thr3ads.net - R help es - [R-es] Problema con el subset [Dec 2014]

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Jose Manuel Veiga del Baño

2014-Dec-17 18:59 UTC

[R-es] Problema con el subset

Hola a todos,

Agradeceros de antemano vuestro tiempo y paciencia ya que soy un poco
novato y tal vez esto sea un poco trivial. 

Lo que quiero hacer es que me represente en eje de las x las fechas
(columna fecha) y los valores de z (columna z) pero de los datos que he
filtrado antes en
(dfgrupo<-subset(df,df$parametroslaboratorio=="Aflatoxinas ByG")) y
que los
parámetros iguales (variables de la columna param) se unan entre sí y
tengan un color cada param. En principio estoy usando un código de un
ejemplo que funciona muy bien pero lo único que consigo es que se me unan
todos los puntos (todos los parm) y que no lo haga por colores. 

Si alguien se le ocurre algo se lo agradezco.

    df  <- read.table(file="xxxx.csv", header=T, sep=";",
dec=",")
    df  <-na.omit(df)
dfgrupo<-subset(df,df$parametroslaboratorio=="Aflatoxinas ByG")
   niveles <- as.numeric(dfgrupo$param)
   ntrees <- max(niveles) 
   xrange <- range(as.Date(dfgrupo$fecha))
   yrange <- range(dfgrupo$z)
   plot(xrange, yrange, type = "n", xlab = "Fecha del
interlaboratorio", 
        ylab = "Z-score")
   colors <- rainbow(ntrees)
   ltipo <- c(1:ntrees)
   char <- seq(18, 18 + ntrees, 1)
   # AÃ±adir las lineas al grafico
   for (i in 1:ntrees) {
       tree <- dfgrupo[ dfgrupo$param == levels( dfinter$param )[ i ], ] 
       lines(as.Date(dfgrupo$fecha), dfgrupo$z, type = "b", lwd =
1.5, 
             col = colors[i], pch = char[i])
   }
   # AÃ±adir un titulo and subtitulo
   title("Evaluacion de los parametros")
   # AÃ±adir la leyenda
   legend(xrange[1], yrange[2], 1:ntrees, cex = 0.8, col = colors, pch char, 
       lty = ltipo, title = "Parametro")
    

Un saludo.

Dr. José M. Veiga
Dpt. Química Agrícola, Geología y Edafología.
Universidad de Murcia.
------------ próxima parte ------------
Se ha borrado un adjunto en formato HTML...
URL:
<https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20141217/3146ea8f/attachment.html>
------------ próxima parte ------------
param;matrizinter;matrizlaboratorio;codigo;parametroslaboratorio;fecha;RESULT
XXX;Uds;RESULT INTER;z;Spropuesta;Sobtenida;incertinter;numeropartic
AFB1 Method;Chilli Powder;ESPECIAS;FAPAS 04218;Aflatoxinas
ByG;01/08/2013;5,62;ppb;3,78;2,2;0,832;0,84;0,25;11
AFB2 Method;Chilli Powder;ESPECIAS;FAPAS 04218;Aflatoxinas
ByG;01/08/2013;1,62;ppb;2,69;-1,8;0,591;0,59;0,18;11
AFG1 Method;Chilli Powder;ESPECIAS;FAPAS 04218;Aflatoxinas
ByG;01/08/2013;2,31;ppb;2,32;0,01;0,509;1;0,3;11
AFG2 Method;Chilli Powder;ESPECIAS;FAPAS 04218;Aflatoxinas
ByG;01/08/2013;1,19;ppb;1,78;-1,5;0,392;0,39;0,12;11
AFM1 Method;Milk Powder;LECHE EN POLVO;FAPAS
04224;M1;01/08/2013;0,181;ppb;0,13;-1,3;0,04;0,04;0,012;11
AFB1 Method;Pistachos;FRUTOS SECOS;FAPAS 04239;Aflatoxinas
ByG;01/06/2014;7,26;ppb;7,6;-0,2;1,67;1,7;0,51;11
AFB2 Method;Pistachos;FRUTOS SECOS;FAPAS 04239;Aflatoxinas
ByG;01/06/2014;1,31;ppb;1,47;-0,5;0,32;0,32;0,097;11
AFG1 Method;Pistachos;FRUTOS SECOS;FAPAS 04239;Aflatoxinas
ByG;01/06/2014;1,85;ppb;1,64;0,6;0,36;0,35;0,11;11
AFG2 Method;Pistachos;FRUTOS SECOS;FAPAS 04239;Aflatoxinas
ByG;01/06/2014;1,17;ppb;0,76;2,5;0,17;0,16;0,049;11
As;WasteWater;AGUAS RESIDUALES;GSCAR-2;Metales aguas y
sales;01/07/2014;0,86;ppm;1,01;-1,48;0,1012;0,1;0,031;11
Cd;WasteWater;AGUAS RESIDUALES;GSCAR-2;Metales aguas y
sales;01/07/2014;1,19;ppm;1,5;-1,85;0,1463;0,17;0,051;11
Cr;WasteWater;AGUAS RESIDUALES;GSCAR-2;Metales aguas y
sales;01/07/2014;3,58;ppm;3,55;0,08;0,355;0,38;0,11;11
TOC;WasteWater;AGUAS
RESIDUALES;GSCAR-2;TOC;01/07/2014;883,5;ppm;854,98;0,33;85,49;86,42;26,1;11

