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2013 Aug 27
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Encontrar las variables más importantes en componentes principales
Hola compañeros de la lista. Qué tal. Tengo un análisis de componentes principales, en el que se evalúan aproximadamente 1000 variables. Usando la función dudi.pca e inertia.dudi obtengo una cantidad de información sobre la influencia de las variables sobre los dos componentes principales. Me gustaría saber si existe alguna función que sobre esta información me ar...
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Hola compañeros de la lista, qué tal. Estoy haciendo un análisis de componentes principales utilizando las funciones "dudi.pca" (paquete "ade4") y "PCA" (paquete "FactoMineR"). Sucede que al comparar las coordenadas de cada individuo que obtiene cada función, las que corresponden al segundo componente principal tienen idéntica magnit...
2013 May 28
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Ocultar componentes de una lista
Hola Javier, Creo que comprendio mal mi pregunta, quiero saber como ocultar algunos componentes de una lista producida por una funcion que uno crea, pero que solo esten ocultos y que pueda tener acceso a esos componentes cuando uso la funcion "str", la cual despliega todos los componentes de la lista. Además como hacer para que salga ordenado o de una forma preferida los componentes...
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
...abren los datos como por ejemplo data(bsetal97) ¿Qué piensan de eso? De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org] En nombre de Francesc Carmona Enviado el: Tuesday, October 01, 2013 7:30 AM Para: r-help-es en r-project.org Asunto: Re: [R-es] Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR Por definición la primera componente principal es una combinación lineal que maximiza la varianza de modo que si la componente 1 es el vector de coeficientes a, entonces, el vector -a también puede ser dicha componente. Las otras componentes, por ejemplo la seg...
2013 Oct 02
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
...ndría que > multiplicar por -1 todos los valores de las coordenadas > correspondientes al segundo componente de los individuos, por ejemplo, > de la función dudi.pca?... ¿de igual forma para las coordenadas de la > gráfica de correlaciones de las variables con los dos primeros > componentes?... ¿habría alguna forma de hacer esto desde el principio, > por ejemplo, al momento de llamar la función dudi.pca? > > De antemano muchas gracias por las aclaraciones. > > Saludos. > > -- > > Argel. > > El 01/10/13 06:30, Francesc Carmona escribió: &gt...
2013 Aug 29
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Resumen de R-help-es, Vol 54, Envío 22
Hola! No he podido consultar la doc. del paquete ade4, algo debe estar caído en CRAN ahora mismo. Dos cosas sobre la metodología -aun desconociendo los detalles de cómo lo hace ade4: El output de un PCA, los "pesos" de cada variable en las dimensiones de los componentes se interpretan como correlaciones, a mayor valor absoluto mayor asociación variable-componente. Ahora, como tales correlaciones ¿cómo decides que una es mucho mayor que otra o sólo un poquito? A lo que voy: no hay (vamos, no creo que haya) una forma "objetiva" de seleccionar unas versus o...
2013 Aug 29
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Encontrar las variables más importantes en componentes principales
...uot;ade4", que es la librería que entiendo estás utilizando. Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 27 de agosto de 2013 23:14, Argel Gastélum Arellánez < argel.gastelum@gmail.com> escribió: > Hola compañeros de la lista. Qué tal. > > Tengo un análisis de componentes principales, en el que se evalúan > aproximadamente 1000 variables. Usando la función dudi.pca e inertia.dudi > obtengo una cantidad de información sobre la influencia de las variables > sobre los dos componentes principales. Me gustaría saber si existe alguna > función que sobre esta i...
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Por definición la primera componente principal es una combinación lineal que maximiza la varianza de modo que si la componente 1 es el vector de coeficientes a, entonces, el vector -a también puede ser dicha componente. Las otras componentes, por ejemplo la segunda, es incorrelacionada con la primera y también maximiza la varianza, luego el signo no importa. Así pues, el signo de cada componente puede variar en función del algoritmo utilizado. Saludos cordiales Francesc El 01/10/13 02:32, Argel Gastélum Arellánez ha escrit: >...
