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2016 Mar 07
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Efectos aleatorios anidados en gamlss
Hola a tod en s,
tengo una duda que la comunidad R me puede ayudar. Estoy trabajando con
gamlss, porque tengo una variable respuesta con valores entre 0 y 1 e
incluidos estos. La distribución que utilizo com gamlss para este caso es
"beta inflated" (Stasinopulos and Rigby 2007. Journal of Statistical
Software 23(7)). El modelo que intento correr es:
m1<-gamlss(Teleosteos ~
2011 Jul 08
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Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey
Queridos R-users:
Tengo una duda que hace mucho tiempo que estoy intentando resolver, os
explico a modo de ejemplo:
Tengo estos efectos: Año(5 niveles),Localidad (10 niveles) y genotipo
(3 niveles), año y localidad son aleatorios y genotipo es fijo (los he
escogido yo).
Me gustaría hacer obtener una tabla parecida a la Tabla Anova donde
aparezca cada factor y sus interacciones y finalmente hacer un
comparación de medias del efecto fijo y del efecto Localidad. NO ser
si es posible hacer tal cosa con los efectos ale...
2013 Dec 18
2
Generación de vectores aleatorios dependientes
Reciban un saludo cordial.
Por favor, ¿en cuál biblioteca de R existe una función para generar
vectores aleatorios correlacionados, por ejemplo (X,Y), con X~Weibull y
Y~Lognormal y corr(X,Y) = 0.7?
Gracias desde ya por su atención/ayuda.
César Escalante C.
[[alternative HTML version deleted]]
2012 Mar 19
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Efectos fijos y aleatorios en un modelo lineal
Hola a todos,
Tengo algunas dudas sobre como introducir en un modelo lineal factores
con efectos fijos y aleatorios. Mi diseño es el siguiente:
Factores
Line: 40 líneas de trigo (Fijo)
Rep: 3 Bloques (Aleatorio)
Year: 2 Años (Aleatorio)
Variable dependiente
alpha.ug.mg
Nota: Adjunto tabla de datos
Dentro del diseño, 'Rep' y 'Year' se considera de efectos aleatorios y
'Line' es...
2013 Jun 30
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EFECTO ANIDADO ALEATORIO SOBRE FIJO
Estimados quería realizarles la siguiente consulta:
1) ¿es posible dentro de un modelo con enfoque bayesiano, anidar un efecto
con distribución multivariada ("aleatorio" en términos frecuentistas) sobre
un factor de distribución no multivariada (fijo en términos frecuentistas)
en R?
.
Trabajo sobre datos de competencia en enduro y dispongo de una variable Año
(33 niveles) y una
2015 Mar 24
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Aleatoriedad
Hola de nuevo, ya empiezo a ser pesado ¿no? bueno, no importa porque
aprendemos todos. Eso, al menos, me parece.
Hoy estuve estudiando en R el tema de la aleatoriedad. Veo que hay
múltiples posibilidades pero me están chocando mucho. Encuentro que el
generador de números pseudo aleatorios es más pseudo de lo que debería.
Me explico, quiero generar 0 y 1 aleatorios. Estoy trabajando con una
martingala.
Uso x <- runif(1,0,1) y después según cual sea la probabilidad de ganar
elijo el punto de división del intervalo apropiado.
Bien, los modelos que extraigo no me parecen coherent...
2011 Jul 08
0
Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey a claración de las datos
...on Producción neta, Peso de 100
semillas y Proteína.
Tercero: Observo los mismos genotipos (G) en varios años (A) en las
misma localidades (L). La especie es Phaseolus vulgaris L., en forma
de judía seca, por lo que cada año se planta y se recolecta.
Con el lme no ser introducir dos efectos aleatorios, ni su
interacción; y en el caso de que no exista significación en ninguna
interacción con G, como podría hacer la comparación múltiple de medias.
Muchas gracias de nuevo y gracias por el comentario Olivier Nuñez.
Marçal Plans
--
UPC-ESAB.
Campus del Baix Llobregat . Edifici D4. C. Esteve...
2013 Dec 18
0
Generación de vectores aleatorios dependientes
...rix and
marginal distributions
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El 18 de diciembre de 2013, 12:42, Cesar Escalante
<c.escalante.c@gmail.com>escribió:
> Reciban un saludo cordial.
>
> Por favor, ¿en cuál biblioteca de R existe una función para generar
> vectores aleatorios correlacionados, por ejemplo (X,Y), con X~Weibull y
> Y~Lognormal y corr(X,Y) = 0.7?
>
> Gracias desde ya por su atención/ayuda.
>
> César Escalante C.
>
> [[alternative HTML version deleted]]
>
>
> _______________________________________________
> R-help-es...
2010 Apr 14
3
pdMat
Alguien tiene experiencia en escribir una pdMat. Para aquellos que no lo
recuerden son las matrices de covarianzas de los efectos aleatorios que
ajusta la función lme de la librería nlme
Estas matrices tiene especial importancia en aplicaciones de genética de
poblaciones y en particular en mapeo de asociación. Pinheiro y Bates dicen
que el usuario puede crear sus propias pdMat y sugiere como ejemplo ver una
pdDiag, pero cuando abro una...
2013 Nov 19
1
Generación de números aleatorios. Mixtura k-puntos
Saludo cordial para cada uno.
Les pido ayuda para generar números aleatorios de una mixtura k-puntos.
