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2015 Aug 06
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consulta graficas para GLM
Estimados amigos y expertos del R, Les escribo para hacerles una pregunta que parece un poco sencilla pero me ha costado mucho. Estoy tratando de graficar los datos correspondientes a tasas de consumo de algunos organismos cuando están expuestos o no expuestos a un químico sobre tres tipos de presa. Por definición, debía ajustar los datos a un glm con distribución gama. Las gráficas pueden ser 1) dos gráficos correspondientes a expuesto o no expuesto ( representado con 0 y 1...
2011 Sep 11
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Cosinor Analysis
Hola,   En el contexto del método del cosinor descrito por Halberg y posteriormente por Bingham, no logro calcular el error standard correspondiente a la amplitud y a la ortofase. La función lm permite obtener, entre otros datos, el error standard correspondiente a los coeficientes de  la regresión (intercept, beta y gamma), pero no sé cómo relacionar ese s.e. de beta y gamma con el s.e. de amplitud y acrofase respectivamente.   A ver si alguie...
2017 Jun 24
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Problema en lectura de datos. Memoria insuficiente
Buenos días Estoy intentando leer una base de datos correspondiente al World Values Survey desde 1981 a 2014. Contiene variables por columnas, y observaciones correspondientes a individuos de diferentes países. Podría tener como aprox. 1000 variables, y mas de 60,000 individuos por año. Esta es la información que obtengo de mi RStudio. > sessionInfo()R version...
2013 Feb 13
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Equivalente a paper="a4", pero en pantalla gráfica
...quede con verticalidad, como en un A4, y luego el usuario final es libre de guardar en pdf o no, con el propio RGui. Ahora voy a describir las propiedades de mi gráfico particular: tiene 4 zonas bien diferenciadas: 1) Zona de título, con un par de líneas de texto. 2) Un plot. 3) Zona de título correspondiente a la tabla de resultados. 4) Tabla de resultados propiamente dicha. Gracias. Atte. Eva [[alternative HTML version deleted]]
2017 Jan 06
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que tal comunidad, una pregunta del paquete data.table
si se tiene un data.table (DT), supongamos de 100 filas por 3 columnas de datos numericos, como puedo hacer para obtener el correspondiente valor de la columna 1 si busco, por ejemplo, el maximo de la columna 2 agrupado por la columna 3 ? para buscar el maximo de la columna 2 escribo. DT[ , max(c2), by=c3 ] muchas gracias, saludos, eric. -- Forest Engineer Master in Environmental and Natural Resource Economics Ph.D. student...
2012 Nov 01
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Duda gráfico DIN A-4
Hola, ¿Alguien me puede indicar cómo conseguir que un gráfico se adapte al formato DIN-A4, con su correspondiente verticalidad?. ¿Hay que hacerlo "manualmente" o existe algún parámetro/función que lo controle?. Gracias. Eva [[alternative HTML version deleted]]
2009 Dec 20
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plot de un cca realizado con Ade4
...l paquete Ade4. Cuando quiero realizar un plot del resultado utilizo plot(). el resultado son 6 gráficos: loadings, correlation, inertia axes, scores and predictions, eigenvalues y species. Lo que quería saber es cómo representar en una sola ventana (los 6 gráficos a parecen en la misma) el gráfico correspondiente a Species. Gracias por vuestra ayuda. Jesús Armand Calejero Román
2012 Feb 15
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extraer datos de un dataframe a partir de un factor
...ies=="setosa"|iris$Species=="virginica",] Que me crea un df nuevo solo con las filas en que Species es setosa o virginica. El problema es que mi factor de interés tiene 22 niveles y a veces he de seleccionar 13, 10, 8 niveles o números así. Esto implica escribir un | con su == correspondiente 13 o 8 veces. Con subset ocurre lo mismo, si tienes que elegir muchos niveles al final tienes que escribir un == o != para cada factor que eliges. ¿Sabéis si se puede abreviar de alguna manera? Me suena que esto se ha tratado en la lista pero lo he estado buscando y no lo he encontrado, si alguie...
