEXO ALTURA PESO 11 0 0 3 0 1 1 12 1 3 0 3 2 1 0 77 2 147 74 11 1.417 0.001 0 0 2 0 0 0 3 0 3 2 1 0.001