Estimados compañeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quería saber si conocéis alguna librería o función para dada la matriz de proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. Un cordial saludo y un mejor año 2013. Juan -- ========================================================Juan Antonio Gil Pascual Prof. Titular de Metodología Cuantitatíva correo: jgil en edu.uned.es web: www.uned.es/personal/jgil U.N.E.D. Fac. de Educación Dpto. MIDE I c/Juan del Rosal,14 desp. 272 28040 MADRID Tel. 91 398 72 79 Fax. 91 398 72 88 Antes de imprimir este correo piense bien si es necesario hacerlo: El medioambiente es cosa de todos
Hola, ¿Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan específicamente con redes permiten obtener tu caso?. Feliz Año! Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual <jgil@edu.uned.es>escribió:> Estimados compañeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quería > saber si conocéis alguna librería o función para dada la matriz de > proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. > > Un cordial saludo y un mejor año 2013. > > Juan > > -- > ==============================**==========================> Juan Antonio Gil Pascual > Prof. Titular de Metodología Cuantitatíva > correo: jgil@edu.uned.es > web: www.uned.es/personal/jgil > > U.N.E.D. > Fac. de Educación > Dpto. MIDE I > c/Juan del Rosal,14 desp. 272 > 28040 MADRID > Tel. 91 398 72 79 > Fax. 91 398 72 88 > > > Antes de imprimir este correo piense bien si es necesario hacerlo: El > medioambiente es cosa de todos > > ______________________________**_________________ > R-help-es mailing list > R-help-es@r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/**listinfo/r-help-es<https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es> >-- Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es [[alternative HTML version deleted]]
Hola Carlos gracias pero ambos paquetes y en otros de simulación de redes no he visto nada de este tipo singular de redes. Un saludo, Juan El 02/01/2013 14:52, Carlos Ortega escribió:> Hola, > > ¿Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan específicamente > con redes permiten obtener tu caso?. > > Feliz Año! > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es <http://www.qualityexcellence.es> > > > El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual > <jgil@edu.uned.es <mailto:jgil@edu.uned.es>> escribió: > > Estimados compañeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y > quería saber si conocéis alguna librería o función para dada la > matriz de proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. > > Un cordial saludo y un mejor año 2013. > > Juan > > -- > ========================================================> Juan Antonio Gil Pascual > Prof. Titular de Metodología Cuantitatíva > correo: jgil@edu.uned.es <mailto:jgil@edu.uned.es> > web: www.uned.es/personal/jgil <http://www.uned.es/personal/jgil> > > U.N.E.D. > Fac. de Educación > Dpto. MIDE I > c/Juan del Rosal,14 desp. 272 > 28040 MADRID > Tel. 91 398 72 79 > Fax. 91 398 72 88 > > > Antes de imprimir este correo piense bien si es necesario hacerlo: > El medioambiente es cosa de todos > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es@r-project.org <mailto:R-help-es@r-project.org> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > > > > -- > Saludos, > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es <http://www.qualityexcellence.es>-- ========================================================Juan Antonio Gil Pascual Prof. Titular de Metodología Cuantitatíva correo: jgil@edu.uned.es web: www.uned.es/personal/jgil U.N.E.D. Fac. de Educación Dpto. MIDE I c/Juan del Rosal,14 desp. 272 28040 MADRID Tel. 91 398 72 79 Fax. 91 398 72 88 Antes de imprimir este correo piense bien si es necesario hacerlo: El medioambiente es cosa de todos [[alternative HTML version deleted]]
Hola, después de echar una ojeada a la tesis de Benjamín Vargas
(http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tenía ni idea de estas
redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se
hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con
R-igraph.
El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las convenciones
de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el
grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" según los
criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos
cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se
debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la función dist para generar
la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner
esta matriz como opción, o hacer la poda previamente en el data frame.
Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su página en sourceforge:
http://igraph.sourceforge.net/index.html
Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con
frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es
un software opensource con muchas funciones específicas para visualización. La
combinación de R-igraph con gephi es potentísima para abordar tanto la analítica
como la visualización.
Espero que te sea útil, y por supuesto, ¡Feliz Año eRReRos!
Pedro
El 02/01/2013 23:20,
r-help-es-request@r-project.org<mailto:r-help-es-request@r-project.org>
escribió:
Message: 1
Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100
From: Carlos Ortega
<cof@qualityexcellence.es><mailto:cof@qualityexcellence.es>
To: Juan Antonio Gil Pascual
<jgil@edu.uned.es><mailto:jgil@edu.uned.es>
Cc: Lista R
<r-help-es@r-project.org><mailto:r-help-es@r-project.org>
Subject: Re: [R-es] redes pathfinder
Message-ID:
<CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g@mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g@mail.gmail.com>
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Hola,
¿Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan
específicamente con
redes permiten obtener tu caso?.
Feliz Año!
Carlos Ortega
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El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual
<jgil@edu.uned.es><mailto:jgil@edu.uned.es>escribió:
> Estimados compañeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quería
> saber si conocéis alguna librería o función para dada la matriz de
> proximidades sacar la matriz de la red pathfinder.
>
> Un cordial saludo y un mejor año 2013.