Sabemos que la función de distribución F es una mixtura k-puntos si es de
la forma F(x) = p_1 F_1(x) + p_2 F_2(x) + … + p_k F_k(x), donde F_j es una
función de distribución de probabilidad, p_j > 0 y suma(p_j) = 1, para j =
1, 2, …, k.
En mi caso particular F es la...
2008 Oct 27
1
Problem with script
Hello :-) I am trying to run the next script, it generates "random
areas" inside a map of the american continent,
and then plot it, it?s suppose that every frame gives you the evolution
of the program but at some point it stops
with the weirdest of the errors I?ve ever seen in R, I don?t even have a
line like that :-|
Error in if (random_matrix[x_list[random_sq] - 1,
2010 Sep 24
7
help
...2: In pf(q, df1, df2, lower.tail, log.p) : NaNs produced
3: In pf(q, df1, df2, lower.tail, log.p) : NaNs produced
Y hasta aquí llegue. Veo que algo está mal con la distribución de los
grados de libertad, ¿Qué es lo que tendría que odificar para resolver
el problema? ¿Están mal elegidos los efectos aleatorios? ¿Tendría que
usar otra formulación del modelo u otro modelo?
Muchas gracias a todos
Saludos
Santiago
--
Santiago. L. Poggio
Ing. Agr., Dr.
CONICET - Cátedra de Producción Vegetal
Departamento de Producción Vegetal
Facultad de Agronomía
Universidad de Buenos Aires
Av. San Martín 4453
(C1417DSE)...
2013 Feb 04
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duda con lmer. Añadir predictor a nivel de grupos
Hola a todos.
Estoy utilizando la función lmer del paquete lme4 para ajustar un modelo
mixto.
Tengo varias variables en mi data.frame, unas son a nivel individual y
otras a nivel de comarcas. Listo algunas.
ingre_6 : Ingresos (nivel individual)
iscs_a : un indicador sintético resumen de otras variables, calculado
mediante componentes principales.
sau_com : superficie agraria útil de cada una
2016 Dec 05
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Suma condicionada.-
Hola comunidad,
Les consulto mi duda. Quisiera generar N números aleatorios tal que su suma
esté predeterminada a un valor k. Sé que con la distribución Dirichlet, por
ejemplo, se podrían obtener números aleatorios tal que su suma es la
unidad. Por ejemplo
MCMCpack::rdirichlet(1,rep(10,7))
genera 7 números tal que su suma es 1 (el parámetro rep(10,7) es cualquier
cosa)....
2015 Jun 10
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Duda glmer
Hola,
Tengo una base de datos con estructura jerárquica en la que quiero
clasificar observaciones en distintas categorías.
En el caso más simple, tengo una variable con dos categorías (variable
Y1) y dentro de cada una de ellas hay otras dos categorías (variable
Y2). Además tengo una variable explicativa cuantitativa discreta X.
El banco de datos sería de este tipo:
X Y1 Y2
5 0 1
9 0 0
2
2015 Mar 02
3
PERMUTACIONES EN R
Buena tarde amigos,
En días pasados hice algunas consultas y ya pude salir de las dudas que
tenia en ese momento, ahora requiero de su colaboración con lo siguiente:
Tengo un vector dicotomico (Binario) con la siguiente información que me
surgio de algunos procesos anteriores:
> MuestraS
[1] 1 1 1 1 0 1 1 0 1 1
Ahora necesito hallar todas las posibles combinaciones que se puedan hacer
con
2015 Jul 13
2
Crear datos aleatorios con restriciones
Hola,
Esta pregunta la hice en stackoverflow
<http://stackoverflow.com/questions/31137940/randomly-assign-teachers-to-classrooms-imposing-restrictions/31143808#31143808>pero
nadie pudo contestarla.
1. Quiero generar N escuelas, con G grados y C divisiones.
2. Quiero asignar cada uno de T maestros a 2 divisiones en un grado y
escuela
Si tengo C=4 divisiones, puedo lograr lo que quiero con
2013 Dec 22
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generacion aleatoria de coordenadas
Hola a todos
He estado trabajando con el paquete osmar y funciona muy bien.Puede alguien decirme donde encontrar informacion o algun script para generar una lista con N pares de puntos (longitud/latitud) aleatorios o siguiendo una funcion determinada dentro del marco de coordenadas definido por corner_bbox(left, bottom, right, top) para despues plotearlos.
saludos
eloy ortiz
--
Este mensaje le ha llegado mediante el servicio de correo electronico que ofrece Infomed para respaldar el cumplimiento de las...
2014 Oct 28
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duda (URGENTE) R
Hola quisiera saber de que manera puedo generar numeros aleatorios enteros entre 0 y 4, para completar una matriz de un automata celular
Muchas gracias
Juan Nicolás Corral GómezEstudiante Carrera de EcologíaPontificia Universidad Javeriana
[[alternative HTML version deleted]]
2014 Oct 19
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Warnings en GLMM (lme4)
Hola,
Soy nuevo manejando R y no tengo mucha experiencia. Estoy intentando modelar una función que me relacione el nº de cebas (nº de presas que los padres traen a los pollos) con el tamaño de parche de un bosque (factor categórico; 2 niveles= grande y pequeño). Al ser un conteo (nº de cebas) he pensado utilizar familia= poisson con link= logarítmico. He construido un GLMM con: Nº de cebas