search for: organisme

...ansform: uppercase; text-align: left; position: relative; float: left; } #accueil { z-index: 10; } #accueilhover { background-color: #CCC; margin-left: -107px; z-index: 5; background-image: url(coin.png); background-repeat: no-repeat; background-position: right bottom; } #organisme { z-index: 10; } #organismehover { background-color: #CCC; margin-left: -107px; z-index: 5; background-image: url(coin.png); background-repeat: no-repeat; background-position: right bottom; } #clients { z-index: 10; } #clientshover { background-color: #CCC; margin-left: -10...

Dear all, I am using a program that generates similarity matrices in the following non-redundant pairwise format. a b 0.4 a c 0.5 a d 0.3 b c 0.9 b d 0.6 c d 0.2 matrix(c('a','a','a','b','b','c','b','c','d','c','d','d',.4,.5,.3,.9,.6,.2),byrow=F,nrow=6) I would like to convert this to a

Hello, Is there an easy function for switching list to matrix. My list is of genetic distances between species pairs: A A 0 A B .5 A C .25 B C .5 and I want a distance matrix such as: A B C A 0 .5 .25 B .5 0 .5 C .25 .5 0 for use in a mantel test. Thank you for the help! cheers, charlie -- ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Charles G. Willis Department of Organismic

Hello, How can one write the output of a GLM/GEE model to a text file, such that the results appear in text file in the same (or similar) format they appear in the R console? For instance, I have the following model: Traitresult <- compar.gee(Y~X, data = data, family = "binomial", phy = tree, scale.fix = TRUE, scale.value = 1) How would I write "Traitresult" to a text

Hello, I am trying to test for non-linearity in a set of non-parametric data. Furthermore, I would like to do so in a multi-variate model. Frankly, I don't even know if this is possible, and if it is possible, I don't know if it is implemented in an R package. Any advice would greatly appreciated. Thank you! Charlie -- ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Charles G.

...+++TM/-Tmp-/RtmppsxaRa/downloaded_packages’ * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.13/Resources/library/rgdal’ Any help would be much appreciated! Best regards. Dr. Arnaud CATHERINE Post-Doctorant UMR 7245 CNRS/MNHN "Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes" Equipe "Cyanobactéries, Cyanotoxines et Environnement" Muséum National d'Histoire Naturelle 12, rue Buffon , Case 39 75231 Paris Cedex 05 Tel : + 33 (0)1 40 79 31 79 Fax : +33 (0)1 40 79 35 94 Email : arnocat@mnhn.fr Site du Muséum National d'Histoire Naturelle : http://ww...

Se ha borrado un adjunto en formato HTML... URL: <https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20151216/d2fd2efe/attachment-0001.html>

...eguda per tercers a l'entrar a la xarxa. Per això, si el missatge inclou contrasenyes, números de targetes de crèdit o qualsevol altra informació que vostè consideri confidencial, seria més segur contestar per una altra via i cancel·lar la seva transmissió. L'Ajuntament de Mataró i els seus organismes dependents no poden assumir la responsabilitat derivada del fet de què terceres persones puguin arribar a conèixer el contingut d'aquest missatge durant la seva transmissió. La presente información se envía únicamente a la persona a la que va dirigida y puede contener información privile...

...eguda per tercers a l'entrar a la xarxa. Per això, si el missatge inclou contrasenyes, números de targetes de crèdit o qualsevol altra informació que vostè consideri confidencial, seria més segur contestar per una altra via i cancel·lar la seva transmissió. L'Ajuntament de Mataró i els seus organismes dependents no poden assumir la responsabilitat derivada del fet de què terceres persones puguin arribar a conèixer el contingut d'aquest missatge durant la seva transmissió. La presente información se envía únicamente a la persona a la que va dirigida y puede contener información privile...

...l'entrar a la xarxa. Per això, si el missatge inclou > contrasenyes, números de targetes de crèdit o qualsevol altra informació > que vostè consideri confidencial, seria més segur contestar per una > altra via i cancel·lar la seva transmissió. L'Ajuntament de Mataró i els > seus organismes dependents no poden assumir la responsabilitat derivada > del fet de què terceres persones puguin arribar a conèixer el contingut > d'aquest missatge durant la seva transmissió. > > La presente información se envía únicamente a la persona a la que va > dirigida y puede contener...

Se ha borrado un adjunto en formato HTML... URL: <https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20130418/96cdfbcc/attachment.html>

...9;entrar a la xarxa. Per això, si el missatge inclou > contrasenyes, números de targetes de crèdit o qualsevol altra > informació que vostè consideri confidencial, seria més segur contestar > per una altra via i cancel·lar la seva transmissió. L'Ajuntament de > Mataró i els seus organismes dependents no poden assumir la > responsabilitat derivada del fet de què terceres persones puguin arribar a conèixer el contingut d'aquest missatge durant la seva transmissió. > > ________________________________ > > La presente información se envía únicamente a la persona a la...

Se ha borrado un adjunto en formato HTML... URL: <https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20141027/1ad7c503/attachment-0001.html>

...<<carte2, echo = FALSE, results= verbatim, fig = TRUE>>= lp <- dbSendQuery(con, "SELECT nom FROM projets") projets <- fetch(lp) nbr=dim(projets)[1] for (i in 1:nbr) { monprojet=(projets)[i,1] myquery=paste("SELECT s.longitude, s.latitude, o.orgashort FROM organisme o JOIN scientist s ON o.codeorga=s.codeorga JOIN partenaire p ON p.codescientist=s.codescientist JOIN projets ON projets.codeproj=p.codeproj WHERE projets.nom LIKE \"",monprojet,"\" ORDER BY s.longitude", sep="") rs <- dbSendQuery(con, myquery ) df...

Hello! When I simulate variance at only a single level in a nested analysis using lme (all levels are random effects), the results confuse me. Instead of lme reporting high variance in only that simulated level, substantial variance (>10% of simulated level) often appears in other levels -- in some configurations, as often as 50% of the time. Usually this spurious variance shows up in

Hello, I am trying to preform a comparative analysis using the partial mantel method. However, i am having trouble creating compatible matrices. I can create matrices from my numerical data using the 'distance(x, method)' function from ecodist, but the row/column names are out put as numbers. While when i create a phyo-distance matrix using 'cophenetic(x)' from APE, the row/column

Do you know any good editor R? -- View this message in context: http://www.nabble.com/Editor-R-tp23822342p23822342.html Sent from the R help mailing list archive at Nabble.com.

Dear list, I am running into 2 problems when using the optimize function from the stats package (note: I've also tried unsuccessfully to use optim, nlm, & nlminb). The second problem is caused by my solution to the first, so I am asking if anyone has a better solution to the first question, or if there exists a solution to the second problem. I should also mention that what I am

Hello, I am running the program COMPAR.GEE within the package APE. My dependent variable is binomial, while my independent variable is a multi-state categorical variable. The output reports an estimate for each state of the independent variable except the first one. For example, for the variable X with 3 states, the output is: intercept (estimate) X2 (estimate) X3 (estimate)

Hello All, I am looking for an R library/function that allows the specification of a custom link function in a linear mixed model. I've been using glm() in library MASS to fit fixed-effect models with a custom link but my study design demands mixed models. Any suggestions on the best R library/function to achieve this would be greatly appreciated. I have tried, to no avail, to