>
> Juan
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> ==============================**==========================> Juan Antonio
Gil Pascual
> Prof. Titular de Metodología Cuantitatíva
> correo: jgil@edu.uned.es<mailto:jgil@edu.uned.es>
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Pedro Concejero
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Hola Pedro muchas gracias, pero el problema es el tema de la poda porque los pfnet tienen una forma muy singular de poda y por eso quería saber si alguien había realizado una función para dada la matriz de distancias de Minkowski pasar a una matriz network donde gplot me permite dibujar el grafo y luego encontrar el índice de complejidad y de coherencia puedo mirar en igraph pero en su defecto realizaría la función. Efectivamente gephi me parece una muy buena herramienta. Un cordial saludo y feliz año. Juan El 03/01/2013 13:05, Pedro Concejero Cerezo escribió:> Hola, después de echar una ojeada a la tesis de Benjamín Vargas (http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tenía ni idea de estas redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con R-igraph. > > El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las convenciones de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" según los criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la función dist para generar la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner esta matriz como opción, o hacer la poda previamente en el data frame. > > Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su página en sourceforge: http://igraph.sourceforge.net/index.html > > Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es un software opensource con muchas funciones específicas para visualización. La combinación de R-igraph con gephi es potentísima para abordar tanto la analítica como la visualización. > > Espero que te sea útil, y por supuesto, ¡Feliz Año eRReRos! > Pedro > > El 02/01/2013 23:20, r-help-es-request@r-project.org<mailto:r-help-es-request@r-project.org> escribió: > > Message: 1 > Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100 > From: Carlos Ortega <cof@qualityexcellence.es><mailto:cof@qualityexcellence.es> > To: Juan Antonio Gil Pascual <jgil@edu.uned.es><mailto:jgil@edu.uned.es> > Cc: Lista R <r-help-es@r-project.org><mailto:r-help-es@r-project.org> > Subject: Re: [R-es] redes pathfinder > Message-ID: > <CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g@mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g@mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain > > Hola, > > ¿Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan específicamente con > redes permiten obtener tu caso?. > > Feliz Año! > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es> > > > El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual > <jgil@edu.uned.es><mailto:jgil@edu.uned.es>escribió: > > > >> Estimados compañeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quería >> saber si conocéis alguna librería o función para dada la matriz de >> proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. >> >> Un cordial saludo y un mejor año 2013. >> >> Juan >> >> -- >> ==============================**==========================>> Juan Antonio Gil Pascual >> Prof. Titular de Metodología Cuantitatíva >> correo: jgil@edu.uned.es<mailto:jgil@edu.uned.es> >> web: www.uned.es/personal/jgil<http://www.uned.es/personal/jgil> >> >> U.N.E.D. >> Fac. de Educación >> Dpto. MIDE I >> c/Juan del Rosal,14 desp. 272 >> 28040 MADRID >> Tel. 91 398 72 79 >> Fax. 91 398 72 88 >> > > -- > Pedro Concejero > User Modeling - Analytics @ Telefónica I+D<http://www.tid.es/es/Paginas/default.aspx> > Part of Telefónica Digital<http://www.telefonica.com/es/digital/html/home/home.shtml> / Telefónica Digital Hub (english)<http://blog.digital.telefonica.com/> > E-mail: pedro.concejero@tid.es<mailto:pedro.concejero@tid.es> > skype: pedro.concejero > twitter: @ConcejeroPedro > linkedin <http://www.linkedin.com/in/pedroconcejero/es> > > ________________________________ > > Este mensaje se dirige exclusivamente a su destinatario. Puede consultar nuestra política de envío y recepción de correo electrónico en el enlace situado más abajo. > This message is intended exclusively for its addressee. We only send and receive email on the basis of the terms set out at: > http://www.tid.es/ES/PAGINAS/disclaimer.aspx > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es@r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es-- ========================================================Juan Antonio Gil Pascual Prof. Titular de Metodología Cuantitatíva correo: jgil@edu.uned.es web: www.uned.es/personal/jgil U.N.E.D. Fac. de Educación Dpto. MIDE I c/Juan del Rosal,14 desp. 272 28040 MADRID Tel. 91 398 72 79 Fax. 91 398 72 88 Antes de imprimir este correo piense bien si es necesario hacerlo: El medioambiente es cosa de todos [[alternative HTML version deleted]]
Hola a todos Para comenzar el año con "papelones": desde mi desconocimiento, estoy acomodando unos datos para luego leer en R, no sabía bien que usar, pero si conozco que con datos desordenados cualquier intento serio quedaría en un intento, R es bueno pero si los datos son malos ... Observando sus correos encuentro dos preguntas, una es ¿como se instala RGL en linux? (me falta algo que desconozco), la segunda pregunta es porque quiero ver esos gráficos en 3D (sin RGL se complica). Mi intención: llegar a un gráfico donde se visualicen esferas de distintos tamaños (como esos circulos que están conectados en la tesis de Benjamín), pero pienso en esferas como si fuesen planetas, con sus lunas, soles, constelaciónes, etc. Es un desafío personal, una idea de hace tiempo, y veo la tesis de Benajmin y hay una gran pista para mi idea original. R ¿podría dibujar mi universo paralelo? "¿medio loco?" Quizás cuando pueda instalar RGL en R y ver los ejemplos el paquete igraph ya tiene todo lo requerido. Javier Marcuzzi El jue, 03-01-2013 a las 13:05 +0100, Pedro Concejero Cerezo escribió:> Hola, despus de echar una ojeada a la tesis de Benjamn Vargas (http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tena ni idea de estas redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con R-igraph. > > El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las convenciones de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" segn los criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la funcin dist para generar la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner esta matriz como opcin, o hacer la poda previamente en el data frame. > > Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su pgina en sourceforge: http://igraph.sourceforge.net/index.html > > Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es un software opensource con muchas funciones especficas para visualizacin. La combinacin de R-igraph con gephi es potentsima para abordar tanto la analtica como la visualizacin. > > Espero que te sea til, y por supuesto, Feliz Ao eRReRos! > Pedro > > El 02/01/2013 23:20, r-help-es-request en r-project.org<mailto:r-help-es-request en r-project.org> escribi: > > Message: 1 > Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100 > From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es><mailto:cof en qualityexcellence.es> > To: Juan Antonio Gil Pascual <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es> > Cc: Lista R <r-help-es en r-project.org><mailto:r-help-es en r-project.org> > Subject: Re: [R-es] redes pathfinder > Message-ID: > <CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com> > Content-Type: text/plain > > Hola, > > Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan especficamente con > redes permiten obtener tu caso?. > > Feliz Ao! > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es> > > > El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual > <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es>escribi: > > > > > Estimados compaeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quera > > saber si conocis alguna librera o funcin para dada la matriz de > > proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. > > > > Un cordial saludo y un mejor ao 2013. > > > > Juan > > > > -- > > ==============================**==========================> > Juan Antonio Gil Pascual > > Prof. Titular de Metodologa Cuantitatva > > correo: jgil en edu.uned.es<mailto:jgil en edu.uned.es> > > web: www.uned.es/personal/jgil<http://www.uned.es/personal/jgil> > > > > U.N.E.D. > > Fac. de Educacin > > Dpto. MIDE I > > c/Juan del Rosal,14 desp. 272 > > 28040 MADRID > > Tel. 91 398 72 79 > > Fax. 91 398 72 88 > > > > > -- > Pedro Concejero > User Modeling - Analytics @ Telefnica I+D<http://www.tid.es/es/Paginas/default.aspx> > Part of Telefnica Digital<http://www.telefonica.com/es/digital/html/home/home.shtml> / Telefnica Digital Hub (english)<http://blog.digital.telefonica.com/> > E-mail: pedro.concejero en tid.es<mailto:pedro.concejero en tid.es> > skype: pedro.concejero > twitter: @ConcejeroPedro > linkedin <http://www.linkedin.com/in/pedroconcejero/es> > > ________________________________ > > Este mensaje se dirige exclusivamente a su destinatario. Puede consultar nuestra poltica de envo y recepcin de correo electrnico en el enlace situado ms abajo. > This message is intended exclusively for its addressee. We only send and receive email on the basis of the terms set out at: > http://www.tid.es/ES/PAGINAS/disclaimer.aspx > > [[alternative HTML version deleted]] > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
Estimado José Luis No ando con suerte, estoy utilizando linux SUSE 12.2 (esta en prueba la 12.3), no me fue posible la instalación glEnd ... falta al correr el autoconfig y compilar en R cuando instala RGL, no lo encuentro. En navidad instale SUSE, ubuntu al actualizar (24 diciembre) "borraba" la conección al wifi, solo andaba la red por cable (yo uso una portátil), y por otro lado SUSE me da mejor experiencia de usuario con R y algunas otras cosas, la batería dura más, R se instala desde CRAN con hacer click en un archivo de CRAN, hay una asociación entre R y SUSE que me da la sensación de ser una computadora rápida. Todo lindo hasta el problema con RGL. Podría instalar Ubuntu, otra versión, pero tengo que estudiarlo. Al día de hoy ¿que linux anda mejor con R?, ¿cual usar?, posiblemente no hay una respuesta. Javier Marcuzzi El vie, 04-01-2013 a las 09:59 +0100, Jose Luis Cañadas escribió:> Hola Javier. > Te respondo a la primera parte, de cómo instalar rgl en linux > > Si usas ubuntu o debian, suele venir en los repositorios oficiales. > Es aconsejable instalar los repositorios que se indican en CRAN. > > Repositorios extras. > > Si usas ubuntu : https://launchpad.net/~marutter/+archive/c2d4u > > Si usas debian: http://debian-r.debian.net/debian-r/ > > Si instalas directamente rgl desde R , quizá tengas problemas de > dependencias. Estos son algunos paquetes que quizá sea necesario instalar > libgl1-mesa-dev > libgl-dev > libglu1-mesa-dev > libglu-dev > libpng12-dev > libx11-dev > libxt-dev > x11proto-core-dev > > Ya nos cuentas. > > Un saludo. > > > El 04/01/13 02:17, Marcuzzi, Javier Rubén escribió: > > Hola a todos > > Para comenzar el año con "papelones": desde mi desconocimiento, estoy > > acomodando unos datos para luego leer en R, no sabía bien que usar, pero > > si conozco que con datos desordenados cualquier intento serio quedaría > > en un intento, R es bueno pero si los datos son malos ... > > Observando sus correos encuentro dos preguntas, una es ¿como se instala > > RGL en linux? (me falta algo que desconozco), la segunda pregunta es > > porque quiero ver esos gráficos en 3D (sin RGL se complica). > > Mi intención: llegar a un gráfico donde se visualicen esferas de > > distintos tamaños (como esos circulos que están conectados en la tesis > > de Benjamín), pero pienso en esferas como si fuesen planetas, con sus > > lunas, soles, constelaciónes, etc. > > Es un desafío personal, una idea de hace tiempo, y veo la tesis de > > Benajmin y hay una gran pista para mi idea original. > > R ¿podría dibujar mi universo paralelo? "¿medio loco?" Quizás cuando > > pueda instalar RGL en R y ver los ejemplos el paquete igraph ya tiene > > todo lo requerido. > > > > Javier Marcuzzi > > > > El jue, 03-01-2013 a las 13:05 +0100, Pedro Concejero Cerezo escribió: > >> Hola, despus de echar una ojeada a la tesis de Benjamn Vargas (http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tena ni idea de estas redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con R-igraph. > >> > >> El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las convenciones de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" segn los criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la funcin dist para generar la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner esta matriz como opcin, o hacer la poda previamente en el data frame. > >> > >> Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su pgina en sourceforge: http://igraph.sourceforge.net/index.html > >> > >> Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es un software opensource con muchas funciones especficas para visualizacin. La combinacin de R-igraph con gephi es potentsima para abordar tanto la analtica como la visualizacin. > >> > >> Espero que te sea til, y por supuesto, Feliz Ao eRReRos! > >> Pedro > >> > >> El 02/01/2013 23:20, r-help-es-request en r-project.org<mailto:r-help-es-request en r-project.org> escribi: > >> > >> Message: 1 > >> Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100 > >> From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es><mailto:cof en qualityexcellence.es> > >> To: Juan Antonio Gil Pascual <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es> > >> Cc: Lista R <r-help-es en r-project.org><mailto:r-help-es en r-project.org> > >> Subject: Re: [R-es] redes pathfinder > >> Message-ID: > >> <CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com> > >> Content-Type: text/plain > >> > >> Hola, > >> > >> Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan especficamente con > >> redes permiten obtener tu caso?. > >> > >> Feliz Ao! > >> Carlos Ortega > >> www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es> > >> > >> > >> El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual > >> <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es>escribi: > >> > >> > >> > >>> Estimados compaeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quera > >>> saber si conocis alguna librera o funcin para dada la matriz de > >>> proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. > >>> > >>> Un cordial saludo y un mejor ao 2013. > >>> > >>> Juan > >>> > >>> -- > >>> ==============================**==========================> >>> Juan Antonio Gil Pascual > >>> Prof. Titular de Metodologa Cuantitatva > >>> correo: jgil en edu.uned.es<mailto:jgil en edu.uned.es> > >>> web: www.uned.es/personal/jgil<http://www.uned.es/personal/jgil> > >>> > >>> U.N.E.D. > >>> Fac. de Educacin > >>> Dpto. MIDE I > >>> c/Juan del Rosal,14 desp. 272 > >>> 28040 MADRID > >>> Tel. 91 398 72 79 > >>> Fax. 91 398 72 88 > >>> > >> > >> -- > >> Pedro Concejero > >> User Modeling - Analytics @ Telefnica I+D<http://www.tid.es/es/Paginas/default.aspx> > >> Part of Telefnica Digital<http://www.telefonica.com/es/digital/html/home/home.shtml> / Telefnica Digital Hub (english)<http://blog.digital.telefonica.com/> > >> E-mail: pedro.concejero en tid.es<mailto:pedro.concejero en tid.es> > >> skype: pedro.concejero > >> twitter: @ConcejeroPedro > >> linkedin <http://www.linkedin.com/in/pedroconcejero/es> > >> > >> ________________________________ > >> > >> Este mensaje se dirige exclusivamente a su destinatario. Puede consultar nuestra poltica de envo y recepcin de correo electrnico en el enlace situado ms abajo. > >> This message is intended exclusively for its addressee. We only send and receive email on the basis of the terms set out at: > >> http://www.tid.es/ES/PAGINAS/disclaimer.aspx > >> > >> [[alternative HTML version deleted]] > >> > >> _______________________________________________ > >> R-help-es mailing list > >> R-help-es en r-project.org > >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > _______________________________________________ > > R-help-es mailing list > > R-help-es en r-project.org > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
Hola Javier. Te respondo a la primera parte, de cómo instalar rgl en linux Si usas ubuntu o debian, suele venir en los repositorios oficiales. Es aconsejable instalar los repositorios que se indican en CRAN. Repositorios extras. Si usas ubuntu : https://launchpad.net/~marutter/+archive/c2d4u Si usas debian: http://debian-r.debian.net/debian-r/ Si instalas directamente rgl desde R , quizá tengas problemas de dependencias. Estos son algunos paquetes que quizá sea necesario instalar libgl1-mesa-dev libgl-dev libglu1-mesa-dev libglu-dev libpng12-dev libx11-dev libxt-dev x11proto-core-dev Ya nos cuentas. Un saludo. El 04/01/13 02:17, Marcuzzi, Javier Rubén escribió:> Hola a todos > Para comenzar el año con "papelones": desde mi desconocimiento, estoy > acomodando unos datos para luego leer en R, no sabía bien que usar, pero > si conozco que con datos desordenados cualquier intento serio quedaría > en un intento, R es bueno pero si los datos son malos ... > Observando sus correos encuentro dos preguntas, una es ¿como se instala > RGL en linux? (me falta algo que desconozco), la segunda pregunta es > porque quiero ver esos gráficos en 3D (sin RGL se complica). > Mi intención: llegar a un gráfico donde se visualicen esferas de > distintos tamaños (como esos circulos que están conectados en la tesis > de Benjamín), pero pienso en esferas como si fuesen planetas, con sus > lunas, soles, constelaciónes, etc. > Es un desafío personal, una idea de hace tiempo, y veo la tesis de > Benajmin y hay una gran pista para mi idea original. > R ¿podría dibujar mi universo paralelo? "¿medio loco?" Quizás cuando > pueda instalar RGL en R y ver los ejemplos el paquete igraph ya tiene > todo lo requerido. > > Javier Marcuzzi > > El jue, 03-01-2013 a las 13:05 +0100, Pedro Concejero Cerezo escribió: >> Hola, despus de echar una ojeada a la tesis de Benjamn Vargas (http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tena ni idea de estas redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con R-igraph. >> >> El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las convenciones de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" segn los criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la funcin dist para generar la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner esta matriz como opcin, o hacer la poda previamente en el data frame. >> >> Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su pgina en sourceforge: http://igraph.sourceforge.net/index.html >> >> Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es un software opensource con muchas funciones especficas para visualizacin. La combinacin de R-igraph con gephi es potentsima para abordar tanto la analtica como la visualizacin. >> >> Espero que te sea til, y por supuesto, Feliz Ao eRReRos! >> Pedro >> >> El 02/01/2013 23:20, r-help-es-request en r-project.org<mailto:r-help-es-request en r-project.org> escribi: >> >> Message: 1 >> Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100 >> From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es><mailto:cof en qualityexcellence.es> >> To: Juan Antonio Gil Pascual <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es> >> Cc: Lista R <r-help-es en r-project.org><mailto:r-help-es en r-project.org> >> Subject: Re: [R-es] redes pathfinder >> Message-ID: >> <CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com> >> Content-Type: text/plain >> >> Hola, >> >> Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan especficamente con >> redes permiten obtener tu caso?. >> >> Feliz Ao! >> Carlos Ortega >> www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es> >> >> >> El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual >> <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es>escribi: >> >> >> >>> Estimados compaeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quera >>> saber si conocis alguna librera o funcin para dada la matriz de >>> proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. >>> >>> Un cordial saludo y un mejor ao 2013. >>> >>> Juan >>> >>> -- >>> ==============================**==========================>>> Juan Antonio Gil Pascual >>> Prof. Titular de Metodologa Cuantitatva >>> correo: jgil en edu.uned.es<mailto:jgil en edu.uned.es> >>> web: www.uned.es/personal/jgil<http://www.uned.es/personal/jgil> >>> >>> U.N.E.D. >>> Fac. de Educacin >>> Dpto. MIDE I >>> c/Juan del Rosal,14 desp. 272 >>> 28040 MADRID >>> Tel. 91 398 72 79 >>> Fax. 91 398 72 88 >>> >> >> -- >> Pedro Concejero >> User Modeling - Analytics @ Telefnica I+D<http://www.tid.es/es/Paginas/default.aspx> >> Part of Telefnica Digital<http://www.telefonica.com/es/digital/html/home/home.shtml> / Telefnica Digital Hub (english)<http://blog.digital.telefonica.com/> >> E-mail: pedro.concejero en tid.es<mailto:pedro.concejero en tid.es> >> skype: pedro.concejero >> twitter: @ConcejeroPedro >> linkedin <http://www.linkedin.com/in/pedroconcejero/es> >> >> ________________________________ >> >> Este mensaje se dirige exclusivamente a su destinatario. Puede consultar nuestra poltica de envo y recepcin de correo electrnico en el enlace situado ms abajo. >> This message is intended exclusively for its addressee. We only send and receive email on the basis of the terms set out at: >> http://www.tid.es/ES/PAGINAS/disclaimer.aspx >> >> [[alternative HTML version deleted]] >> >> _______________________________________________ >> R-help-es mailing list >> R-help-es en r-project.org >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
