thr3ads.net - R help es - [R-es] setdiff y/o intersect para diferencias entre vectores [Jul 2013]

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Prof. Dr. Marcos Egea-Cortines

2013-Jul-18 14:46 UTC

[R-es] setdiff y/o intersect para diferencias entre vectores

hola, 
tengo dos vectores de 1134 y 385 elementos que se corresponden con números de
accesión de genes. Necesito saber que números son comunes o intersección de
vectores.
He utilizado intersect(x,y) y me da todo el rato un único valor:
V1     V1.1     V1.2     V1.3     V1.4     V1.5     V1.6     V1.7     V1.8    
V1.9    V1.10    V1.11    V1.12
1 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
     V1.13    V1.14    V1.15    V1.16    V1.17    V1.18    V1.19    V1.20   
V1.21    V1.22    V1.23    V1.24    V1.25
1 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 
…. y así sigue.

utilizando setdiff(uplr, upcrow)
  V166
1   NA

pues menos todavia. Parece algo muy muy simple a mi entender 
pero no (me) sale
saludos
Marcos
Prof. Dr. Marcos Egea Gutiérrez-Cortines
Genetics, ETSIA
Instituto de Biotecnología Vegetal
Edificio I+D+i, Plaza del Hospital s/n
Campus Muralla del Mar 30202, Cartagena
Spain
Phone: 34868071077; 34968325705
marcos.egea@upct.es
http://www.upct.es/genetica/index.php
skype: marcosegeacortines
Twitter: @Marcosegeacorti
Tweets are my own






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Eva Prieto Castro

2013-Jul-18 16:40 UTC

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[R-es] setdiff y/o intersect para diferencias entre vectores

Hola, Marcos:

Puedes resolver con which, del siguiente modo:
> a<-c(2.4, 5.7, 9.2)
> b<-c(1, 4, 5.7)
> w<-which(a %in% b)
> a[w][1] 5.7


Como ves, el which te devuelve las posiciones de "a" cuyo valor
también está en "b".

Un saludo.

Eva


________________________________
 De: Prof. Dr. Marcos Egea-Cortines <marcos.egea@upct.es>
Para: r-help-es@r-project.org 
Enviado: Jueves 18 de julio de 2013 16:46
Asunto: [R-es] setdiff y/o intersect para diferencias entre vectores


hola, 
tengo dos vectores de 1134 y 385 elementos que se corresponden con números de
accesión de genes. Necesito saber que números son comunes o intersección de
vectores.
He utilizado intersect(x,y) y me da todo el rato un único valor:
V1     V1.1     V1.2     V1.3     V1.4     V1.5     V1.6     V1.7     V1.8    
V1.9    V1.10    V1.11    V1.12
1 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
     V1.13    V1.14    V1.15    V1.16    V1.17    V1.18    V1.19    V1.20   
V1.21    V1.22    V1.23    V1.24    V1.25
1 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 
…. y así sigue.

utilizando setdiff(uplr, upcrow)
  V166
1   NA

pues menos todavia. Parece algo muy muy simple a mi entender 
pero no (me) sale
saludos
Marcos
Prof. Dr. Marcos Egea Gutiérrez-Cortines
Genetics, ETSIA
Instituto de Biotecnología Vegetal
Edificio I+D+i, Plaza del Hospital s/n
Campus Muralla del Mar 30202, Cartagena
Spain
Phone: 34868071077; 34968325705
marcos.egea@upct.es
http://www.upct.es/genetica/index.php
skype: marcosegeacortines
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_______________________________________________
R-help-es mailing list
R-help-es@r-project.org
https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
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miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es

2013-Jul-23 11:41 UTC

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[R-es] setdiff y/o intersect para diferencias entre vectores

Hola Marcos.

Yo probaría algo del estilo a esto....

Intersecc<-v1[v1%in%v2]

Un saludo,
_____________________________
Miguel Ángel Rodríguez Muíños
Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública
Consellería de Sanidade
Xunta de Galicia
http://dxsp.sergas.es







-----Mensaje original-----
De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en
r-project.org] En nombre de Prof. Dr. Marcos Egea-Cortines
Enviado el: jueves, 18 de julio de 2013 16:47
Para: r-help-es en r-project.org
Asunto: [R-es] setdiff y/o intersect para diferencias entre vectores

hola,
tengo dos vectores de 1134 y 385 elementos que se corresponden con números de
accesión de genes. Necesito saber que números son comunes o intersección de
vectores.
He utilizado intersect(x,y) y me da todo el rato un único valor:
V1     V1.1     V1.2     V1.3     V1.4     V1.5     V1.6     V1.7     V1.8    
V1.9    V1.10    V1.11    V1.12
1 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
     V1.13    V1.14    V1.15    V1.16    V1.17    V1.18    V1.19    V1.20   
V1.21    V1.22    V1.23    V1.24    V1.25
1 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
.... y así sigue.

utilizando setdiff(uplr, upcrow)
  V166
1   NA

pues menos todavia. Parece algo muy muy simple a mi entender
pero no (me) sale
saludos
Marcos
Prof. Dr. Marcos Egea Gutiérrez-Cortines
Genetics, ETSIA
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miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es

2013-Jul-23 11:45 UTC

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[R-es] setdiff y/o intersect para diferencias entre vectores

Otra opción....

V3=c(v1,v2)
Intersecc=V3[duplicated(V3)]

Un Saludo,
Miguel.




-----Mensaje original-----
De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en
r-project.org] En nombre de Rodríguez Muíños, Miguel Ángel
Enviado el: martes, 23 de julio de 2013 13:41
Para: marcos.egea en upct.es; r-help-es en r-project.org
Asunto: Re: [R-es] setdiff y/o intersect para diferencias entre vectores

Hola Marcos.

Yo probaría algo del estilo a esto....

Intersecc<-v1[v1%in%v2]

Un saludo,
_____________________________
Miguel Ángel Rodríguez Muíños
Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública Consellería de Sanidade
Xunta de Galicia http://dxsp.sergas.es







-----Mensaje original-----
De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en
r-project.org] En nombre de Prof. Dr. Marcos Egea-Cortines Enviado el: jueves,
18 de julio de 2013 16:47
Para: r-help-es en r-project.org
Asunto: [R-es] setdiff y/o intersect para diferencias entre vectores

hola,
tengo dos vectores de 1134 y 385 elementos que se corresponden con números de
accesión de genes. Necesito saber que números son comunes o intersección de
vectores.
He utilizado intersect(x,y) y me da todo el rato un único valor:
V1     V1.1     V1.2     V1.3     V1.4     V1.5     V1.6     V1.7     V1.8    
V1.9    V1.10    V1.11    V1.12
1 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
     V1.13    V1.14    V1.15    V1.16    V1.17    V1.18    V1.19    V1.20   
V1.21    V1.22    V1.23    V1.24    V1.25
1 AJ558305 AJ558305 AJ558305 AJ558305
.... y así sigue.

utilizando setdiff(uplr, upcrow)
  V166
1   NA

pues menos todavia. Parece algo muy muy simple a mi entender pero no (me) sale
saludos Marcos Prof. Dr. Marcos Egea Gutiérrez-Cortines Genetics, ETSIA
Instituto de Biotecnología Vegetal Edificio I+D+i, Plaza del Hospital s/n Campus
Muralla del Mar 30202, Cartagena Spain
Phone: 34868071077; 34968325705
marcos.egea en upct.es
http://www.upct.es/genetica/index.php
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