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individuo
2010 Mar 30
5
limpieza datos
...tos son tomados de una
base de datos que tiene algunos errores, importaciones de programas viejos,
etc.
Básicamente son dos tablas, la primer tabla identifica al individuo, esta
tabla tiene valores mal ingresados.
La segunda tabla tiene mediciones.
Al buscar desde la tabla de mediciones a los individuos solo obtengo solo
los individuos con mediciones, eliminando de esta forma los individuos que
no aportan datos encontrándose entre estos muchos errores.
El resultado es aproximadamente
Individuo 1 fecha medición 1 medición
Individuo 1 fecha medición 2...
2012 Feb 04
5
Comparaciones múltiples en ANOVA anidadp
...análisis incurre en evidente pseudoreplicación: El valor F es
el cociente entre el Cuadrado Medio del Tratamiento y los Residuos como
si las 45 mediciones fuesen independientes entre sí.
Para tener en cuenta que la variabilidad inducida en la respuesta por
los Tratamientos debe ser medida entre individuos y no entre mediciones
el análisis procedente podría ser:
> AnovaModel.2 <- aov(VR ~ Tratamiento + Error(Individuo),data=Medidas)
> summary(AnovaModel.2)
Error: Individuo
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
Tratamiento 4 1.148 0.2871 0.232 0.914
Residuals 10 12.395...
2016 Jan 26
2
Corregir mismo ID para individuos diferentes en una serie temporal
...aber un tercer individuo con el mismo nombre (e.g. el individuo 1 en el año 5 que coge como referencia la primera aparicion del individuo 1 renombrado como individuo 13).
Muchas gracias.
Un cordial saludo,
Rubén
Date: Mon, 25 Jan 2016 23:09:13 +0100
Subject: Re: [R-es] Corregir mismo ID para individuos diferentes en una serie temporal
From: cof en qualityexcellence.es
To: ruben_bm en hotmail.com
CC: r-help-es en r-project.org
Hola,
Creo que el código que te adjunto hace lo que pides.Los nuevos ids los he generado con números no con letras, me resulta más fácil tratar el problema así.
#---------...
2016 Jan 25
4
Corregir mismo ID para individuos diferentes en una serie temporal
Hola a todos,
Quería preguntar si alguno sabe como puedo identificar registros con un mismo ID en el tiempo, pero que hacer referencia a objetos o individuos diferentes.
En mi caso en particular estoy estudiando un animal que tiene una vida media cercana 2 años, y tengo una serie longitudinal de 25 años. El problema es que durante el muestreo en algunos casos durante la recoleccion de los datos, se repitieron los nombres de los individuos porque se asu...
2016 Jan 26
2
Corregir mismo ID para individuos diferentes en una serie temporal
...aparicion del
>> individuo 1 renombrado como individuo 13).
>>
>> Muchas gracias.
>> Un cordial saludo,
>> Rubén
>>
>>
>> ------------------------------
>> Date: Mon, 25 Jan 2016 23:09:13 +0100
>> Subject: Re: [R-es] Corregir mismo ID para individuos diferentes en una
>> serie temporal
>> From: cof en qualityexcellence.es
>> To: ruben_bm en hotmail.com
>> CC: r-help-es en r-project.org
>>
>>
>> Hola,
>>
>> Creo que el código que te adjunto hace lo que pides.
>> Los nuevos ids los he ge...
2011 Oct 10
2
tapply
...)
yo_funca <- ifelse (n_accion >1, (d_inicio-d_inicio[n_accion+1]), d_inicio)
# como tengo numeradas las acciónes tomo el valor de d_inicio para la acción siquiente n_accion + 1
ver <- data.frame(datos_quiero, yo_funca)
ver
#
# Ahora el problema
#
#
# en este ejemplo solo tengo individuos (a,b,c) y no hay acciónes repetidas mayores a 1
# lógicamente en los datos reales tengo muchos individuos con el mismo n_accion
# por tal motivo pense en crear un conteo utilizando tapply
# pero hay un error en lo siguiente "conteo <- with ..."
conteo <- with(ver, tapply(n_accion, i...
2017 Jan 16
2
Error al fusionar tablas
Buenas tardes,
Estoy tratando de fusionar dos data.frames pero no obtengo lo deseado.
