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reconstruct
2024 Aug 13
1
Reconstrucción de hojas con herbivoría
...ozco de morfología vegetal, pero si supongo que la hoja es plana, me refiero que al verla sobre el eje se forma un rectángulo, la altura en cada parte de la hoja es la misma, a una misma densidad, puedo calcular la masa. En ese caso como siguieren, por medio de fotos y entrenar un modelo, se podía ?reconstruir? lo perdido.
Pero entiendo que las hojas no deben tener esa forma morfológica, tan plana, miro morfología vegetal en wikipedia y no está a simple vista mi duda, pero agrega nervadura, como una complicación más.
Aquí hay dos problemas, el cálculo realizado con su error, más el error de no tener la...
2024 Aug 13
1
Reconstrucción de hojas con herbivoría
...or sus respuestas Manuel y Javier.
El problema al que me enfrento es que a veces estas afectaciones por
herbivoría dejan cicatrices que pueden deformar la hoja, a veces se pliegan
sobre sí mismas y otras veces se pierde bastante la configuración de la
hoja. Por el momento solo me interesa tratar de reconstruir la hoja para
poder obtener el área que tendría esa hoja si no se hubiese afectado.
Cuento con hojas escaneadas de individuos sanos y defoliados, por así
decirlo, la idea mía es comparar los valores predichos de área foliar
reconstruida y estimar la pérdida de biomasa, aunque la biomasa lo puedo
hac...
2024 Aug 12
2
Reconstrucción de hojas con herbivoría
...modelo de reconstrucción del área de la
hoja para así estimar su masa seca en relación con esa área perdida y
obtener valores de pérdida de biomasa foliar.
Tengo algunas ideas, pero no sé cómo empezar.
Una de ellas es usar un algoritmo de machine learning para poder obtener un
modelo que me permita reconstruir el margen de la hoja, pero la verdad
desconozco mucho acerca de si puedo usar este método.
Les agradecería muchísimo si pudieran colaborarme con información o si
alguien puede darme una idea de cómo abordar este tema.
Saludos
Jimmy
[[alternative HTML version deleted]]
2024 Aug 13
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Reconstrucción de hojas con herbivoría
...del área de la
> hoja para así estimar su masa seca en relación con esa área perdida y
> obtener valores de pérdida de biomasa foliar.
> Tengo algunas ideas, pero no sé cómo empezar.
> Una de ellas es usar un algoritmo de machine learning para poder obtener un
> modelo que me permita reconstruir el margen de la hoja, pero la verdad
> desconozco mucho acerca de si puedo usar este método.
> Les agradecería muchísimo si pudieran colaborarme con información o si
> alguien puede darme una idea de cómo abordar este tema.
> Saludos
> Jimmy
>
> [[alternative HTML versi...
2019 Nov 28
4
Coeficientes GLM binomial
...l modelo.
Extraigo los coeficientes mediante:
x<-coefficients(m1.pile)
y los destransformo por que el GLM los transforma al decirle que es
binomial (es lo mismo que hace ?response? en el predict()... creo)
Coeficientes buenos <- exp(x)/(1+exp(x))
Hasta aquí todo teóricamente correcto ¿No?
Al reconstruir la formula del modelo con los coeficientes buenos me queda
esto:
0,0006077 + 0,7043138*temp + 0,9962766*pot + 0,5060756*time +
0,4923288*temp^2 + 0,4997649*temp^2*pot
Pero al calcular esta formula con unos valores concretos de temp, pot y
time, no me da los mismos valores que el predict con el mis...
2024 Aug 16
0
Reconstrucción de hojas con herbivoría
...para abordar el problema. Si ya de partida ves que no va a tener sentido,
> pues se abandona la idea y a por otra.
>
> Si las fotos que tienes de las hojas son de la misma especie, puedes
> estimar a partir de las hojas no afectadas el ratio de largo y ancho. Con
> este ratio podrías reconstruir el ancho de la hoja afectada por lo que veo
> se suele conservar el largo. Claro esto tendrá un margen de error, pero al
> menos tendrás una estimación del tamaño. De las hojas no afectadas, la
> relación ancho/largo estará asociada a un valor de superficie. Con estos
> cálculos de form...
