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aleatorios
2016 Mar 07
2
Efectos aleatorios anidados en gamlss
...tware 23(7)). El modelo que intento correr es:
m1<-gamlss(Teleosteos ~
cs(LT_max)+random(Familia/Genero,lambda=T),family=BEINF, data = datos)
donde LT_max es la talla máxima de especies de peces y la variable
respuesta es la proporción del consumo de peces teleósteos de cada especie.
El efecto aleatorio es anidado de géneros y familias taxonómicas de
especies (género dentro de familia). El problema que tengo es que los
gamlss no toman el efecto aleatorio como random(Familia/Genero) o
(1|Familia/Genero), sino como:
m2<-gamlss(Teleosteos ~ cs(LT_max)+
random(Familia,lambda=T)+random(Familia:Gene...
2011 Jul 08
3
Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey
Queridos R-users:
Tengo una duda que hace mucho tiempo que estoy intentando resolver, os
explico a modo de ejemplo:
Tengo estos efectos: Año(5 niveles),Localidad (10 niveles) y genotipo
(3 niveles), año y localidad son aleatorios y genotipo es fijo (los he
escogido yo).
Me gustaría hacer obtener una tabla parecida a la Tabla Anova donde
aparezca cada factor y sus interacciones y finalmente hacer un
comparación de medias del efecto fijo y del efecto Localidad. NO ser
si es posible hacer tal cosa con los efectos al...
2013 Dec 18
2
Generación de vectores aleatorios dependientes
Reciban un saludo cordial.
Por favor, ¿en cuál biblioteca de R existe una función para generar
vectores aleatorios correlacionados, por ejemplo (X,Y), con X~Weibull y
Y~Lognormal y corr(X,Y) = 0.7?
Gracias desde ya por su atención/ayuda.
César Escalante C.
[[alternative HTML version deleted]]
2012 Mar 19
9
Efectos fijos y aleatorios en un modelo lineal
Hola a todos,
Tengo algunas dudas sobre como introducir en un modelo lineal factores
con efectos fijos y aleatorios. Mi diseño es el siguiente:
Factores
Line: 40 líneas de trigo (Fijo)
Rep: 3 Bloques (Aleatorio)
Year: 2 Años (Aleatorio)
Variable dependiente
alpha.ug.mg
Nota: Adjunto tabla de datos
Dentro del diseño, 'Rep' y 'Year' se considera de efectos aleatorios y
'Line' e...
2013 Jun 30
0
EFECTO ANIDADO ALEATORIO SOBRE FIJO
Estimados quería realizarles la siguiente consulta:
1) ¿es posible dentro de un modelo con enfoque bayesiano, anidar un efecto
con distribución multivariada ("aleatorio" en términos frecuentistas) sobre
un factor de distribución no multivariada (fijo en términos frecuentistas)
en R?
.
Trabajo sobre datos de competencia en enduro y dispongo de una variable Año
(33 niveles) y una variable Reglamento (3 niveles) y la distribución de
datos es la siguiente:...
2015 Mar 24
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Aleatoriedad
Hola de nuevo, ya empiezo a ser pesado ¿no? bueno, no importa porque
aprendemos todos. Eso, al menos, me parece.
Hoy estuve estudiando en R el tema de la aleatoriedad. Veo que hay
múltiples posibilidades pero me están chocando mucho. Encuentro que el
generador de números pseudo aleatorios es más pseudo de lo que debería.
Me explico, quiero generar 0 y 1 aleatorios. Estoy trabajando con una
martingala.
Uso x <- runif(1,0,1) y después según cual sea la probabilidad de ganar
elijo el punto de división del intervalo apropiado.
Bien, los modelos que extraigo no me parecen coheren...
2011 Jul 08
0
Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey a claración de las datos
...on Producción neta, Peso de 100
semillas y Proteína.
