R help es - Jan 2019 - Cómo replicar unos clusters según sistema anterior.

Buenas noches;
vengo con una consulta, que no se si es fácilmente resoluble o necesito
saber más para entender porqué no tengo que hacer lo que me propongo.

Tengo una matriz de distancias y unos clusters según metodo "ward" que
me
los da una web construida hace ya unos años. Supongo que fue publicada en
el 2012, por lo que estará construida en el 11, 10 o antes).

Esta web me devuelve unas agrupaciones (el gráfico) o me permite a mí bajar
la matriz de distancias.

Bajé la matriz de distancias y pretendí replicar los
resultados
> plot(hclust(matriz.bajada, method = 'ward.D2')
pero no se replicó, sino que salieron otros clusters.
También probé con ward.D. No consigo los resultados de la web.

La matriz de datos, insisto, es la que usa la web en custión. Por lo que no
debería ser tan difícil replicar los resultados.

Tengo entendido que en algún momento el "standard" de cómo calcular
los
clusters según ward en R cambió.

Pregunta: **¿Cómo podría rehacer con los metodos anteriores?** Acá hay
espacio para las cábalas.
O **por qué no hacerlo?**

Muchas gracias


-- 
Juan Abasolo

Hizkuntzaren eta Literaturaren Didaktika Saila | EUDIA ikerketa taldea
Bilboko Hezkuntza Fakultatea
Euskal Herriko Unibertsitatea
UPV/EHU

Sarriena auzoa z/g 48940 - Leioa (Bizkaia)

T: (+34) 94 601 7567
Telegram: @JuanAbasolo
Skype: abasolo72

Tutoretza ordutegia <https://labur.eus/JAbasolo-tutoretzak>

	[[alternative HTML version deleted]]

Estimado Juán Abasolo

No se si comprendo, usted no quiere replicar sino recalcular datos. Por
ejemplo:

En el trabajo original: datos ---> análisis ---> resultados

Usted tiene: resultados

Usted desea:  resultados --> escribir análisis en R --> datos
"calculados"

Si es así, habría que mirar porque es lo que realiza predict, pero no creo
que pueda porque no tiene los parámetros ni escritura del "análisis".

Javier Rubén Marcuzzi

El sáb., 12 ene. 2019 a las 15:44, Juan Abasolo (<juan.abasolo en
ehu.eus>)
escribió:
> Buenas noches;
> vengo con una consulta, que no se si es fácilmente resoluble o necesito
> saber más para entender porqué no tengo que hacer lo que me propongo.
>
> Tengo una matriz de distancias y unos clusters según metodo
"ward" que me
> los da una web construida hace ya unos años. Supongo que fue publicada en
> el 2012, por lo que estará construida en el 11, 10 o antes).
>
> Esta web me devuelve unas agrupaciones (el gráfico) o me permite a mí bajar
> la matriz de distancias.
>
> Bajé la matriz de distancias y pretendí replicar los resultados
> > plot(hclust(matriz.bajada, method = 'ward.D2')
> pero no se replicó, sino que salieron otros clusters.
> También probé con ward.D. No consigo los resultados de la web.
>
> La matriz de datos, insisto, es la que usa la web en custión. Por lo que no
> debería ser tan difícil replicar los resultados.
>
> Tengo entendido que en algún momento el "standard" de cómo
calcular los
> clusters según ward en R cambió.
>
> Pregunta: **¿Cómo podría rehacer con los metodos anteriores?** Acá hay
> espacio para las cábalas.
> O **por qué no hacerlo?**
>
> Muchas gracias
>
>
> --
> Juan Abasolo
>
> Hizkuntzaren eta Literaturaren Didaktika Saila | EUDIA ikerketa taldea
> Bilboko Hezkuntza Fakultatea
> Euskal Herriko Unibertsitatea
> UPV/EHU
>
> Sarriena auzoa z/g 48940 - Leioa (Bizkaia)
>
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>
> Tutoretza ordutegia <https://labur.eus/JAbasolo-tutoretzak>
>
>         [[alternative HTML version deleted]]
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
	[[alternative HTML version deleted]]

Puede que no me haya expresado certeramente. Es lo que pasa al tocar de
oído.

Tengo unos datos (df) de los que se alguien calculó unas distancias
(dis.df) de las que se hicieron/hacen unos clusters (plot.clus.dis.df).
Todo esto usando un programa on line al que no tengo acceso para ver cómo
hace los cálculos.

