R help es - May 2019 - Como reordenar datos para analisis multiples correspondencias (MCA)

Mil gracias, José Antonio!
Creo que, entre tu recomendación y el apelo al ingenio de Javier, voy a
terminar generando la tabla que necesito.

Mi problema, al contrario de lo que entiendo que les pasa a los que
necesitan condensar, es que necesito extender... mi ya extensa data.frame.
Pero poder pensar en el problema de otros me ayuda a entender el mío.

Hau idatzi du José Antonio Palazón Ferrando (palazon en um.es) erabiltzaileak
(2019 mai. 14, ar. (09:03)):
> Hola:
>
> Quizá esto pueda ser de utilidad:
> Se trata de prepara una ?tabla? que tenga tantas columnas como
> modalidades hay en el total de los individuos.
> Cada columna toma el nombre de la modalidad y
> hacemos que cada individuo tome el valor 1 en las
> modalidades correspondientes.
>
> En este texto <http://ares.inf.um.es/mmcl/formatoCondensado.html> se
> explica y proporciona el procedimiento
> para hacerlo con listas de especies o caracteres,
> es muy fácil adaptarlo a tus necesidades.
>
> Seguimos
>
>
>
> El 14/5/19 a las 0:04, Juan Abasolo escribió:
> > Gracias, Javier;
> > Anduve buscando entre tus dos propuestas para mi encarables (plyr y
> > reshape2) y presupongo que el problema es eso del ingenio que
comentás,
> que
> > hay que tener y no tengo.
> >
> > Los paquetes me vinieron igualmente re-bien, porque me di cuenta que
no
> > tengo por qué sufrir haciéndolo a mano cada vez que encaro algunas de
> esas
> > situaciones.
> >
> > Pero lo de ordenar los datos para el MCA... el ingenio estara en
alguna
> > inlampara de casa, porque a mí no se me enciende la bombilla. Parece
> > prudente, a falta de más, idea purgar las respuestas dobles según
algún
> > criterio, que siempre es deformar la realidad un poquito más.
> >
> >
> >
> > Hau idatzi du Javier Marcuzzi (javier.ruben.marcuzzi en gmail.com)
> > erabiltzaileak (2019 mai. 13, al. (14:47)):
> >
> >> Estimado Juan Abasolo
> >>
> >> Para esas actividades se necesita algo de ingenio, no hay una sola
> >> solución, para esto existen librerías como plyr, reshape2, entre
otras,
> o
> >> simplemente a mano, en lo personal mis primeros pasos para ordenar
fue
> >> sqldf porque conocía sql más que R, sin embargo hoy las
alternativas al
> >> respecto son muy amplias.
> >>
> >> Yo pienso en como debo colocar los datos en el modelo, luego en
como
> tengo
> >> los datos originales, y finalmente busco la forma de acomodarlos.
En
> este
> >> paso posiblemente es donde R tiene la mayor cantidad de
alternativas e
> >> insumo de tiempo razonando puesto que tiene algo de
"artesanal en R".
> >>
> >> Javier Rubén Marcuzzi
> >>
> >> El dom., 12 may. 2019 a las 18:53, Juan Abasolo (<juan.abasolo
en ehu.eus
> >)
> >> escribió:
> >>
> >>> Necesito luz para ordenar unos datos... en realidad, para
ordenar
> muchos
> >>> muchoas veces. El problema hoy:
> >>>
> >>> Tengo una base de datos que incluye respuestas dobles en
algunas
> variables
> >>> en algunos individuos, tabla didáctica:
> >>>
> >>>              idioma   alergia          color
> >>> individuo1  en,es     0               amarillo
> >>> individuo2  es,en     huevo           limon
> >>> individuo3  es,fr,en  pescado, huevo  salmon
> >>>
> >>> Necesitaría ordenarlos de otra manera (creo), para poder hacer
un
> análisis
> >>> de multiples concordancias, porque tal y como lo tengo puesto,
por
> >>> ejemplo,
> >>> en idioma no hay concordancia, aunque es evidente que entre
todos
> podrían
> >>> comunicarse entre castellano o inglés, por ejemplo o que son
> equivalentes,
> >>> también en idioma, los sujetos 1 y 2.
> >>>
> >>> Los datos con los que tengo que trabajar, de momento, son
equivalentes
> a
> >>> los del ejemplo, lease categóricos e incluyen posibilidad de
respuestas
> >>> múltiples.
> >>>
> >>> Supongo que le resultará obvio a alguno cómo resolverlo o en
qué está
> mal
> >>> el orden así de los datos... pero yo nopuedo darme cuenta.
> >>>
> >>> a) Alguna pista?
> >>> b) Recomendación de lectura para abrir un poco la mente?
(tengo más de
> una
> >>> de este estilo)
> >>>
> >>> Gracias
> >>>
> >>>
> >>>
> >>> --
> >>> Juan Abasolo
> >>>
> >>> Hizkuntzaren eta Literaturaren Didaktika Saila | EUDIA
ikerketa taldea
> >>> Bilboko Hezkuntza Fakultatea
> >>> Euskal Herriko Unibertsitatea
> >>> UPV/EHU
> >>>
> >>> Sarriena auzoa z/g 48940 - Leioa (Bizkaia)
> >>>
> >>> T: (+34) 94 601 7567
> >>> Telegram: @JuanAbasolo
> >>> Skype: abasolo72
> >>>
> >>> Tutoretza ordutegia
<https://labur.eus/JAbasolo-tutoretzak>
> >>>
> >>>          [[alternative HTML version deleted]]
> >>>
> >>> _______________________________________________
> >>> R-help-es mailing list
> >>> R-help-es en r-project.org
> >>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> >>>
>
> --
>
> ____________________________________________________________
> José Antonio Palazón Ferrando
> Profesor Titular. Departamento de Ecología e Hidrología.
> Facultad de Biología. Universidad de Murcia.
> Campus Universitario de Espinardo
> 30100 MURCIA-SPAIN
> Telf: +34 868 88 49 80
> Fax : +34 868 88 39 63
> Email: palazon en um.es
>
>
>         [[alternative HTML version deleted]]
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>

