Gracias por la pronta respuesta, pero tras leer la contestación de la gente,
sigo sin entender muy bien la explicación.
Le responden lo siguiente:
"Each point on the partial dependence plot is the average vote
percentage in favor of the "Yes trees" class across all observations,
given a fixed level of TRI.
It's not a probability of correct classification. It has absolutely
nothing to do with accuracy, true negatives, and true positives.
When you see the phrase
Values greater than TRI 30 begin to have a positive influence for
classification in your model
is an puffed-up way of saying
Values greater than TRI 30 begin to predict "Yes trees" more
strongly than values lower than TRI 30"
Es decir, que el eje Y es el total de votos de una clase frente a la otra,
pero como está codificado con -1 y +1, como se cual es la clase OK y la NOK?
Gracias
Jesús
Date: Tue, 12 Apr 2016 10:04:15 +0200
Subject: Re: [R-es] Random Forest para clasificación
From: cof en qualityexcellence.es
To: j.para.fernandez en hotmail.com
CC: r-help-es en r-project.org
Hola,
Aquí tienes una explicación:
http://stats.stackexchange.com/questions/121383/interpreting-y-axis-of-a-partial-dependence-plots
Saludos,Carlos Ortegawww.qualityexcellence.es
El 12 de abril de 2016, 7:13, Jesús Para Fernández <j.para.fernandez en
hotmail.com> escribió:
Buenas,
Cuando estoy haciendo un random Forest para clasificación y hago el gráfico
partialPlot, siendo mi respuesta OK/NOK, me sale en el eje X el valor de la
variable, pero en el eje Y me salen valores de entre -1 y 1. ¿Qué significado
tiene?
Adjunto un ejemplo:
https://www.dropbox.com/s/4b92lqxi3592r0d/Captura.JPG?dl=0
Gracias!!!
[[alternative HTML version deleted]]
_______________________________________________
R-help-es mailing list
R-help-es en r-project.org
https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
--
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
[[alternative HTML version deleted]]
Hola, Entonces, por tu última pregunta, tu duda no es realmente sobre el significado de "partialPlot" si no realmente si a la hora de hacer tu modelo, "randomForest" está haciendo una buena o mala clasificación. ¿Es así?. Porque entonces lo que hay que aclarar es otra cosa. Si lo que quieres determinar con precisión es si cuando "randomForest" (o cualquier otro modelo) te está indicando que un individuo (una fila) pertenece o no a una clase determinada (en tu caso "OK" o "KO") lo que tienes que plantearte son otras cosas. Antes de hablar de ellas, prefiero confirmar contigo si es esto lo que buscas o no. Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es El 12 de abril de 2016, 10:17, Jesús Para Fernández < j.para.fernandez en hotmail.com> escribió:> > Gracias por la pronta respuesta, pero tras leer la contestación de la > gente, sigo sin entender muy bien la explicación. > > Le responden lo siguiente: > "Each point on the partial dependence plot is the average vote percentage > in favor of the "Yes trees" class across all observations, given a fixed > level of TRI. > It's not a probability of correct classification. It has absolutely > nothing to do with accuracy, true negatives, and true positives. > When you see the phrase > > Values greater than TRI 30 begin to have a positive influence for > classification in your model > > is an puffed-up way of saying > > Values greater than TRI 30 begin to predict "Yes trees" more strongly than > values lower than TRI 30" > > Es decir, que el eje Y es el total de votos de una clase frente a la otra, > pero como está codificado con -1 y +1, como se cual es la clase OK y la NOK? > > Gracias > Jesús > ------------------------------ > Date: Tue, 12 Apr 2016 10:04:15 +0200 > Subject: Re: [R-es] Random Forest para clasificación > From: cof en qualityexcellence.es > To: j.para.fernandez en hotmail.com > CC: r-help-es en r-project.org > > > Hola, > > Aquí tienes una explicación: > > > http://stats.stackexchange.com/questions/121383/interpreting-y-axis-of-a-partial-dependence-plots > > Saludos, > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es > > El 12 de abril de 2016, 7:13, Jesús Para Fernández < > j.para.fernandez en hotmail.com> escribió: > > Buenas, > > Cuando estoy haciendo un random Forest para clasificación y hago el > gráfico partialPlot, siendo mi respuesta OK/NOK, me sale en el eje X el > valor de la variable, pero en el eje Y me salen valores de entre -1 y 1. > ¿Qué significado tiene? > > Adjunto un ejemplo: > > https://www.dropbox.com/s/4b92lqxi3592r0d/Captura.JPG?dl=0 > > > Gracias!!! > > [[alternative HTML version deleted]] > > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > > > > -- > Saludos, > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es >-- Saludos, Carlos Ortega www.qualityexcellence.es [[alternative HTML version deleted]]
Lo razonable es pensar que los positivos son la clase "OK", la rama
"SÍ" de los árboles.
Un saludo
Isidro Hidalgo Arellano
Observatorio del Mercado de Trabajo
Consejería de Economía, Empresas y Empleo
http://www.castillalamancha.es/
-----Mensaje original-----
De: R-help-es [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org] En nombre de Jesús
Para Fernández
Enviado el: martes, 12 de abril de 2016 10:18
Para: Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>
CC: r-help-es en r-project.org
Asunto: Re: [R-es] Random Forest para clasificación
Gracias por la pronta respuesta, pero tras leer la contestaci n de la gente,
sigo sin entender muy bien la explicaci n.
