search for: flowfram

Queridos amigos tengo el siguiente problema: Tengo alrededor de 100 archivos del tipo flowFrame (datos de citometria) que he importado a R. Estos archivos tienen 6 columnas y 10.000 (diez mil) filas. Tengo que calcular el promedio de la quinta columna y graficarlo contra el promedio de la segunda columna. La segunda columna tiene el mismo valor para las 10.000 filas en cada archivo asi es qu...

...e a general calculating problem. the code i use now is the following: logTransi <- truncateTransform("truncate at 1", a=1) testSetLog <- transform(testSet, 'FL10'= logTransi('FL10'), 'FL11'=logTransi('FL11')) testSet looks like this: > testSet flowFrame object 'MarjanD.20120926.A.0026.fcs' with 100000 cells and 14 observables: name desc range minRange maxRange $P1 pulse.width <NA> 65536 768 65535 $P2 FSC_PER <NA> 65536 0 65535 $P3 FSC_PAR <NA> 65536 0 65535 $P4...