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2013 May 08
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lme4 y residuales
...En el primer conjunto de datos que se analiza hay dos niveles. Obtener el los residuales y los valores ajustados por al nivel inferior no ha sido problema con las funciones residuals y fitted. Para el segundo nivel, la función ranef me extrae los residuales. El problema lo tengo con los valores predichos, y no puedo realizar el gráfico de los residuales frente a los valores predichos. Mi pregunta es: ¿cómo puedo realizar tal gráfico para el nivel 2? ¿Cómo obtengo los valores predichos?¿Serían estos las medias predichas para cada grupo del nivel 2? Gracias. Joan. [[alternative HTML version...
2014 Nov 06
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Duda_Observed vs Predicted
Hola Javier, Si, cuando hablo de valor observado me refiero al valor real en campo y el predicho al que estiman los modelos. Disculpa, que no lo detallase así desde el principio. En mi caso trabajo con dos diferentes: Zero inflated y Binomial Negativo y me gustaría comprobar que diferencia (distancia) existe entre cada uno de ellos y la realidad. Estoy trabajando con los siguientes paquetes:...
2014 Nov 06
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Duda_Observed vs Predicted
...tabla: 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 pred 3600 589 349 224 151 105 75 55 42 32 25 20 16 13 obs 3529 743 300 203 135 81 76 44 33 37 30 12 14 13 La duda me surge al intentarlo con el Modelo Binomial negativo.¿Sabeis que comando podría introducir para obtener los 13 valores predichos por el modelo BN? Muchas gracias por vuestra ayuda y buen día. Lorena [[alternative HTML version deleted]]
2020 Sep 01
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Cálculo - intervalo de confianza - modelo nls - predict
Buenas tardes, Quisiera obtener el intervalo de confianza (y también intervalos de predicción) para los valores predichos en un modelo nls. ¿Hay alguna manera que no sea por ggplot2 (me interesaría obtener el valor listado -además de en el gráfico-) o por bootstrap? Os copio el código del ajuste del modelo y predicción para los 3 días siguientes: *#Ajuste del modelo* model = nls(formula = N~K*exp(-log(K/N0)*exp(-a...
2011 Apr 01
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Predicción de valor máximo en superficie de respuesta, con paquete rsm
Hola compañeros de la lista. Estoy aprendiendo a usar el paquete "rsm" para superficies de respuesta. Siguiendo este ejemplo todo va bien, hasta que trato de obtener el valor máximo predicho para la variable de respuesta en los valores de x1 y x2 estimados. ------------------------------------------------------------- library("rsm") ChemReact CR <- coded.data(ChemReact, x1 ~ (Time - 85)/5, x2 ~ (Temp - 175)/5) CR # Realizando un ajuste de segundo orden: CR.rsm2 <- rsm...
2014 Jan 13
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Ayuda con Neuralnet
...ilidad,data=Datos.chelo,hidden=1,algorithm="backprop",learningrate=0.01, hidden=1,threshold = 0.01,act.fct="tanh",linear.output=FALSE) A partir de aquí puedo ver la red e incluso ver la imagen de la red con los diferentes pesos. Entonces, me gustaría poder obtener los valores predichos por la red para luego poder hacer la curva ROC y compararla con otros modelos. Sé que rattle hace algo parecido, pero utiliza otro paquete para ver la red neuronal, creo que lo hace con nnet, pero me gustaría hacerlo con neuralnet, si es que me aclaro. En segundo lugar, comentar que también me he...
2013 Mar 11
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Pedigreemm
Hola a todos, me gustaría realizar una consulta asociada a la generación de valores genéticos del pedigreemm en R. Primero generé el archivo de pedigree incluyendo los parentales para posteriormente estimar la varianza aditiva y los valores genéticos para cada individuo, relacionando los individuos por medio de la matriz de parentesco. Me da todo perfecto, el complemento pedigreemm trabaja muy