Tercero: Observo los mismos genotipos (G) en varios años (A) en las
misma localidades (L). La especie es Phaseolus vulgaris L., en forma
de judía seca, por lo que cada año se planta y se recolecta.
Con el lme no ser introducir dos efectos aleatorios, ni su
interacción; y en el caso de que no exista significación en ninguna
interacción con G, como podría hacer la comparación múltiple de medias.
Muchas gracias de nuevo y gracias por el comentario Olivier Nuñez.
Marçal Plans
--
UPC-ESAB.
Campus del Baix Llobregat . Edifici D4. C. Esteve...
2013 Dec 18
0
Generación de vectores aleatorios dependientes
...rix and
marginal distributions
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El 18 de diciembre de 2013, 12:42, Cesar Escalante
<c.escalante.c@gmail.com>escribió:
> Reciban un saludo cordial.
>
> Por favor, ¿en cuál biblioteca de R existe una función para generar
> vectores aleatorios correlacionados, por ejemplo (X,Y), con X~Weibull y
> Y~Lognormal y corr(X,Y) = 0.7?
>
> Gracias desde ya por su atención/ayuda.
>
> César Escalante C.
>
> [[alternative HTML version deleted]]
>
>
> _______________________________________________
> R-help-e...
2010 Apr 14
3
pdMat
Alguien tiene experiencia en escribir una pdMat. Para aquellos que no lo
recuerden son las matrices de covarianzas de los efectos aleatorios que
ajusta la función lme de la librería nlme
Estas matrices tiene especial importancia en aplicaciones de genética de
poblaciones y en particular en mapeo de asociación. Pinheiro y Bates dicen
que el usuario puede crear sus propias pdMat y sugiere como ejemplo ver una
pdDiag, pero cuando abro una...
2013 Nov 19
1
Generación de números aleatorios. Mixtura k-puntos
Saludo cordial para cada uno.
Les pido ayuda para generar números aleatorios de una mixtura k-puntos.
Sabemos que la función de distribución F es una mixtura k-puntos si es de
la forma F(x) = p_1 F_1(x) + p_2 F_2(x) + … + p_k F_k(x), donde F_j es una
función de distribución de probabilidad, p_j > 0 y suma(p_j) = 1, para j =
1, 2, …, k.
En mi caso particular F es la...
2008 Oct 27
1
Problem with script
...if(random_matrix[x_list[random_sq]-1, y_list[random_sq]]== 0 ||
random_matrix[x_list[random_sq] + 1, y_list[random_sq]] == 0 ||
random_matrix[x_list[random_sq], y_list[random_sq] + 1] == 0 ||
random_matrix[x_list[random_sq], y_list[random_sq] - 1] == 0) {
aleatorio <- runif(1)
if (aleatorio < 1) {
if (random_matrix[x_list[random_sq],y_list[random_sq]-1]== 0 ) {
random_matrix[x_list[random_sq], y_list[random_sq] - 1] <- 1
flag <- 1
range_counter <- range_counter + 1
x_list[range_counter] <...
2010 Sep 24
7
help
...2: In pf(q, df1, df2, lower.tail, log.p) : NaNs produced
3: In pf(q, df1, df2, lower.tail, log.p) : NaNs produced
Y hasta aquí llegue. Veo que algo está mal con la distribución de los
grados de libertad, ¿Qué es lo que tendría que odificar para resolver
el problema? ¿Están mal elegidos los efectos aleatorios? ¿Tendría que
usar otra formulación del modelo u otro modelo?
Muchas gracias a todos
Saludos
Santiago
--
Santiago. L. Poggio
Ing. Agr., Dr.
CONICET - Cátedra de Producción Vegetal
Departamento de Producción Vegetal
Facultad de Agronomía
Universidad de Buenos Aires
Av. San Martín 4453
(C1417DSE...
2013 Feb 04
10
duda con lmer. Añadir predictor a nivel de grupos
Hola a todos.
Estoy utilizando la función lmer del paquete lme4 para ajustar un modelo
mixto.