Igor Sosa Mayor

2014-Dec-18 13:35 UTC

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[R-es] Problema con el subset

Jose Manuel Veiga del Baño <chemavb en um.es>
writes:
> Hola a todos,
>
> Agradeceros de antemano vuestro tiempo y paciencia ya que soy un poco
> novato y tal vez esto sea un poco trivial. 
>
> Lo que quiero hacer es que me represente en eje de las x las fechas
> (columna fecha) y los valores de z (columna z) pero de los datos que
> he filtrado antes en (dfgrupo<-subset
> (df,df$parametroslaboratorio=="Aflatoxinas ByG")) y que los
parámetros
> iguales (variables de la columna param) se unan entre sí y tengan un
> color cada param. En principio estoy usando un código de un ejemplo
> que funciona muy bien pero lo único que consigo es que se me unan
> todos los puntos (todos los parm) y que no lo haga por colores. 
>
> Si alguien se le ocurre algo se lo agradezco.
>
> df <- read.table(file="xxxx.csv", header=T, sep=";",
dec=",")
> df <-na.omit(df)
> dfgrupo<-subset(df,df$parametroslaboratorio=="Aflatoxinas
ByG")
> niveles <- as.numeric(dfgrupo$param)
> ntrees <- max(niveles) 
> xrange <- range(as.Date(dfgrupo$fecha))
> yrange <- range(dfgrupo$z)
> plot(xrange, yrange, type = "n", xlab = "Fecha del
interlaboratorio",
> ylab = "Z-score")
> colors <- rainbow(ntrees)
> ltipo <- c(1:ntrees)
> char <- seq(18, 18 + ntrees, 1)
> # AÃ±adir las lineas al grafico
> for (i in 1:ntrees) {
> tree <- dfgrupo[ dfgrupo$param == levels( dfinter$param )[ i ], ] 
> lines(as.Date(dfgrupo$fecha), dfgrupo$z, type = "b", lwd = 1.5, 
> col = colors[i], pch = char[i])
mirando el código así un poco rápido... ¿eso de
> lines(as.Date(dfgrupo$fecha), dfgrupo$z, type = "b", lwd = 1.5, 
> col = colors[i], pch = char[i])
¿no tendría que ser?
lines(as.Date(dfgrupo$fecha), tree, type = "b", lwd = 1.5, 
col = colors[i], pch = char[i])

Saludos,

-- 
:: Igor Sosa Mayor     :: joseleopoldo1792 en gmail.com ::
:: GnuPG: 0x1C1E2890   :: http://www.gnupg.org/      ::
:: jabberid: rogorido  ::                            ::

Carlos Ortega

2014-Dec-19 23:13 UTC

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[R-es] Problema con el subset

Hola,

El error lo tienes aqui:

#-------------------
  tree <- dfgrupo[ dfgrupo$param == levels( dfinter$param )[ i ], ]
    lines(as.Date(*tree*$fecha), *tree*$z, type = "b", lwd = 1.5,
           col = colors[i], pch = char[i])
#-------------------
Primero seleccionas un subconjunto "tree", pero luego a la hora de
pintar
las lineas, vuelves a escoger "dfgrupo" y une todos los puntos del
conjunto
dfgroup en vez de solamente los del subconjunto "tree".

