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2016 Dec 21
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Modificación de ejes con ggplot
Hola, Estoy haciendo unas gráficas de evolución temporal con el paquete "ggplot" y me he encontrado con una dificultad que no logro resolver. En el eje "x" tengo las fechas y en el "y" la concentración de un parámetro. En el eje x me sale de forma predeterminada intervalos en años (de 2012 a 2016), y unicamente salen 3 etiquetas (una cada 2 años). Necesito
2012 May 07
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que valores está informando R en summary???
Hola a todos! perdón por molestarlos nuevamente con los contrastes, pero estoy trantando de entender que es lo que está haciendo R y de donde vienen los valores que informa pero  no lo logro. Creí haberlo entendido pero a la hora de usar mis datos los resultados no dan como deberían. Tengo dos variables explicativas que son factores con 3 niveles cada uno. Esta es la tabla de medias de la
2010 Nov 19
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help
Hola, Tengo la base de datos de un censo agropecuario el cual está en formato de SPSS, cuando cuando ejecuto el comando para introducirlo a R, despues de permanecer lento R, aparece esto: Error: cannot allocate vector of size 1.6 Mb Hasta aquí llega y no introduce ninguna observación. Mi pregunta es si existe alguna solución, talvez aumentar la memoria de R?? Imagino que como ustedes han
2015 Aug 02
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ayuda con análisis de supervivencia
Hola a todos, -Estoy estudiando el efecto de dos genotipos (~tratamientos) en la aparición de síndrome metabólico (MetS) con datos longitudinales recogidos a tiempo 0,7,10,15,20 y 25 años. -He hecho un dataframe con las siguientes variables MetS: Síndrome Metabólico (Si=1,No=0) bmi: Indice de masa corporal (IMC) cuando se produce la conversión a MetS+ . Para los que permancen MetS-, esta variable
2018 Feb 19
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gbm.step para clasificación no binaria
Gracias Carlos. Hasta donde yo entiendo si las hay: El argumento family puede ser: "gaussian" (for minimizing squared error); por lo que tiene que ser numérica "bernoulli" (logistic regression for 0-1 out-comes); binaria por narices "poisson" (count outcomes; requires the response to be a positive integer); numérica también, pues. La única podría ser
2011 Aug 12
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problem in asreml function in wgaim package
Dear R users,   I am trying to use "wgaim" package for QTL analysis using mixed model approach. But i am stuck with "asreml" function while using "wgaim" package. Do i need a separate package to activate "asreml" function beside "wgaim" package ?   If so, i tried to download "Asreml-R" package (i guess this is right package
2018 Feb 19
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Gráficas 3D
Gracias Carlos, mi idea es construir un cono, un cilindro u otros cuerpos geométrico y luego graficarlos. Alguna idea de como empezar? Muchas gracias como siempre El lun., 19 de feb. de 2018 15:06, <r-help-es-request en r-project.org> escribió: > Envíe los mensajes para la lista R-help-es a > r-help-es en r-project.org > > Para subscribirse o anular su subscripción a
2009 Mar 02
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how to pass a command variable in DOS to R program in R CMD BATCH
Hi all, I need to run a program (asreml) thousands of times and each time I have to provide a slightly different dataset. Because I have to run asreml under Windows (DOS or scripts) environment, I have trouble to pass a command variable (or pointer variable or %counter in the following example) to R program so at each counter R can generate a different data set for asreml to run. Any
2007 May 15
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qr.solve and lm
Dear R experts, I have a Matlab code which I am translating to R in order to examine and enhance it. First of all, I need to reproduce in R the results which were already obtained in Matlab (to make sure that everything is correct). There are some matrix manipulations and '\' operation among them in the code. I have the following data frame > ABS.df Pro syn
2014 Apr 30
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Anova 2 vías NO PARAMÉTRICO
Hola, tenemos como equivalencia no paramétrica al Anova de 1 vía el test Kruskal Wallis, pero ¿existe un test no paramétrico equivalente al Anova de 2 vías? Gracias. Saludos. -- Sec. Apoyo Estadístico. Servicio de Apoyo a la Investigación (SAI) Vicerrectorado de Investigación e Internacionalización. Universidad de Murcia Edif. SACE. Campus de Espinardo. 30100 Murcia @. mariaelvira.ferre en
2013 Mar 19
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how to do association study based on mixed linear model
