R help es - Nov 2013 - ¿Cómo superar el error de Java?

Buenos días,

Me gustaría compartir una duda con la que me acabo de encontrar y no se
como solucionar, por si podrías echarme una mano:

Trabajo con bases de datos en R que importo de excel. Cargando las
librerías de: rJava , xlsxjars y xlsx. Al principio no parecía haber ningún
inconveniente, pero después de un tiempo de trabajo me aparece el siguiente
error en la consola de datos:


*Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;",
"invokeMethod", cl,
: java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space*

De manera que no puedo abrir/importar el archivo en excel y seguir
trabajando. Entiendo que se trata de un problema en la memoria de Java,
pero no se como solucionarlo.

¿Alguien ha tenido el mismo problema y ha conseguido solventarlo?

Muchas gracias, cualquier aportación sera bienvenida!

Un abrazo, que tengáis un buen día.

	[[alternative HTML version deleted]]

Hola Lorena.

Te recomiendo que uses XLConnect para trabajar con ficheros Excel.
Esta recomendación está basada en mi experiencia personal, no tengo una opinión
magistral ni razones para convencerte.
Simplemente, a mí es lo que mejor me ha funcionado (que, seguramente, no
coincidirá con un montón de gente de la que lee esta lista).

Eso sí... independientemente de los paquetes que uses... los ficheros Excel
debieran tener los nombre de los campos "cortos", que no coincidan
unos con otros, un tamaño adecuado de registros (para que el ordenador pueda
manejar el fichero, ... ), además de abrirlos y cerraros a demanda (tanto los
ficheros propiamente dichos como los data.frames resultantes) y no dejarlos
cargados en memoria, etc, etc... lo básico, vamos.


Un Saludo,
Miguel.




-----Mensaje original-----
De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en
r-project.org] En nombre de Lorena Tudela Marco
Enviado el: viernes, 29 de noviembre de 2013 12:13
Para: r-help-es en r-project.org
Asunto: [R-es] ¿Cómo superar el error de Java?

Buenos días,

Me gustaría compartir una duda con la que me acabo de encontrar y no se como
solucionar, por si podrías echarme una mano:

Trabajo con bases de datos en R que importo de excel. Cargando las librerías de:
rJava , xlsxjars y xlsx. Al principio no parecía haber ningún inconveniente,
pero después de un tiempo de trabajo me aparece el siguiente error en la consola
de datos:


*Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;",
"invokeMethod", cl,
: java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space*

De manera que no puedo abrir/importar el archivo en excel y seguir trabajando.
Entiendo que se trata de un problema en la memoria de Java, pero no se como
solucionarlo.

¿Alguien ha tenido el mismo problema y ha conseguido solventarlo?

Muchas gracias, cualquier aportación sera bienvenida!

Un abrazo, que tengáis un buen día.

        [[alternative HTML version deleted]]


________________________________

Nota: A información contida nesta mensaxe e os seus posibles documentos adxuntos
é privada e confidencial e está dirixida únicamente ó seu destinatario/a. Se
vostede non é o/a destinatario/a orixinal desta mensaxe, por favor elimínea. A
distribución ou copia desta mensaxe non está autorizada.

Nota: La información contenida en este mensaje y sus posibles documentos
adjuntos es privada y confidencial y está dirigida únicamente a su
destinatario/a. Si usted no es el/la destinatario/a original de este mensaje,
por favor elimínelo. La distribución o copia de este mensaje no está autorizada.

See more languages: http://www.sergas.es/aviso_confidencialidad.htm

Estimada Lorena

Creo que lo comentado por Miguel y su interpretación de memoria son 
correctos, pero me permito una prueba, desde Rcmdr hay una opción para 
importar datos de Excel, esa alternativa ¿también falla?. Me refiero a 
intentar abrir un archivo con los datos que necesita, por las dudas en 
que aparezca algún mensaje distinto, que no creo, pero son solo 10 
segundos de prueba.

