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2016 Mar 07
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Efectos aleatorios anidados en gamlss
Hola a tod en s, tengo una duda que la comunidad R me puede ayudar. Estoy trabajando con gamlss, porque tengo una variable respuesta con valores entre 0 y 1 e incluidos estos. La distribución que utilizo com gamlss para este caso es "beta inflated" (Stasinopulos and Rigby 2007. Journal of Statistical Software 23(7)). El modelo que intento correr es: m1<-gamlss(Teleosteos ~
2011 Jul 08
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Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey
Queridos R-users: Tengo una duda que hace mucho tiempo que estoy intentando resolver, os explico a modo de ejemplo: Tengo estos efectos: Año(5 niveles),Localidad (10 niveles) y genotipo (3 niveles), año y localidad son aleatorios y genotipo es fijo (los he escogido yo). Me gustaría hacer obtener una tabla parecida a la Tabla Anova donde aparezca cada factor y sus interacciones y finalmente hacer un comparación de medias del efecto fijo y del efecto Localidad. NO ser si es posible hacer tal cosa con los efectos ale...
2013 Dec 18
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Generación de vectores aleatorios dependientes
Reciban un saludo cordial. Por favor, ¿en cuál biblioteca de R existe una función para generar vectores aleatorios correlacionados, por ejemplo (X,Y), con X~Weibull y Y~Lognormal y corr(X,Y) = 0.7? Gracias desde ya por su atención/ayuda. César Escalante C. [[alternative HTML version deleted]]
2012 Mar 19
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Efectos fijos y aleatorios en un modelo lineal
Hola a todos, Tengo algunas dudas sobre como introducir en un modelo lineal factores con efectos fijos y aleatorios. Mi diseño es el siguiente: Factores Line: 40 líneas de trigo (Fijo) Rep: 3 Bloques (Aleatorio) Year: 2 Años (Aleatorio) Variable dependiente alpha.ug.mg Nota: Adjunto tabla de datos Dentro del diseño, 'Rep' y 'Year' se considera de efectos aleatorios y 'Line' es...
2013 Jun 30
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EFECTO ANIDADO ALEATORIO SOBRE FIJO
Estimados quería realizarles la siguiente consulta: 1) ¿es posible dentro de un modelo con enfoque bayesiano, anidar un efecto con distribución multivariada ("aleatorio" en términos frecuentistas) sobre un factor de distribución no multivariada (fijo en términos frecuentistas) en R? . Trabajo sobre datos de competencia en enduro y dispongo de una variable Año (33 niveles) y una
2015 Mar 24
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Aleatoriedad
Hola de nuevo, ya empiezo a ser pesado ¿no? bueno, no importa porque aprendemos todos. Eso, al menos, me parece. Hoy estuve estudiando en R el tema de la aleatoriedad. Veo que hay múltiples posibilidades pero me están chocando mucho. Encuentro que el generador de números pseudo aleatorios es más pseudo de lo que debería. Me explico, quiero generar 0 y 1 aleatorios. Estoy trabajando con una martingala. Uso x <- runif(1,0,1) y después según cual sea la probabilidad de ganar elijo el punto de división del intervalo apropiado. Bien, los modelos que extraigo no me parecen coherent...
2011 Jul 08
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Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey a claración de las datos
...on Producción neta, Peso de 100 semillas y Proteína. Tercero: Observo los mismos genotipos (G) en varios años (A) en las misma localidades (L). La especie es Phaseolus vulgaris L., en forma de judía seca, por lo que cada año se planta y se recolecta. Con el lme no ser introducir dos efectos aleatorios, ni su interacción; y en el caso de que no exista significación en ninguna interacción con G, como podría hacer la comparación múltiple de medias. Muchas gracias de nuevo y gracias por el comentario Olivier Nuñez. Marçal Plans -- UPC-ESAB. Campus del Baix Llobregat . Edifici D4. C. Esteve...
2013 Dec 18
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Generación de vectores aleatorios dependientes
...rix and marginal distributions Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 18 de diciembre de 2013, 12:42, Cesar Escalante <c.escalante.c@gmail.com>escribió: > Reciban un saludo cordial. > > Por favor, ¿en cuál biblioteca de R existe una función para generar > vectores aleatorios correlacionados, por ejemplo (X,Y), con X~Weibull y > Y~Lognormal y corr(X,Y) = 0.7? > > Gracias desde ya por su atención/ayuda. > > César Escalante C. > > [[alternative HTML version deleted]] > > > _______________________________________________ > R-help-es...
2010 Apr 14
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pdMat
Alguien tiene experiencia en escribir una pdMat. Para aquellos que no lo recuerden son las matrices de covarianzas de los efectos aleatorios que ajusta la función lme de la librería nlme Estas matrices tiene especial importancia en aplicaciones de genética de poblaciones y en particular en mapeo de asociación. Pinheiro y Bates dicen que el usuario puede crear sus propias pdMat y sugiere como ejemplo ver una pdDiag, pero cuando abro una...
