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2013 Aug 27
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Encontrar las variables más importantes en componentes principales
Hola compañeros de la lista. Qué tal.
Tengo un análisis de componentes principales, en el que se evalúan
aproximadamente 1000 variables. Usando la función dudi.pca e
inertia.dudi obtengo una cantidad de información sobre la influencia de
las variables sobre los dos componentes principales. Me gustaría saber
si existe alguna función que sobre esta información me arrojara la lista
de
2013 Aug 29
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Encontrar las variables más importantes en componentes principales
Hola Argel,
Puedes encontrar un par de ejemplos que cómo conseguir una valoración
(qualitativa y cuantitativa) de la contribución de cada variable a cada
componente principal, en el libro "Exploratory Multivariate Analysis by
Example Using R".
Este libro está basado en la librería "FactoMineR".
Los ejemplos están en el capítulo primero.
No he mirado como se haría esto con
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Hola compañeros de la lista, qué tal.
Estoy haciendo un análisis de componentes principales utilizando
las funciones "dudi.pca" (paquete "ade4") y "PCA" (paquete
"FactoMineR"). Sucede que al comparar las coordenadas de cada individuo
que obtiene cada función, las que corresponden al segundo componente
principal tienen idéntica magnitud pero con
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Instalo ade4 correctamente y no me abren los datos como por ejemplo
data(bsetal97)
¿Qué piensan de eso?
De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org]
En nombre de Francesc Carmona
Enviado el: Tuesday, October 01, 2013 7:30 AM
Para: r-help-es en r-project.org
Asunto: Re: [R-es] Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Por definición
2013 Oct 02
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Efectivamente. Puedes cambiar el signo de todos los valores de la
segunda componente, por ejemplo al hacer un gráfico de dispersión.
No creo que se pueda hacer directamente en la función.
Saludos
Francesc
El 01/10/13 17:53, Argel Gastélum Arellánez ha escrit:
> Hola Francesc, muchas gracias por tu respuesta.
>
> Entonces, si quisiera que las gráficas de los resultados de
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Por definición la primera componente principal es una combinación lineal
que maximiza la varianza de modo que si la componente 1 es el vector de
coeficientes a, entonces, el vector -a también puede ser dicha
componente. Las otras componentes, por ejemplo la segunda, es
incorrelacionada con la primera y también maximiza la varianza, luego el
signo no importa.
Así pues, el signo de cada
2013 Jul 23
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Comparación entre dos DL50's
Hola compañeros de la lista.
Tengo el análisis que muestro abajo, para la estimación de la Dosis
Letal Media (DL50) por medio de regresión logística, de dos compuestos
similares (denominados 1 y 2) aplicados a grupos de individuos
similares, evaluando el número de individuos vivos y muertos al final
del ensayo. Mi duda es qué forma me recomiendan para determinar si la
diferencia es
2011 Apr 01
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Predicción de valor máximo en superficie de respuesta, con paquete rsm
Hola compañeros de la lista. Estoy aprendiendo a usar el paquete
"rsm" para superficies de respuesta. Siguiendo este ejemplo todo va
bien, hasta que trato de obtener el valor máximo predicho para la
variable de respuesta en los valores de x1 y x2 estimados.
-------------------------------------------------------------
library("rsm")
ChemReact
CR <- coded.data(ChemReact,
2011 Aug 10
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anova medidas repetidas con lme
Hola compañeros de la lista.
Tengo el siguiente set de datos:
Repeticiones <- c(rep("RI", 14), rep("RII", 14), rep("RIII", 14))
Tiempo <- rep(c(0, 2, 4, 6, 8, 10, 12, 24, 36, 48, 60, 72, 96, 120), 3)
Concentracion_celular <- c(0.4862, 0.5375, 0.4309, 0.4390, 0.4603,
0.4733, 0.3936, 0.9085, 0.5838, 0.5477, 0.6331, 0.8693, 1.0092, 0.6341,
0.5350,
2013 Jul 23
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Comparación entre dos DL50's
H
ola Argel,
Muchisimas gracias por los datos y el codigo! ;-)
Una forma es hacer bootstrap. En
http://www.mayin.org/ajayshah/KB/R/documents/boot.html hay una corta
introduccion.
Seria algo similar a lo siguiente:
d <- LD50.1 - LD50.2 # diferencia real
d
#p = 0.5:
#37.31248
# ------------
# bootstrap
# ------------
B <- 1000 # numero de muestras bootstrap
d.sample <-
2010 Sep 23
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Contraste polinomial con dos factores con niveles no equidistantes
Hola compañeros de la lista, qué tal.
