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valores
2014 Jun 13
3
p values con LMER
Hola Manuel
lo he tratado de hacer pero me sale
Error: unexpected string constante in:
"anova(a,as,test=Chisq")
no tengo ni idea de por qué...
Me resulta alucinante no poder contar ya con pvals.fnc. ¿Será imposible hacerse con ello?
Saludos,
Miguel
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El vie, 13/6/14, Manuel Azcárate <mazcarategarcia en gmail.com> escribió:
2014 Jun 13
2
p values con LMER
Hola a todos,
quería preguntaros un medio para obtener los valores p usando lmer. He tratado con pvals.fnc, que es lo que me habían recomendado, pero por algún motivo no está ya disponible etc.
Ésta es la función que tengo, pero da las "t", sin los valores p. Aunque Baayen indica que valores por encima de 2 son significativos necesito saber las p.
resultado = lmer(rt_ln ~ (fre_ln *
2014 Jun 13
3
p values con LMER
Existe discusión sobre el uso de los p-valores en modelos mixtos. Como se
ha dicho antes, para mi lo más adecuado es comparar modelos mediante la
función anova. Por Internet se puede encontrar un buen libro de Douglas
Bates y en español, busca modelos mixtos con R de Luis Cayuela, enfocado
hacia ecología, pero está muy bien
El 13/06/2014 14:00, "Jorge I Velez"
2015 Feb 25
4
DUDA LLENAR MATRIZ CREADA
Buena tarde,
Estoy llevando a cabo un trabajo y no encuentro la forma de llenar una
matriz con el p_value y un estadístico calculado.
Un poco mas detallado, tengo muestras aleatorias, calculo por ejemplo la
prueba t, wilcoxon, etc y requiero llevar por una parte los p_value de k
muestras a una matriz creada anteriormente y por otro lado el valor del
estadístico de las mismas k muestras a otra
2010 Jul 13
6
permutation-based FDR
Hola a todos,
Tengo un pequeño problemilla...
Tengo unas 9000 variables que he contrastado con 1 en concreto con el test
de wilcoxon. He calculado el p-valor, y queria corregirlo con el
permutation-based FDR. He encontrado una funcion con R comp.fdr()que hace
esta corrección, pero te pide que le pongas las variables con las
observaciones y te hace el test (según he entendido). Yo solo quiero
2016 Aug 18
2
Porcentajes por grupos
...o mismo sobre una variable agregada a datos, de modo:
datos$p_Valores <- datos[, Valores/sum(Valores), by=MesAño]
pero no funciona, porque pega un data.table en una única variable:
In `[<-.data.table`(x, j = name, value = value) :
Supplied 2 items to be assigned to 5849 items of column 'pValores'
(recycled leaving remainder of 1 items).
El cálculo es correcto, pero si:
head(datos)
#Solo copio y pego la columna de interés:
pValores
1: 2011-1,2011-1,2011-1,2011-1,2011-1,2011-1,
2: 0.17677003,0.08411600,0.06379952,0.05113864,0.04911275,0.04214248,
3:...
2020 Oct 18
2
Resultado de la consola como un tibble
Buen día
estimados
Estoy tratando de hacer un tibble con los resultados de un apply que se
muestran en la consola que me da R, no estoy seguro si eso se pueda hacer,
pero me gustaría organizar los resultados de esa manera.
mi código es:
data("mtcars")
Mtcars_matriz <- as.matrix(mtcars)
apply(Mtcars_matriz, MARGIN =2, FUN = shapiro.test)
DF2 <- tibble(Variable = NA, W = NA, Pvalue =
2012 Oct 23
1
factor or character
Hi,
The program below work very well.
(snps = c('rs621782_G', 'rs8087639_G', 'rs8094221_T', 'rs7227515_A',
'rs537202_C'))
Selec = todos[ , colnames(todos) %in% snps]
head(Selec)
But, I have a data set with 1.000 columns and I need extract 70 to use
(like snps in command above).
This 70 snps are in a file. So I create a file to extract them with
2011 May 10
0
Series temporales
Hola Jorge:
Disculpa la tardanza pero me han tenido liado en otros menesteres. Yo no
soy ni muchísimo menos un experto ni en series temporales ni en R de hecho
retomo el tema después de muchos (demasiados) años aparcado y dedicándome
a labores de programación pura y dura.
Respecto a la diferencia de resultados con R y Statgraphics, no conozco el
proceso de selección del modelo ARIMA que hace
2020 Oct 18
1
Resultado de la consola como un tibble
Hola,
Bueno, puedes hacer el cálculo de una forma mucho más compacta y rápida.
Esta forma es especialmente recomendable cuando tienes muchas columnas y
muchas filas.
> library(data.table)
> myDT <- as.data.table(mtcars)
> myDTlong <- melt(myDT, measure.vars=1:ncol(myDT))
> myDTlong[ , list(p_value = shapiro.test(value)$p.value, v_stat =
shapiro.test(value)$statistic) , by
2020 Oct 18
0
Resultado de la consola como un tibble
Hola,
No hace falta (en este caso) capturarlo de la consola.
El resultado de la función apply se puede capturar y procesar.
> data("mtcars")
> # Mtcars_matriz <- as.matrix(mtcars)
> res_out <- apply(mtcars, MARGIN =2, FUN = shapiro.test)
>
>
> res_df <- as.data.frame(unlist(res_out))
> res_df$vars <- rownames(res_df)
> rownames(res_df) <- NULL
2016 Aug 17
3
Porcentajes por grupos
Hola.
Necesito calcular los porcentajes de un valor dado (valores) como
porcentaje de la suma de ese mismo valor pero agrupando por una tercera
columna (en este caso, podría ser Mes-Año). El resultado sería el que se ve
en la var: "EnR"
Necesito además que ese resultado quede pegado en mi data.frame.
Año Mes AñoMes Factor Valores enR
2015 1 2015-1 a 105 0.25
2015 1 2015-1 b 104 0.24
2015
2012 Aug 15
4
Import Data from Excel
Dear all,
I want to import just part of an excel data file into R.
I would like to have the data imported without
rownames or colume names.
I used read.delim("clipboard", header=F). Somehow even though
I added the argument "header=F", I still have the row names V1, V2, ...,
Does anyone know how to fix this?
Thanks very much in advance.
Hannah
[[alternative
2016 Mar 28
7
Mann-Whitney con datos temporales
Hola a tod en s,
queremos hacer una comparación entre dos lugares muy alejados entre sí
en relación a la temperatura de cada sitio usando medias horarias de
un período determinado. Sólo hay medidas de un sensor en cada sitio y
queremos saber si las diferencias son significativas o no entre
sitios/curvas. Hemos usado un test de Mann?Whitney U con la función
wilcox.test (paired=F) ya que los