search for: interacciones

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2011 Jul 08
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Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey
...esolver, os explico a modo de ejemplo: Tengo estos efectos: Año(5 niveles),Localidad (10 niveles) y genotipo (3 niveles), año y localidad son aleatorios y genotipo es fijo (los he escogido yo). Me gustaría hacer obtener una tabla parecida a la Tabla Anova donde aparezca cada factor y sus interacciones y finalmente hacer un comparación de medias del efecto fijo y del efecto Localidad. NO ser si es posible hacer tal cosa con los efectos aleatorios. He probado de todos, con lme y lmer pero no he podido introducir las interacciones deseada ni al final he podido hacer un LSD o SNK. Como pued...
2010 Sep 23
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Calculo de los Std. Error de las interacciones en matrices no balanceadas
Buenos dias a tod en s, queria calcular los Std. Error de las interaciones en una anova para despues calcular los I.C, o directamente los I.C.. Se que para una matriz balanceada podemos hacer el modelo con aov() y despues con model.table (aov(), type="means", se=T) nos da los Std. Error de los efectos principales y las interaciones, pero cuando tenemos una matrix no balanceada
2011 Jul 08
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Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey a claración de las datos
Hola de nuevo R-Users, me he dejado cosas para aclara. Primero de todo tengo cinco repeticiones y 20 missings, así que mi n es de 5×10×3×5-20= 730 datos en total, todos los grupos tienen al menos 3 representantes. Segundo: Las variables estudiadas son Producción neta, Peso de 100 semillas y Proteína. Tercero: Observo los mismos genotipos (G) en varios años (A) en las misma localidades
2007 Feb 28
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no df to test the effect of an interaccion on a lmer mixed model
Dear useRs, I am fitting a mixed model using the function lmer from the package lme4, but I have some problems when I try to test the effect of my factors of interest. First let me explain the structure of the model: I'm measuring animal movements. Explicitly, I am interested in displacement (straight-line distance from an initial point). Displacements are measured longitudinally, with one
2013 Aug 14
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obtener matriz de contactos
...fertility in Argentina using R. de Herrera Gómez, Marcos; Cid , Juan Carlos and Paz , Jorge Augusto. La diferencia es que voy a usar datos de Uruguay del Censo 2011. Ellos utilizan GeoDaSpace para calcular la matriz de contigüidad (tambien llamada de contactos, pesos, ponderaciones, distancias o interacciones espaciales). ¿Hay alguna libreria que sirva para hacer todo en R así como algun material didactico sobre el tema? Saludos, Sebastián. [[alternative HTML version deleted]]
2014 Oct 19
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Warnings en GLMM (lme4)
...den repetir entre años. La estructura de mi modelo es la siguiente: #paquete(lme4), mi versión de R es la 3.1.1. m1<- glmer(ncebas~offset(LogDur_video)+ TamañoParche*Ldate*Csize+(1|YEAR) + (1|Bosque/nideo)+ (1|Hembra) + (1|Macho), data=Cebas, family=poisson(link=log)) #con todas las variables e interacciones posibles para que sirva como referencia a la hora de la selección del modelo final. El modelo me funciona, sin embargo me aparecen unos warnings que no sé a que se deben ni la importancia real en el cáculo de mi modelo. Mi pregunta es si alguien en el foro sabe porqué aparecen y como solucionarlo...
2012 Jun 08
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Consulta sobre GLM-log linear
Estimados amigos, Estoy familiarizándome con los modelos lineales generalizados en R. Estoy interesado en realizar un análisis lig linear y me gustaría saber cuáles son o como extraer los valores correspondientes al chi cuadrado en el análisis para cada grupo y para las interacciones. Desde ya muchas gracias y disculpas si la pregunta es muy básica, adjunto los comandos que estoy utilizando. Si hiciera falta el archivo de texto puedo adjuntarlo. Desde ya mcuhas gracias library(MuMIn) archivo<-read.table("C:\\Users\\R\\arch.txt",header=T) attach(C.narino) glm1=...
2012 Jun 08
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Consulta sobre GLM-log linear
Estimados amigos, Estoy familiarizándome con los modelos lineales generalizados en R. Estoy interesado en realizar un análisis lig linear y me gustaría saber cuáles son o como extraer los valores correspondientes al chi cuadrado en el análisis para cada grupo y para las interacciones. Desde ya muchas gracias y disculpas si la pregunta es muy básica, adjunto los comandos que estoy utilizando. Si hiciera falta el archivo de texto puedo adjuntarlo. Desde ya mcuhas gracias library(MuMIn) archivo<-read.table("C:\\Users\\R\\arch.txt",header=T) attach(C.narino) glm1=...
2012 Jun 08
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Consulta GLM
Estimados amigos, Estoy familiarizándome con los modelos lineales generalizados en R. Estoy interesado en realizar un análisis lig linear y me gustaría saber cuáles son o como extraer los valores correspondientes al chi cuadrado en el análisis para cada grupo y para las interacciones. Desde ya muchas gracias y disculpas si la pregunta es muy básica, adjunto los comandos que estoy utilizando. Si hiciera falta el archivo de texto puedo adjuntarlo. Desde ya mcuhas gracias library(MuMIn) archivo<-read.table("C:\\Users\\R\\arch.txt",header=T) attach(C.narino) glm1=...