2013 May 28
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Ocultar componentes de una lista
...pantalla es lo mismo que si hubieses escrito print(A). Tu objeto A es de la clase "nls". Por lo tanto, la función print a la que llamas es print.nls (dentro de las opciones que muestra methods(print)). Si escribes getAnywhere(print.nls) verás el código de dicha función, cuáles de los componentes de A muestra y de qué manera. Un saludo, Carlos J. Gil Bellosta http://www.datanalytics.com El día 28 de mayo de 2013 19:06, Gabriel Trujillo Paucar <gabriel_enter en hotmail.com> escribió: > Hola Javier, > > > > Creo que comprendio mal mi pregunta, quiero saber como ocultar...
2013 Mar 06
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almacenamiento en lista y funcion lapply
Estimados su ayuda, tengo un total de 20 matrices las cuales deseo colocarlas como componentes de la lista, es decir matrices<-list(matriz1,matriz2,matriz3,...,matriz20) existe alguna manera de hacer esto de manera automatica ya que puede que exista un mayor numero de matrices por ejemplo 100, donde el ingreso de una por una puede resultar un poco cansado. A su vez a las matrices ingres...
2016 Jul 25
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Duda sobre construccion de vectores
...z de partida es: M <- matrix(c(2,3,3,4,5,6,7,7,8,11,10,5), nrow = 3, ncol = 4) -Así pues se tiene que: M [,1] [,2] [,3] [,4][1,] 2 4 7 11[2,] 3 5 7 10[3,] 3 6 8 5 -Y el vector indicador es: Indicador <- c(2,3,3) -Me gustaría tener una nuevo vector, cuyos componentes fueran (si el vector se llamase Resultado) los siguientes: Resultado{1} 4 7 8 -Es decir sería la segunda componente del primer registro, la tercera componente del segundo registro y la tercera componente del tercer registro -No recuerdo si se digo hace tiempo algo de con la librería data.table, me...
2013 May 28
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Ocultar componentes de una lista
Saludos a todos, Quisiera saber como ocultar algunos componentes de una lista para que cuando crees una funcion solo se muestre una parte de esa lista, y que al resto tengas acceso cuando descompongas ese objeto, por ejemplo: Tengo la siguiente data: data=data.frame(Samples=1:10,Sobs=c(12.6,22.4,27.4,30.5,32.5,34.3,36,37.4,38.9,39.9)) Cuando uso la f...
2013 May 28
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Ocultar componentes de una lista
...concepto de clase y lo que ello implica en cuanto a funciones print, plot, etc. ésto te parecerá muy simple. Saludos. Eva --- El mar, 28/5/13, Gabriel Trujillo Paucar <gabriel_enter@hotmail.com> escribió: De: Gabriel Trujillo Paucar <gabriel_enter@hotmail.com> Asunto: [R-es] Ocultar componentes de una lista Para: "r-help-es@r-project.org" <r-help-es@r-project.org> Fecha: martes, 28 de mayo, 2013 18:25 Saludos a todos, Quisiera saber como ocultar algunos componentes de una lista para que cuando crees una funcion solo se muestre una parte de esa lista, y que al resto te...
2012 Jul 01
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Regresión lineal múltiple: modelo polinómico de grado 3 superpuesto a componentes cosenoidales
Hola:   Tengo un modelo de regresión lineal en el cual las componentes son cosenoidales, y lo construyo del siguiente modo:     modelo = "y ~ I(t) + I(t^2) + I(t^3) + x1[, 1] + x2[, 1]" x1[, 1] = cos(2 * pi * t / periods[1]) x2[, 1] = sin(2 * pi * t / periods[1]) for (i in 2:nComp) {   x1[, i] = cos(2 * pi * t / periods[i])   x2[, i] = sin(2 * pi * t / perio...