¿Puede exportar desde excel a texto separado por comas *.csv?

Javier Marcuzzi

El 29/11/13 08:43, miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es
escribió:
> Hola Lorena.
>
> Te recomiendo que uses XLConnect para trabajar con ficheros Excel.
> Esta recomendación está basada en mi experiencia personal, no tengo una
opinión magistral ni razones para convencerte.
> Simplemente, a mí es lo que mejor me ha funcionado (que, seguramente, no
coincidirá con un montón de gente de la que lee esta lista).
>
> Eso sí... independientemente de los paquetes que uses... los ficheros Excel
debieran tener los nombre de los campos "cortos", que no coincidan
unos con otros, un tamaño adecuado de registros (para que el ordenador pueda
manejar el fichero, ... ), además de abrirlos y cerraros a demanda (tanto los
ficheros propiamente dichos como los data.frames resultantes) y no dejarlos
cargados en memoria, etc, etc... lo básico, vamos.
>
>
> Un Saludo,
> Miguel.
>
>
>
>
> -----Mensaje original-----
> De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en
r-project.org] En nombre de Lorena Tudela Marco
> Enviado el: viernes, 29 de noviembre de 2013 12:13
> Para: r-help-es en r-project.org
> Asunto: [R-es] ¿Cómo superar el error de Java?
>
> Buenos días,
>
> Me gustaría compartir una duda con la que me acabo de encontrar y no se
como solucionar, por si podrías echarme una mano:
>
> Trabajo con bases de datos en R que importo de excel. Cargando las
librerías de: rJava , xlsxjars y xlsx. Al principio no parecía haber ningún
inconveniente, pero después de un tiempo de trabajo me aparece el siguiente
error en la consola de datos:
>
>
> *Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;",
"invokeMethod", cl,
> : java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space*
>
> De manera que no puedo abrir/importar el archivo en excel y seguir
trabajando. Entiendo que se trata de un problema en la memoria de Java, pero no
se como solucionarlo.
>
> ¿Alguien ha tenido el mismo problema y ha conseguido solventarlo?
>
> Muchas gracias, cualquier aportación sera bienvenida!
>
> Un abrazo, que tengáis un buen día.
>
>          [[alternative HTML version deleted]]
>
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>
> Nota: A información contida nesta mensaxe e os seus posibles documentos
adxuntos é privada e confidencial e está dirixida únicamente ó seu
destinatario/a. Se vostede non é o/a destinatario/a orixinal desta mensaxe, por
favor elimínea. A distribución ou copia desta mensaxe non está autorizada.
>
> Nota: La información contenida en este mensaje y sus posibles documentos
adjuntos es privada y confidencial y está dirigida únicamente a su
destinatario/a. Si usted no es el/la destinatario/a original de este mensaje,
por favor elimínelo. La distribución o copia de este mensaje no está autorizada.
>
> See more languages: http://www.sergas.es/aviso_confidencialidad.htm
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

Lorena,

En este link se pasa revista a varios paquetes para importar datos de
Excel. También hay un par de links sobre mensajes de problemas con el
espacio heap de Java. Los comentarios sobre el paquete xlxs están casi al
final, pero también te recomiendo que leas los comentarios sobre XLConnect.

http://rwiki.sciviews.org/doku.php?id=tips%3adata-io%3ams_windows#exchanging_data_between_r_and_ms_windows_apps_excel_etc

Daniel Merino


El 29 de noviembre de 2013 08:13, Lorena Tudela Marco <
lorenatudelamarco@gmail.com> escribió:
> Buenos días,
>
> Me gustaría compartir una duda con la que me acabo de encontrar y no se
> como solucionar, por si podrías echarme una mano:
>
> Trabajo con bases de datos en R que importo de excel. Cargando las
> librerías de: rJava , xlsxjars y xlsx. Al principio no parecía haber ningún
> inconveniente, pero después de un tiempo de trabajo me aparece el siguiente
> error en la consola de datos:
>
>
> *Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;",
"invokeMethod", cl,
> : java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space*
>
> De manera que no puedo abrir/importar el archivo en excel y seguir
> trabajando. Entiendo que se trata de un problema en la memoria de Java,
> pero no se como solucionarlo.
>
> ¿Alguien ha tenido el mismo problema y ha conseguido solventarlo?
>
> Muchas gracias, cualquier aportación sera bienvenida!
>
> Un abrazo, que tengáis un buen día.
>
>         [[alternative HTML version deleted]]
>
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es@r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
>