Yo tengo los datos, y el programa también me da la matriz de distancias.
Quiero, además, tener los clusters (no el dibujo, si no el elemento:
elemento <- hclus(dis.df))
Pero el elemento que yo genero con hclus(dis.df, methd = c(ward.D, ward.D2)
genera agrupamientos que no coinciden con los que me devuelve en el plot.
No sé si lo que yo quiero hacer es 'replicar' o solamente
'repetir'. Que es
como lo diría en casa.

Tengo entendido que en algún momento no muy lejano se cambió algo en la
manera de calcular los clusters siguiendo los agrupamientos de Ward. Y me
temo que el programa que uso on line estará calculando según aquella forma.
Lo que querría es encontrar aquella forma (que entiendo que será menos
correcta que la actual), para poder 'repetir' los mismos resultados.

Disculpá el ser tan poco claro. Pero creeme que lo intento.

Buena semana


Hau idatzi du Javier Marcuzzi (javier.ruben.marcuzzi en gmail.com)
erabiltzaileak (2019 urt. 13, ig. (15:28)):
> Estimado Juán Abasolo
>
> No se si comprendo, usted no quiere replicar sino recalcular datos. Por
> ejemplo:
>
> En el trabajo original: datos ---> análisis ---> resultados
>
> Usted tiene: resultados
>
> Usted desea:  resultados --> escribir análisis en R --> datos
"calculados"
>
> Si es así, habría que mirar porque es lo que realiza predict, pero no creo
> que pueda porque no tiene los parámetros ni escritura del
"análisis".
>
> Javier Rubén Marcuzzi
>
> El sáb., 12 ene. 2019 a las 15:44, Juan Abasolo (<juan.abasolo en
ehu.eus>)
> escribió:
>
>> Buenas noches;
>> vengo con una consulta, que no se si es fácilmente resoluble o necesito
>> saber más para entender porqué no tengo que hacer lo que me propongo.
>>
>> Tengo una matriz de distancias y unos clusters según metodo
"ward" que me
>> los da una web construida hace ya unos años. Supongo que fue publicada
en
>> el 2012, por lo que estará construida en el 11, 10 o antes).
>>
>> Esta web me devuelve unas agrupaciones (el gráfico) o me permite a mí
>> bajar
>> la matriz de distancias.
>>
>> Bajé la matriz de distancias y pretendí replicar los resultados
>> > plot(hclust(matriz.bajada, method = 'ward.D2')
>> pero no se replicó, sino que salieron otros clusters.
>> También probé con ward.D. No consigo los resultados de la web.
>>
>> La matriz de datos, insisto, es la que usa la web en custión. Por lo
que
>> no
>> debería ser tan difícil replicar los resultados.
>>
>> Tengo entendido que en algún momento el "standard" de cómo
calcular los
>> clusters según ward en R cambió.
>>
>> Pregunta: **¿Cómo podría rehacer con los metodos anteriores?** Acá hay
>> espacio para las cábalas.
>> O **por qué no hacerlo?**
>>
>> Muchas gracias
>>
>>
>> --
>> Juan Abasolo
>>
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>> Telegram: @JuanAbasolo
>> Skype: abasolo72
>>
>> Tutoretza ordutegia <https://labur.eus/JAbasolo-tutoretzak>
>>
>>         [[alternative HTML version deleted]]
>>
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>> R-help-es en r-project.org
>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
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Juan Abasolo

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Telegram: @JuanAbasolo
Skype: abasolo72

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	[[alternative HTML version deleted]]

¿Has probado la versión de la función "agnes"?:
https://www.rdocumentation.org/packages/cluster/versions/1.4-1/topics/agnes
Por lo que parece, utiliza el mismo método que la antigua "hclust",
que
debería ser el mismo que la opción "method = "Ward.D2". Por
probar no
pierdes nada...
Un saludo

Isidro Hidalgo Arellano
Observatorio del Mercado de Trabajo
Consejería de Economía, Empresas y Empleo
http://www.castillalamancha.es/


-----Mensaje original-----
De: R-help-es <r-help-es-bounces en r-project.org> En nombre de Juan
Abasolo
Enviado el: sábado, 12 de enero de 2019 19:45
Para: R-help-es <r-help-es en r-project.org>
Asunto: [R-es] Cómo replicar unos clusters según sistema anterior.