Un data.frame (Df1)tiene 53.657 observaciones (y 8 variables) que
pertenecen una a cada individuo de la muestra. El otro (Df2) tiene 63.987
observaciones (y 17 variables), de los 53.657 individuos previos porque
algun individuo tiene varias observaciones. Ambos solo coinciden por la
variable "Reviewer.Username".
Quiero fusionar ambos data.frame por la columna "Reviewer.Username", pero
la tabla resultante solo me da 76 observaciones, cuando realmente
necesitaría tener 63....
2014 Sep 30
2
Clasificacion de individuos
...mplicar" el proceso y por otra tengo mis dudas acerca de que en que el
análisis cluster pueda prescindir de la hipótesis de Normalidad en las dos
variables "raras" que tengo.
De cualquier forma muchas gracias por tu idea.
Un saludo
{In Archive} RE: [R-es] Clasificacion de individuos
(Internet)
ihidalgo
To:
Jluis GILSANZ, r-help-es
30/09/2014 12:40
Archive:
This message is being viewed in an archive.
¿Has probado a hacer directamente una clasificación de los individuos con
3
clusters? Es muy sencillo y quizá te funcione. En un espacio
tridimensional un
cluster s...
2014 Sep 30
5
Clasificacion de individuos
Estimados apañeRos:
La duda o propuesta que os voy a plantear es a la vez metodológica y
relacionada con R.
Me encuentro trabajando con tres variables que son el resultado de un
computo de porcentajes.
Me explico, se toma una muestra de n casos (unos 6.500 aprox)
pertenecientes a i individuos (unos 230 aprox) en la que se comprueba si
un determinado evento ha ocurrido o no, anotándose 1 en caso de dicha
ocurrencia y 0 en caso de no ocurrencia.
Algo así como:
indiv ocurrencia
-------- -----------------
1 0
1 0
1 1
2 0
2 1
3 0
3 0
3...
2014 Sep 30
3
Clasificacion de individuos
...s 2 y 3?
Todo esto sin saber de lo que estamos tratando, claro? XD
Un saludo,
Isidro
De: Olivier Nuñez [mailto:onunez en unex.es]
Enviado el: martes, 30 de septiembre de 2014 15:23
Para: jluis gilsanz
CC: ihidalgo en jccm.es; r-help-es en r-project.org
Asunto: Re: [R-es] Clasificacion de individuos
Me parece que tu ordenación es esencialmente unidimensional.
Por lo tanto, en algún momento tendrás que considerar una combinación de tus tres variables.
Ignoro el contexto, pero la ponderación de cada una debería ser conforme a los criterios de la empresa que evalúa al personal.
Una vez te...
2013 Mar 11
4
Pedigreemm
Hola a todos, me gustaría realizar una consulta asociada a la generación
de valores genéticos del pedigreemm en R. Primero generé el archivo de
pedigree incluyendo los parentales para posteriormente estimar la varianza
aditiva y los valores genéticos para cada individuo, relacionando los
individuos por medio de la matriz de parentesco.
Me da todo perfecto, el complemento pedigreemm trabaja muy bien, pero no
pude obtener los valores genéticos de los parentales, sólo pude extraer los
valores genéticos individuos o de la progenie, si alguien sabe como
extraerlos se lo agradecería. Saludos
F...
2013 Jun 12
3
calculo de poder estadistico en glm
...t; las variables independientes son año, estacion, cantidad total de
> > embryones
> > por individuo y estadio en que se encuentra el embryon.
> >
> > Hay gran variabilidad en la data debido a que las malformaciones dependen
> > de muchos factores, ademas el numero de individuos por estacion varia
> > mucho
> > al igual que el numero de embryones. Por esta razon se utiliza la
> > frequencia. La idea del estudio es mostrar un valor medio con un intervalo
> > de confinza por estacion de la frequencia de malformaciones por individo.
> >
> >...
2013 Jun 11
2
calculo de poder estadistico en glm
...mbryones en este individuo y
> las variables independientes son año, estacion, cantidad total de embryones
> por individuo y estadio en que se encuentra el embryon.
>
> Hay gran variabilidad en la data debido a que las malformaciones dependen
> de muchos factores, ademas el numero de individuos por estacion varia mucho
> al igual que el numero de embryones. Por esta razon se utiliza la
> frequencia. La idea del estudio es mostrar un valor medio con un intervalo
> de confinza por estacion de la frequencia de malformaciones por individo.
