R help es - May 2020 - Instalar paquetes no disponibles para la versión actual

Buenas tardes. Tenía la versión 3.6.0 de R. Quería instalar el paquete
edarf, pero decía que no estaba disponible para esa versión. Actualicé R a
la versión 4.0.0, que creo que es la última, pero al tratar de reinstalar
forestFloor, me dice que no está disponible para la versión 4.0.0. He
abierto R 3.6.0 directamente, cliqueo install.packages("forestfloor")
y
ahora me dice que no está disponible para esa versión.
A ver si me podéis echar una mano,
Gracias,
Manuel

	[[alternative HTML version deleted]]

El mensaje de que no está disponible para esa versión aparece incluso si 
intentas instalar un paquete que no existe para ninguna versión 
(inventado, vaya). Es un mensaje con una redacción un tanto 
desafortunada porque te hace pensar que actualizando lo puedes resolver 
y no tiene nada que ver.

Para el caso de edarf en cran puedes encontrar:
> https://cran.r-project.org/web/packages/edarf/index.html
>
> Package ?edarf? was removed from the CRAN repository.
>
> Formerly available versions can be obtained from thearchive 
> <https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/edarf>.
>
> Archived on 2020-03-07 as check problems were not corrected despite 
> reminders.
>
> Please use the canonical formhttps://CRAN.R-project.org/package=edarf 
> <https://cran.r-project.org/package=edarf>to link to this page.
>
Para instalar un paquete antiguo puedes descargarte la fuente desde la 
referencia anterior e instalarlo utilizando la función install.packages.

Consulta la ayuda de esta función (help(install.packages) y ten en 
cuenta que la opción "repos" puede ser una url de internet o de tu 
ordenador local (ruta completa hasta el archivo fuente).

Y después necesitarás mucha suerte para resolver todas las dependencias 
que te irán apareciendo durante la compilación.

No es una solución segura, pero a veces funciona.

Saludos.


El 30/4/20 a las 18:15, Manuel Mendoza escribió:
> Buenas tardes. Tenía la versión 3.6.0 de R. Quería instalar el paquete
> edarf, pero decía que no estaba disponible para esa versión. Actualicé R a
> la versión 4.0.0, que creo que es la última, pero al tratar de reinstalar
> forestFloor, me dice que no está disponible para la versión 4.0.0. He
> abierto R 3.6.0 directamente, cliqueo
install.packages("forestfloor") y
> ahora me dice que no está disponible para esa versión.
> A ver si me podéis echar una mano,
> Gracias,
> Manuel
>
> 	[[alternative HTML version deleted]]
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
	[[alternative HTML version deleted]]

Gracias José, la cuestión es que yo tenía forestfloor, que es el que
realmente me hace falta, y funcionaba bien. Ahora tengo unos cuantos
scripts con resultados importantes que no puedo reproducir. Un colega me ha
dicho que le pasó algo parecido y consiguió instalarlo desde un GitHub,
pero yo sigo sin conseguirlo.

El vie., 1 may. 2020 a las 10:43, José Trujillo Carmona (<trujillo en
unex.es>)
escribió:
> El mensaje de que no está disponible para esa versión aparece incluso si
> intentas instalar un paquete que no existe para ninguna versión
> (inventado, vaya). Es un mensaje con una redacción un tanto
> desafortunada porque te hace pensar que actualizando lo puedes resolver
> y no tiene nada que ver.
>
> Para el caso de edarf en cran puedes encontrar:
>
> > https://cran.r-project.org/web/packages/edarf/index.html
> >
> > Package ?edarf? was removed from the CRAN repository.
> >
> > Formerly available versions can be obtained from thearchive
> > <https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/edarf>.
> >
> > Archived on 2020-03-07 as check problems were not corrected despite
> > reminders.
> >
> > Please use the canonical formhttps://CRAN.R-project.org/package=edarf
> > <https://cran.r-project.org/package=edarf>to link to this page.
> >
> Para instalar un paquete antiguo puedes descargarte la fuente desde la
> referencia anterior e instalarlo utilizando la función install.packages.
>
> Consulta la ayuda de esta función (help(install.packages) y ten en
> cuenta que la opción "repos" puede ser una url de internet o de
tu
> ordenador local (ruta completa hasta el archivo fuente).
>
> Y después necesitarás mucha suerte para resolver todas las dependencias
> que te irán apareciendo durante la compilación.
>
> No es una solución segura, pero a veces funciona.
>
> Saludos.
>
>
> El 30/4/20 a las 18:15, Manuel Mendoza escribió:
> > Buenas tardes. Tenía la versión 3.6.0 de R. Quería instalar el paquete
> > edarf, pero decía que no estaba disponible para esa versión. Actualicé
R
> a
> > la versión 4.0.0, que creo que es la última, pero al tratar de
reinstalar
> > forestFloor, me dice que no está disponible para la versión 4.0.0. He
> > abierto R 3.6.0 directamente, cliqueo
install.packages("forestfloor") y
> > ahora me dice que no está disponible para esa versión.
> > A ver si me podéis echar una mano,
> > Gracias,
> > Manuel
> >
> >       [[alternative HTML version deleted]]
> >
> > _______________________________________________
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> > R-help-es en r-project.org
> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
>         [[alternative HTML version deleted]]
>
> _______________________________________________
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> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
	[[alternative HTML version deleted]]