Si, hice eso, SUSE tiene un sistema para instalar ..., en el caso de R, desde CRAN hay un archivo y este realiza todo el trabajo (en eso difiere algo de Ubuntu). En la instalación (parte del mensaje que le envié a la persona que se encarga de R para SUSE):> install.packages("rgl")Installing package(s) into ?/home/javier/R/x86_64-suse-linux-gnu-library/2.15? ............ checking for GL/glu.h... yes checking for glEnd in -lGL... no configure: error: missing required library GL ERROR: configuration failed for package ?rgl? * removing ?/home/javier/R/x86_64-suse-linux-gnu-library/2.15/rgl? Warning in install.packages : installation of package ?rgl? had non-zero exit status Rstudio no me dio ningún problema en SUSE (la impresora que se yo como se instala pero imprimo desde windows y listo). R, Rmsql, mysql, etc. todo sin problemas. Javier El vie, 04-01-2013 a las 13:44 +0100, Jose Luis Cañadas escribió:> No sabría decirte cuál anda mejor. Yo estaba usando linux mint debian > con xfce y R iba bien, pero tenía un problema con RStudio y he instalado > xubuntu 12.10. > > No conozco SUSE , pero supongo que tendrá un sistema de paquetería. > Prueba a instalar las librerías que te indico y luego instala rgl > directamente desde R a ver. Si no compila bien, fíjate en el log ,ya que > ahí te da pistas sobre qué le falta. > > Saludos. > El 04/01/13 09:35, Marcuzzi, Javier Rubén escribió: > > Estimado José Luis > > > > No ando con suerte, estoy utilizando linux SUSE 12.2 (esta en prueba la > > 12.3), no me fue posible la instalación glEnd ... falta al correr el > > autoconfig y compilar en R cuando instala RGL, no lo encuentro. > > > > En navidad instale SUSE, ubuntu al actualizar (24 diciembre) "borraba" > > la conección al wifi, solo andaba la red por cable (yo uso una > > portátil), y por otro lado SUSE me da mejor experiencia de usuario con R > > y algunas otras cosas, la batería dura más, R se instala desde CRAN con > > hacer click en un archivo de CRAN, hay una asociación entre R y SUSE que > > me da la sensación de ser una computadora rápida. Todo lindo hasta el > > problema con RGL. > > > > Podría instalar Ubuntu, otra versión, pero tengo que estudiarlo. Al día > > de hoy ¿que linux anda mejor con R?, ¿cual usar?, posiblemente no hay > > una respuesta. > > > > Javier Marcuzzi > > > > El vie, 04-01-2013 a las 09:59 +0100, Jose Luis Cañadas escribió: > >> Hola Javier. > >> Te respondo a la primera parte, de cómo instalar rgl en linux > >> > >> Si usas ubuntu o debian, suele venir en los repositorios oficiales. > >> Es aconsejable instalar los repositorios que se indican en CRAN. > >> > >> Repositorios extras. > >> > >> Si usas ubuntu : https://launchpad.net/~marutter/+archive/c2d4u > >> > >> Si usas debian: http://debian-r.debian.net/debian-r/ > >> > >> Si instalas directamente rgl desde R , quizá tengas problemas de > >> dependencias. Estos son algunos paquetes que quizá sea necesario instalar > >> libgl1-mesa-dev > >> libgl-dev > >> libglu1-mesa-dev > >> libglu-dev > >> libpng12-dev > >> libx11-dev > >> libxt-dev > >> x11proto-core-dev > >> > >> Ya nos cuentas. > >> > >> Un saludo. > >> > >> > >> El 04/01/13 02:17, Marcuzzi, Javier Rubén escribió: > >>> Hola a todos > >>> Para comenzar el año con "papelones": desde mi desconocimiento, estoy > >>> acomodando unos datos para luego leer en R, no sabía bien que usar, pero > >>> si conozco que con datos desordenados cualquier intento serio quedaría > >>> en un intento, R es bueno pero si los datos son malos ... > >>> Observando sus correos encuentro dos preguntas, una es ¿como se instala > >>> RGL en linux? (me falta algo que desconozco), la segunda pregunta es > >>> porque quiero ver esos gráficos en 3D (sin RGL se complica). > >>> Mi intención: llegar a un gráfico donde se visualicen esferas de > >>> distintos tamaños (como esos circulos que están conectados en la tesis > >>> de Benjamín), pero pienso en esferas como si fuesen planetas, con sus > >>> lunas, soles, constelaciónes, etc. > >>> Es un desafío personal, una idea de hace tiempo, y veo la tesis de > >>> Benajmin y hay una gran pista para mi idea original. > >>> R ¿podría dibujar mi universo paralelo? "¿medio loco?" Quizás cuando > >>> pueda instalar RGL en R y ver los ejemplos el paquete igraph ya tiene > >>> todo lo requerido. > >>> > >>> Javier Marcuzzi > >>> > >>> El jue, 03-01-2013 a las 13:05 +0100, Pedro Concejero Cerezo escribió: > >>>> Hola, despus de echar una ojeada a la tesis de Benjamn Vargas (http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tena ni idea de estas redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con R-igraph. > >>>> > >>>> El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las convenciones de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" segn los criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la funcin dist para generar la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner esta matriz como opcin, o hacer la poda previamente en el data frame. > >>>> > >>>> Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su pgina en sourceforge: http://igraph.sourceforge.net/index.html > >>>> > >>>> Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es un software opensource con muchas funciones especficas para visualizacin. La combinacin de R-igraph con gephi es potentsima para abordar tanto la analtica como la visualizacin. > >>>> > >>>> Espero que te sea til, y por supuesto, Feliz Ao eRReRos! > >>>> Pedro > >>>> > >>>> El 02/01/2013 23:20, r-help-es-request en r-project.org<mailto:r-help-es-request en r-project.org> escribi: > >>>> > >>>> Message: 1 > >>>> Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100 > >>>> From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es><mailto:cof en qualityexcellence.es> > >>>> To: Juan Antonio Gil Pascual <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es> > >>>> Cc: Lista R <r-help-es en r-project.org><mailto:r-help-es en r-project.org> > >>>> Subject: Re: [R-es] redes pathfinder > >>>> Message-ID: > >>>> <CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com> > >>>> Content-Type: text/plain > >>>> > >>>> Hola, > >>>> > >>>> Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan especficamente con > >>>> redes permiten obtener tu caso?. > >>>> > >>>> Feliz Ao! > >>>> Carlos Ortega > >>>> www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es> > >>>> > >>>> > >>>> El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual > >>>> <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es>escribi: > >>>> > >>>> > >>>> > >>>>> Estimados compaeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quera > >>>>> saber si conocis alguna librera o funcin para dada la matriz de > >>>>> proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. > >>>>> > >>>>> Un cordial saludo y un mejor ao 2013. > >>>>> > >>>>> Juan > >>>>> > >>>>> -- > >>>>> ==============================**==========================> >>>>> Juan Antonio Gil Pascual > >>>>> Prof. Titular de Metodologa Cuantitatva > >>>>> correo: jgil en edu.uned.es<mailto:jgil en edu.uned.es> > >>>>> web: www.uned.es/personal/jgil<http://www.uned.es/personal/jgil> > >>>>> > >>>>> U.N.E.D. > >>>>> Fac. de Educacin > >>>>> Dpto. MIDE I > >>>>> c/Juan del Rosal,14 desp. 272 > >>>>> 28040 MADRID > >>>>> Tel. 91 398 72 79 > >>>>> Fax. 91 398 72 88 > >>>>> > >>>> -- > >>>> Pedro Concejero > >>>> User Modeling - Analytics @ Telefnica I+D<http://www.tid.es/es/Paginas/default.aspx> > >>>> Part of Telefnica Digital<http://www.telefonica.com/es/digital/html/home/home.shtml> / Telefnica Digital Hub (english)<http://blog.digital.telefonica.com/> > >>>> E-mail: pedro.concejero en tid.es<mailto:pedro.concejero en tid.es> > >>>> skype: pedro.concejero > >>>> twitter: @ConcejeroPedro > >>>> linkedin <http://www.linkedin.com/in/pedroconcejero/es> > >>>> > >>>> ________________________________ > >>>> > >>>> Este mensaje se dirige exclusivamente a su destinatario. Puede consultar nuestra poltica de envo y recepcin de correo electrnico en el enlace situado ms abajo. > >>>> This message is intended exclusively for its addressee. 