search for: pegas

Hi, For the last few days I have tried utilise your package "pegas" in order to obtain some values for indices like the nuclear diversity and tajimas d value. I have modified my dataset (a text file containing dna sequences) in order to be able to read it in with the tools provided by pegas. Here, I have oriented myself on the description provided by the...

Hi! I am trying to analyse my data using amova (http://www.oga-lab.net/RGM2/func.php?rd_id=pegas:amova): My input to R is a DNA sequence file, format=fasta dna<- read.dna("XX.fasta", format="fasta") #left other options as default d<- dist.dna(dna, model="raw") g<- read.table("XXX.design") Load necessary libraries: library(pegas)...

Para mi lo más práctico y rápido es prescindir de estos paquetes, seleccionar los datos que me interesan del excel, copiarlos y en R poner: datos<-read.table("clipboard",header=T,dec=",",sep="\t",na.strings="") Y con eso me pega los datos como un data.frame en excel. Un saludo Jesús [[alternative HTML version deleted]]

Dear friends, I would like to announce for tests and free use a good add-on for Samba. It is a LAN-based interface for famous Pegasus Mail by David Harris, emulating his Mercury MTA. Note that this message have passed through this system. Look in headers. It is working! http://www.cor.neva.ru/~aal/pegas/pegas+qmail-1_0.tar.gz (7k) The file contains the patch against qmail 1.03, source of sendmail launcher, a piece of Sam...

He tratado de usar lo siguiente: a<- ifelse(BD$Divisi?n>=50 & BD$Divisi?n<59,"D", ifelse (BD$Divisi?n>=60 & BD$Divisi?n<=69,"G", ifelse (BD$Divisi?n>=70 & BD$Divisi?n<=79,"L", ifelse (BD$Divisi?n>=80 &

...tirar por su cuenta".. no sé yo... > > Opiniones? creo que, en primer lugar, deberíamos felicitarnos con que el superpoderoso Microsoft se haya fijado en R. ¡Quién nos lo iba a decir hace 10 o 12 años! Tiene otra ventaja. Ayer mismo hablaba con una gente de un banco y me contaban las pegas (reales o potenciales) que ponía el Banco de España a modelos de riesgos desarrollados en R. Ahora se le puede decir al regulador que se está usando código bajado del mismo sitio que sus actualizaciones del sistema operativo. Finalmente, creo que mientras no se pruebe lo contrario, Microsoft está...

Hola erreros! Acudo de nuevo a ustedes porque ando enredado con algo que debe ser simple pero que no consigo. Lo que ando buscando hacer es pasar todas las variables de un dataframe a solo una variable (columna) con la info apilada. Lo que tengo es un dataframe así (con 200 variables y 30,000 filas): Var1 Var2 Var3 1 5 9 2 6 10 3 7 11 4 8 12 y lo que necesito es convertirlo a: Var1 1 2 3 4 5 6

Hola amigos, de nuevo aquí haciendo preguntas, Tengo instalada la versión de R 3.1.2 para Windows veo que está disponible la 3.1.3 Hoy empece a trabajar con la interconexión R con Excel. Quise Instalar el paquete XLConnect y ya tuve alguna pega porque decía que una parte del mismo está escrito en la versión 3.1.3. Aquí, en este mundillo, ya veo que el que no corre vuela porque la 3.1.3 es de

Y muchas veces, se guardan los datos en esas hojas excel, donde los usuarios, que no son estadísticos, que no conocen R y no lo van a conocer completan esos excel. Es más cómodo hacer que guarden los datos en esos ficheros fijos respetando ciertas reglas en cuanto a formatos, estando dichos ficheros en ubicaciones fijas y llamar los datos desde R directamente a los archivos en sí, que tener que

Hola Eric. Muchas gracias por tu respuesta. Intenté hacer lo mismo sobre una variable agregada a datos, de modo: datos$p_Valores <- datos[, Valores/sum(Valores), by=MesAño] pero no funciona, porque pega un data.table en una única variable: In `[<-.data.table`(x, j = name, value = value) : Supplied 2 items to be assigned to 5849 items of column 'pValores' (recycled leaving remainder

