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Hi, I'm trying to calculate p-value to findout definitely expressed genes compare A to B situation. I got this data(this is a part of data) from whole organism , and each number means each expression values (that means, we could think 'a' gene is 13 in A situation, and it turns 30 in B situation) To findout probability, I'm going to use Audic - Claverie Method. ( The significance

Hola a todos! perdón por molestarlos nuevamente con los contrastes, pero estoy trantando de entender que es lo que está haciendo R y de donde vienen los valores que informa pero  no lo logro. Creí haberlo entendido pero a la hora de usar mis datos los resultados no dan como deberían. Tengo dos variables explicativas que son factores con 3 niveles cada uno. Esta es la tabla de medias de la