2024 Aug 14
1
Reconstrucción de hojas con herbivoría
...tas Manuel y Javier.
>> > El problema al que me enfrento es que a veces estas afectaciones por herbivoría dejan cicatrices que pueden deformar la hoja, a veces se pliegan sobre sí mismas y otras veces se pierde bastante la configuración de la hoja. Por el momento solo me interesa tratar de reconstruir la hoja para poder obtener el área que tendría esa hoja si no se hubiese afectado. Cuento con hojas escaneadas de individuos sanos y defoliados, por así decirlo, la idea mía es comparar los valores predichos de área foliar reconstruida y estimar la pérdida de biomasa, aunque la biomasa lo puedo hac...
2024 Aug 15
1
Reconstrucción de hojas con herbivoría
...t; > El problema al que me enfrento es que a veces estas afectaciones por
>> herbivoría dejan cicatrices que pueden deformar la hoja, a veces se pliegan
>> sobre sí mismas y otras veces se pierde bastante la configuración de la
>> hoja. Por el momento solo me interesa tratar de reconstruir la hoja para
>> poder obtener el área que tendría esa hoja si no se hubiese afectado.
>> Cuento con hojas escaneadas de individuos sanos y defoliados, por así
>> decirlo, la idea mía es comparar los valores predichos de área foliar
>> reconstruida y estimar la pérdida de bio...
2024 Aug 15
3
Reconstrucción de hojas con herbivoría
...roblema al que me enfrento es que a veces estas afectaciones por
>>> herbivoría dejan cicatrices que pueden deformar la hoja, a veces se pliegan
>>> sobre sí mismas y otras veces se pierde bastante la configuración de la
>>> hoja. Por el momento solo me interesa tratar de reconstruir la hoja para
>>> poder obtener el área que tendría esa hoja si no se hubiese afectado.
>>> Cuento con hojas escaneadas de individuos sanos y defoliados, por así
>>> decirlo, la idea mía es comparar los valores predichos de área foliar
>>> reconstruida y estimar l...
2024 Aug 15
1
Reconstrucción de hojas con herbivoría
...el y Javier.
>>>> > El problema al que me enfrento es que a veces estas afectaciones por herbivoría dejan cicatrices que pueden deformar la hoja, a veces se pliegan sobre sí mismas y otras veces se pierde bastante la configuración de la hoja. Por el momento solo me interesa tratar de reconstruir la hoja para poder obtener el área que tendría esa hoja si no se hubiese afectado. Cuento con hojas escaneadas de individuos sanos y defoliados, por así decirlo, la idea mía es comparar los valores predichos de área foliar reconstruida y estimar la pérdida de biomasa, aunque la biomasa lo puedo hac...
2019 Dec 05
3
Coeficientes GLM binomial
...oefficients(m1.pile)
>> y los destransformo por que el GLM los transforma al decirle que es
>> binomial (es lo mismo que hace ?response? en el predict()... creo)
>> Coeficientes buenos <- exp(x)/(1+exp(x))
>>
>> Hasta aquí todo teóricamente correcto ¿No?
>> Al reconstruir la formula del modelo con los coeficientes buenos me queda
>> esto:
>> 0,0006077 + 0,7043138*temp + 0,9962766*pot + 0,5060756*time +
>> 0,4923288*temp^2 + 0,4997649*temp^2*pot
>>
>> Pero al calcular esta formula con unos valores concretos de temp, pot y
>> time,...
2019 Jan 13
2
Cómo replicar unos clusters según sistema anterior.
Puede que no me haya expresado certeramente. Es lo que pasa al tocar de
oído.
Tengo unos datos (df) de los que se alguien calculó unas distancias
(dis.df) de las que se hicieron/hacen unos clusters (plot.clus.dis.df).
Todo esto usando un programa on line al que no tengo acceso para ver cómo
hace los cálculos.
Yo tengo los datos, y el programa también me da la matriz de distancias.
Quiero,