similar to: ROC curve with survival data

Hi, Anybody knows a function that can fit haplotype data to a Cox model. I've been searching it in the web without succeed. I use "haplo.stats" package, but unfortunatelly it's not possible to analyse survival data, amb I right?. Thanks in advance. Isaac Subirana (isubirana@imim.es) [[alternative HTML version deleted]]

Hi, Does anybody know how to obtain the same information as the SPSS command "DISPLAY DICTIONARY". I know the read.spss function in the package foreign, but it doesn't give either the missing values defined by the user under SPSS or the format variables (for example if they are dates or not). Thanks in advance. Isaac Subirana (isubirana@imim.es) [[alternative HTML

Hi R-users, When I import a data base from SPSS with some variable with a name of more than 8 characters (which is possible in version 12 or later of SPSS software) I find that the name of these variables have been truncated to 8 characters. I used the 'read.spss' function from the 'foreign' package. Is there a function in R that solves this 'length variable names'

I've calculated as follows: matusita<-function(f1,f2,lw,up){ fmatu<-function(x) ( sqrt(f1(x)) - sqrt(f2(x)) )^2 sqrt (integrate( fmatu, lower=lw, upper=up, subdivisions=1000000)$value) } Josué Almansa Unitat de Recerca en Serveis Sanitaris Institut Municipal d'Investigació Mèdica, IMIM c/ Doctor Aiguader, 80 08003 Barcelona e-mail: jalmansa@imim.es

Hi, Does anybody know how to perform a Cox model analysis for right truncated data? All my data is right truncated, since I only have patients who entered in a hospital for a particular desease, and I would like to modelate the age at hospital entrance as the response variable. Thanks in advance. Isaac Subirana. isubirana@imim.es -------- La informació continguda en aquest missatge i

¡Hola! ¿Alguien sabe si existe una función en R que devuelve el nombre del área de trabajo (workspace) en uso si éste ha sido guardado anteriormente? Con getwd() R me devuelve la carpeta de trabajo, pero si en ésta tengo varios áreas de trabajo guardados, p.e. a.RData y b.RData, ¿cómo podría saber en cuál estoy trabajando si por un despiste no me acordara cuál he abierto anteriormente (sin tener

I have a question about how to compare a GLM with a GAM model using anova function. A GLM is performed for example: model1 <-glm(formula = exitus ~ age+gender+diabetes, family = "binomial", na.action = na.exclude) A second nested model could be: model2 <-glm(formula = exitus ~ age+gender, family = "binomial", na.action = na.exclude) To compare these two GLM

Dear R users, I am building a packaged where I want to use the "update.formula" function, but modifying the option "simplify = TRUE" to "FALSE". Since this is not an argument, I modified the code and created a new function as: update.formula2 <- function (old, new, ...) { tmp <- .Internal(update.formula(as.formula(old), as.formula(new))) out <-

Hello all, I've tried to reproduce the contour plot that appears in the book of Venables and Ripley, at page 255. Is a F-statistic surface and a confidence region for the regression parameters of a non-linear model. It uses the stormer data that are in the MASS package. I haven't been able to reproduce the plot either in R ( version 1.5 ) and S. It makes the axes and it puts the

Amigos de la erre. He creado mi primer bucle con for para entrenar unos modelos con GAM. La respuesta es quasipoisson porque estoy trabajando con densidades de peces. Sin embargo, tengo un problema, no se muy bien como añadir el offset a la formula siguiente cuando creo el bucle. GAM.A1 <-gam ((DYO)~s(DMA,k=4)+ s(WOD,k=4)+s(CIN,k=4)+s(DRA,k=4)+s(DBR,k=4)

Hi everyone, Does anybody knows if there is an equivalent R function that gives the same outcome as in "Explore" function in SPSS ? (Analize->Descriptive Statistics->Explore) It does a categorical vs quantitative variables analysis. ( But not linear regression) I need to compare intragroup (categorical variable with 4 values) means and confidence intervals of a quantitative

Amigos de la erre. He creado mi primer bucle con for para entrenar unos modelos con GAM. La respuesta es quasipoisson porque estoy trabajando con densidades de peces. Sin embargo, tengo un problema, no se muy bien como añadir el offset a la formula siguiente cuando creo el bucle. GAM.A1 <-gam ((DYO)~s(DMA,k=4)+ s(WOD,k=4)+s(CIN,k=4)+s(DRA,k=4)+s(DBR,k=4)

I'm trying to use procmail and I'm having trouble getting it to set some headers. I have one mailing list that sets ?Newsgroups: in the header and I want to remove it. I have the following test recipe: :0 * ^Subject:.*\<testing * ^(Mime-Version:|Content-) | formail -IMime-Version: -IContent- If I understand it correctly, it should remove the Mime-Verion and Content headers. The

Hola a todos, y gracias por leer mi mensaje: Llevo utilizando unos meses R, vengo de SPSS, y estoy muy sorprendido con su capacidad. Mi problema, es que estoy intentando hacer una comparación entre tres sistemas de predicción: una regresión logística, un árbol de clasificación y una red neuronal. De momento, he podido hacer las comparaciones con los dos primeros sistemas, pero mi problema es la

>Hola colegas, no encuentro como hacer el Mann-Whitney U Test en R. > > Alguna solución????? > > Un abrazo a todos. > > Leonardo > Hola Leonardo: La prueba de Mann-Whitney también se conoce como la prueba de suma de rangos de wilcoxon y puede calcularse mediante la función wilcox.test Un saludo, Nicolás Benítez Parejo Técnico de Evaluación e Investigación Agencia

I might be missing something but I thought that AUC was a measure for comparing ROC curves, so there is nothing else needed to "compare" them. The larger AUC is the higher correlation of 2 variables compared. No other measures or calculations are needed. Jarek Tuszynski -----Original Message----- From: r-help-bounces at stat.math.ethz.ch [mailto:r-help-bounces at stat.math.ethz.ch] On

2010/9/6 <r-help-es-request@r-project.org> > Envíe los mensajes para la lista R-help-es a > r-help-es@r-project.org > > Para subscribirse o anular su subscripción a través de la WEB > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > O por correo electrónico, enviando un mensaje con el texto "help" en > el asunto (subject) o en el cuerpo a:

Hola a todos. En linux uso rkward o gedit con el plugin Rgedit, pero me gustaría saber qué editores se pueden usar en windows. He probado Tinn-R , ¿qué usáis vosotros? Gracias

What is the difference between ROC curve and gains/lift chart? how to do them in R? Thanks. -- View this message in context: http://www.nabble.com/ROC-curve-and-gains-lift-chart-tp25083979p25083979.html Sent from the R help mailing list archive at Nabble.com.

Hello R-List: Does anybody have code to optimize a logistic regression using ROC curves? I've seen S+ code that does it but never in R. Thanks. __________________________________________________ You Rock! Your E-mail should, too. Visit Rock.com! [[alternative HTML version deleted]]