2012 Jun 08
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Consulta sobre GLM-log linear
Estimados amigos, Estoy familiarizándome con los modelos lineales generalizados en R. Estoy interesado en realizar un análisis lig linear y me gustaría saber cuáles son o como extraer los valores correspondientes al chi cuadrado en el análisis para cada grupo y para las interacciones. Desde ya muchas gracias y disculpas si la pregunta es muy básica, adjunto los comandos que estoy utilizando. Si hiciera falta el archivo de texto puedo adjuntarlo. Desde ya mcuhas gracias library(MuMIn) archivo<-read.ta...
2012 Jun 08
2
Consulta sobre GLM-log linear
Estimados amigos, Estoy familiarizándome con los modelos lineales generalizados en R. Estoy interesado en realizar un análisis lig linear y me gustaría saber cuáles son o como extraer los valores correspondientes al chi cuadrado en el análisis para cada grupo y para las interacciones. Desde ya muchas gracias y disculpas si la pregunta es muy básica, adjunto los comandos que estoy utilizando. Si hiciera falta el archivo de texto puedo adjuntarlo. Desde ya mcuhas gracias library(MuMIn) archivo<-read.ta...
2010 Dec 06
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Combinar los niveles de un factor
...uisiera saber como combinar los niveles de un factor en un "data frame": Por ejemplo, mi "data frame": x y 2.9 a 1.2 a 3.4 b 1.4 b 1.5 c 1.7 c Ahora quiero que los niveles b y c pasen a llamarse nivel d (un nuevo nivel con las 4 observaciones correspondientes a b y c) y mi nuevo data frame tenga un factor con 2 niveles (a y d) en lugar de 3 niveles. Muchas gracias, Manuel -- *Manuel Spínola, Ph.D.* Instituto Internacional en Conservación y Manejo de Vida Silvestre Universidad Nacional Apartado 1350-3000 Heredia COSTA RICA mspinola@una.ac.cr mspino...
2012 Jun 08
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Consulta GLM
Estimados amigos, Estoy familiarizándome con los modelos lineales generalizados en R. Estoy interesado en realizar un análisis lig linear y me gustaría saber cuáles son o como extraer los valores correspondientes al chi cuadrado en el análisis para cada grupo y para las interacciones. Desde ya muchas gracias y disculpas si la pregunta es muy básica, adjunto los comandos que estoy utilizando. Si hiciera falta el archivo de texto puedo adjuntarlo. Desde ya mcuhas gracias library(MuMIn) archivo<-read.ta...
2011 Jan 31
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Reemplazar valores en data frame con valores de otro data frame
...ie la columna y por los numeros de la primera tabla. En este ejemplo sería: y data 5 667766 5 666666 2 666666 3 666666 Pensaba que me iba a funcionar esto: attach( x ) attach( y ) id.x[ x %in% y ] Pero igual hay alguna funcion que reemplaza valores de un data frame en función del correspondiente de otro data frame. Comoceis alguna solución sencilla? Gracias, un saludo [[alternative HTML version deleted]]
2023 Dec 04
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Transformar una base de datos a matriz
Buenos d?as. Tengo una duda: Trabajo con comundiades de especies, y mis datos se ordenan de tal forma que, cada especie corresponde a una fila de la base de datos, por lo que cada muestra tiene un n?mero de filas correspondiente al n?mero de especies. Mi objetivo es transformar esa base de datos a un formato de matriz donde, cada muestra sea una fila ?nica y las especies sean las columnas, con su dato de abundancia para cada muestra. Lo equivalente en Excel es crear una tabla din?mica donde: muestras en filas, especies en...
