Hola a todos! Espero que me pod?is ayudar porque estoy un poco atascado.
He hecho un modelo de regresi?n de Cox para la supervivencia a 3 a?os de
pacientes con c?ncer colorrectal en funci?n de una serie de factores. De la
muestra total de unos 1000 casos, cre? dos grupos: uno de entrenamiento y otro
de test. El modelo lo hice con el grupo de entranamiento. La asignaci?n de los
pacientes a cada grupo lo hice de forma aleatoria a trav?s de la librer?a
CaTools, en una proporci?n 70/30.
Bueno, he conseguido hacer el nomograma a partir del modelo basado en la
regresi?n de Cox con la librer?a rms, pero ahora no s? c?mo calibrarlo y
validarlo.
He intentado utilizar "calibrate" del paquete "rms", pero me
pierdo en c?mo hacerlo. Soy incapaz de crear una variable con las predicciones.
He visto que hab?a una charla sobre el tema de Luis Mariano Estaban y
colaboradores de la que se hab?an extra?do unas diapositivas, pero no acabo de
entender bien c?mo lo hacen. Lo que me ha parecido entender es que primero
ten?an que hacer que el modelo predijese resultados a partir de la muestra de
test y luego, se hac?a la calibraci?n.
Otra cosa que me resultar?a interesante es hacer una gr?fica donde se vea la
regresi?n de Cox del modelo y la curva correspondiente a las predicciones de
?ste. Entiendo que se deber?a hacer con la muestra de test o prueba.
Os estar?a muy agradecido si me pudi?seis dar informaci?n de c?mo hacerlo o
ejemplos con el c?digo para ver si soy capaz de adaptarlo a mi estudio.
Bueno, muchas gracias a todos
Pepe Mart?n
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