-- 
Juan Abasolo

Hizkuntzaren eta Literaturaren Didaktika Saila | EUDIA ikerketa taldea
Bilboko Hezkuntza Fakultatea
Euskal Herriko Unibertsitatea
UPV/EHU

Sarriena auzoa z/g 48940 - Leioa (Bizkaia)

T: (+34) 94 601 7567
Telegram: @JuanAbasolo
Skype: abasolo72

Tutoretza ordutegia <https://labur.eus/JAbasolo-tutoretzak>

	[[alternative HTML version deleted]]

Buenos dias,

Espero que esto te pueda ayudar. Por lo que entiendo quieres llegar a una seríe
de columnas boleanas de ausencia/presencia de determinada alergia o idioma.

library(tidyverse)

ind<- c("individuo1", "individuo2",
"individuo3")
idioma<-c( "en,es", "es,en", "es,fr,en")
alergia<-c(0, "huevo", "pescado,huevo")
color<- c("amarillo", "limon", "salmon")

dbs<-data.frame(ind, idioma, alergia, color)

dbs%>%gather(caracteristica, valor, 2:4)%>%
  separate(valor, c("v1", "v2", "v3"))%>%
  gather(v, valor, 3:5)%>%
  filter(!is.na(valor))%>%
  mutate(categoria_bin=paste(caracteristica, ":", valor))%>%
  select(ind, categoria_bin)%>%
  mutate(value = 1)%>%
  spread(categoria_bin, value, fill= 0)

Saludos

Jorge



Jorge Senán Salinas
Análisis de Ciclo de Vida y Sostenibilidad
Grupo de Tecnología de Membranas
IMDEA-Agua



-----Mensaje original-----
De: R-help-es [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org] En nombre de Juan
Abasolo
Enviado el: martes, 14 de mayo de 2019 10:19
Para: José Antonio Palazón Ferrando <palazon en um.es>
CC: R-help-es <r-help-es en r-project.org>
Asunto: Re: [R-es] Como reordenar datos para analisis multiples correspondencias
(MCA)

Mil gracias, José Antonio!
Creo que, entre tu recomendación y el apelo al ingenio de Javier, voy a terminar
generando la tabla que necesito.

Mi problema, al contrario de lo que entiendo que les pasa a los que necesitan
condensar, es que necesito extender... mi ya extensa data.frame.
Pero poder pensar en el problema de otros me ayuda a entender el mío.