He encontrado esto:

Package ?forestFloor? was removed from the CRAN repository.

Formerly available versions can be obtained from the archive
<https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/forestFloor>.

Archived on 2020-02-19 as check problems were not corrected despite
reminders.

Please use the canonical form
https://CRAN.R-project.org/package=forestFloor
<https://cran.r-project.org/package=forestFloor> to link to this page.

Cuando voy a  archive
<https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/forestFloor> me sale una
lista de ficheros comprimidos. He descomprimido algunos, y a pesar de que
hay una carpeta que se llama inst, ninguno de los scripts que abrí me
permite instalar forestfloor :(

A ver si alguien puede ayudarme, pues si no, pierdo todo el trabajo que ya
hice con ese paquete.

Gracias,

Manuel


El vie., 1 may. 2020 a las 10:43, José Trujillo Carmona (<trujillo en
unex.es>)
escribió:
> El mensaje de que no está disponible para esa versión aparece incluso si
> intentas instalar un paquete que no existe para ninguna versión
> (inventado, vaya). Es un mensaje con una redacción un tanto
> desafortunada porque te hace pensar que actualizando lo puedes resolver
> y no tiene nada que ver.
>
> Para el caso de edarf en cran puedes encontrar:
>
> > https://cran.r-project.org/web/packages/edarf/index.html
> >
> > Package ?edarf? was removed from the CRAN repository.
> >
> > Formerly available versions can be obtained from thearchive
> > <https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/edarf>.
> >
> > Archived on 2020-03-07 as check problems were not corrected despite
> > reminders.
> >
> > Please use the canonical formhttps://CRAN.R-project.org/package=edarf
> > <https://cran.r-project.org/package=edarf>to link to this page.
> >
> Para instalar un paquete antiguo puedes descargarte la fuente desde la
> referencia anterior e instalarlo utilizando la función install.packages.
>
> Consulta la ayuda de esta función (help(install.packages) y ten en
> cuenta que la opción "repos" puede ser una url de internet o de
tu
> ordenador local (ruta completa hasta el archivo fuente).
>
> Y después necesitarás mucha suerte para resolver todas las dependencias
> que te irán apareciendo durante la compilación.
>
> No es una solución segura, pero a veces funciona.
>
> Saludos.
>
>
> El 30/4/20 a las 18:15, Manuel Mendoza escribió:
> > Buenas tardes. Tenía la versión 3.6.0 de R. Quería instalar el paquete
> > edarf, pero decía que no estaba disponible para esa versión. Actualicé
R
> a
> > la versión 4.0.0, que creo que es la última, pero al tratar de
reinstalar
> > forestFloor, me dice que no está disponible para la versión 4.0.0. He
> > abierto R 3.6.0 directamente, cliqueo
install.packages("forestfloor") y
> > ahora me dice que no está disponible para esa versión.
> > A ver si me podéis echar una mano,
> > Gracias,
> > Manuel
> >
> >       [[alternative HTML version deleted]]
> >
> > _______________________________________________
> > R-help-es mailing list
> > R-help-es en r-project.org
> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
>         [[alternative HTML version deleted]]
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
	[[alternative HTML version deleted]]