Tengo varias variables en mi data.frame, unas son a nivel individual y
otras a nivel de comarcas. Listo algunas.
ingre_6 : Ingresos (nivel individual)
iscs_a : un indicador sintético resumen de otras variables, calculado
mediante componentes principales.
sau_com : superficie agraria útil de cada una
2016 Dec 05
2
Suma condicionada.-
Hola comunidad,
Les consulto mi duda. Quisiera generar N números aleatorios tal que su suma
esté predeterminada a un valor k. Sé que con la distribución Dirichlet, por
ejemplo, se podrían obtener números aleatorios tal que su suma es la
unidad. Por ejemplo
MCMCpack::rdirichlet(1,rep(10,7))
genera 7 números tal que su suma es 1 (el parámetro rep(10,7) es cualquier
cosa)....
2015 Jun 10
2
Duda glmer
...cuado he simulado unos datos. En
primer lugar, trato de clasificar las observaciones en las categorías de
Y1 mediante un glm y obtengo estimadores de los coeficientes que son muy
similares a los valores simulados, como era esperable.
Sin embargo, cuando trato de utilizar un glmer con un intercepto
aleatorio y pendientes fijas para tratar de distinguir entre categorías,
obtengo estimadores muy alejados de los valores simulados.
He leído mucha de la bibliografía específica (por ejemplo, los capítulos
relacionados con los glmer de los libros de Bates o Goldstein) y he
buscado por internet pero no logro...
2015 Mar 02
3
PERMUTACIONES EN R
...ción con lo siguiente:
Tengo un vector dicotomico (Binario) con la siguiente información que me
surgio de algunos procesos anteriores:
> MuestraS
[1] 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1
Ahora necesito hallar todas las posibles combinaciones que se puedan hacer
con estos elementos para luego hacer un muestro aleatorio simple con
reemplazo y seleccionar algunas de las posibles muestras que se obtengan.
Agradezco me puedan ayudar con este asunto
Saludos,
DC.
[[alternative HTML version deleted]]
2015 Jul 13
2
Crear datos aleatorios con restriciones
Hola,
Esta pregunta la hice en stackoverflow
<http://stackoverflow.com/questions/31137940/randomly-assign-teachers-to-classrooms-imposing-restrictions/31143808#31143808>pero
nadie pudo contestarla.
1. Quiero generar N escuelas, con G grados y C divisiones.
2. Quiero asignar cada uno de T maestros a 2 divisiones en un grado y
escuela
Si tengo C=4 divisiones, puedo lograr lo que quiero con
2013 Dec 22
3
generacion aleatoria de coordenadas
Hola a todos
He estado trabajando con el paquete osmar y funciona muy bien.Puede alguien decirme donde encontrar informacion o algun script para generar una lista con N pares de puntos (longitud/latitud) aleatorios o siguiendo una funcion determinada dentro del marco de coordenadas definido por corner_bbox(left, bottom, right, top) para despues plotearlos.
saludos
eloy ortiz
--
Este mensaje le ha llegado mediante el servicio de correo electronico que ofrece Infomed para respaldar el cumplimiento de la...
2014 Oct 28
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duda (URGENTE) R
Hola quisiera saber de que manera puedo generar numeros aleatorios enteros entre 0 y 4, para completar una matriz de un automata celular
Muchas gracias
Juan Nicolás Corral GómezEstudiante Carrera de EcologíaPontificia Universidad Javeriana
[[alternative HTML version deleted]]
2014 Oct 19
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Warnings en GLMM (lme4)
Hola,
Soy nuevo manejando R y no tengo mucha experiencia. Estoy intentando modelar una función que me relacione el nº de cebas (nº de presas que los padres traen a los pollos) con el tamaño de parche de un bosque (factor categórico; 2 niveles= grande y pequeño). Al ser un conteo (nº de cebas) he pensado utilizar familia= poisson con link= logarítmico. He construido un GLMM con: Nº de cebas