Los molesto con la siguiente duda: Tengo un experimento con dos
factores A y B, cada uno de los cuales tiene los siguientes niveles (que
son concentraciones de dos hormonas vegetales aplicadas a plantas):
niveles del factor A: 0, 0.2, 0.5, 1
niveles del factor B: 0, 0.1, 0.2, 0.5, 1
y mi variable de respuesta es continua, todo dentro del set de datos
2016 Jul 25
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Duda sobre construccion de vectores
Hola buenas tardes comunidad, seguro que hay algo fácil, pero se me escapa y es que estoy hoy algo torpe seguramente, a ver me gustaría hacer lo siguiente:
Dada una matriz M (que puede ser muy grande), me gustaria crear un vector, sin usar bucles (ya que cuando es muy grande, todo puede ser muy lento) del siguiente modo.
Para cada una de sus filas, me gustaría seleccionar un único elemento de una
2013 Jun 26
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Resumen de R-help-es, Vol 52, Envío 33
Hola,
Las presentaciones de la sesión sobre ecuaciones estructurales (SEM) así como los vídeos -como ya anunció Carlos ayer- están subidos a la página del Grupo de Madrid:
http://r-es.org/Grupo+de+Inter%C3%A9s+Local+de+Madrid+-+GIL+Madrid
Saludos!
--
Pedro Concejero
BigData - Analytics @ Telefónica I+D<http://www.tid.es/es/Paginas/default.aspx>
Part of Telefónica
2013 Dec 10
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gplots y alternativas
Hola, queremos consultaros sobre alternativas a esta librería.
http://cran.r-project.org/web/packages/gplots/index.html
Estamos usando gplots para producir pdfs -un único fichero, que integra output en forma de texto y gráficos- como salida de un proceso por lotes para hacer el seguimiento y presentar resultados. Sabemos que hay alternativas como knitr y sweave, pero nos parecen mucho más
2013 Oct 29
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Hoy reunión del "Grupo de Usuarios de R de Madrid - martes 29-octubre"
Para los perezosos como yo, para el talleR de mapas hoy en Madrid:
install.packages(c("maps",
"sp",
"maptools",
"rgdal",
"rgeos",
"mapproj",
"RgoogleMaps",
"plotGoogleMaps",
2016 Jul 25
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Duda sobre construccion de vectores
Creo que me puede valer, muchas gracias Jorge, voy a probarlo y te cuento
From: jorgeivanvelez en gmail.com
Date: Mon, 25 Jul 2016 12:05:05 -0500
Subject: Re: [R-es] Duda sobre construccion de vectores
To: fjroar en hotmail.com
CC: r-help-es en r-project.org
Buenas tardes, Francisco.
Quizás no sea la manera mas eficiente, pero proporciona el resultado que buscas:
R> M <-
2012 May 01
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Coeficiente de determinación - Contribución parcial
Buenos días:
Antes de nada, disculpadme por ocuparos tiempo en el día del trabajador...
Hace unos días o semanas pregunté acerca de cómo calcular la contribución parcial de una componente al Multiple R-squared que devuelve lm.
En su momento Carlos Ortega me informó acerca de varias opciones (ols, regsubsets,... e incluso me referenció un libro). El caso es que por ninguna de las vías he
2012 Sep 27
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Modelos de CRM o Marketing Relacional en R
Quisiera saber si alguien desarrollo modelos de CRM o Marketing Relacional en la herramienta R?
[[alternative HTML version deleted]]
2012 Mar 16
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Cosinor
Hola, ¿qué tal?:
Tengo la siguiente duda:
Para el caso del Cosinor Simple:
Y = M + A * cos(2*pi*t/T + phi) + error
Cuando T conocido, podemos asumir:
Y = M + beta * X1 + gamma * X2 + error,
siendo X1 = cos(2*pi*t/T) y X2 = sin(2*pi*t/T)
En este caso (Cosinor simple) el modelado lo llevo a cabo del siguiente modo:
lm( y ~ X1 + X2)
Para el caso de componentes múltiples:
Y = M + ?Aj *
2009 Nov 24
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extraer un valor de un objeto lmer
>
> Hola, a todos!
Estoy ajustando un modelo componentes de varianza utilizando el paquete
lme4, quiero extraer luego los valores estimados de varianza de cada factor
aleatorio de este objeto lmer y guardarlo en un vector.
Existe la función VarCorr, Esto es lo que hago:
Mi ejemplo: tengo 3 factores NDVIaño; Máx.IH; TV
# Ajusto el modelos
lmer(peligro100 ~ 1 + (1|NDVIaño) + (1|Máx.IH) +