R help es - Oct 2024 - Error in .local(x, ...) invalid layer names

¡Buenas tardes!

Antes de nada, dar las gracias por permitirme participar en esta lista.

Soy un usuario recién llegado a R de la mano del análisis geoespacial. Soy un
arqueólogo que se ha topado con un package para R creado por un arqueólogo para
la ejecución de procesos para a creación de rutas de menor coste cuyo nombre es
leastcostpath y que se encuentra en el repositorio de GitHub. Contiene
diferentes scripts relacionados con esta cuestión.

En concreto, estoy intentando realizar un cálculo de tipo  FETE (from everywhere
to everywhere approach). Para ello he utilizado una capa de tipo ráster, en este
caso de costes, y otra de tipo vectorial con puntos. Ambas las he creado en
QGIS. La de costes es un mapa de pendientes en grados reclasificado. He usado
una capa de costes por ser la que se utiliza en algunos ejemplos de uso que he
visto, si bien en ellos se utiliza otra generada a partir de un mdt con la
aplicación de algún algoritmo, por el ejemplo el de Tobler. Esta se puede crear
con otro script incluido en el paquete, pero que no he sido capaz de ejecutar
porque me da error.

Tras cargar todos los packages necesarios en RStudio,  ejecuto el siguiente
código:

r <- raster("pendiente_grados_reclas.tif")
locs <- st_read("puntos.geojson")

lcps <- create_FETE_lcps(x = r, locations = locs, cost_distance = FALSE,
ncores = 1)

Y me da el siguiente mensaje de error:
"Error in .local(x, ...) invalid layer names"

El código usado es igual al que viene en la ayuda del script y los nombres de
las capas son iguales a las creadas, por lo que no comprendo el error. He estado
buscando por internet pero no encuentro nada parecido.

¿Alquien me podría ayudar a solucionarlo ? ¿O indicarme dónde puede estar el
problema?

Incluyo el texto de la ayuda en cuanto al uso del script por si resulta de
interés.

Usage
create_FETE_lcps(x, locations, cost_distance = FALSE, ncores = 1)

Arguments
x?????conductanceMatrix

locations???sf 'POINT' or 'MULTIPOINT', SpatVector, data.frame
or matrix containing the locations coordinates

cost_distance?????logical if TRUE computes total accumulated cost from origin to
destination. FALSE (default)

ncores??????numeric Number of cores used when calculating least-cost paths
from-everywhere-to-everywhere. 1 (default)

Un saludo

Andrés Ocaña Carretón





	[[alternative HTML version deleted]]

Hola, Andrés;
Mientras no aparezca algo más consistente de alguien que sepa de verdad, 
te hablo de tuerto a tuerto.

a) Por si no lo sabés, existe en Telegram un grupo de usuarios de R 
vinculado específicamente con el análisis espacial: @rspatial_es
Pero no me suena que haya arqueólogos. Así que podría pasar que el 
paquete no lo use nadie del grupo. Seguramente no de los usuarios más 
participativos.

b) Me fijé que el paquete no incluye ningún vignette, que es lo que yo 
suelo usar cuando no termino de entender cómo usarlo.

c) Vi que en la página del autor no linkea la página de CRAN, si no la 
de GitHJub, que no aparece mencionada en la de CRAN.
Por eso mismo te diría que confirmaras que lo que tenés instalado con 
los paquetes que tenés instalados puedan correr.
En el help de las funciones suele traer la opción de hacer correr un 
código mínimo, que también es práctico.

d) Capaz que este es el que más sobre: parece que a partir de la versión 
2 cambiaron los paquetes sobre los que corre, para que use terra y algún 
otro más.

Suerte!


Juan


24/10/14 17:20(e)an, Andrés Ocaña Carretón via R-help-es igorleak idatzi 
zuen:
> ¡Buenas tardes!
>
> Antes de nada, dar las gracias por permitirme participar en esta lista.
>
> Soy un usuario recién llegado a R de la mano del análisis geoespacial. Soy
un arqueólogo que se ha topado con un package para R creado por un arqueólogo
para la ejecución de procesos para a creación de rutas de menor coste cuyo
nombre es leastcostpath y que se encuentra en el repositorio de GitHub. Contiene
diferentes scripts relacionados con esta cuestión.
>
> En concreto, estoy intentando realizar un cálculo de tipo  FETE (from
everywhere to everywhere approach). Para ello he utilizado una capa de tipo
ráster, en este caso de costes, y otra de tipo vectorial con puntos. Ambas las
he creado en QGIS. La de costes es un mapa de pendientes en grados
reclasificado. He usado una capa de costes por ser la que se utiliza en algunos
ejemplos de uso que he visto, si bien en ellos se utiliza otra generada a partir
de un mdt con la aplicación de algún algoritmo, por el ejemplo el de Tobler.
Esta se puede crear con otro script incluido en el paquete, pero que no he sido
capaz de ejecutar porque me da error.
>
> Tras cargar todos los packages necesarios en RStudio,  ejecuto el siguiente
código:
>
> r <- raster("pendiente_grados_reclas.tif")
> locs <- st_read("puntos.geojson")
>
> lcps <- create_FETE_lcps(x = r, locations = locs, cost_distance = FALSE,
ncores = 1)
>
> Y me da el siguiente mensaje de error:
> "Error in .local(x, ...) invalid layer names"
>
> El código usado es igual al que viene en la ayuda del script y los nombres
de las capas son iguales a las creadas, por lo que no comprendo el error. He
estado buscando por internet pero no encuentro nada parecido.
>
> ¿Alquien me podría ayudar a solucionarlo ? ¿O indicarme dónde puede estar
el problema?
>
> Incluyo el texto de la ayuda en cuanto al uso del script por si resulta de
interés.
>
> Usage
> create_FETE_lcps(x, locations, cost_distance = FALSE, ncores = 1)
>
> Arguments
> x?????conductanceMatrix
>
> locations???sf 'POINT' or 'MULTIPOINT', SpatVector,
data.frame or matrix containing the locations coordinates
>
> cost_distance?????logical if TRUE computes total accumulated cost from
origin to destination. FALSE (default)
>
> ncores??????numeric Number of cores used when calculating least-cost paths
from-everywhere-to-everywhere. 1 (default)
>
> Un saludo
>
> Andrés Ocaña Carretón
>
>
>
>
>
> 	[[alternative HTML version deleted]]
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
-- 
image/svg+xml eman ta zabal zazu Euskal Herriko Unibertsitatea 
Universidad del País Vasco
*Euskal Herriko Unibertsitatea*