Buenas noches;
vengo con una consulta, que no se si es fácilmente resoluble o necesito
saber más para entender porqué no tengo que hacer lo que me propongo.

Tengo una matriz de distancias y unos clusters según metodo "ward" que
me
los da una web construida hace ya unos años. Supongo que fue publicada en el
2012, por lo que estará construida en el 11, 10 o antes).

Esta web me devuelve unas agrupaciones (el gráfico) o me permite a mí bajar
la matriz de distancias.

Bajé la matriz de distancias y pretendí replicar los
resultados
> plot(hclust(matriz.bajada, method = 'ward.D2')
pero no se replicó, sino que salieron otros clusters.
También probé con ward.D. No consigo los resultados de la web.

La matriz de datos, insisto, es la que usa la web en custión. Por lo que no
debería ser tan difícil replicar los resultados.

Tengo entendido que en algún momento el "standard" de cómo calcular
los
clusters según ward en R cambió.

Pregunta: **¿Cómo podría rehacer con los metodos anteriores?** Acá hay
espacio para las cábalas.
O **por qué no hacerlo?**

Muchas gracias


--
Juan Abasolo

Hizkuntzaren eta Literaturaren Didaktika Saila | EUDIA ikerketa taldea
Bilboko Hezkuntza Fakultatea Euskal Herriko Unibertsitatea UPV/EHU

Sarriena auzoa z/g 48940 - Leioa (Bizkaia)

T: (+34) 94 601 7567
Telegram: @JuanAbasolo
Skype: abasolo72

Tutoretza ordutegia <https://labur.eus/JAbasolo-tutoretzak>

	[[alternative HTML version deleted]]

_______________________________________________
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https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

Muchas gracias, Isidro;
Hice la prueba que me recomendás y con mis datos me da los mismos clusters.
La única diferencia que aprecio es el orden estético. Pero las agrupaciones
que me surgen son idénticas a hclust(x, method = 'ward.D2').
Si se te ocurre algún otro más, bienvenido será.

Juan

Hau idatzi du Isidro Hidalgo Arellano (ihidalgo en jccm.es) erabiltzaileak
(2019 urt. 14, al. (07:48)):
> ¿Has probado la versión de la función "agnes"?:
> https://www.rdocumentation.org/packages/cluster/versions/1.4-1/topics/agnes
> Por lo que parece, utiliza el mismo método que la antigua
"hclust", que
> debería ser el mismo que la opción "method = "Ward.D2". Por
probar no
> pierdes nada...
> Un saludo
>
> Isidro Hidalgo Arellano
> Observatorio del Mercado de Trabajo
> Consejería de Economía, Empresas y Empleo
> http://www.castillalamancha.es/
>
>
> -----Mensaje original-----
> De: R-help-es <r-help-es-bounces en r-project.org> En nombre de Juan
Abasolo
> Enviado el: sábado, 12 de enero de 2019 19:45
> Para: R-help-es <r-help-es en r-project.org>
> Asunto: [R-es] Cómo replicar unos clusters según sistema anterior.
>
> Buenas noches;
> vengo con una consulta, que no se si es fácilmente resoluble o necesito
> saber más para entender porqué no tengo que hacer lo que me propongo.
>
> Tengo una matriz de distancias y unos clusters según metodo
"ward" que me
> los da una web construida hace ya unos años. Supongo que fue publicada en
> el
> 2012, por lo que estará construida en el 11, 10 o antes).
>
> Esta web me devuelve unas agrupaciones (el gráfico) o me permite a mí bajar
> la matriz de distancias.
>
> Bajé la matriz de distancias y pretendí replicar los resultados
> > plot(hclust(matriz.bajada, method = 'ward.D2')
> pero no se replicó, sino que salieron otros clusters.
> También probé con ward.D. No consigo los resultados de la web.
>
> La matriz de datos, insisto, es la que usa la web en custión. Por lo que no
> debería ser tan difícil replicar los resultados.
>
> Tengo entendido que en algún momento el "standard" de cómo
calcular los
> clusters según ward en R cambió.
>
> Pregunta: **¿Cómo podría rehacer con los metodos anteriores?** Acá hay
> espacio para las cábalas.
> O **por qué no hacerlo?**
>
> Muchas gracias
>
>
> --
> Juan Abasolo
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