2010 Sep 24
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help
...res posiciones en el lote están anidadas dentro de los cultivos, los que a su vez lo están dentro de los cuatro paisajes. Mi objetivo es determinar en qué medida la variación en el número de especies de malezas es explicada por el tipo de paisaje, el cultivo y la posición en el lote agrícola, o las interacciones entre factores. Usé la library (nlme) con el siguiente modelo: alpha.lme<-lme(log(alpha+1)~1+Landscape+Crop+Position+Landscape:Crop+Landscape:Position+Crop:Position, random=~1|Landscape/Crop/Position, method="REML") Obtengo la siguiente solución en el ANVA: > anova(alpha.lme)...
2012 Feb 02
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Error con package agricolae
Hola a todos Estoy trabajando con el package agricolae para realizar pruebas de medias y obtengo un error que no entiendo al trabajar las interacciones. Os explico: Poseo un Diseño Completamente al Azar para el arreglo de tratamientos factorial de la forma 2*2*4. El modelo consta de 6228 observaciones, el esquema para el anova es: A= 2 niveles={2,5} B= 4 niveles={F1,F2,F3,F4} C= 2 niveles={S,N} FV GL A 1 B...
2010 Jan 26
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fisheyeR en r-forge
Hola usuaRios, He alojado un paquete en r-forge, ya a punto de ser enviado a CRAN. fisheyeR implementa ideas de varios autores acerca de metodos visualizacion de datos. Para disfrutar de capacidad de interaccion es necesario instalar el paquete tkrplot. Agradeceria enormemente sugerencias, dudas y comentarios. install.packages("fisheyeR",
2012 May 07
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que valores está informando R en summary???
Hola a todos! perdón por molestarlos nuevamente con los contrastes, pero estoy trantando de entender que es lo que está haciendo R y de donde vienen los valores que informa pero  no lo logro. Creí haberlo entendido pero a la hora de usar mis datos los resultados no dan como deberían. Tengo dos variables explicativas que son factores con 3 niveles cada uno. Esta es la tabla de medias de la
2013 Aug 20
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obtener matriz de contactos
...Gracias, Sebastían. El 14 de agosto de 2013 16:19, Freddy Omar López Quintero < freddy.vate01@gmail.com> escribió: > Hola Sebastian, > > Ellos utilizan GeoDaSpace para calcular la matriz de contigüidad (tambien >> llamada de contactos, pesos, ponderaciones, distancias o interacciones >> espaciales). >> > > Creo que te puedes aproximar a lo que necesitas con la función knn2nb del > paquete spdep. > > Saludos. > > > > > -- > «But Gwindor answered: 'The doom lies in yourself, not in your name.'» > > JRR Tolkien > [[al...
2012 May 06
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comparaciones planeadas
...t;frecuencia" y "longitud". La variable dependiente es el tiempo que tardan en leer las palabras "tiempo" Si hacemos el anova siguiente   anova=aov(tiempo~niño*frecuencia*longitud + Error(sujeto/frecuencia*longitud)) summary(anova)   todo marcha bien y podemos ver si en las interacciones hay significación, pero no podemos comparar. Por ejemplo podría ser interesante saber que la frecuencia de las palabras tiene un efecto significativo tan solo en los colegios uno, dos y tres, pero no en cuatro etc. En mi caso, si cambio "colegio" por "patologías" pues cobra much...
2013 Jan 23
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Mixed effects para factores y no para covariables. Guia y dudas
...<- plotLMER.fnc(mod, pred = "Word", withList=TRUE) max(dfr$Word$Y)-min(dfr$Word$Y) #--------------------------------------------------------------------------------------------------------- # Comparaciones post hoc summary(glht(model= mod,linfct=mcp(Word="Tukey"))) # Interacciones summary(glht(model= modI,linfct=mcp(SoaWord="Tukey"))) [[alternative HTML version deleted]]
2013 Aug 14
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obtener matriz de contactos
​Hola Sebastian,​ Ellos utilizan GeoDaSpace para calcular la matriz de contigüidad (tambien > llamada de contactos, pesos, ponderaciones, distancias o interacciones > espaciales). > Creo que te puedes aproximar a lo que necesitas con la función knn2nb del paquete spdep. Saludos.​ -- «But Gwindor answered: 'The doom lies in yourself, not in your name.'» JRR Tolkien [[alternative HTML version deleted]]
2020 Sep 14
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Interpretación de salida de un GLM
Estimada comunidad, tengo unas dudas que son muy básicas creo, pero es mi primera incursión en GLM. Estoy ajustando un modelo binomial a unos datos de germinación. El modelo es muy sencillo, tengo un factor "Condicion" con dos niveles: "a" y "b" (nivel de humedad en suelo). Por otro lado, tengo una variable explicativa "HF" (horas frío=estratificación) que
2013 May 06
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Comparaciones multiples lmer
...djust.method="bonferroni") # Dos factores. Interacción pairwise.t.test( x= datos$LogRT , g= paste(datos$Affix,datos$group), p.adjust.method="bonferroni") #-------------------------------------- # B) Solución glht #-------------------------------------- # Es buena, pero para interacciones me chirria # http://stats.stackexchange.com/questions/14078/post-hoc-test-after-anova-with-repeated-measures-using-r # http://www.ats.ucla.edu/stat/r/faq/testing_contrasts.htm # http://thebiobucket.blogspot.com.es/2011/06/glmm-with-custom-multiple-comparisons.html#more # Un Factor summary(glht(mod...
2012 Apr 02
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graficar superficie de respuesta con los valores de las variables originales ...
estimados, ajusté una superficie de respuesta con el paquete "rsm" de R y hago un grafico 2D de la superficie de respuesta con contour(), pero como el argumento de esta función es la superficie de respuesta ajustada y ésta se ha ajustado codificando las variables, de acuerdo a la recomendación de la documentación del paquete rsm, obtengo un gráfico con los ejes en unidades codificadas