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Problema solucionado Seleccione algunos archivos al azar y justo ... Les paso la respuesta de la persona que mantiene R en SUSE. Hi Javier !> checking for glEnd in -lGL... no > configure: error: missing required library GL > ERROR: configuration failed for package ?rgl? > * removing ?/home/javier/R/x86_64-suse-linux-gnu-library/2.15/rgl? > Warning in install.packages : > installation of package ?rgl? had non-zero exit status > > The downloaded source packages are in > ?/tmp/RtmpasrV5Z/downloaded_packages?It seems you are missing a library "libGL". You seem to have installes libGL*-devel but not the library itself. Hope that helps. Detlef El vie, 04-01-2013 a las 13:44 +0100, Jose Luis Cañadas escribió:> No sabría decirte cuál anda mejor. Yo estaba usando linux mint debian > con xfce y R iba bien, pero tenía un problema con RStudio y he instalado > xubuntu 12.10. > > No conozco SUSE , pero supongo que tendrá un sistema de paquetería. > Prueba a instalar las librerías que te indico y luego instala rgl > directamente desde R a ver. Si no compila bien, fíjate en el log ,ya que > ahí te da pistas sobre qué le falta. > > Saludos. > El 04/01/13 09:35, Marcuzzi, Javier Rubén escribió: > > Estimado José Luis > > > > No ando con suerte, estoy utilizando linux SUSE 12.2 (esta en prueba la > > 12.3), no me fue posible la instalación glEnd ... falta al correr el > > autoconfig y compilar en R cuando instala RGL, no lo encuentro. > > > > En navidad instale SUSE, ubuntu al actualizar (24 diciembre) "borraba" > > la conección al wifi, solo andaba la red por cable (yo uso una > > portátil), y por otro lado SUSE me da mejor experiencia de usuario con R > > y algunas otras cosas, la batería dura más, R se instala desde CRAN con > > hacer click en un archivo de CRAN, hay una asociación entre R y SUSE que > > me da la sensación de ser una computadora rápida. Todo lindo hasta el > > problema con RGL. > > > > Podría instalar Ubuntu, otra versión, pero tengo que estudiarlo. Al día > > de hoy ¿que linux anda mejor con R?, ¿cual usar?, posiblemente no hay > > una respuesta. > > > > Javier Marcuzzi > > > > El vie, 04-01-2013 a las 09:59 +0100, Jose Luis Cañadas escribió: > >> Hola Javier. > >> Te respondo a la primera parte, de cómo instalar rgl en linux > >> > >> Si usas ubuntu o debian, suele venir en los repositorios oficiales. > >> Es aconsejable instalar los repositorios que se indican en CRAN. > >> > >> Repositorios extras. > >> > >> Si usas ubuntu : https://launchpad.net/~marutter/+archive/c2d4u > >> > >> Si usas debian: http://debian-r.debian.net/debian-r/ > >> > >> Si instalas directamente rgl desde R , quizá tengas problemas de > >> dependencias. Estos son algunos paquetes que quizá sea necesario instalar > >> libgl1-mesa-dev > >> libgl-dev > >> libglu1-mesa-dev > >> libglu-dev > >> libpng12-dev > >> libx11-dev > >> libxt-dev > >> x11proto-core-dev > >> > >> Ya nos cuentas. > >> > >> Un saludo. > >> > >> > >> El 04/01/13 02:17, Marcuzzi, Javier Rubén escribió: > >>> Hola a todos > >>> Para comenzar el año con "papelones": desde mi desconocimiento, estoy > >>> acomodando unos datos para luego leer en R, no sabía bien que usar, pero > >>> si conozco que con datos desordenados cualquier intento serio quedaría > >>> en un intento, R es bueno pero si los datos son malos ... > >>> Observando sus correos encuentro dos preguntas, una es ¿como se instala > >>> RGL en linux? (me falta algo que desconozco), la segunda pregunta es > >>> porque quiero ver esos gráficos en 3D (sin RGL se complica). > >>> Mi intención: llegar a un gráfico donde se visualicen esferas de > >>> distintos tamaños (como esos circulos que están conectados en la tesis > >>> de Benjamín), pero pienso en esferas como si fuesen planetas, con sus > >>> lunas, soles, constelaciónes, etc. > >>> Es un desafío personal, una idea de hace tiempo, y veo la tesis de > >>> Benajmin y hay una gran pista para mi idea original. > >>> R ¿podría dibujar mi universo paralelo? "¿medio loco?" Quizás cuando > >>> pueda instalar RGL en R y ver los ejemplos el paquete igraph ya tiene > >>> todo lo requerido. > >>> > >>> Javier Marcuzzi > >>> > >>> El jue, 03-01-2013 a las 13:05 +0100, Pedro Concejero Cerezo escribió: > >>>> Hola, despus de echar una ojeada a la tesis de Benjamn Vargas (http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tena ni idea de estas redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con R-igraph. > >>>> > >>>> El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las convenciones de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" segn los criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la funcin dist para generar la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner esta matriz como opcin, o hacer la poda previamente en el data frame. > >>>> > >>>> Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su pgina en sourceforge: http://igraph.sourceforge.net/index.html > >>>> > >>>> Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es un software opensource con muchas funciones especficas para visualizacin. La combinacin de R-igraph con gephi es potentsima para abordar tanto la analtica como la visualizacin. > >>>> > >>>> Espero que te sea til, y por supuesto, Feliz Ao eRReRos! > >>>> Pedro > >>>> > >>>> El 02/01/2013 23:20, r-help-es-request en r-project.org<mailto:r-help-es-request en r-project.org> escribi: > >>>> > >>>> Message: 1 > >>>> Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100 > >>>> From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es><mailto:cof en qualityexcellence.es> > >>>> To: Juan Antonio Gil Pascual <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es> > >>>> Cc: Lista R <r-help-es en r-project.org><mailto:r-help-es en r-project.org> > >>>> Subject: Re: [R-es] redes pathfinder > >>>> Message-ID: > >>>> <CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com> > >>>> Content-Type: text/plain > >>>> > >>>> Hola, > >>>> > >>>> Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan especficamente con > >>>> redes permiten obtener tu caso?. > >>>> > >>>> Feliz Ao! > >>>> Carlos Ortega > >>>> www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es> > >>>> > >>>> > >>>> El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual > >>>> <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es>escribi: > >>>> > >>>> > >>>> > >>>>> Estimados compaeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quera > >>>>> saber si conocis alguna librera o funcin para dada la matriz de > >>>>> proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. > >>>>> > >>>>> Un cordial saludo y un mejor ao 2013. > >>>>> > >>>>> Juan > >>>>> > >>>>> -- > >>>>> ==============================**==========================> >>>>> Juan