Hau idatzi du José Antonio Palazón Ferrando (palazon en um.es) erabiltzaileak
(2019 mai. 14, ar. (09:03)):
> Hola:
>
> Quizá esto pueda ser de utilidad:
> Se trata de prepara una ?tabla? que tenga tantas columnas como 
> modalidades hay en el total de los individuos.
> Cada columna toma el nombre de la modalidad y hacemos que cada 
> individuo tome el valor 1 en las modalidades correspondientes.
>
> En este texto <http://ares.inf.um.es/mmcl/formatoCondensado.html> se 
> explica y proporciona el procedimiento para hacerlo con listas de 
> especies o caracteres, es muy fácil adaptarlo a tus necesidades.
>
> Seguimos
>
>
>
> El 14/5/19 a las 0:04, Juan Abasolo escribió:
> > Gracias, Javier;
> > Anduve buscando entre tus dos propuestas para mi encarables (plyr y
> > reshape2) y presupongo que el problema es eso del ingenio que 
> > comentás,
> que
> > hay que tener y no tengo.
> >
> > Los paquetes me vinieron igualmente re-bien, porque me di cuenta que 
> > no tengo por qué sufrir haciéndolo a mano cada vez que encaro 
> > algunas de
> esas
> > situaciones.
> >
> > Pero lo de ordenar los datos para el MCA... el ingenio estara en 
> > alguna inlampara de casa, porque a mí no se me enciende la bombilla. 
> > Parece prudente, a falta de más, idea purgar las respuestas dobles 
> > según algún criterio, que siempre es deformar la realidad un poquito
más.
> >
> >
> >
> > Hau idatzi du Javier Marcuzzi (javier.ruben.marcuzzi en gmail.com) 
> > erabiltzaileak (2019 mai. 13, al. (14:47)):
> >
> >> Estimado Juan Abasolo
> >>
> >> Para esas actividades se necesita algo de ingenio, no hay una sola
> >> solución, para esto existen librerías como plyr, reshape2, entre 
> >> otras,
> o
> >> simplemente a mano, en lo personal mis primeros pasos para ordenar
> >> fue sqldf porque conocía sql más que R, sin embargo hoy las 
> >> alternativas al respecto son muy amplias.
> >>
> >> Yo pienso en como debo colocar los datos en el modelo, luego en 
> >> como
> tengo
> >> los datos originales, y finalmente busco la forma de acomodarlos. 
> >> En
> este
> >> paso posiblemente es donde R tiene la mayor cantidad de 
> >> alternativas e insumo de tiempo razonando puesto que tiene algo de
"artesanal en R".
> >>
> >> Javier Rubén Marcuzzi
> >>
> >> El dom., 12 may. 2019 a las 18:53, Juan Abasolo 
> >> (<juan.abasolo en ehu.eus
> >)
> >> escribió:
> >>
> >>> Necesito luz para ordenar unos datos... en realidad, para
ordenar
> muchos
> >>> muchoas veces. El problema hoy:
> >>>
> >>> Tengo una base de datos que incluye respuestas dobles en
algunas
> variables
> >>> en algunos individuos, tabla didáctica:
> >>>
> >>>              idioma   alergia          color
> >>> individuo1  en,es     0               amarillo
> >>> individuo2  es,en     huevo           limon
> >>> individuo3  es,fr,en  pescado, huevo  salmon
> >>>
> >>> Necesitaría ordenarlos de otra manera (creo), para poder hacer
un
> análisis
> >>> de multiples concordancias, porque tal y como lo tengo puesto,
por
> >>> ejemplo, en idioma no hay concordancia, aunque es evidente que
> >>> entre todos
> podrían
> >>> comunicarse entre castellano o inglés, por ejemplo o que son
> equivalentes,
> >>> también en idioma, los sujetos 1 y 2.
> >>>
> >>> Los datos con los que tengo que trabajar, de momento, son 
> >>> equivalentes
> a
> >>> los del ejemplo, lease categóricos e incluyen posibilidad de 
> >>> respuestas múltiples.
> >>>
> >>> Supongo que le resultará obvio a alguno cómo resolverlo o en
qué
> >>> está
> mal
> >>> el orden así de los datos... pero yo nopuedo darme cuenta.
> >>>
> >>> a) Alguna pista?
> >>> b) Recomendación de lectura para abrir un poco la mente?
(tengo
> >>> más de
> una
> >>> de este estilo)
> >>>
> >>> Gracias
> >>>
> >>>
> >>>
> >>> --
> >>> Juan Abasolo
> >>>
> >>> Hizkuntzaren eta Literaturaren Didaktika Saila | EUDIA
ikerketa
> >>> taldea Bilboko Hezkuntza Fakultatea Euskal Herriko
Unibertsitatea
> >>> UPV/EHU
> >>>
> >>> Sarriena auzoa z/g 48940 - Leioa (Bizkaia)
> >>>
> >>> T: (+34) 94 601 7567
> >>> Telegram: @JuanAbasolo
> >>> Skype: abasolo72
> >>>
> >>> Tutoretza ordutegia
<https://labur.eus/JAbasolo-tutoretzak>
> >>>
> >>>          [[alternative HTML version deleted]]
> >>>
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> >>>
>
> --
>
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> José Antonio Palazón Ferrando
> Profesor Titular. Departamento de Ecología e Hidrología.
> Facultad de Biología. Universidad de Murcia.
> Campus Universitario de Espinardo
> 30100 MURCIA-SPAIN
> Telf: +34 868 88 49 80
> Fax : +34 868 88 39 63
> Email: palazon en um.es
>
>
>         [[alternative HTML version deleted]]
>
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Juan Abasolo