2012 Mar 06
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Buscando la solución más eficiente para generar resultados a partir de un list
...os cuales contiene información relativa a un sujeto (Pablo y Carlos).   lSujetos <- list() lSujetos[[1]] <- list(nomfich="Pablo", colTime=5, colVars=c(6,7,8)) lSujetos[[2]] <- list(nomfich="Carlos", colTime=5, colVars=c(6,7,8)) A continuación, leo las series temporales correspondientes a cada individuo. En este caso leo, para cada individuo, las series correspondientes a las columnas de las posiciones 6, 7 y 8 en el fichero:   misSeries <- lapply(lSujetos, leeSeries)   siendo leeSeries la función que se encarga de recoger esas series.   Como consecuencia de lo anterior, en &q...
2018 Dec 07
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Matriz de Datos
...2 3.497 a 1 4.749 b 1 3.999 b 1 1.638 b 3 4.445 c 2 4.935 c 1 2.299 c 3 1.111 Y quiero crear una matriz que a la fila tenga la descripcion y en la columna el grupo y en cada valor interno la suma del monto correspondiente, Es decir algo como Descripcion/Grupo 1 2 3 a 6.575 3.497 0 b 5.637 0 4.445 c 2.299 4.935 1.111 En excel lo haria con una tabla dinamica, hay alguna forma de hacerlo en R? esty utilizando un "for" pero tarda mucho Muchas Gracias [...
2017 May 15
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Datos atómicos
...ema. Porque la matriz en realidad es: g1 g2 g3 g4 g5 g6 g7 g1 0 18 13 16 11 12 15 g2 18 0 25 13 22 16 10 g3 13 25 0 28 23 13 25 g4 16 13 28 0 6 7 3 g5 11 22 23 6 0 18 17 g6 12 16 13 7 18 0 8 g7 15 10 25 3 17 8 0 Entonces cada cantidad debe conservar la pertenencia al grupo correspondiente . La ordenación la pretendí hacer con el índice de la matriz de 39x39 pero no me funcionó; ¿es posible hacerlo o se debe hacer una por una? Nuevamente mis disculpas y mi agradecimiento por adelantado. Atentamente; *MANOLO MÁRQUEZ P.* [[alternative HTML version deleted]]
2011 Sep 12
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Rv: Re: Cosinor Analysis
...igo en R que has utilizado nos puede ayudar un poco más. Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es 2011/9/11 Cristalina <pa100cia77@yahoo.es> Hola,   En el contexto del método del cosinor descrito por Halberg y posteriormente por Bingham, no logro calcular el error standard correspondiente a la amplitud y a la ortofase. La función lm permite obtener, entre otros datos, el error standard correspondiente a los coeficientes de  la regresión (intercept, beta y gamma), pero no sé cómo relacionar ese s.e. de beta y gamma con el s.e. de amplitud y acrofase respectivamente.   A ver si alguie...
2017 Jun 14
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Regresión ponderada
Colegas: Necesito hacer una serie de ajustes de un modelo de decaimiento exponencial a unos datos de concentración de compuestos fluorescentes contra el tiempo. Para la mayoría de los experimentos tengo tres réplicas por cada tiempo, y haciendo los gráficos correspondientes parece haber diferencias muy grandes en la dispersión de los datos, siendo generalmente mas grandes al principio del experimento que al final. Quiero hacer el ajuste de un modelo ponderado para tomar en cuenta las diferencias en la dispersión de los datos. Tengo los datos en un "data frame&q...
2010 Dec 15
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Generacion de binomiales correlacionadas
...a variable respuesta _sigue_ una distribucion binomial, i.e., X_i ~Binomial(n_i, p_i), i=1,2 y que, por ahora, n_i y p_i son conocidos. El interes principal es calcular T = P(X_1=1, X_2=1). Si las X_i''s fueran independientes (caso 1), seria suficiente generar binomiales con los parametros correspondientes a cada tipo de experimento (via rbinom) y calcular lo que se necesita usando table(). Ahora, si X_i''s *no* son independientes (caso 2), el calculo de T no puede hacerse de la misma forma. Observe que independiente del modelo (caso) bajo el cual estemos trabajando, T _podria_ calcularse co...