2013 Nov 19
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Generación de números aleatorios. Mixtura k-puntos
Saludo cordial para cada uno. Les pido ayuda para generar números aleatorios de una mixtura k-puntos. Sabemos que la función de distribución F es una mixtura k-puntos si es de la forma F(x) = p_1 F_1(x) + p_2 F_2(x) + … + p_k F_k(x), donde F_j es una función de distribución de probabilidad, p_j > 0 y suma(p_j) = 1, para j = 1, 2, …, k. En mi caso particular F es la...
2008 Oct 27
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Problem with script
Hello :-) I am trying to run the next script, it generates "random areas" inside a map of the american continent, and then plot it, it?s suppose that every frame gives you the evolution of the program but at some point it stops with the weirdest of the errors I?ve ever seen in R, I don?t even have a line like that :-| Error in if (random_matrix[x_list[random_sq] - 1,
2010 Sep 24
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help
...2: In pf(q, df1, df2, lower.tail, log.p) : NaNs produced 3: In pf(q, df1, df2, lower.tail, log.p) : NaNs produced Y hasta aquí llegue. Veo que algo está mal con la distribución de los grados de libertad, ¿Qué es lo que tendría que odificar para resolver el problema? ¿Están mal elegidos los efectos aleatorios? ¿Tendría que usar otra formulación del modelo u otro modelo? Muchas gracias a todos Saludos Santiago -- Santiago. L. Poggio Ing. Agr., Dr. CONICET - Cátedra de Producción Vegetal Departamento de Producción Vegetal Facultad de Agronomía Universidad de Buenos Aires Av. San Martín 4453 (C1417DSE)...
2013 Feb 04
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duda con lmer. Añadir predictor a nivel de grupos
Hola a todos. Estoy utilizando la función lmer del paquete lme4 para ajustar un modelo mixto. Tengo varias variables en mi data.frame, unas son a nivel individual y otras a nivel de comarcas. Listo algunas. ingre_6 : Ingresos (nivel individual) iscs_a : un indicador sintético resumen de otras variables, calculado mediante componentes principales. sau_com : superficie agraria útil de cada una
2016 Dec 05
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Suma condicionada.-
Hola comunidad, Les consulto mi duda. Quisiera generar N números aleatorios tal que su suma esté predeterminada a un valor k. Sé que con la distribución Dirichlet, por ejemplo, se podrían obtener números aleatorios tal que su suma es la unidad. Por ejemplo MCMCpack::rdirichlet(1,rep(10,7)) genera 7 números tal que su suma es 1 (el parámetro rep(10,7) es cualquier cosa)....
2015 Jun 10
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Duda glmer
Hola, Tengo una base de datos con estructura jerárquica en la que quiero clasificar observaciones en distintas categorías. En el caso más simple, tengo una variable con dos categorías (variable Y1) y dentro de cada una de ellas hay otras dos categorías (variable Y2). Además tengo una variable explicativa cuantitativa discreta X. El banco de datos sería de este tipo: X Y1 Y2 5 0 1 9 0 0 2
2015 Mar 02
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PERMUTACIONES EN R
Buena tarde amigos, En días pasados hice algunas consultas y ya pude salir de las dudas que tenia en ese momento, ahora requiero de su colaboración con lo siguiente: Tengo un vector dicotomico (Binario) con la siguiente información que me surgio de algunos procesos anteriores: > MuestraS [1] 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1 Ahora necesito hallar todas las posibles combinaciones que se puedan hacer con
2015 Jul 13
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Crear datos aleatorios con restriciones
Hola, Esta pregunta la hice en stackoverflow <http://stackoverflow.com/questions/31137940/randomly-assign-teachers-to-classrooms-imposing-restrictions/31143808#31143808>pero nadie pudo contestarla. 1. Quiero generar N escuelas, con G grados y C divisiones. 2. Quiero asignar cada uno de T maestros a 2 divisiones en un grado y escuela Si tengo C=4 divisiones, puedo lograr lo que quiero con
2013 Dec 22
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generacion aleatoria de coordenadas
Hola a todos He estado trabajando con el paquete osmar y funciona muy bien.Puede alguien decirme donde encontrar informacion o algun script para generar una lista con N pares de puntos (longitud/latitud) aleatorios o siguiendo una funcion determinada dentro del marco de coordenadas definido por corner_bbox(left, bottom, right, top) para despues plotearlos. saludos eloy ortiz -- Este mensaje le ha llegado mediante el servicio de correo electronico que ofrece Infomed para respaldar el cumplimiento de las...
2014 Oct 28
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duda (URGENTE) R
Hola quisiera saber de que manera puedo generar numeros aleatorios enteros entre 0 y 4, para completar una matriz de un automata celular Muchas gracias Juan Nicolás Corral GómezEstudiante Carrera de EcologíaPontificia Universidad Javeriana [[alternative HTML version deleted]]
2014 Oct 19
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Warnings en GLMM (lme4)
Hola, Soy nuevo manejando R y no tengo mucha experiencia. Estoy intentando modelar una función que me relacione el nº de cebas (nº de presas que los padres traen a los pollos) con el tamaño de parche de un bosque (factor categórico; 2 niveles= grande y pequeño). Al ser un conteo (nº de cebas) he pensado utilizar familia= poisson con link= logarítmico. He construido un GLMM con: Nº de cebas