search for: abundancia

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2015 Mar 28
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Comparaciones múltiples
Saludos, tengo una base de datos con tres variables: especie, tratamiento y abundancia. Quiero hacer comparaciones múltiples con Tukey. Ya había usado el comando TukeyHSD(aov(x~y)). La cuestión esque ahora tengo varios niveles del factor especie y varios niveles del factor tratamiento. Si hago TukeyHSD(aov(abundancia~especie:tratamiento)) me salen todas las comparaciones posibles,...
2010 Jun 14
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Sintaxis para Medidas repetidas
Estimados, Mi problema consiste en probar efectos de dos sistemas de siembra en la abundancia de insectos (variable de conteo). Tengo un diseño en bloques con el sistema de siembra, con muestreo semanales de insectos (10 semanas) en cada unidad experimental. Quiero aplicar un modelo lineal generalizado con distribución de Poisson, con medidas repetidas en el tiempo. Agradecería ayuda con la...
2023 Dec 04
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Transformar una base de datos a matriz
...ada especie corresponde a una fila de la base de datos, por lo que cada muestra tiene un n?mero de filas correspondiente al n?mero de especies. Mi objetivo es transformar esa base de datos a un formato de matriz donde, cada muestra sea una fila ?nica y las especies sean las columnas, con su dato de abundancia para cada muestra. Lo equivalente en Excel es crear una tabla din?mica donde: muestras en filas, especies en columnas y abundancia en datos. Un saludo, y gracias de antemano. Antonio [[alternative HTML version deleted]]
2011 Feb 14
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MCMC glmm
...s? I'm searching in the notes available in the models but found no clear answer. My first approach to this wil be to wrote a formula like: Abundance~BA+CI+BA*CI. 2.- Even when I try to fit a model without interactions I can't do it because I obtain the following error: > fit<-MCMCglmm(Abundancia~BA+CI, random=NULL, > family="zapoisson",data=Trucha) Error in MCMCglmm(Abundancia ~ BA + CI, random = NULL, family = "zapoisson", : please use idh(trait):units or us(trait):units or trait:units for error structures involving multinomial data with more than 2 categories o...
2020 Apr 14
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desagregar distribución de frecuencias
Hola a tod en s, Trabajo con datos de abundancia (número de individuos) por tallas (medidas al medio centímetro inferior) de diferentes especies de peces y mis datos base son el número medido de peces por talla. Necesitaría vuestra ayuda para transformar las distribuciones de frecuencias de talla a los datos brutos que las generaían. Es d...
2015 Jul 27
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Como modificar valores en un data frame
Estimad en s, quería realizar una consulta Dado un data frame llamado aves, como puedo sustiuir las variables area, dist y distm por sus logaritmos en base10 y volver a crear un data frame? Muchas gracias Saludos Susana [[alternative HTML version deleted]]
2023 Dec 04
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Transformar una base de datos a matriz
...ada especie corresponde a una fila de la base de datos, por lo que cada muestra tiene un n?mero de filas correspondiente al n?mero de especies. Mi objetivo es transformar esa base de datos a un formato de matriz donde, cada muestra sea una fila ?nica y las especies sean las columnas, con su dato de abundancia para cada muestra. Lo equivalente en Excel es crear una tabla din?mica donde: muestras en filas, especies en columnas y abundancia en datos. Un saludo, y gracias de antemano. Antonio [[alternative HTML version deleted]] _______________________________________________ R-help-es mailing li...
2013 Sep 26
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overdispersión en glmm
Hola! Estoy con un problema con mis datos, tengo datos de abundancia y tengo que analizarlas con glmm. Uso la función glmmadmb() del paquete glmmADMB de R, que acepta varias familias de distribución. El problema es que al hacer los modelos, no me muestra el residual deviance ni los grados de libertad, para poder calcular la overdispersión. Alguien sabe cómo puedo ca...
2012 Jan 25
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gravy y modelos HOF
Hola, ¿Alguien ha usado el paquete gravy? En su caso: -¿ha corrido los modelos HOF con abundancias u otros datos continuos? (no solo con dato binomial de presencia-ausencia) - ¿conoce cuál es el sentido de ingresar en la matriz de las especies una columna con datos de las parcelas? Me gustaría entender mejor el arreglo de los datos que requieren las funciones. En especial porque quiero trabaja...
2020 May 03
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Fwd: Re: Fwd: Re: Instalar paquetes no disponibles para la versión actual
Hola a todos: Las versiones oficiales de R no son versiones beta, sino versiones "definitivas" convenientemente testadas. Los paquetes disponibles en el servidor de CRAN están testados contra la versión actual de R. Mantenerse en una versión anticuada normalmente conduce a la pérdida de funcionalidad, errores de dependencias entre versiones de paquetes nuevos etc. En R, actualizar