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2018 Jan 17
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Random Forests
Buenas tardes a todos. El paquete randomForest tiene la función treesize, que es el nº de nodos. Me dan valores realmente elevados (en torno a 1000), y eso me parece extraño. ¿sabéis si es así? Gracias, Manuel -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID Spain
2015 Apr 23
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Usar una matriz sparse desde python a R
Hola erreros Estoy rizando el rizo con esto de las matrices sparse y he encontrado la forma de hacerlo en python, que va rapidísimo. Por tanto tengo una matriz sparse en un objeto python con esta info: <138493x26744 sparse matrix of type '<type 'numpy.int64'> Quiero hacer lo mismo con R pero me he topado con la lentitud de los bucles para rellenar la sparse (también por mi
2018 Jan 20
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Paquete pdp
Buenas. El Paquete pdp es muy fácil de usar, pero cuando se lo aplico a mis datos me da: Error in eval(stats::getCall(object)$data) : object 'x.data' not found. Os copio abajo un ejemplo de aplicación a un RF. El mio es de un boosted regression trees (paquete gbm). No sé si esa puede ser la razón del error. En el paquete pdp no especifica que sea solo para RF, aunque en los
2015 Apr 09
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A vueltas con los UTF-8 en RStudio
Hola, otra vez a vueltas con los UTF8, seguro que es un tema sempiterno de esta lista y que ya se ha contestado, regannadme por ello (y por escribir sin acentos). Genero un .rda en unix con el system default UTF8 y me lo traigo a un windows. Tengo el Rstudio en windows configurado con Global Options > Default text encoding UTF8. Cargo el .rda con load y nada, los acentos a la porra. Vamos, que
2016 Aug 11
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Comparación de probabilidades de supervivencia en R
Hola, Manuel, No entiendo tu pregunta (la repito aqui para que sea mas explicito): hay alguna forma de comparar la probabilidad de supervivencias (en este caso anual) entre grupos sin utilizar un chi-cuadrado y un valor de P. Entiendo que lo que hace survdiff es comparar las curvas de supervivencia, pero yo quiero comparar la probabilidad de supervivencia entre grupos al final del estudio. Con
2019 Feb 07
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Paquete de R que use la sintaxis de SQL
Buenas a todos, Tengo que adaptar un proyecto que esta en lenguaje de SQL Server a RStudio. En el transcurso de este procedimiento tengo que realizar algunas consultas bastante complejas seleccionando campos de varias tablas y utilizar algunas clausulas como EXCEPT o UNION ALL. También debo actualizar varios campos de tablas usando la sentencia UPDATE y eliminar tablas bien con usando DROP TABLE o
2014 Oct 08
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Pregunta sobre manipulación de shapefile
Oscar, al final no he podido esperar hasta mañana Con: library(maptools)library(sp) poligonos <- readShapeLines("C:\\...\\DATOS\\MUNICIPIO.shp") sink("C:\\ ... \\DATOS\\MUNICIPIO.csv") coordinates(poligonos) Consigo un fichero con la suficiente estructura para tratarlo fácilmente y de una tacada montar la tabla .csv tal y como he indicado en un correo anterior Necesito el
2018 Jan 20
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Random Forests
Gracias Carlos y Javier, ntrees es el nº de árboles y treesize sus respectivos tamaños (nº de nodos) ntree: Number of trees to grow. This should not be set to too small ...... treesize: Size of trees (number of nodes) in and ensemble. Puse 1000 árboles (ntree=1000), si, pero la función treesize te da el nº de nodos: treesize(RFfit, terminal=TRUE) me da un vector de 1000 elementos (uno
2016 Jul 11
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Esperanza de vida librería 'demography'
Buenos días, Necesito calcular la vida media de cada uno de nuestros modelos de producto pero tengo un histórico incompleto (para los productos más nuevos tengo la vida completa de las cohortes, pero para los más antiguos tengo sólo la parte final de la vida de las cohortes). He decidido calcular la esperanza de vida dinámica con un modelo actuarial, concretamente la librería 'demography'
2014 Oct 14
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Heatmap de paro (o de otra cosa) en España
Hola eRReRos, estamos preparando un talleR de coloR para el próximo congreso y pensamos que el mejor ejemplo sería un mapa de España de alguna variable interesante. Puesto que algunas de las cosas candentes que preocupan en España son (afortunadamente) casos únicos, se nos ocurre el gran problema del paro. Atención pregunta: ¿Hay algún script maravilloso publicado por ahí que nos permita
