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pd2
2013 Mar 11
4
Pedigreemm
Hola a todos, me gustaría realizar una consulta asociada a la generación
de valores genéticos del pedigreemm en R. Primero generé el archivo de
pedigree incluyendo los parentales para posteriormente estimar la varianza
aditiva y los valores genéticos para cada individuo, relacionando los
individuos por medio de la matriz de parentesco.
Me da todo perfecto, el complemento pedigreemm trabaja muy
2017 Oct 24
0
as.data.frame doesn't set col.names
...sapply(yo, toupper)
E11.5 F20het BA40 E11.5 F20het BA40 E11.5 F20HET
E11.5 F20het BA45 E11.5 F20het BA45 E11.5 F20HET
E11.5 F20het BB84 E11.5 F20het BB84 E11.5 F20HET
E11.5 F9.20DKO KTr3 E11.5 F9.20DKO KTr3 E11.5 F9.20DKO
E11.5 F9.20DKO PEd2 E11.5 F9.20DKO PEd2 E11.5 F9.20DKO
E11.5 F9.20DKO j0J1 E11.5 F9.20DKO j0J1 E11.5 F9.20DKO
> colnames(samples)
[1] "quant_samples" "age" "geno"
Really, really confused.
On Tue, Oct 24, 2017 at 12:58 PM, Ed Siefker <ebs15242 at gma...
2017 Oct 24
2
as.data.frame doesn't set col.names
Why doesn't this work?
> samples$geno <- as.data.frame(sapply(yo, toupper), col.names="geno")
> samples
quant_samples age sapply(yo, toupper)
E11.5 F20het BA40 E11.5 F20het BA40 E11.5 F20HET
E11.5 F20het BA45 E11.5 F20het BA45 E11.5 F20HET
2017 Oct 24
2
as.data.frame doesn't set col.names
...sapply(yo, toupper)
E11.5 F20het BA40 E11.5 F20het BA40 E11.5 F20HET
E11.5 F20het BA45 E11.5 F20het BA45 E11.5 F20HET
E11.5 F20het BB84 E11.5 F20het BB84 E11.5 F20HET
E11.5 F9.20DKO KTr3 E11.5 F9.20DKO KTr3 E11.5 F9.20DKO
E11.5 F9.20DKO PEd2 E11.5 F9.20DKO PEd2 E11.5 F9.20DKO
E11.5 F9.20DKO j0J1 E11.5 F9.20DKO j0J1 E11.5 F9.20DKO
> colnames(samples)
[1] "quant_samples" "age" "geno"
Really, really confused.
On Tue, Oct 24, 2017 at 12:58 PM, Ed Siefker <ebs15242 at gma...