Hola,

Una alternativa para evitar tener que instalarte todo de nuevo es usar
"RStudiio Cloud"  (https://rstudio.cloud/)

   - Acabo de instalarme el paquete que te interesa "forestFloor" en
una de
   las versiones que en RStudio_Cloud está disponible (3.5.3). También está la
   3.6.0.
   - He tenido que instalar sus dependencias (Rcpp, kknn, randomForest,
   caret).
   - Para instalar "forestFloor" he subido la librería a RStudio Cloud
(se
   puede sin problemas) e instalarla una vez estaban instaladas estas
   dependencias.
   - He ejecutado los ejemplos que aparecen en la ayuda de la función
   "forestFloor()".

Si el conjunto de datos no es muy pesado, puedes subirlo igualmente a tu
entorno en RStudio_Cloud (realmente un proyecto) y ejecutarlo todo ahí. Los
resultados igualmente te los puedes bajar.

Como referencia, en RStudio Cloud, uno puede tener en la misma cuenta
diferentes proyectos cada uno corriendo con versiones de R diferentes.
Tiene limitaciones de espacio (1Gb) y de ejecución, no puedes dejar algo
muy pesado corriendo durante mucho tiempo.

Comparto la idea de José sobre que la actualización a una nueva versión de
R tiene consecuencias, que te pueden dejar un tanto colgado tu código
previo. Creo que la comunidad está al tanto de esto y en particular
RStudio, de ahí que estén apostando por una gestión de entornos parecida a
la que existe en Python. En este sentido, su última apuesta es el paquete
"renv". Que es mejor que su anterior iniciativa (Packrat).

   - https://rstudio.github.io/renv/articles/renv.html

Otra alternativa interesante, para no cambiar tu entorno, aunque tiene la
limitación que su uso es en modo trial durante 45 días es esta:

   - https://rstudio.com/products/quickstart/

En este caso, te instalas en tu ordenador una máquina virtual con todos
estos productos: RStudio_Server_Pro, Connect y el Package Manager.
Como en el caso de RStudio_Cloud esta versión trial viene instalada con
varias versiones de R.

Gracias,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es

El jue., 30 abr. 2020 a las 18:16, Manuel Mendoza (<
mmendoza en fulbrightmail.org>) escribió:
> Buenas tardes. Tenía la versión 3.6.0 de R. Quería instalar el paquete
> edarf, pero decía que no estaba disponible para esa versión. Actualicé R a
> la versión 4.0.0, que creo que es la última, pero al tratar de reinstalar
> forestFloor, me dice que no está disponible para la versión 4.0.0. He
> abierto R 3.6.0 directamente, cliqueo
install.packages("forestfloor") y
> ahora me dice que no está disponible para esa versión.
> A ver si me podéis echar una mano,
> Gracias,
> Manuel
>
>         [[alternative HTML version deleted]]
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>

-- 
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es

	[[alternative HTML version deleted]]

Gracias Jose, Marcelino, Rafael y Carlos por vuestra ayuda. Finalmente
conseguí reinstalar forestfloor utilizando RStudio Cloud, tal y como
proponía Carlos, pero gracias a todos (y si hubo alguno más) por vuestras
sugerencias.
Manuel