2014 Oct 16
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Heatmap de paro (o de otra cosa) en España
Hola Pedro. El INE cambió los ficheros de microdatos no hace mucho, aquí dejo como se haría ahora, (utilizando MicroDatosEs). Lo que cambia es la función para recodificar. http://rpubs.com/joscani/unemplrate El 15/10/14 a las #4, Carlos Ortega escribió: > Hola Pedro, > > Acabo de recordar que hace poco José Luis Cañadas (participa en esta lista) > publicó un enlace suyo a un
2015 Sep 29
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sobre fread {data.table}
Hola, M. Luz. Hay infinidad de motivos por los que se te puede cortar la lectura de un archivo de datos, pero los más habituales son encontrar un "#" o unas "" en los registros, o una línea toda en blanco. Lo primero yo creo que es dejar el archivo en texto plano (lo que te recomendaba Carlos de usar el original, no el docx), y buscar esos caracteres con un editor de texto
2017 Dec 20
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virt-customize error
Hi, I´m need to customize a debian qcow image, but I have this error virt-customize: error: no operating systems were found in the guest image The command that I´m trying is: virt-customize -v -x -a ./kvm_av_4_4_n0.qcow2 --attach ./one_context/packages.iso -root-password password:acens --run ./ctpd/pro/scripts/one_altavault.sh --firstboot-command "dpkg-reconfigure openssh-server I attach
2015 May 06
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Resumen de R-help-es, Vol 75, Envío 7
Vaya, polémica. ¿R puro es R base? Porque van ya por 6618 paquetes en CRAN http://cran.r-project.org/web/packages/index.html Y nadie sabe bien cuántos hay en github. Por cierto, ¿alguno conoce un código para hacer una estimación? El 06/05/2015 a las 16:09, Freddy Omar López Quintero escribió: 2015-05-06 11:00 GMT-03:00 Pedro Concejero Cerezo <pedro.concejerocerezo en
2015 Sep 29
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sobre fread {data.table}
También si nos envías el .rel nos ayudaría a ver qué pasa... Saludos, Carlos Ortega. El 29 de septiembre de 2015, 17:38, MªLuz Morales <mlzmrls en gmail.com> escribió: > De acuerdo, > voy a probarlo > Muchas gracias > > Saludos > MªLuz > > El 29 de septiembre de 2015, 17:31, Pedro Concejero Cerezo < > pedro.concejerocerezo en telefonica.com> escribió: >
2014 Oct 08
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Pregunta sobre manipulación de shapefile
Gracias Beatriz, efectivamente, lo que indicas en tu ejemplo es lo que obtengo al final de mi proceso. En todo caso pruebo tu opción con mis datos, si es como imagino seguro que es más rápida de montar y más elegante que tratar el resultado de un sink() (recuerdo que en su momento lo intenté con fotify pero no supe bien como atacarlo, no conocía el enlace que me mandas, por tanto lo pruebo de
2012 Nov 09
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(sin asunto)
Saludos, tengo un problema que no puedo resolver dentro del R Estoy creando una funcion que a partir de un objeto compuesto por diferentes matrices como el que esta a continuacion: [[1]] M1 M2 M3 M4 sp1 2 0 1 8 sp2 4 5 2 4 sp3 0 0 4 0 sp4 5 7 5 0 sp5 0 4 0 0 [[2]] M3 M2 M4 M1 sp1 1 0 8 2 sp2 2 5 4 4 sp3 4 0 0 0 sp4 5 7 0 5 sp5 0 4 0 0 [[3]]
2015 Sep 29
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sobre fread {data.table}
Y con fread.. directamente sobre el ".rel"... > datIn <- fread("DRUG-AE.rel") > dim(datIn) [1] 6821 8 Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 29 de septiembre de 2015, 18:45, Pedro Concejero Cerezo < pedro.concejerocerezo en telefonica.com> escribió: > No tiene cabecera. Tendrás que ponerle nombre a las variables > Prueba este código,
2018 Jan 20
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Random Forests
Si, Carlos. Yo hago lo mismo, pero esos mismos numeritos salen enormes. > treesize(RFfit) [1] 4304 4302 4311 4319 4343 4298 4298 4311 4349 4327 4331 4317 4294 4321 4283 4362 [17] 4300 4330 4266 4331 4308 4352 4294 4315 4372 4349 4331 4347 4329 4348 4298 4335 [33] 4346 4396 4345 4313 4293 4276 4353 4272 4304 4325 4317 4336 4308 4351 4374 4324 [49] 4386 4359 4311 4346 4300
2016 Aug 03
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¿Qué hace as.numeric()?
Tranquilo que no te han hackeado tu "R"... Simplemente que al importar tu CSV, no has indicado que los decimales son las ",". Y ese campo lo importa como un character (un string). Y cuando lo conviertes a numeric, el resultado es un tanto impredecible. Si utilizas read.table para importar, simplemente incluye el parámetro "dec" de esta forma "read.table(..... ,