search for: fastgreedi

Hi everyone, I am using the fastgreedy.community function to get the $merges matrix and the $modularity vector. This serves my purpose of testing modularity of my graph. But I am "greedy" to plot the heat map and dendrrogram based on the $merges dendogram matrix. I know that heatplot does the graphics part but I am not sure if the dendogram generated by the heatplot will match the one

Estimado Luisfo Chiroque Hay aristas múltiples, eso es por la preparación de los datos, es que separe por componentes, no me refiero al término componente estadístico, sino a descomposición de algo en los componentes que lo construyen, algunos son comunes y otros no, cuándo son comunes hay una relación en la red. Voy a probar con simplify, cuándo lo leí yo lo descarté, lo releeré, ¿Qué opina de

Estimados, estoy ?jugando? con unos datos clínicos donde realizo un análisis de redes, utilicé igraph como nerwork, pero finalmente uso igraph (creo que tiene más opciónes). Son algo de 200 nodos y algo más de 2000 relaciones. Puedo graficarlos. Los datos están de la siguiente forma, por ejemplo, individuo, patología, (las dos primeras columnas son la relación), luego un fármaco, el grupo

Estimados Copio un mensaje de error que da igraph, es más fácil verlo que explicarlo. > fastgreedy.community(udatos) Error in .Call("R_igraph_community_fastgreedy", graph, as.logical(merges), : At fast_community.c:553 : fast-greedy community finding works only on graphs without multiple edges, Invalid value > cluster_louvain(udatos) IGRAPH clustering multi level, groups: 7,