-- 
Daniel

	[[alternative HTML version deleted]]

Estimada Lorena

Creo que lo comentado por Miguel y su interpretación de memoria son 
correctos, pero me permito una prueba, desde Rcmdr hay una opción para 
importar datos de Excel, esa alternativa ¿también falla?. Me refiero a 
intentar abrir un archivo con los datos que necesita, por las dudas en 
que aparezca algún mensaje distinto, que no creo, pero son solo 10 
segundos de prueba.

¿Puede exportar desde excel a texto separado por comas *.csv?

Javier Marcuzzi

El 29/11/13 08:43, miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es
escribió:
> Hola Lorena.
>
> Te recomiendo que uses XLConnect para trabajar con ficheros Excel.
> Esta recomendación está basada en mi experiencia personal, no tengo una
opinión magistral ni razones para convencerte.
> Simplemente, a mí es lo que mejor me ha funcionado (que, seguramente, no
coincidirá con un montón de gente de la que lee esta lista).
>
> Eso sí... independientemente de los paquetes que uses... los ficheros Excel
debieran tener los nombre de los campos "cortos", que no coincidan
unos con otros, un tamaño adecuado de registros (para que el ordenador pueda
manejar el fichero, ... ), además de abrirlos y cerraros a demanda (tanto los
ficheros propiamente dichos como los data.frames resultantes) y no dejarlos
cargados en memoria, etc, etc... lo básico, vamos.
>
>
> Un Saludo,
> Miguel.
>
>
>
>
> -----Mensaje original-----
> De:r-help-es-bounces en r-project.org  [mailto:r-help-es-bounces en
r-project.org] En nombre de Lorena Tudela Marco
> Enviado el: viernes, 29 de noviembre de 2013 12:13
> Para:r-help-es en r-project.org
> Asunto: [R-es] ¿Cómo superar el error de Java?
>
> Buenos días,
>
> Me gustaría compartir una duda con la que me acabo de encontrar y no se
como solucionar, por si podrías echarme una mano:
>
> Trabajo con bases de datos en R que importo de excel. Cargando las
librerías de: rJava , xlsxjars y xlsx. Al principio no parecía haber ningún
inconveniente, pero después de un tiempo de trabajo me aparece el siguiente
error en la consola de datos:
>
>
> *Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;",
"invokeMethod", cl,
> : java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space*
>
> De manera que no puedo abrir/importar el archivo en excel y seguir
trabajando. Entiendo que se trata de un problema en la memoria de Java, pero no
se como solucionarlo.
>
> ¿Alguien ha tenido el mismo problema y ha conseguido solventarlo?
>
> Muchas gracias, cualquier aportación sera bienvenida!
>
> Un abrazo, que tengáis un buen día.
>
>          [[alternative HTML version deleted]]
>
>
> ________________________________
>
> Nota: A información contida nesta mensaxe e os seus posibles documentos
adxuntos é privada e confidencial e está dirixida únicamente ó seu
destinatario/a. Se vostede non é o/a destinatario/a orixinal desta mensaxe, por
favor elimínea. A distribución ou copia desta mensaxe non está autorizada.
>
> Nota: La información contenida en este mensaje y sus posibles documentos
adjuntos es privada y confidencial y está dirigida únicamente a su
destinatario/a. Si usted no es el/la destinatario/a original de este mensaje,
por favor elimínelo. La distribución o copia de este mensaje no está autorizada.
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