>
> El tamaño de efecto que busco es d...
2012 Dec 14
2
una programación sencilla
...o, que estoy segura es
algo bastante sencillo para muchos de Uds que tienen amplia experiencia
programando. Lo describo a continuación.
Tengo una base de datos (file = datos) de especies (de plantas) en donde
cada fila es un individuo de una especie con ciertos atributos (alrededor
de 1500 filas = individuos). Quería anexar en esta base una columna que me
indicara la forma de crecimiento de cada individuo de cada especie (si es
árbol, arbusto, etc), pues no lo puse desde el principio. Esta información
la tengo en otra base de datos (file = datos2), la cual tiene en cada fila
el nombre de la especie y s...
2016 Jan 24
2
test z de tres proporciones
...; Asunto: Re: [R-es] test z de tres proporciones
>
> El 24/01/16 a las 00:32, Fernando Sánchez Lasheras escribió:
>> Estimado José,
>>
>> Muchas gracias por el tiempo que has dedicado a elaborar tu respuesta
>> que me ha sido de mucha utilidad. Se trata de una serie de individuos,
>> que en cierto periodo de tiempo pueden presentar una enfermedad o no.
>> El que haya algunos que tengan más de un evento es porque algunos (muy
>> pocos) padecen la enfermedad y transcurrido cierto tiempo la vuelven a
> sufrir.
>> Es decir, tengo pacientes de tres tip...
2014 Jul 17
3
FW: Selección eficiente de individuos
Hola,
Otra forma, utilizando la función de intervalos y la que comprueba si otro
intervalo se solapa del paquete "lubridate":
#----------------------
library(lubridate)
fe.chas <- data.frame(
entra=c('2001-01-01','2001-06-01','2003-01-01')
,sale=c('2002-01-01','2002-06-01','2004-01-01')
)
ref <-
2017 Jan 16
2
Error al fusionar tablas
...Error al fusionar tablas
Buenas tardes,
Estoy tratando de fusionar dos data.frames pero no obtengo lo deseado.
Un data.frame (Df1)tiene 53.657 observaciones (y 8 variables) que
pertenecen una a cada individuo de la muestra. El otro (Df2) tiene 63.987
observaciones (y 17 variables), de los 53.657 individuos previos porque
algun individuo tiene varias observaciones. Ambos solo coinciden por la
variable "Reviewer.Username".
Quiero fusionar ambos data.frame por la columna "Reviewer.Username", pero
la tabla resultante solo me da 76 observaciones, cuando realmente
necesitaría tener 63....
2014 Apr 26
3
Acumulado hasta una fecha exacta según individuo
Buenas noches a todos las personas del foro,
Me dirijo a vosotros con la siguiente cuestión:
¿Cómo es posible obtener, para cada individuo (identificado con la variable ID) de un data frame, la CANTIDAD ACUMULADA hasta una determinada fecha (día, mes y año), que es diferente para cada individuo y que se denota por la variable ENTRADA?
Ejemplo:
require(data.table)
datos2 <-
2013 Jun 11
0
calculo de poder estadistico en glm
...es en este individuo y
> las variables independientes son año, estacion, cantidad total de
> embryones
> por individuo y estadio en que se encuentra el embryon.
>
> Hay gran variabilidad en la data debido a que las malformaciones dependen
> de muchos factores, ademas el numero de individuos por estacion varia
> mucho
> al igual que el numero de embryones. Por esta razon se utiliza la
> frequencia. La idea del estudio es mostrar un valor medio con un intervalo
> de confinza por estacion de la frequencia de malformaciones por individo.
>
> El tamaño de efecto que busc...
2013 Jun 12
0
calculo de poder estadistico en glm
...uctiva? Mi pregunta es porque, si interpretamos los embriones con estadios embrionarios a lo largo del tiempo, la ubicación geográfica de estos ¿tiene alguna relación con la toma de muestra o es totalmente al azar?. Mi tercer pregunta es ¿ustedes toman una muestra, luego de un tiempo otra, pero los individuos de la primera son descartados?, porque si es así entiendo que es por población porque no tienen un seguimiento por individuo. En este caso creo que el enfoque de epidemiología puede aportar ideas a su trabajo en R. De pronto entendiendo los estados embrionarios como recuentos de embriones en cada u...