R help es - Feb 2021 - Obtener una df a partir de una lista (o algo así)

Buenos días, estoy tratando de implementar el código que veis abajo, de la
documentación del paquete xgboost. Me desconcierta que al cargar las bases
de datos aparezcan como listas. Cuando la llama directamente al aplicar la
función xgboost (data = train$data) me desconcierta todavía más. Entiendo
que se puede hacer así también, claro. Aunque no aparezca en el documento,
pretendo componer la df para trabajar desde ella (tal y como acostumbro a
hacer) pero, en mi infinita ignorancia, no lo consigo.
He probado cosas como:
df<-as.data.frame(train),
df<-as.data.frame(train$data)
y también con as.matrix, pero no funcionan.
Si alguien me dice cómo hacerlo (y de paso, por qué) se lo agradecería
mucho.

library(xgboost)
data(agaricus.train, package='xgboost')
data(agaricus.test, package='xgboost')
train <- agaricus.train
test <- agaricus.test
bst <- xgboost(data = train$data, label = train$label, max_depth = 2, eta 1,
nrounds = 2, objective = "binary:logistic")

Gracias, como siempre,
Manuel

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Hola, ¿qué tal?

Por razones que no vienen al caso y a diferencia de muchos otros tipos de
modelos tal como se implementan en R, xgboost admite como argumentos la X
(data) y la Y (label) de tu problema por separado. Son dos objetos
distintos. agaricus.train es una lista que contiene esos dos objetos (la X
y la Y); de hecho, una lista es precisamente eso: una estructura que
permite yuxtaponer otras.

Los dos objetos son, el uno, la matriz agaricus.train$data ---puedes ver
que se trata de una matriz "sparse" haciendo
class(agaricus.train$data) o
usar las funciones head, etc. para inspeccionarla--- y el otro es un vector
de números (0 o 1), agaricus.train$label.

Puedes convertir todo en un df tradicional haciendo algo así como

datos <- data.frame(as.matrix(agaricus.train$data), label
agaricus.train$label)

Dicho todo lo cual, creo que te vendría bien echarle un buen vistazo a los
capítulos 2, 3 y 5 de esto <https://datanalytics.com/libro_r/> antes de
meterte con XGBoost o sufrirás mucho.

Un saludo,

Carlos J. Gil Bellosta
http://www.datanalytics.com


El vie, 5 feb 2021 a las 6:11, Manuel Mendoza (<mmendoza en
fulbrightmail.org>)
escribió:
> Buenos días, estoy tratando de implementar el código que veis abajo, de la
> documentación del paquete xgboost. Me desconcierta que al cargar las bases
> de datos aparezcan como listas. Cuando la llama directamente al aplicar la
> función xgboost (data = train$data) me desconcierta todavía más. Entiendo
> que se puede hacer así también, claro. Aunque no aparezca en el documento,
> pretendo componer la df para trabajar desde ella (tal y como acostumbro a
> hacer) pero, en mi infinita ignorancia, no lo consigo.
> He probado cosas como:
> df<-as.data.frame(train),
> df<-as.data.frame(train$data)
> y también con as.matrix, pero no funcionan.
> Si alguien me dice cómo hacerlo (y de paso, por qué) se lo agradecería
> mucho.
>
> library(xgboost)
> data(agaricus.train, package='xgboost')
> data(agaricus.test, package='xgboost')
> train <- agaricus.train
> test <- agaricus.test
> bst <- xgboost(data = train$data, label = train$label, max_depth = 2,
eta > 1, nrounds = 2, objective = "binary:logistic")
>
> Gracias, como siempre,
> Manuel
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