Estimado Gemma Ruiz Olalla De curioso miré una búsqueda en internet, y se la comparto, de esta observe la página 8 http://adegenet.r-forge.r-project.org/files/tutorial-basics.pdf Estoy de acuerdo con Jorge y Carlos, pero por las dudas, es solo una codificación, yo sin mirar más no interpretaría que el heterocigota tiene un "peso" de 0.5, porque si hay sobredominancia, dominancia, etc ..., aunque desconozco el caso en particular. Javier Rubén Marcuzzi El 11 de abril de 2015, 11:52, Jorge I Velez <jorgeivanvelez en gmail.com> escribió:> Gemma, > > Tiene que ver con cuantos alelos hay en cada locus. Generalmente esto > se codifica como 0, 1 y 2, pero los autores optaron por una codificacion 0, > 0.5 y 1 (que corresponde a tener 0, 1 o 2 alelos, respectivamente, en > el locus de interes). Asumiendo un microsatelite con alelos "A" y "a", por > ejemplo, 0 corresponderia al genotipo "aa", 0.5 a "Aa" y 1 a "AA". > > Saludos cordiales, > Jorge.- > > > > 2015-04-12 0:37 GMT+10:00 Gemma Ruiz-Olalla <gemma.ruizolalla en gmail.com>: > > > Buenas tardes, > > > > Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos callejeros > > ('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería 'adegenet') de > R. > > Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede > explicarnos a > > qué corresponde la variable respuesta? > > > > Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las > columnas > > se corresponden con los 9 microsatélites (¿dentro de los que hay las 17 > > colonias de gatos?) > > Pero a qué se corresponden las cifras 0.0, 0.1, 0.5, etc.? > > > > Muchas gracias de antemano. > > > > -- > > Gemma > > gemma.ruizolalla en gmail.com > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > _______________________________________________ > > R-help-es mailing list > > R-help-es en r-project.org > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > _______________________________________________ > R-help-es mailing list > R-help-es en r-project.org > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es > >[[alternative HTML version deleted]]
Javier, Como mencione, es solo una codificacion y no un "peso" como mencionas. Entiendo perfectamente a lo que te refieres con los heterocigotos y hay que tener cuidado en la interpretacion. Sin embargo, "0.5" solo significa que es heterocigoto en ese marcador, nada mas. Saludos, Jorge.- 2015-04-12 1:11 GMT+10:00 Javier Marcuzzi <javier.ruben.marcuzzi en gmail.com>:> Estimado Gemma Ruiz Olalla > > De curioso miré una búsqueda en internet, y se la comparto, de esta > observe la página 8 > > http://adegenet.r-forge.r-project.org/files/tutorial-basics.pdf > > Estoy de acuerdo con Jorge y Carlos, pero por las dudas, es solo una > codificación, yo sin mirar más no interpretaría que el heterocigota tiene > un "peso" de 0.5, porque si hay sobredominancia, dominancia, etc ..., > aunque desconozco el caso en particular. > > Javier Rubén Marcuzzi > > El 11 de abril de 2015, 11:52, Jorge I Velez <jorgeivanvelez en gmail.com> > escribió: > >> Gemma, >> >> Tiene que ver con cuantos alelos hay en cada locus. Generalmente esto >> se codifica como 0, 1 y 2, pero los autores optaron por una codificacion >> 0, >> 0.5 y 1 (que corresponde a tener 0, 1 o 2 alelos, respectivamente, en >> el locus de interes). Asumiendo un microsatelite con alelos "A" y "a", >> por >> ejemplo, 0 corresponderia al genotipo "aa", 0.5 a "Aa" y 1 a "AA". >> >> Saludos cordiales, >> Jorge.- >> >> >> >> 2015-04-12 0:37 GMT+10:00 Gemma Ruiz-Olalla <gemma.ruizolalla en gmail.com>: >> >> > Buenas tardes, >> > >> > Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos callejeros >> > ('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería 'adegenet') de >> R. >> > Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede >> explicarnos a >> > qué corresponde la variable respuesta? >> > >> > Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las >> columnas >> > se corresponden con los 9 microsatélites (¿dentro de los que hay las 17 >> > colonias de gatos?) >> > Pero a qué se corresponden las cifras 0.0, 0.1, 0.5, etc.? >> > >> > Muchas gracias de antemano. >> > >> > -- >> > Gemma >> > gemma.ruizolalla en gmail.com >> > >> > [[alternative HTML version deleted]] >> > >> > _______________________________________________ >> > R-help-es mailing list >> > R-help-es en r-project.org >> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es >> > >> >> [[alternative HTML version deleted]] >> >> >> _______________________________________________ >> R-help-es mailing list >> R-help-es en r-project.org >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es >> >> >[[alternative HTML version deleted]]