El lun., 4 may. 2020 a las 16:04, Carlos Ortega (<cof en
qualityexcellence.es>)
escribió:
> Hola Manuel,
>
>
>    - Una vez entras en RStudio Cloud tienes que abrir un
"proyecto" para
>    poder empezar a ejecutar R.
>    - La forma de subir ficheros a la nube, es sencillo, mira la captura
>    de pantalla que te adjunto:
>       - En la pestaña de "files" hay otra con "Upload".
>       - Le dices qué fichero subir, y aparecerá en tu environment.
>
>
>
> [image: Captura de pantalla 2020-05-04 a las 16.00.29.png]
>
>
> El lun., 4 may. 2020 a las 13:52, Manuel Mendoza (<
> mmendoza en fulbrightmail.org>) escribió:
>
>> Gracias Carlos, he instalado las dependencias de forestFloor, y me he
>> registrado en R Studio Cloud, pero no encuentro la forma de subir su
>> librería.
>> Llevo años usando R y seguro que más de 100 scripts con varios miles de
>> líneas, pero  no trabajo con proyectos, creo, ni sé muy bien lo que
son.
>> Lamento mi torpeza.
>> Manuel
>>
>> El dom., 3 may. 2020 a las 20:21, Carlos Ortega (<
>> cof en qualityexcellence.es>) escribió:
>>
>>> Hola,
>>>
>>> Una alternativa para evitar tener que instalarte todo de nuevo es
usar
>>> "RStudiio Cloud"  (https://rstudio.cloud/)
>>>
>>>    - Acabo de instalarme el paquete que te interesa
"forestFloor" en
>>>    una de las versiones que en RStudio_Cloud está disponible
(3.5.3). También
>>>    está la 3.6.0.
>>>    - He tenido que instalar sus dependencias (Rcpp, kknn,
randomForest,
>>>    caret).
>>>    - Para instalar "forestFloor" he subido la librería a
RStudio Cloud
>>>    (se puede sin problemas) e instalarla una vez estaban instaladas
estas
>>>    dependencias.
>>>    - He ejecutado los ejemplos que aparecen en la ayuda de la
función
>>>    "forestFloor()".
>>>
>>> Si el conjunto de datos no es muy pesado, puedes subirlo igualmente
a tu
>>> entorno en RStudio_Cloud (realmente un proyecto) y ejecutarlo todo
ahí. Los
>>> resultados igualmente te los puedes bajar.
>>>
>>> Como referencia, en RStudio Cloud, uno puede tener en la misma
cuenta
>>> diferentes proyectos cada uno corriendo con versiones de R
diferentes.
>>> Tiene limitaciones de espacio (1Gb) y de ejecución, no puedes dejar
algo
>>> muy pesado corriendo durante mucho tiempo.
>>>
>>> Comparto la idea de José sobre que la actualización a una nueva
versión
>>> de R tiene consecuencias, que te pueden dejar un tanto colgado tu
código
>>> previo. Creo que la comunidad está al tanto de esto y en particular
>>> RStudio, de ahí que estén apostando por una gestión de entornos
parecida a
>>> la que existe en Python. En este sentido, su última apuesta es el
paquete
>>> "renv". Que es mejor que su anterior iniciativa
(Packrat).
>>>
>>>    - https://rstudio.github.io/renv/articles/renv.html
>>>
>>> Otra alternativa interesante, para no cambiar tu entorno, aunque
tiene
>>> la limitación que su uso es en modo trial durante 45 días es esta:
>>>
>>>    - https://rstudio.com/products/quickstart/
>>>
>>> En este caso, te instalas en tu ordenador una máquina virtual con
todos
>>> estos productos: RStudio_Server_Pro, Connect y el Package Manager.
>>> Como en el caso de RStudio_Cloud esta versión trial viene instalada
con
>>> varias versiones de R.
>>>
>>> Gracias,
>>> Carlos Ortega
>>> www.qualityexcellence.es
>>>
>>> El jue., 30 abr. 2020 a las 18:16, Manuel Mendoza (<
>>> mmendoza en fulbrightmail.org>) escribió:
>>>
>>>> Buenas tardes. Tenía la versión 3.6.0 de R. Quería instalar el
paquete
>>>> edarf, pero decía que no estaba disponible para esa versión.
Actualicé
>>>> R a
>>>> la versión 4.0.0, que creo que es la última, pero al tratar de
>>>> reinstalar
>>>> forestFloor, me dice que no está disponible para la versión
4.0.0. He
>>>> abierto R 3.6.0 directamente, cliqueo
install.packages("forestfloor") y
>>>> ahora me dice que no está disponible para esa versión.
>>>> A ver si me podéis echar una mano,
>>>> Gracias,
>>>> Manuel
>>>>
>>>>         [[alternative HTML version deleted]]
>>>>
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>>>> R-help-es mailing list
>>>> R-help-es en r-project.org
>>>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
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>>> Saludos,
>>> Carlos Ortega
>>> www.qualityexcellence.es
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> Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
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