R help es - May 2017 - En la salida pone otro grafico R+LaTeX*LyX con documentos "hijos"

Buenas;
Estoy ya en la corrección de la tesis a contrareloj y un director me dijo:
"esto no ahí, va acá". Digamos:

1 cap
2 cap
  * quitar de acá
3 cap
  * poner acá
4 cap

Estoy usando LyX, una especie de front-end para LaTeX. Lo tengo organizado,
más o menos, a un documento por capitulo, aunque hay alguno en el que van
más de un capitulo. Todo anidado en un documento padre-madre que lo
contiene todo.
En cada capítulo llamo a R mediante un chunk y el primero de la serie suele
comenzar, por si acaso, así, para borrar cualquier cosa que haya antes:

rm(list=ls(all=TRUE))

Todos los documentos (padres e hijos) están en una sola carpeta y todos los
elementos de R en diversas carpetas, que corresponden a la información de
cada capítulo.

Problema:
Al generar el PDF de toda la tesis, el grafico que incluye no es el que
debería, sino el siguiente (?!!).

Tesis
 3 capitulo
   R grafico 0k1
   R grafico 0k n
   R GRAFICO KO KK :-(
 4 capitulo
   (sin graficos R)
 5 capitulo
   R tabla ok 1
   R tabla ok n
   R grafico Ok (el que aparece arriba tb)
   R etcetera tablas y graficos ok

Puedo contar que el chunk ese en cuestión empieza con el
rm(list=ls(all=TRUE)) mencionado arriba; carga datos de un csv y genera el
grafico.
Si genero el PDF solamente del capítulo ese en cuestión, sale bien el
gráfico que tiene que salir.

Doctores, ¿es grave? ¿Qué tratamiento me recomiendan?

Juan

	[[alternative HTML version deleted]]

¡Solucionado!

Remedio de vieja:
Invocar en  otro chunk diferente con la mágica frase:

rm(list=ls(all=TRUE))

cerrar el chunk y ahí sí, hacer los conjuros debidos para generar el
gráfico.

Funcionó!

Que quede documentado por si a alguien más le pasa. Si algún gurú, además,
puede explicarlo para que deje de creer en lo mágico de la informática...
Todavía mejor.

Buen domingo

2017-05-20 7:38 GMT+02:00 Juan Abasolo <juan.abasolo en ehu.eus>:
> Buenas;
> Estoy ya en la corrección de la tesis a contrareloj y un director me dijo:
> "esto no ahí, va acá". Digamos:
>
> 1 cap
> 2 cap
>   * quitar de acá
> 3 cap
>   * poner acá
> 4 cap
>
> Estoy usando LyX, una especie de front-end para LaTeX. Lo tengo
> organizado, más o menos, a un documento por capitulo, aunque hay alguno en
> el que van más de un capitulo. Todo anidado en un documento padre-madre que
> lo contiene todo.
> En cada capítulo llamo a R mediante un chunk y el primero de la serie
> suele comenzar, por si acaso, así, para borrar cualquier cosa que haya
> antes:
>
> rm(list=ls(all=TRUE))
>
> Todos los documentos (padres e hijos) están en una sola carpeta y todos
> los elementos de R en diversas carpetas, que corresponden a la información
> de cada capítulo.
>
> Problema:
> Al generar el PDF de toda la tesis, el grafico que incluye no es el que
> debería, sino el siguiente (?!!).
>
> Tesis
>  3 capitulo
>    R grafico 0k1
>    R grafico 0k n
>    R GRAFICO KO KK :-(
>  4 capitulo
>    (sin graficos R)
>  5 capitulo
>    R tabla ok 1
>    R tabla ok n
>    R grafico Ok (el que aparece arriba tb)
>    R etcetera tablas y graficos ok
>
> Puedo contar que el chunk ese en cuestión empieza con el
> rm(list=ls(all=TRUE)) mencionado arriba; carga datos de un csv y genera el
> grafico.
> Si genero el PDF solamente del capítulo ese en cuestión, sale bien el
> gráfico que tiene que salir.
>
> Doctores, ¿es grave? ¿Qué tratamiento me recomiendan?
>
> Juan
>
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