R help es - Jul 2014 - Calcular Conductance, cut ratio, Expansion

Saludo!, ante todo gracias por su ayuda. Estoy trabajando con grafos y
quería validar las comunidades encontradas con los diferentes algoritmos
presentes en igraph.
A la hora de validar las comunidades considero la modularidad, pero también
me gustaría ver Conductancia, Radio de corte, Expansión, pero no se si ya
están implementados en algunas otras librerías, alguien sabe?, pues busqué
y no hay sugerencias.
Por otro lado tenía pensado calcularlas pero alguien sabe como se puede
contar los edges de un grafo en base a unos determinados nodos
indicados?.POR FAVOR SE RECIBE SUGERENCIAS.

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Hola.

Quizá te pueda servir la charla que dieron en el GIL (Grupo de Interés 
Local) de Madrid que se impartió el jueves 4 de Abril de 2013. Mira aquí
http://r-es.org/tiki-index.php?page=Grupo%20de%20Inter%C3%A9s%20Local%20de%20Madrid%20-%20GIL%20Madrid

  y busca en la página "*Análisis de Redes Sociales con R*"

Saludos.

PD: Y ya de paso podrías darte de alta en la comunidad de usuarios de 
R-hispano ;)
El 24/07/14 a las #4, Amalia Carolina Guaymas Canavire
escribió:
> Saludo!, ante todo gracias por su ayuda. Estoy trabajando con grafos y
> quería validar las comunidades encontradas con los diferentes algoritmos
> presentes en igraph.
> A la hora de validar las comunidades considero la modularidad, pero también
> me gustaría ver Conductancia, Radio de corte, Expansión, pero no se si ya
> están implementados en algunas otras librerías, alguien sabe?, pues busqué
> y no hay sugerencias.
> Por otro lado tenía pensado calcularlas pero alguien sabe como se puede
> contar los edges de un grafo en base a unos determinados nodos
> indicados?.POR FAVOR SE RECIBE SUGERENCIAS.
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>
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es@r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

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Hola,

Alguna ayuda adicional.
¿Has mirado las funciones neighbors(), vcount(), ecount()?

Y sobre los parámetros adicionales que quieres calcular sobre tu red,
efectivamente no parece que estén definidas en igraph, pero tienes otros
múltiples paquetes en R que trabajan sobre redes. De ellos, he visto que el
paquete "QuACN" está justamente orientado al cálculo de múltiples
parámetros descriptivos de redes. Si lo instalas, tendrás que bajarte
algunos paquetes adicionales de "bioconductor".

Otra referencia a tener a mano es el reciente libro sobre igraph:
"Statistical Analyhsis of Network Data with R".
http://www.amazon.com/Statistical-Analysis-Network-Data-Use/dp/1493909827/ref=la_B00LAFO7SU_1_1?s=books&ie=UTF8&qid=1406278010&sr=1-1

Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es



El 24 de julio de 2014, 16:07, Amalia Carolina Guaymas Canavire <
acarolinagc@gmail.com> escribió:
> Saludo!, ante todo gracias por su ayuda. Estoy trabajando con grafos y
> quería validar las comunidades encontradas con los diferentes algoritmos
> presentes en igraph.
> A la hora de validar las comunidades considero la modularidad, pero también
> me gustaría ver Conductancia, Radio de corte, Expansión, pero no se si ya
> están implementados en algunas otras librerías, alguien sabe?, pues busqué
> y no hay sugerencias.
> Por otro lado tenía pensado calcularlas pero alguien sabe como se puede
> contar los edges de un grafo en base a unos determinados nodos
> indicados?.POR FAVOR SE RECIBE SUGERENCIAS.
>
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Saludos,
Carlos Ortega
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