R help es - Oct 2018 - Librería para simulación de datos GWAS en estudios de casos y controles

Hola a todos,
Estoy buscando alguna librería de R que sea capaz de generar datos sintéticos
para estudios GWAS (Genome-Wide association studies) de casos y controles. Sé
que hay unas cuantas, pero me gustaría tener información de primera mano de
alguien que haya usado alguna y me la pueda recomendar.
un saludo y muchas gracias,
Fernando


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Fernando,

Efectivamente hay varias opciones.  Dos alternativas son

https://rdrr.io/bioc/hierGWAS/man/simGWAS.html
https://arxiv.org/pdf/1710.01236.pdf
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5605948/
https://cnsgenomics.com/software/gcta/#Overview (no propiamente en R, pero
tiene interfaz)

Espero sea de utilidad.

Saludos,
Jorge Velez.-


On Mon, Oct 29, 2018 at 2:19 PM Fernando Sanchez via R-help-es <
r-help-es en r-project.org> wrote:
> Hola a todos,
> Estoy buscando alguna librería de R que sea capaz de generar datos
> sintéticos para estudios GWAS (Genome-Wide association studies) de casos y
> controles. Sé que hay unas cuantas, pero me gustaría tener información de
> primera mano de alguien que haya usado alguna y me la pueda recomendar.
> un saludo y muchas gracias,
> Fernando
>
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