search for: borgan

Hi, I am wondering if there is a package for doing conditional logistic regression for nested case-control study as described in "Estimation of absolute risk from nested case-control data" by Langholz and Borgan (1997) where Horvitz-Thompson sampling weight (log of (number in the risk set divided by the number sampled)) is used with regression. In SAS Proc Phreg, this is implemented as an offset (offset=logweight). I checked clogistic() in Epi package and clogit() in survival package, but couldn't...

Hola. Una duda.... Alguien sabe si hay algo hecho en R para comprobar si un modelo de supervivencia está bien calibrado? (usando las pruebas de Nam-D'Agostino o de Gronnesby & Borgan). Thnks. Un Saludo, _____________________________ Miguel Ángel Rodríguez Muíños Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública Consellería de Sanidade Xunta de Galicia http://dxsp.sergas.es ________________________________ Nota: A información contida nesta mensaxe e os seus pos...

I'm getting unexpected results from the coxph function when using weights from counter-matching. For example, the following code produces a parameter estimate of -1.59 where I expect 0.63: d2 = structure(list(x = c(1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1), wt = c(5, 42, 40, 4, 43, 4, 42, 4, 44, 5, 38, 4, 39, 4, 4, 37, 40, 4, 44, 5, 45, 5, 44, 5), riskset =

Hola Carlos. Muchas gracias. No es exactamente lo que estoy buscando (sería genial ver que alguien tiene un paquete con la prueba de Nam-D'Agostino) pero puedo aprovechar algo de código. Encontré alguna referencia al test de Gronnesby&Borgan en el paquete stcoxgof de Stata, pero estoy torpe para encontrar algo hecho en R (y me extraña que no haya nada) Un saludo, Miguel. De: Carlos Ortega [mailto:cof@qualityexcellence.es] Enviado el: viernes, 04 de octubre de 2013 10:07 Para: Rodríguez Muíños, Miguel Ángel CC: Lista R Asunto: Re:...

...ualityexcellence.es 2013/10/4 <miguel.angel.rodriguez.muinos@sergas.es> > Hola. > > Una duda.... > > Alguien sabe si hay algo hecho en R para comprobar si un modelo de > supervivencia está bien calibrado? > (usando las pruebas de Nam-D'Agostino o de Gronnesby & Borgan). > > Thnks. > > Un Saludo, > _____________________________ > Miguel Ángel Rodríguez Muíños > Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública > Consellería de Sanidade > Xunta de Galicia > http://dxsp.sergas.es > > > > > > > > > ____...

...ió: > Hola Carlos. > > > > Muchas gracias. > > No es exactamente lo que estoy buscando (sería genial ver que alguien > tiene un paquete con la prueba de Nam-D’Agostino) pero puedo aprovechar > algo de código. > > Encontré alguna referencia al test de Gronnesby&Borgan en el paquete > stcoxgof de Stata, pero estoy torpe para encontrar algo hecho en R (y me > extraña que no haya nada) > > > > Un saludo, > > Miguel. > > > > > > > > > > *De:* Carlos Ortega [mailto:cof@qualityexcellence.es] > *Enviado el:* vier...

Hello, coxph does not use any information that are in the dataset between event times (or "death times") , since computation only occurs at event times. For instance, removing observations when there is no event at that time in the whole dataset does not change the results: > set.seed(1) > data <- as.data.frame(cbind(start=c(1:5,1:5,1:4),stop=c(2:6,2:6,2:5),status=c(rep(