Antonio Gil Pascual > >>>>> Prof. Titular de Metodologa Cuantitatva > >>>>> correo: jgil en edu.uned.es<mailto:jgil en edu.uned.es> > >>>>> web: www.uned.es/personal/jgil<http://www.uned.es/personal/jgil> > >>>>> > >>>>> U.N.E.D. > >>>>> Fac. de Educacin > >>>>> Dpto. MIDE I > >>>>> c/Juan del Rosal,14 desp. 272 > >>>>> 28040 MADRID > >>>>> Tel. 91 398 72 79 > >>>>> Fax. 91 398 72 88 > >>>>> > >>>> -- > >>>> Pedro Concejero > >>>> User Modeling - Analytics @ Telefnica I+D<http://www.tid.es/es/Paginas/default.aspx> > >>>> Part of Telefnica Digital<http://www.telefonica.com/es/digital/html/home/home.shtml> / Telefnica Digital Hub (english)<http://blog.digital.telefonica.com/> > >>>> E-mail: pedro.concejero en tid.es<mailto:pedro.concejero en tid.es> > >>>> skype: pedro.concejero > >>>> twitter: @ConcejeroPedro > >>>> linkedin <http://www.linkedin.com/in/pedroconcejero/es> > >>>> > >>>> ________________________________ > >>>> > >>>> Este mensaje se dirige exclusivamente a su destinatario. Puede consultar nuestra poltica de envo y recepcin de correo electrnico en el enlace situado ms abajo. > >>>> This message is intended exclusively for its addressee. We only send and receive email on the basis of the terms set out at: > >>>> http://www.tid.es/ES/PAGINAS/disclaimer.aspx > >>>> > >>>> [[alternative HTML version deleted]] > >>>> > >>>> _______________________________________________ > >>>> R-help-es mailing list > >>>> R-help-es en r-project.org > >>>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > >>> _______________________________________________ > >>> R-help-es mailing list > >>> R-help-es en r-project.org > >>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > >> _______________________________________________ > >> R-help-es mailing list > >> R-help-es en r-project.org > >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > >
Hola a todos Bueno, ahora que pude instalar igraph con todo (rgl) pude ver un ejemplo:> library(igraph) > g <- graph.lattice( c(5,5,5) ) > coords <- layout.fruchterman.reingold(g, dim=3) > rglplot(g, layout=coords)Por lo que posiblemente R con igraph pueda realizar un gráfico como el que pensé, claro, ahora hay que estudiar el como, pero la herramienta aparentemente existe. Javier Marcuzzi El jue, 03-01-2013 a las 22:17 -0300, Marcuzzi, Javier Rubén escribió:> Hola a todos > Para comenzar el año con "papelones": desde mi desconocimiento, estoy > acomodando unos datos para luego leer en R, no sabía bien que usar, pero > si conozco que con datos desordenados cualquier intento serio quedaría > en un intento, R es bueno pero si los datos son malos ... > Observando sus correos encuentro dos preguntas, una es ¿como se instala > RGL en linux? (me falta algo que desconozco), la segunda pregunta es > porque quiero ver esos gráficos en 3D (sin RGL se complica). > Mi intención: llegar a un gráfico donde se visualicen esferas de > distintos tamaños (como esos circulos que están conectados en la tesis > de Benjamín), pero pienso en esferas como si fuesen planetas, con sus > lunas, soles, constelaciónes, etc. > Es un desafío personal, una idea de hace tiempo, y veo la tesis de > Benajmin y hay una gran pista para mi idea original. > R ¿podría dibujar mi universo paralelo? "¿medio loco?" Quizás cuando > pueda instalar RGL en R y ver los ejemplos el paquete igraph ya tiene > todo lo requerido. > > Javier Marcuzzi > > El jue, 03-01-2013 a las 13:05 +0100, Pedro Concejero Cerezo escribió: > > Hola, despus de echar una ojeada a la tesis de Benjamn Vargas (http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tena ni idea de estas redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con R-igraph. > > > > El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las convenciones de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" segn los criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la funcin dist para generar la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner esta matriz como opcin, o hacer la poda previamente en el data frame. > > > > Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su pgina en sourceforge: http://igraph.sourceforge.net/index.html > > > > Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es un software opensource con muchas funciones especficas para visualizacin. La combinacin de R-igraph con gephi es potentsima para abordar tanto la analtica como la visualizacin. > > > > Espero que te sea til, y por supuesto, Feliz Ao eRReRos! > > Pedro > > > > El 02/01/2013 23:20, r-help-es-request en r-project.org<mailto:r-help-es-request en r-project.org> escribi: > > > > Message: 1 > > Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100 > > From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es><mailto:cof en qualityexcellence.es> > > To: Juan Antonio Gil Pascual <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es> > > Cc: Lista R <r-help-es en r-project.org><mailto:r-help-es en r-project.org> > > Subject: Re: [R-es] redes pathfinder > > Message-ID: > > <CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com> > > Content-Type: text/plain > > > > Hola, > > > > Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan especficamente con > > redes permiten obtener tu caso?. > > > > Feliz Ao! > > Carlos Ortega > > www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es> > > > > > > El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual > > <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es>escribi: > > > > > > > > > Estimados compaeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quera > > > saber si conocis alguna librera o funcin para dada la matriz de > > > proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. > > > > > > Un cordial saludo y un mejor ao 2013. > > > > > > Juan > > > > > > -- > > > ==============================**==========================> > > Juan Antonio Gil Pascual > > > Prof. Titular de Metodologa Cuantitatva > > > correo: jgil en edu.uned.es<mailto:jgil en edu.uned.es> > > > web: www.uned.es/personal/jgil<http://www.uned.es/personal/jgil> > > > > > > U.N.E.D. > > > Fac. de Educacin > > > Dpto. MIDE I > > > c/Juan del Rosal,14 desp. 272 > > > 28040 MADRID > > > Tel. 91 398 72 79 > > > Fax. 91 398 72 88 > > > > > > > > > -- > > Pedro Concejero > > User Modeling - Analytics @ Telefnica I+D<http://www.tid.es/es/Paginas/default.aspx> > > Part of Telefnica Digital<http://www.telefonica.com/es/digital/html/home/home.shtml> / Telefnica Digital Hub (english)<http://blog.digital.telefonica.com/> > > E-mail: pedro.concejero en tid.es<mailto:pedro.concejero en tid.es> > > skype: pedro.concejero > > twitter: @ConcejeroPedro > > linkedin <http://www.linkedin.com/in/pedroconcejero/es> > > > > ________________________________ > > > > Este mensaje se dirige exclusivamente a su destinatario. Puede consultar nuestra poltica de envo y recepcin de correo electrnico en el enlace situado ms abajo. > > This message is intended exclusively for its addressee. We only send and receive email on the basis of the terms set out at: > > http://www.tid.es/ES/PAGINAS/disclaimer.aspx > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > _______________________________________________ > > R-help-es mailing list > > R-help-es en r-project.org > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > >
No sabría decirte cuál anda mejor. Yo estaba usando linux mint debian con xfce y R iba bien, pero tenía un problema con RStudio y he instalado xubuntu 12.10. No conozco SUSE , pero supongo que tendrá un sistema de paquetería. Prueba a instalar las librerías que te indico y luego instala rgl directamente desde R a ver. Si no compila bien, fíjate en el log ,ya que ahí te da pistas sobre qué le falta. Saludos. El 04/01/13 09:35, Marcuzzi, Javier Rubén escribió:> Estimado José Luis > > No ando con suerte, estoy utilizando linux SUSE 12.2 (esta en prueba la > 12.3), no me fue posible la instalación glEnd ... falta al correr el > autoconfig y compilar en R cuando instala RGL, no lo encuentro. > > En navidad instale SUSE, ubuntu al actualizar (24 diciembre) "borraba" > la conección al wifi, solo andaba la red por cable (yo uso una > portátil), y por otro lado SUSE me da mejor experiencia de usuario con R > y algunas otras cosas, la batería dura más, R se instala desde CRAN con > hacer click en un archivo de CRAN, hay una asociación entre R y SUSE que > me da la sensación de ser una computadora rápida. Todo lindo hasta el > problema con RGL. > > Podría instalar Ubuntu, otra versión, pero tengo que estudiarlo. Al día > de hoy ¿que linux anda mejor con R?, ¿cual usar?, posiblemente no hay > una respuesta. > > Javier Marcuzzi > > El vie, 04-01-2013 a las 09:59 +0100, Jose Luis Cañadas escribió: >> Hola Javier. >> Te respondo a la primera parte, de cómo instalar rgl en linux >> >> Si usas ubuntu o debian, suele venir en los repositorios oficiales. >> Es aconsejable instalar los repositorios que se indican en CRAN. >> >> Repositorios extras. >> >> Si usas ubuntu : https://launchpad.net/~marutter/+archive/c2d4u >> >> Si usas debian: http://debian-r.debian.net/debian-r/ >> >> Si instalas directamente rgl desde R , quizá tengas problemas de >> dependencias. Estos son algunos paquetes que quizá sea necesario instalar >> libgl1-mesa-dev >> libgl-dev >> libglu1-mesa-dev >> libglu-dev >> libpng12-dev >> libx11-dev >> libxt-dev >> x11proto-core-dev >> >> Ya nos cuentas. >> >> Un saludo. >> >> >> El 04/01/13 02:17, Marcuzzi, Javier Rubén escribió: >>> Hola a todos >>> Para comenzar el año con "papelones": desde mi desconocimiento, estoy >>> acomodando unos datos para luego leer en R, no sabía bien que usar, pero >>> si conozco que con datos desordenados cualquier intento serio quedaría >>> en un intento, R es bueno pero si los datos son malos ... >>> Observando sus correos encuentro dos preguntas, una es ¿como se instala >>> RGL en linux? (me falta algo que desconozco), la segunda pregunta es >>> porque quiero ver esos gráficos en 3D (sin RGL se complica). >>> Mi intención: llegar a un gráfico donde se visualicen esferas de >>> distintos tamaños (como esos circulos que están conectados en la tesis >>> de Benjamín), pero pienso en esferas como si fuesen planetas, con sus >>> lunas, soles, constelaciónes, etc. >>> Es un desafío personal, una idea de hace tiempo, y veo la tesis de >>> Benajmin y hay una gran pista para mi idea original. >>> R ¿podría dibujar mi universo paralelo? "¿medio loco?" Quizás cuando >>> pueda instalar RGL en R y ver los ejemplos el paquete igraph ya tiene >>> todo lo requerido. >>> >>> Javier Marcuzzi >>> >>> El jue, 03-01-2013 a las 13:05 +0100, Pedro Concejero Cerezo escribió: >>>> Hola, despus de echar una ojeada a la tesis de Benjamn Vargas (http://www.ugr.es/~benjamin/Tesis-Benjamin.pdf, no tena ni idea de estas redes), puedo confirmar lo que propone Carlos Ortega, esto es, todo lo que se hace en esta tesis, entre ello las redes pathfinder, se puede hacer con R-igraph. >>>> >>>> El punto de partida puede ser un data frame que, si se respeta las convenciones de nomenclatura de nodos, igraph convierte en un grafo. Una vez generado el grafo (si no me equivoco, las PFNETs son grafos "podados" segn los criterios de q y r) se pueden utilizar los layouts de igraph, que tiene unos cuantos (mira layout en http://igraph.sourceforge.net/doc/R/igraph.pdf). Si se debe usar la distancia de Minkowski se puede usar la funcin dist para generar la matriz de distancia de nodos (aparte de igraph) y en layout le puedes poner esta matriz como opcin, o hacer la poda previamente en el data frame. >>>> >>>> Por cierto la mejor referencia para igraph es la de su pgina en sourceforge: http://igraph.sourceforge.net/index.html >>>> >>>> Para visualizar las redes generadas un camino alternativo que hacemos con frecuencia es exportar el grafo resultante a graphml y leerlo en gephi, que es un software opensource con muchas funciones especficas para visualizacin. La combinacin de R-igraph con gephi es potentsima para abordar tanto la analtica como la visualizacin. >>>> >>>> Espero que te sea til, y por supuesto, Feliz Ao eRReRos! >>>> Pedro >>>> >>>> El 02/01/2013 23:20, r-help-es-request en r-project.org<mailto:r-help-es-request en r-project.org> escribi: >>>> >>>> Message: 1 >>>> Date: Wed, 2 Jan 2013 14:52:02 +0100 >>>> From: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es><mailto:cof en qualityexcellence.es> >>>> To: Juan Antonio Gil Pascual <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es> >>>> Cc: Lista R <r-help-es en r-project.org><mailto:r-help-es en r-project.org> >>>> Subject: Re: [R-es] redes pathfinder >>>> Message-ID: >>>> <CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com><mailto:CAOKbq8hQ9Y0kbOT-jV8HMdLqVadOyFJLfD3QBnWDGZ1HL=UT7g en mail.gmail.com> >>>> Content-Type: text/plain >>>> >>>> Hola, >>>> >>>> Has visto si los paquetes "igraph" o "sna" que tratan especficamente con >>>> redes permiten obtener tu caso?. >>>> >>>> Feliz Ao! >>>> Carlos Ortega >>>> www.qualityexcellence.es<http://www.qualityexcellence.es> >>>> >>>> >>>> El 1 de enero de 2013 21:04, Juan Antonio Gil Pascual >>>> <jgil en edu.uned.es><mailto:jgil en edu.uned.es>escribi: >>>> >>>> >>>> >>>>> Estimados compaeros estoy con un trabajo sobre redes pathfinder y quera >>>>> saber si conocis alguna librera o funcin para dada la matriz de >>>>> proximidades sacar la matriz de la red pathfinder. >>>>> >>>>> Un cordial saludo y un mejor ao 2013. >>>>> >>>>> Juan >>>>> >>>>> -- >>>>> ==============================**==========================>>>>> Juan Antonio Gil Pascual >>>>> Prof. Titular de Metodologa Cuantitatva >>>>> correo: jgil en edu.uned.es<mailto:jgil en edu.uned.es> >>>>> web: www.uned.es/personal/jgil<http://www.uned.es/personal/jgil> >>>>> >>>>> U.N.E.D. >>>>> Fac. de Educacin >>>>> Dpto. MIDE I >>>>> c/Juan del Rosal,14 desp. 272 >>>>> 28040 MADRID >>>>> Tel. 91 398 72 79 >>>>> Fax. 91 398 72 88 >>>>> >>>> -- >>>> Pedro Concejero >>>> User Modeling - Analytics @ Telefnica I+D<http://www.tid.es/es/Paginas/default.aspx> >>>> Part of Telefnica Digital<http://www.telefonica.com/es/digital/html/home/home.shtml> / Telefnica Digital Hub (english)<http://blog.digital.telefonica.com/> >>>> E-mail: pedro.concejero en tid.es<mailto:pedro.concejero en tid.es> >>>> skype: pedro.concejero >>>> twitter: @ConcejeroPedro >>>> linkedin <http://www.linkedin.com/in/pedroconcejero/es> >>>> >>>> ________________________________ >>>> >>>> Este mensaje se dirige exclusivamente a su destinatario. Puede consultar nuestra poltica de envo y recepcin de correo electrnico en el enlace situado ms abajo. >>>> This message is intended exclusively for its addressee. 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