*Juan Abasolo*
Irakasle eta ikertzailea
/Hizkuntzaren eta Literaturaren Didaktika Saila | EUDIA ikerketa taldea/
(+34) 94 601 7567 <tel:(+34) 94 601 7567>
juan.abasolo en ehu.eus
https://mastodon.eus/@juan
https://juanabasolo.netlify.app

	[[alternative HTML version deleted]]

Hola Andrés,

El argumento x dice que debe ser una
conductanceMatrix no un raster.

Manuel


*Manuel Spínola, Ph.D.*
Instituto Internacional en Conservación y Manejo de Vida Silvestre
Universidad Nacional
Apartado 1350-3000
Heredia
COSTA RICA
mspinola en una.cr <mspinola en una.ac.cr>
mspinola10 en gmail.com
Teléfono: (506) 8706 - 4662
Sitio web institucional: ICOMVIS
<http://www.icomvis.una.ac.cr/index.php/manuel>
Sitio web personal: Sitio personal <https://mspinola-sitioweb.netlify.app>
Blog sobre Ciencia de Datos: Blog de Ciencia de Datos
<https://mspinola-ciencia-de-datos.netlify.app>


El El lun, 14 oct 2024 a la(s) 09:20, Andrés Ocaña Carretón via R-help-es <
r-help-es en r-project.org> escribió:
> ¡Buenas tardes!
>
> Antes de nada, dar las gracias por permitirme participar en esta lista.
>
> Soy un usuario recién llegado a R de la mano del análisis geoespacial. Soy
> un arqueólogo que se ha topado con un package para R creado por un
> arqueólogo para la ejecución de procesos para a creación de rutas de menor
> coste cuyo nombre es leastcostpath y que se encuentra en el repositorio de
> GitHub. Contiene diferentes scripts relacionados con esta cuestión.
>
> En concreto, estoy intentando realizar un cálculo de tipo  FETE (from
> everywhere to everywhere approach). Para ello he utilizado una capa de tipo
> ráster, en este caso de costes, y otra de tipo vectorial con puntos. Ambas
> las he creado en QGIS. La de costes es un mapa de pendientes en grados
> reclasificado. He usado una capa de costes por ser la que se utiliza en
> algunos ejemplos de uso que he visto, si bien en ellos se utiliza otra
> generada a partir de un mdt con la aplicación de algún algoritmo, por el
> ejemplo el de Tobler. Esta se puede crear con otro script incluido en el
> paquete, pero que no he sido capaz de ejecutar porque me da error.
>
> Tras cargar todos los packages necesarios en RStudio,  ejecuto el
> siguiente código:
>
> r <- raster("pendiente_grados_reclas.tif")
> locs <- st_read("puntos.geojson")
>
> lcps <- create_FETE_lcps(x = r, locations = locs, cost_distance = FALSE,
> ncores = 1)
>
> Y me da el siguiente mensaje de error:
> "Error in .local(x, ...) invalid layer names"
>
> El código usado es igual al que viene en la ayuda del script y los nombres
> de las capas son iguales a las creadas, por lo que no comprendo el error.
> He estado buscando por internet pero no encuentro nada parecido.
>
> ¿Alquien me podría ayudar a solucionarlo ? ¿O indicarme dónde puede estar
> el problema?
>
> Incluyo el texto de la ayuda en cuanto al uso del script por si resulta de
> interés.
>
> Usage
> create_FETE_lcps(x, locations, cost_distance = FALSE, ncores = 1)
>
> Arguments
> x conductanceMatrix
>
> locations sf 'POINT' or 'MULTIPOINT', SpatVector,
data.frame or matrix
> containing the locations coordinates
>
> cost_distance logical if TRUE computes total accumulated cost from origin
> to destination. FALSE (default)
>
> ncores numeric Number of cores used when calculating least-cost paths
> from-everywhere-to-everywhere. 1 (default)
>
> Un saludo
>
> Andrés Ocaña Carretón
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