Le responden lo siguiente:
"Each point on the partial dependence plot is the average vote percentage
in favor of the "Yes trees" class across all observations, given a
fixed level of TRI.
It's not a probability of correct classification. It has absolutely nothing
to do with accuracy, true negatives, and true positives.
When you see the phrase
Values greater than TRI 30 begin to have a positive influence for
classification in your model
is an puffed-up way of saying
Values greater than TRI 30 begin to predict "Yes trees" more
strongly than values lower than TRI 30"
Es decir, que el eje Y es el total de votos de una clase frente a la otra,
pero como est codificado con -1 y +1, como se cual es la clase OK y la NOK?
Gracias
Jes s
Date: Tue, 12 Apr 2016 10:04:15 +0200
Subject: Re: [R-es] Random Forest para clasificaci n
From: cof en qualityexcellence.es
To: j.para.fernandez en hotmail.com
CC: r-help-es en r-project.org
Hola,
Aqu tienes una explicaci n:
http://stats.stackexchange.com/questions/121383/interpreting-y-axis-of-a-partial-dependence-plots
Saludos,Carlos Ortegawww.qualityexcellence.es
El 12 de abril de 2016, 7:13, Jes s Para Fern ndez <j.para.fernandez en
hotmail.com> escribi :
Buenas,
Cuando estoy haciendo un random Forest para clasificaci n y hago el gr fico
partialPlot, siendo mi respuesta OK/NOK, me sale en el eje X el valor de la
variable, pero en el eje Y me salen valores de entre -1 y 1. Qu significado
tiene?
Adjunto un ejemplo:
https://www.dropbox.com/s/4b92lqxi3592r0d/Captura.JPG?dl=0
Gracias!!!
[[alternative HTML version deleted]]
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Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
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No no, eso lo he sacaod, es decir, tengo la matriz de confusión para las OK/NOK,
lo que no entiendo es como extraer las conclusiones sobre el modelo, de cara a
como afectan las variables. He seguido dos estrategias:
1-Crear arboles de clasificacion con las variables más importantes del random
Forest, pero el modelo se empobrece bastante.
2- Sacar los partialPlot, para ver la influencia de cada variable, pero no
termino de entender el significado del eje Y para estos gráficos. Por lo que he
visto, con tu aportación primera, es que es el porcentaje de Votos OK/NOK, pero
me queda la duda de saber si el 1 es el OK y el -1 el NOK o al revés.
Gracias Carlos!
Jesús
Date: Tue, 12 Apr 2016 10:28:44 +0200
Subject: Re: [R-es] Random Forest para clasificación
From: cof en qualityexcellence.es
To: j.para.fernandez en hotmail.com
CC: r-help-es en r-project.org
Hola,
Entonces, por tu última pregunta, tu duda no es realmente sobre el significado
de "partialPlot" si no realmente si a la hora de hacer tu modelo,
"randomForest" está haciendo una buena o mala clasificación. ¿Es así?.
Porque entonces lo que hay que aclarar es otra cosa.
Si lo que quieres determinar con precisión es si cuando "randomForest"
(o cualquier otro modelo) te está indicando que un individuo (una fila)
pertenece o no a una clase determinada (en tu caso "OK" o
"KO") lo que tienes que plantearte son otras cosas. Antes de hablar de
ellas, prefiero confirmar contigo si es esto lo que buscas o no.
Saludos,Carlos Ortegawww.qualityexcellence.es
El 12 de abril de 2016, 10:17, Jesús Para Fernández <j.para.fernandez en
hotmail.com> escribió:
Gracias por la pronta respuesta, pero tras leer la contestación de la gente,
sigo sin entender muy bien la explicación.
Le responden lo siguiente:
"Each point on the partial dependence plot is the average vote
percentage in favor of the "Yes trees" class across all observations,
given a fixed level of TRI.
It's not a probability of correct classification. It has absolutely
nothing to do with accuracy, true negatives, and true positives.
When you see the phrase
Values greater than TRI 30 begin to have a positive influence for
classification in your model
is an puffed-up way of saying
Values greater than TRI 30 begin to predict "Yes trees" more
strongly than values lower than TRI 30"
Es decir, que el eje Y es el total de votos de una clase frente a la otra,
pero como está codificado con -1 y +1, como se cual es la clase OK y la NOK?
Gracias
Jesús
Date: Tue, 12 Apr 2016 10:04:15 +0200
Subject: Re: [R-es] Random Forest para clasificación
From: cof en qualityexcellence.es
To: j.para.fernandez en hotmail.com
CC: r-help-es en r-project.org
Hola,
Aquí tienes una explicación:
http://stats.stackexchange.com/questions/121383/interpreting-y-axis-of-a-partial-dependence-plots
Saludos,Carlos Ortegawww.qualityexcellence.es
El 12 de abril de 2016, 7:13, Jesús Para Fernández <j.para.fernandez en
hotmail.com> escribió:
Buenas,
Cuando estoy haciendo un random Forest para clasificación y hago el gráfico
partialPlot, siendo mi respuesta OK/NOK, me sale en el eje X el valor de la
variable, pero en el eje Y me salen valores de entre -1 y 1. ¿Qué significado
tiene?
Adjunto un ejemplo:
https://www.dropbox.com/s/4b92lqxi3592r0d/Captura.JPG?dl=0
Gracias!!!
[[alternative HTML version deleted]]
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R-help-es mailing list
R-help-es en r-project.org
https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
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Saludos,
Carlos Ortega
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Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
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