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Hezkuntza Fakultatea Euskal Herriko Unibertsitatea UPV/EHU

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Telegram: @JuanAbasolo
Skype: abasolo72

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	[[alternative HTML version deleted]]

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Es evidente que no soy demasiado ingenioso, porque con todo lo que me
ayudaron, terminé pasando horas hasta que lo conseguí (y una vez conseguido
pienso que tendría que haber tardado menos de la cuarta parte). Gracias,
Jorge, también.

Así que, desde este estado mental que describo, vengo con una pregunta que
más que de R es de teoría del análisis de datos.

Una vez que consigo que los datos se me ordenen en variables binarias tipo
presencia/ausencia de los valores que toman las variables originales, al
pedirle que haga el Análisis de Multiples Concordancias, resulta que toma
muchísima peso la ausencia de las características. Eso no distorciona el
análisis? ¿o estoy preguntando una tontería, porque también se puede
caracterizar mediante la ausencia? ¿O qué?

Si alguien entiende mi duda y además tiene el tiempo y la paciencia de
explicar, agradecidísimo. Pero con señalarme qué leer, me sentiría muy
ayudado. Soy de letras, señalen con piedad.



Hau idatzi du Jorge Senán Salinas (jorge.senan en imdea.org) erabiltzaileak
(2019 mai. 14, ar. (11:19)):
> Buenos dias,
>
> Espero que esto te pueda ayudar. Por lo que entiendo quieres llegar a una
> seríe de columnas boleanas de ausencia/presencia de determinada alergia o
> idioma.
>
> library(tidyverse)
>
> ind<- c("individuo1", "individuo2",
"individuo3")
> idioma<-c( "en,es", "es,en", "es,fr,en")
> alergia<-c(0, "huevo", "pescado,huevo")
> color<- c("amarillo", "limon", "salmon")
>
> dbs<-data.frame(ind, idioma, alergia, color)
>
> dbs%>%gather(caracteristica, valor, 2:4)%>%
>   separate(valor, c("v1", "v2", "v3"))%>%
>   gather(v, valor, 3:5)%>%
>   filter(!is.na(valor))%>%
>   mutate(categoria_bin=paste(caracteristica, ":", valor))%>%
>   select(ind, categoria_bin)%>%
>   mutate(value = 1)%>%
>   spread(categoria_bin, value, fill= 0)
>
> Saludos
>
> Jorge
>
>
>
> Jorge Senán Salinas
> Análisis de Ciclo de Vida y Sostenibilidad
> Grupo de Tecnología de Membranas
> IMDEA-Agua
>
>
>
> -----Mensaje original-----
> De: R-help-es [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org] En nombre de Juan
> Abasolo
> Enviado el: martes, 14 de mayo de 2019 10:19
> Para: José Antonio Palazón Ferrando <palazon en um.es>
> CC: R-help-es <r-help-es en r-project.org>
> Asunto: Re: [R-es] Como reordenar datos para analisis multiples
> correspondencias (MCA)
>
> Mil gracias, José Antonio!
> Creo que, entre tu recomendación y el apelo al ingenio de Javier, voy a
> terminar generando la tabla que necesito.
>
> Mi problema, al contrario de lo que entiendo que les pasa a los que
> necesitan condensar, es que necesito extender... mi ya extensa data.frame.
> Pero poder pensar en el problema de otros me ayuda a entender el mío.
>
> Hau idatzi du José Antonio Palazón Ferrando (palazon en um.es)
erabiltzaileak
> (2019 mai. 14, ar. (09:03)):
>
> > Hola:
> >
> > Quizá esto pueda ser de utilidad:
> > Se trata de prepara una ?tabla? que tenga tantas columnas como
> > modalidades hay en el total de los individuos.
> > Cada columna toma el nombre de la modalidad y hacemos que cada
> > individuo tome el valor 1 en las modalidades correspondientes.
> >
> > En este texto
<http://ares.inf.um.es/mmcl/formatoCondensado.html> se
> > explica y proporciona el procedimiento para hacerlo con listas de