Estimado Jorge Velez Lo que usted dice es correcto, no hay dudas en su redacción, todo claro de su parte. Simplemente coloqué mi comentario algo superpuesto al de usted porque en una exposición que realizaba un extranjero que visitaba mi país, quería "vendernos" cosas en la facultad (a los asistentes), y justo daba un "peso" para el heterocigota, es algo que escapa a la lista, la genómica es buena pero mal interpretada, o solo con fines comerciales de vender el semen de una empresa, puede llevar a errores. Lo expuesto sobre genómica en mi facultad por ese extranjero que nos visitaba, está contrario a lo que nosotros pensamos (técnicamente opinamos igual en el asunto de la consulta a esta lista), lógicamente en mi ping pong de preguntas y respuestas intentó intervenir la traductora, gente que lo patrocinaba, y finalmente me "dio la razón", pero muchas veces se toma como verdad lo que dice el de afuera, posiblemente es algo que nos pasa por estos lados donde la educación tiene puntos flojos. Puede ser que mi comentario superpuesto al de usted en este lugar quede mal, es redundante, sin embargo por estas latitudes hay personas que vienen y nos dicen que como hay un análisis de genético, conocen si es homicigota y ,..., lo más curioso es el silencio de muchos profesionales, incluso profesores universitarios. Javier Marcuzzi El 11 de abril de 2015, 12:15, Jorge I Velez <jorgeivanvelez en gmail.com> escribió:> Javier, > Como mencione, es solo una codificacion y no un "peso" como mencionas. > Entiendo perfectamente a lo que te refieres con los heterocigotos y hay > que tener cuidado en la interpretacion. Sin embargo, "0.5" solo significa > que es heterocigoto en ese marcador, nada mas. > Saludos, > Jorge.- > > 2015-04-12 1:11 GMT+10:00 Javier Marcuzzi <javier.ruben.marcuzzi en gmail.com > >: > >> Estimado Gemma Ruiz Olalla >> >> De curioso miré una búsqueda en internet, y se la comparto, de esta >> observe la página 8 >> >> http://adegenet.r-forge.r-project.org/files/tutorial-basics.pdf >> >> Estoy de acuerdo con Jorge y Carlos, pero por las dudas, es solo una >> codificación, yo sin mirar más no interpretaría que el heterocigota tiene >> un "peso" de 0.5, porque si hay sobredominancia, dominancia, etc ..., >> aunque desconozco el caso en particular. >> >> Javier Rubén Marcuzzi >> >> El 11 de abril de 2015, 11:52, Jorge I Velez <jorgeivanvelez en gmail.com> >> escribió: >> >>> Gemma, >>> >>> Tiene que ver con cuantos alelos hay en cada locus. Generalmente esto >>> se codifica como 0, 1 y 2, pero los autores optaron por una codificacion >>> 0, >>> 0.5 y 1 (que corresponde a tener 0, 1 o 2 alelos, respectivamente, en >>> el locus de interes). Asumiendo un microsatelite con alelos "A" y "a", >>> por >>> ejemplo, 0 corresponderia al genotipo "aa", 0.5 a "Aa" y 1 a "AA". >>> >>> Saludos cordiales, >>> Jorge.- >>> >>> >>> >>> 2015-04-12 0:37 GMT+10:00 Gemma Ruiz-Olalla <gemma.ruizolalla en gmail.com >>> >: >>> >>> > Buenas tardes, >>> > >>> > Estamos intentando hacer un estudio sobre diversidad en gatos >>> callejeros >>> > ('stray cats') de la base de datos 'nancycats' (librería 'adegenet') >>> de R. >>> > Sin embargo, no entendemos muy bien los datos. ¿Alguien puede >>> explicarnos a >>> > qué corresponde la variable respuesta? >>> > >>> > Entendemos que las filas son los 237 gatos (observaciones), y las >>> columnas >>> > se corresponden con los 9 microsatélites (¿dentro de los que hay las 17 >>> > colonias de gatos?) >>> > Pero a qué se corresponden las cifras 0.0, 0.1, 0.5, etc.? >>> > >>> > Muchas gracias de antemano. >>> > >>> > -- >>> > Gemma >>> > gemma.ruizolalla en gmail.com >>> > >>> > [[alternative HTML version deleted]] >>> > >>> > _______________________________________________ >>> > R-help-es mailing list >>> > R-help-es en r-project.org >>> > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es >>> > >>> >>> [[alternative HTML version deleted]] >>> >>> >>> _______________________________________________ >>> R-help-es mailing list >>> R-help-es en r-project.org >>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es >>> >>> >> >[[alternative HTML version deleted]]