Hola Estoy tratando de correr un survival analysis usando un Cox regression model. Tengo una duda respecto a la organizacion del script. Tengo una variable que es -tamano del individuo- y quiero ver si hay diferencia en sobrevivencia respecto a tamano. Como diseno de campo los tamanos fueron ubicados de forma aleatoria en bloques al azar. Cuado planteo el script tengo algo como:

Estimado Mauricio Monsalvo Le paso una idea, no es un código muy lindo que digamos, pero al correrlo seguramente se dará cuenta de mi sugerencia. datos<-c(2,3,4,5,6,7,8) quantile(datos) quantile(datos,probs = c(0.25, 0.75, 0.85, 0.90, 0.95)) as.matrix(quantile(datos,probs = c(0.25, 0.75, 0.85, 0.90, 0.95))) as.data.frame(quantile(datos,probs = c(0.25, 0.75, 0.85, 0.90, 0.95))) # ¿ y si solo

Ambas son buenas opciones, pero, en mi opinion, deducR aspira a ser mas un interfaz para quien ni sepa ni quiera programar, mientras que Rcmdr es mas, una forma sencilla de empezar... Un saludo, Xavier Tibau El 24 may. 2017 10:15, <miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es> escribió: > Tienes razón, Xavier, DeduceR es sencillo e intuitivo. > > Mi experiencia (en el pasado) con

Estimados, Junto con saludar, agradecer? si alguien me pueda ayudar con un problema que tengo: Tengo una base de datos llamada "BD", la cu?l posee 300 columnas y 2800 filas, tengo una columna llamada "DIVISION" que se compone de dos d?gitos. Lo que quiero hacer, pero no s? como es: Generar una nueva columna (adicional), llamada "SECCION" que me clasifique con letras

?Tienes un nuevo mensaje en Badoo! Marcos Ortiz te dej? un mensaje. Haz click en este enlace para verlo: http://us1.badoo.com/marcosluis2186/in/GZba-jJeopY/?lang_id=7 M?s gente que tambi?n te est? esperando: Relquis (Trinidad, Cuba) Yadiria (Trinidad, Cuba) Elcubanito (Trinidad, Cuba) http://us1.badoo.com/marcosluis2186/in/GZba-jJeopY/?lang_id=7 Si al hacer click sobre el enlace, no funciona,

Hi, I'd like to conduct an amova in R from diploid genotpyic data. The packages pegas and ade4 require a Euclidian distance matrix. Is there a simple method to generate a dist object from genotypic data at the individual level? I think the dist.genet of ade4 only generates distances at the population level. Thanks for any help, Mike. [[alternative HTML version deleted]]

Buenas. He visto el siguiente ejemplo en uno de los blogs en inglés ( http://4dpiecharts.com/2011/05/11/a-clock-utility-via-console-hackery/). Copia y pega el código en la consola de R, verás un resultado curioso: clock <- function() { repeat { cat("\r", format(Sys.time(), "%H:%M:%S")) flush.console() Sys.sleep(1) } } clock() -- Dr. Gregorio R. Serrano

Hi, I'm doing haplotype networks with the package pegas and the script from Jimmy O'Donell's blog. The networks which I obtain are a little ugly and I'd like to change some aspects of their appearance, but I'm just starting with R and I don't know how to do it. I have the following problems: -Some nodes overlap. I increase the scale...

Yo he tratado de instalar DEDUCER tanto en Windows como en una Mac, y no he podido. Aún siguiendo las instrucciones en el blog del autor, que involucra instalando una versión mas vieja de R. Parece haber problemas con Java y con el paquete Rjava. Saludos, Gerardo 2017-05-24 9:00 GMT-05:00 Manuel Spínola <mspinola10 en gmail.com>: > Hola, > > Otra alternativa es el paquete

DeduceR es mas intuitivo que Rconander. Espero que te ayude! Xavier El 24 may. 2017 9:17, <miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es> escribió: > Hola Eduardo. > > Creo que RCommander es un buen entorno gráfico para empezar con R (y en tu > escenario te resultará muy útil) > > Te recomiendo que uses el plugin EZR (Easy R) para ampliar la > funcionalidad de