> > especies o caracteres, es muy fácil adaptarlo a tus necesidades.
> >
> > Seguimos
> >
> >
> >
> > El 14/5/19 a las 0:04, Juan Abasolo escribió:
> > > Gracias, Javier;
> > > Anduve buscando entre tus dos propuestas para mi encarables (plyr
y
> > > reshape2) y presupongo que el problema es eso del ingenio que
> > > comentás,
> > que
> > > hay que tener y no tengo.
> > >
> > > Los paquetes me vinieron igualmente re-bien, porque me di cuenta
que
> > > no tengo por qué sufrir haciéndolo a mano cada vez que encaro
> > > algunas de
> > esas
> > > situaciones.
> > >
> > > Pero lo de ordenar los datos para el MCA... el ingenio estara en
> > > alguna inlampara de casa, porque a mí no se me enciende la
bombilla.
> > > Parece prudente, a falta de más, idea purgar las respuestas
dobles
> > > según algún criterio, que siempre es deformar la realidad un
poquito
> más.
> > >
> > >
> > >
> > > Hau idatzi du Javier Marcuzzi (javier.ruben.marcuzzi en
gmail.com)
> > > erabiltzaileak (2019 mai. 13, al. (14:47)):
> > >
> > >> Estimado Juan Abasolo
> > >>
> > >> Para esas actividades se necesita algo de ingenio, no hay una
sola
> > >> solución, para esto existen librerías como plyr, reshape2,
entre
> > >> otras,
> > o
> > >> simplemente a mano, en lo personal mis primeros pasos para
ordenar
> > >> fue sqldf porque conocía sql más que R, sin embargo hoy las
> > >> alternativas al respecto son muy amplias.
> > >>
> > >> Yo pienso en como debo colocar los datos en el modelo, luego
en
> > >> como
> > tengo
> > >> los datos originales, y finalmente busco la forma de
acomodarlos.
> > >> En
> > este
> > >> paso posiblemente es donde R tiene la mayor cantidad de
> > >> alternativas e insumo de tiempo razonando puesto que tiene
algo de
> "artesanal en R".
> > >>
> > >> Javier Rubén Marcuzzi
> > >>
> > >> El dom., 12 may. 2019 a las 18:53, Juan Abasolo
> > >> (<juan.abasolo en ehu.eus
> > >)
> > >> escribió:
> > >>
> > >>> Necesito luz para ordenar unos datos... en realidad, para
ordenar
> > muchos
> > >>> muchoas veces. El problema hoy:
> > >>>
> > >>> Tengo una base de datos que incluye respuestas dobles en
algunas
> > variables
> > >>> en algunos individuos, tabla didáctica:
> > >>>
> > >>>              idioma   alergia          color
> > >>> individuo1  en,es     0               amarillo
> > >>> individuo2  es,en     huevo           limon
> > >>> individuo3  es,fr,en  pescado, huevo  salmon
> > >>>
> > >>> Necesitaría ordenarlos de otra manera (creo), para poder
hacer un
> > análisis
> > >>> de multiples concordancias, porque tal y como lo tengo
puesto, por
> > >>> ejemplo, en idioma no hay concordancia, aunque es
evidente que
> > >>> entre todos
> > podrían
> > >>> comunicarse entre castellano o inglés, por ejemplo o que
son
> > equivalentes,
> > >>> también en idioma, los sujetos 1 y 2.
> > >>>
> > >>> Los datos con los que tengo que trabajar, de momento, son
> > >>> equivalentes
> > a
> > >>> los del ejemplo, lease categóricos e incluyen posibilidad
de
> > >>> respuestas múltiples.
> > >>>
> > >>> Supongo que le resultará obvio a alguno cómo resolverlo o
en qué
> > >>> está
> > mal
> > >>> el orden así de los datos... pero yo nopuedo darme
cuenta.
> > >>>
> > >>> a) Alguna pista?
> > >>> b) Recomendación de lectura para abrir un poco la mente?
(tengo
> > >>> más de
> > una
> > >>> de este estilo)
> > >>>
> > >>> Gracias
> > >>>
> > >>>
> > >>>
> > >>> --
> > >>> Juan Abasolo
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Unibertsitatea
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> > Email: palazon en um.es
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