R help es - Dec 2015 - help

> Hola, estoy utilizando RCommander con el plugin Rcmdrplugin.EZR para
calcular curvas de supervivencia de Kaplan-Meier y luego intento ver la
diferencia mediante el test log rank.
> 
> El problema me surge cuando intento calcular el tamaño muestral necesario
para saber si la diferencia entre las curvas es significativa o no. En el
paquete está la opción para hacer este cálculo pero hay varias cosas que no
entiendo a qué se refieren:
> - Accrual duration
> - Total (accural + follow-up) duration
> - Survival ratio at n year in each group (esto es lo que menos  entiendo
porque luego aparece la tasa de supervivencia para cada grupo)
> 
> He intentado ver si existe algún manual del paquete, pero parece que el
único que he conseguido está en japonés!!!
> 
> ¿Me podéis explicar cómo hacer estos cálculos?
> 
> El problema que intento resolver es ver si existe diferencia en cuanto a la
supervivencia entre dos grupos de pacientes con una mismo tipo de cáncer pero
con una localización diferente del tumor. La supervivencia está calculada por
meses.
Gracias por todo


JOSE MARTIN AREVALO
martin_jose en gva.es




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Hola:

Nunca he utilizado el RcmdrPlugin.EZR, pero lo único que he entendido:

- accrual time during which subjects are recruited to the study: tiempo que ja
durado el reclutamiento de los pacientes.
- Total (accural + follow-up) duration: Duración total del estudio:
reclutamiento + seguimiento.
- Survival ratio at n year in each group: si miras la función, a este argumento
le denomina "followup":


    PowerHazard = function (enrol, observe, followup, group1, group2, alpha,
sample,
                            method, ratio)

Si se ejecuta con los valores:

PowerHazard(2, 8, 6, 0.90, 0.80, 0.05, 20, 2, 1)

El resultado es:
> PowerHazard(2, 8, 6, 0.90, 0.80, 0.05, 20, 2, 1)
                                Assumptions
P1                                      0,9
P2                                      0,8
(Follow-up duration for P1, P2)           6
Enrollment duration                       2
Total study duration                      8
Alpha                                  0,05
                                  two-sided
Sample size                                
N1                                       20
N2                                       20
                                           
                                  Estimated
Power                                 0,157

Parece que "Survival ratio at n year in each group" es (Follow-up
duration for P1, P2).

Espero que esto te ayude.

Saludos.

On Tue, 1 Dec 2015 18:55:51 +0100
JOSE MARTIN AREVALO <martin_jose en gva.es> wrote:
> > Hola, estoy utilizando RCommander con el plugin Rcmdrplugin.EZR para
calcular curvas de supervivencia de Kaplan-Meier y luego intento ver la
diferencia mediante el test log rank.
> > 
> > El problema me surge cuando intento calcular el tamaño muestral
necesario para saber si la diferencia entre las curvas es significativa o no. En
el paquete está la opción para hacer este cálculo pero hay varias cosas que no
entiendo a qué se refieren:
> > - Accrual duration
> > - Total (accural + follow-up) duration
> > - Survival ratio at n year in each group (esto es lo que menos 
entiendo porque luego aparece la tasa de supervivencia para cada grupo)
> > 
> > He intentado ver si existe algún manual del paquete, pero parece que
el único que he conseguido está en japonés!!!
> > 
> > ¿Me podéis explicar cómo hacer estos cálculos?
> > 
> > El problema que intento resolver es ver si existe diferencia en cuanto
a la supervivencia entre dos grupos de pacientes con una mismo tipo de cáncer
pero con una localización diferente del tumor. La supervivencia está calculada
por meses.
> 
> Gracias por todo
> 
> 
> JOSE MARTIN AREVALO
> martin_jose en gva.es
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