Dear All: I want to do association study based on mixed linear model, My model not only includes serval fixed effects and random effects but also incorporates some covariates such as "birth weight". Otherwise, the size of the data are about 180 individuals and 12 variables and 60000 Fixed effect estimates As asreml-R is not free ,is there any packages for my study? I heard nlme or
2015 Jan 22
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Simulación de modelo logit con interacción
Hola, Deseo simular un modelo logit con interacción, estimar sus coeficientes y comprobar si son o no parecidos al modelo teórico. Con este ejemplo obtengo que los coeficientes estimados no se asemejan mucho a los originales. ¿Se le ocurre a alguien cuál es el motivo de esta discrepancia? ¿y cómo solucionarlo? Muchas gracias Emilio logisticsimulation <- function(n){ dat <-
2018 May 23
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coef does not work for my ASReml model
Hi Everyone, I am using ASReml to fit a spatial model. I do not have all the components of ASReml when I call; names(summary()) e.g. names(summary(fcov.asr2)) [1] "call" "loglik" "nedf" "sigma" "varcomp" I am trying to get the coefs but I get "NULL". Does anybody know the reason? Any help would be much appreciated. Regards
2011 Oct 21
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lattice::xyplot/ggplot2: plotting weighted data frames with lmline and smooth
In the HistData package, I have a data frame, PearsonLee, containing observations on heights of parent and child, in weighted form: library(HistData) > str(PearsonLee) 'data.frame': 746 obs. of 6 variables: $ child : num 59.5 59.5 59.5 60.5 60.5 61.5 61.5 61.5 61.5 61.5 ... $ parent : num 62.5 63.5 64.5 62.5 66.5 59.5 60.5 62.5 63.5 64.5 ... $ frequency: num 0.5 0.5
2010 Mar 05
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Defining a method in two packages
The coxme package has a ranef() method, as does lme4. I'm having trouble getting them to play together, as shown below. (The particular model in the example isn't defensible, but uses a standard data set.) The problem is that most of the time only one of lme4 or coxme will be loaded, so each needs to define the basic ranef function as well as a method for it. But when loaded together
2015 Feb 04
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Interpretación de coeficientes en un cox proportional hazards con variable strata
Buenas. Abajo pongo la salida de un modelo de cox , dónde he estratificado por una variable de país (Countryb) y por otra (Q6). Además hay interacción entre la variable mobilityPDurG2 (es una variable 0,1, y 0 es la categoría de referencia) país. La categoría de referencia para país es "united kingdom". Mi duda surge si quiero calcular el hazard ratio para los que tienen un 1
2010 Sep 23
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How to pass a model formula as argument to with.mids
Hello I would like to pass a model formula as an argument to the with.mids function from the mice package. The with.mids functon fits models to multiply imputed data sets. Here's a simple example library(mice) #Create multiple imputations on the nhanes data contained in the mice package. imp <- mice(nahnes) #Fitting a linear model with each imputed data set the regular way works
2011 Jul 08
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Efectos aleatorios, interaccions y SNK, LSD o Tukey
Queridos R-users: Tengo una duda que hace mucho tiempo que estoy intentando resolver, os explico a modo de ejemplo: Tengo estos efectos: Año(5 niveles),Localidad (10 niveles) y genotipo (3 niveles), año y localidad son aleatorios y genotipo es fijo (los he escogido yo). Me gustaría hacer obtener una tabla parecida a la Tabla Anova donde aparezca cada factor y sus interacciones y
2019 Jan 28
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instalar administrar RStudio Server Open Source
Hola Jesús, Muchas gracias por tu respuesta. Te comento algunas dudas iniciales que tengo respecto a la versión gratuïta de RStudio Server Open Source. * Características técnicas del servidor: Consulté hace unos días el enlace que has pasado (https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/), donde se apunta que Rstudio Server puede instalarse en plataformas Linux. Según indican
2017 Feb 24
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Rstudio
Estimados colegas: Tuve que instalar en mi PC Ubuntu 16.10 y quiero instalar nuevamente RStudio, sin embargo no sucede así, porque en la terminal se indica que hay dependencias incumplidas. He encontrado que se ha cambiado una librería libgstreamer y no se como hacer para que se pueda instalar adecuadamente el paquete RStudio. ¿Alguno de ustedes me puede decir el procedimiento completo para lograr