2013 May 28
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Ocultar componentes de una lista
...está fitted. ¿Usted pregunta algo como el siguiente ejemplo? fitted(A) O comprendí mal su pregunta. Javier Marcuzzi El 28 de mayo de 2013 13:25, Gabriel Trujillo Paucar < gabriel_enter@hotmail.com> escribió: > Saludos a todos, > > > > Quisiera saber como ocultar algunos componentes de una lista para que > cuando crees una funcion solo se muestre una parte de esa lista, y que al > resto tengas acceso cuando descompongas ese objeto, por ejemplo: > > > > Tengo la siguiente data: > > > > > data=data.frame(Samples=1:10,Sobs=c(12.6,22.4,27.4,30.5,32...
2016 Jul 25
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Duda sobre construccion de vectores
...rtida es: M <- matrix(c(2,3,3,4,5,6,7,7,8,11,10,5), nrow = 3, ncol = 4) -Así pues se tiene que: M [,1] [,2] [,3] [,4][1,] 2 4 7 11[2,] 3 5 7 10[3,] 3 6 8 5 -Y el vector indicador es: Indicador <- c(2,3,3) -Me gustaría tener una nuevo vector, cuyos componentes fueran (si el vector se llamase Resultado) los siguientes: Resultado{1} 4 7 8 -Es decir sería la segunda componente del primer registro, la tercera componente del segundo registro y la tercera componente del tercer registro -No recuerdo si se digo hace tiempo algo de con la librería data.table,...
2013 May 29
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Ocultar componentes de una lista
...print.nls) > > > > Esa es una de las dudas que tengo > > > Gabriel Antonio Trujillo Paucar > Estudiante de Biologia > 997603768 > > > > > > > Date: Tue, 28 May 2013 20:49:26 +0100 > From: evapcastro en yahoo.es > Subject: Re: [R-es] Ocultar componentes de una lista > To: r-help-es en r-project.org; gabriel_enter en hotmail.com > > > > > > > Perdón por el goteo. > > Gabriel, aquí tienes el código de nls: > > http://svn.r-project.org/R/trunk/src/library/stats/R/nls.R > > Si buscas "print.nls" verá...
2012 Mar 16
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Cosinor
...Cosinor Simple: Y = M + A * cos(2*pi*t/T + phi) + error Cuando T conocido, podemos asumir: Y = M + beta * X1 + gamma * X2 + error, siendo X1 = cos(2*pi*t/T) y X2 = sin(2*pi*t/T) En este caso (Cosinor simple) el modelado lo llevo a cabo del siguiente modo: lm( y ~ X1 + X2) Para el caso de componentes múltiples: Y = M + ?Aj * cos(2*pi*t/Tj + phij) + error Si Tj conocidos: Y = M + ?(betaj*X1j + gammaj * X2j) + error Modelado: y ~ x1tot+ x2tot, donde los xtot (x totales) resultan de la suma de los parciales (donde cada parcial corresponde a un Tj). Sin embargo, en el caso del modelo generaliz...
2012 May 01
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Coeficiente de determinación - Contribución parcial
...e) y buscando he encontrado partial.R2, en la librería asbio. ¿Alguien conoce su funcionamiento?. No  obtengo el resultado esperado, y creo que es porque sólo admite que los dos modelos que se pasan como parámetro difieran en una variable, y en mi caso difiere en 2, porque se trata de un cosinor de componentes múltiples, donde por tanto cada componente implica 2 variables en el modelo: una para el seno y otra para el coseno.   A ver si me podéis echar un cable.   Oscar: gracias por tus aportaciones con el tema de los gráficos y tablas. Aún no me he estudiado esos links pero seguro que me servirán de much...
2009 Nov 24
1
extraer un valor de un objeto lmer
> > Hola, a todos! Estoy ajustando un modelo componentes de varianza utilizando el paquete lme4, quiero extraer luego los valores estimados de varianza de cada factor aleatorio de este objeto lmer y guardarlo en un vector. Existe la función VarCorr, Esto es lo que hago: Mi ejemplo: tengo 3 factores NDVIaño; Máx.IH; TV # Ajusto el modelos lmer(peligro...