Como alternativa, aunque estás empezando a usar R, mira esta otra forma que
evita todos los cálculos intermedios que has utilizado:

#---------------------
library(lattice)
parVal <- unique(as.vector(dfgrupo$param))
colVal <- rainbow(length(parVal))

xyplot(
        z ~ as.Date(fecha)
       ,data=dfgrupo
       ,group=param
       ,type="b"
       ,main="Evaluación de los parámetros"
       ,xlab=list("Fecha del interlaboratorio", font=2, cex=1.1)
       ,ylab=list("Z-Score", font=2, cex=1.1)
       ,scales=list(col="blue", font=2, cex=1.1)
       ,key=simpleKey(parVal, columns=4)
       ,par.settings=simpleTheme(fill=colVal, col=colVal, pch=19)
  )
#---------------------

Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es

El 17 de diciembre de 2014, 19:59, Jose Manuel Veiga del Baño <chemavb en
um.es> escribió:
>
>   Hola a todos,
>
> Agradeceros de antemano vuestro tiempo y paciencia ya que soy un poco
> novato y tal vez esto sea un poco trivial.
>
> Lo que quiero hacer es que me represente en eje de las x las fechas
> (columna fecha) y los valores de z (columna z) pero de los datos que he
> filtrado antes en
> (dfgrupo<-subset(df,df$parametroslaboratorio=="Aflatoxinas
ByG")) y que los
> parámetros iguales (variables de la columna param) se unan entre sí y
> tengan un color cada param. En principio estoy usando un código de un
> ejemplo que funciona muy bien pero lo único que consigo es que se me unan
> todos los puntos (todos los parm) y que no lo haga por colores.
>
> Si alguien se le ocurre algo se lo agradezco.
>
> df  <- read.table(file="xxxx.csv", header=T,
sep=";", dec=",")
>  df  <-na.omit(df)
> dfgrupo<-subset(df,df$parametroslaboratorio=="Aflatoxinas
ByG")
>  niveles <- as.numeric(dfgrupo$param)
>  ntrees <- max(niveles)
>  xrange <- range(as.Date(dfgrupo$fecha))
>  yrange <- range(dfgrupo$z)
>  plot(xrange, yrange, type = "n", xlab = "Fecha del
interlaboratorio",
>       ylab = "Z-score")
>  colors <- rainbow(ntrees)
>  ltipo <- c(1:ntrees)
>  char <- seq(18, 18 + ntrees, 1)
>  # AÃ±adir las lineas al grafico
>  for (i in 1:ntrees) {
>      tree <- dfgrupo[ dfgrupo$param == levels( dfinter$param )[ i ], ]
>      lines(as.Date(dfgrupo$fecha), dfgrupo$z, type = "b", lwd =
1.5,
>            col = colors[i], pch = char[i])
>  }
>  # AÃ±adir un titulo and subtitulo
>  title("Evaluacion de los parametros")
>  # AÃ±adir la leyenda
>  legend(xrange[1], yrange[2], 1:ntrees, cex = 0.8, col = colors, pch >
char,
>      lty = ltipo, title = "Parametro")
>
>  Un saludo.
> Dr. José M. Veiga
> Dpt. Química Agrícola, Geología y Edafología.
> Universidad de Murcia.
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
>
-- 
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es

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Jose Manuel Veiga del Baño

2014-Dec-20 08:23 UTC

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[R-es] Problema con el subset

Muchas gracias. 

Tienes razón era ese el problema. Voy a mirar la opción alternativa.

Un saludo.

Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es> escribió:
> Hola,
>  
>    El error lo tienes aqui:
>
> #-------------------
>   tree <- dfgrupo[ dfgrupo$param == levels( dfinter$param )[ i ], ] 
>        lines(as.Date(TREE$fecha), TREE$z, type = "b", lwd = 1.5, 
>               col = colors[i], pch = char[i])
> #-------------------
>    Primero seleccionas un subconjunto "tree", pero luego a la
hora de
> pintar las lineas, vuelves a escoger "dfgrupo" y une todos los
puntos
> del conjunto dfgroup en vez de solamente los del subconjunto
"tree".
>     
>    Como alternativa, aunque estás empezando a usar R, mira esta otra
> forma que evita todos los cálculos intermedios que has utilizado:
>
> #---------------------
> library(lattice)
> parVal <- unique(as.vector(dfgrupo$param))
> colVal <- rainbow(length(parVal))
>
> xyplot(
>         z ~ as.Date(fecha)
>        ,data=dfgrupo
>        ,group=param
>        ,type="b"
>        ,main="Evaluación de los parámetros"
>        ,xlab=list("Fecha del interlaboratorio", font=2, cex=1.1)
>        ,ylab=list("Z-Score", font=2, cex=1.1)
>        ,scales=list(col="blue", font=2, cex=1.1)
>        ,key=simpleKey(parVal, columns=4)
>        ,par.settings=simpleTheme(fill=colVal, col=colVal, pch=19)
>   )
> #---------------------
>     
>    Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es[1]
>
>
>    El 17 de diciembre de 2014, 19:59, Jose Manuel Veiga del Baño
> <chemavb en um.es> escribió:
>> _Hola a todos,
>>
>> Agradeceros de antemano vuestro tiempo y paciencia ya que soy un poco
>> novato y tal vez esto sea un poco trivial. 
>>
>> Lo que quiero hacer es que me represente en eje de las x las fechas
>> (columna fecha) y los valores de z (columna z) pero de los datos que he
>> filtrado antes en
>> (dfgrupo<-subset(df,df$parametroslaboratorio=="Aflatoxinas
ByG")) y que
>> los parámetros iguales (variables de la columna param) se unan entre
sí>> y tengan un color cada param. En principio estoy usando un código de un
>> ejemplo que funciona muy bien pero lo único que consigo es que se me
>> unan todos los puntos (todos los parm) y que no lo haga por colores. 
>>
>> Si alguien se le ocurre algo se lo agradezco._
>>
>>         _df  <- read.table(file="xxxx.csv", header=T,
sep=";",
dec=",")_>>         _df  <-na.omit(df)_
>> _dfgrupo<-subset(df,df$parametroslaboratorio=="Aflatoxinas
ByG")_
>>        _niveles <- as.numeric(dfgrupo$param)_
>>        _ntrees <- max(niveles) _
>>        _xrange <- range(as.Date(dfgrupo$fecha))_
>>        _yrange <- range(dfgrupo$z)_
>>        _plot(xrange, yrange, type = "n", xlab = "Fecha
del
>> interlaboratorio", _
>>        _     ylab = "Z-score")_
>>        _colors <- rainbow(ntrees)_
>>        _ltipo <- c(1:ntrees)_
>>        _char <- seq(18, 18 + ntrees, 1)_
>>        _# AÃ±adir las lineas al grafico_
>>        _for (i in 1:ntrees) {_
>>        _    tree <- dfgrupo[ dfgrupo$param == levels( dfinter$param
)[
>> i ], ] _
>>        _    lines(as.Date(dfgrupo$fecha), dfgrupo$z, type =
"b", lwd >> 1.5, _
>>        _          col = colors[i], pch = char[i])_
>>        _}_
>>        _# AÃ±adir un titulo and subtitulo_
>>        _title("Evaluacion de los parametros")_
>>        _# AÃ±adir la leyenda_
>>        _legend(xrange[1], yrange[2], 1:ntrees, cex = 0.8, col = colors,
>> pch = char, _
>>        _    lty = ltipo, title = "Parametro")_
>>        _ _
>>
>> _Un saludo._           _Dr. José M. Veiga
>> Dpt. Química Agrícola, Geología y Edafología.
>> Universidad de Murcia._
>>
>> ________________________________________________
>> R-help-es mailing list
>> R-help-es en r-project.org
>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es_
>>  
>
> _-- _
>    _Saludos,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es[1]_


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Dr. José M. Veiga
Dpt. Química Agrícola, Geología y Edafología.
Universidad de Murcia.

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